মূল পার্থক্য – cDNA বনাম জিনোমিক লাইব্রেরি
জেনেটিক ইঞ্জিনিয়ারিং কৌশল ব্যবহার করে বিজ্ঞানীদের দ্বারা নির্মিত দুটি প্রধান ধরনের ডিএনএ লাইব্রেরি রয়েছে। সেগুলি হল সিডিএনএ লাইব্রেরি এবং জিনোমিক লাইব্রেরি। সিডিএনএ এবং জিনোমিক লাইব্রেরির মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে সিডিএনএ লাইব্রেরিতে একটি জীবের মোট এমআরএনএর ক্লোন করা পরিপূরক ডিএনএ থাকে যখন জিনোমিক ডিএনএ লাইব্রেরিতে একটি জীবের সমগ্র জিনোমের ক্লোন করা অংশ থাকে। জিনোমিক ডিএনএ লাইব্রেরি সিডিএনএ লাইব্রেরির চেয়ে বড়৷
জিনোমিক লাইব্রেরি কি?
একটি জিনোমিক ডিএনএ লাইব্রেরি হল একটি জীবের মোট জিনোমিক ডিএনএর টুকরোগুলি বহনকারী ক্লোনগুলির একটি সংগ্রহ৷এতে কোডিং এবং ননকোডিং সিকোয়েন্স সহ সেই জীবের সম্পূর্ণ জিনোমিক ডিএনএ রয়েছে। একটি জিনোমিক লাইব্রেরি নির্মাণ রিকম্বিন্যান্ট ডিএনএ প্রযুক্তি দ্বারা সঞ্চালিত হয় এবং ক্লোনিং (জেনেটিক ইঞ্জিনিয়ারিং) দ্বারা অনুসরণ করা হয়। চিত্র 01-এ দেখানো হিসাবে নির্মাণে বিভিন্ন ধাপ জড়িত। প্রক্রিয়াটি শুরু হয় জিনোমিক ডিএনএ বিচ্ছিন্নকরণের মাধ্যমে। একটি উপযুক্ত ডিএনএ নিষ্কাশন প্রোটোকল ব্যবহার করে, একটি জীবের মোট জিনোমিক ডিএনএ বিচ্ছিন্ন করা উচিত। তারপর ডিএনএকে নিয়ন্ত্রণযোগ্য আকারে বা সীমাবদ্ধ এন্ডোনিউক্লিজ (ডিএনএ কাটিং এনজাইম) দ্বারা নির্দিষ্ট খণ্ডে রূপান্তরিত করা উচিত। খণ্ডিত ডিএনএ ডিএনএ লিগ্যাসেস (ডিএনএ জয়েনিং এনজাইম) ব্যবহার করে ভেক্টরে ঢোকানো উচিত। ভেক্টর একটি স্ব-প্রতিলিপিকারী জীব। প্লাজমিড এবং ব্যাকটেরিওফেজগুলি সাধারণত রিকম্বিন্যান্ট ডিএনএ প্রযুক্তিতে ব্যবহৃত ভেক্টর। এই লিগেটেড ভেক্টরগুলিকে রিকম্বিন্যান্ট ডিএনএ অণু বলা হয় কারণ তারা নিজস্ব এবং সন্নিবেশিত ডিএনএ সিকোয়েন্স উভয়ই বহন করে। রিকম্বিন্যান্ট ভেক্টরগুলি একটি হোস্ট ব্যাকটেরিয়াতে যোগ করা হয় এবং ব্যাকটেরিয়া কোষের ভিতরে রিকম্বিন্যান্ট ভেক্টরগুলিকে গ্রহণ করার জন্য তৈরি করা হয়।রিকম্বিন্যান্ট ভেক্টর (প্লাজমিড) সহ ব্যাকটেরিয়া একটি সংস্কৃতির মাধ্যমে জন্মানো উচিত। ব্যাকটেরিয়া গুণনের সময়, ব্যাকটেরিয়া ডিএনএ, রিকম্বিন্যান্ট প্লাজমিডের সাথে, তাদের জিনোমের প্রতিলিপি তৈরি করে এবং ক্লোন তৈরি করে। এই ক্লোনগুলি উৎস জীবের সমগ্র জিনোম ধারণ করে। তাই একে জিনোমিক লাইব্রেরি বলা হয়। সেই জীবের জিনোমিক লাইব্রেরি তৈরি করতে প্লাজমিডগুলিকে ব্যাকটেরিয়া ক্রোমোজোমাল ডিএনএ থেকে সহজেই আলাদা করা যায়। যদি কোনো নির্দিষ্ট জীবে আগ্রহী জিন থাকে, তাহলে আণবিক প্রোব (মার্কার) ব্যবহার করে হাইব্রিডাইজেশনের মাধ্যমে জিনোমিক লাইব্রেরিতে এটি সনাক্ত করা সহজ।
জিনোমিক লাইব্রেরিগুলি জিনোমিক গঠন এবং কার্যকারিতা, নির্দিষ্ট জিন, জিনের অবস্থান, জিন ম্যাপিং, মিউটেশন, জিন সিকোয়েন্সিং, অভিনব থেরাপিউটিক জিন সনাক্তকরণ ইত্যাদি অধ্যয়ন করার জন্য গুরুত্বপূর্ণ৷
চিত্র_১: একটি জিনোমিক লাইব্রেরি নির্মাণ
সিডিএনএ লাইব্রেরি কী?
A cDNA লাইব্রেরি হল একটি জীবের মোট mRNA থেকে সংশ্লেষিত পরিপূরক DNA (cDNA) ক্লোনের একটি সংগ্রহ। নির্মাণ পদ্ধতিতে বিভিন্ন ধাপ জড়িত। একটি জীব থেকে মোট mRNA বিশুদ্ধকরণ জড়িত প্রথম ধাপ। বিচ্ছিন্ন এমআরএনএ বিপরীত প্রতিলিপি নামক একটি প্রক্রিয়ার মাধ্যমে সিডিএনএ স্ট্র্যান্ডে রূপান্তরিত হয়। রিভার্স ট্রান্সক্রিপশন রিভার্স ট্রান্সক্রিপ্টেস নামক একটি এনজাইম দ্বারা সহজতর হয়। এটি একটি ছোট 3’ প্রাইমার ব্যবহার করে এবং টেমপ্লেট এমআরএনএ স্ট্র্যান্ডের পরিপূরক প্রথম সিডিএনএ স্ট্র্যান্ডের সংশ্লেষণ শুরু করে। ফলস্বরূপ ডবল স্ট্র্যান্ডেড সিডিএনএ সীমাবদ্ধ এন্ডোনিউক্লিজ ব্যবহার করে ছোট খণ্ডে রূপান্তরিত হয় এবং উপযুক্ত ভেক্টরে ঢোকানো হয়। এই তৈরি করা রিকম্বিন্যান্ট অণুগুলিকে তারপর একটি হোস্ট জীবে যুক্ত করা হয় এবং ক্লোন তৈরির জন্য একটি সংস্কৃতি মাধ্যমে বেড়ে ওঠে। একটি জীবের cDNA টুকরা ধারণকারী ক্লোন সংগ্রহ একটি cDNA লাইব্রেরি নামে পরিচিত। সম্পূর্ণভাবে কাটা পরিপক্ক mRNA তে ইন্ট্রোন এবং নিয়ন্ত্রক অঞ্চল থাকে না।তাই জিনোমিক লাইব্রেরির মতো নন-কোডিং টুকরা সিডিএনএ লাইব্রেরিতে থাকে না।
cDNA লাইব্রেরিগুলি কোডিং অঞ্চল, জিনের কার্যকারিতা, জিনের প্রকাশ ইত্যাদির বিশ্লেষণের জন্য গুরুত্বপূর্ণ৷
চিত্র_২: একটি সিডিএনএ লাইব্রেরি নির্মাণ
cDNA এবং জিনোমিক লাইব্রেরির মধ্যে পার্থক্য কী?
cDNA বনাম জিনোমিক লাইব্রেরি |
|
| cDNA লাইব্রেরি হল একটি জীবের mRNA এর পরিপূরক DNA বহনকারী ক্লোনের একটি সংগ্রহ | জিনোমিক লাইব্রেরি হল একটি জীবের মোট জিনোমিক ডিএনএ বহনকারী ক্লোনগুলির একটি সংগ্রহ৷ |
| কোডিং বনাম ননকোডিং সিকোয়েন্স | |
| cDNA লাইব্রেরিতে শুধুমাত্র কোডিং সিকোয়েন্স রয়েছে; এতে ইন্ট্রোন নেই। | জিনোমিক লাইব্রেরিতে ননকোডিং (ইন্ট্রন এবং নিয়ন্ত্রক) ডিএনএ সহ সম্পূর্ণ জিনোমিক ডিএনএ রয়েছে৷ |
| আকার | |
| cDNA লাইব্রেরি ছোট৷ | জিনোমিক লাইব্রেরি বড়৷ |
| প্রারম্ভিক উপাদান | |
| শুরু করার উপাদান হল mRNA | প্রারম্ভিক উপাদান হল ডিএনএ৷ |
| রিভার্স ট্রান্সক্রিপশন জড়িত। | |
| বিপরীত প্রতিলিপি প্রথম সিডিএনএ স্ট্র্যান্ড সংশ্লেষণে ঘটে। | রিভার্স ট্রান্সক্রিপশন ঘটবে না। |
সারাংশ – cDNA এবং জিনোমিক লাইব্রেরি
জিনোমিক লাইব্রেরি একটি জীবের খণ্ডিত মোট জিনোমিক ডিএনএ বহনকারী ক্লোনের জনসংখ্যার প্রতিনিধিত্ব করে। cDNA লাইব্রেরি একটি জীবের মোট mRNA এর পরিপূরক DNA বহনকারী ক্লোনের জনসংখ্যাকে প্রতিনিধিত্ব করে। একটি cDNA ক্লোন শুধুমাত্র mRNA তে পাওয়া ক্রম ধারণ করে যখন জিনোমিক ক্লোন সমগ্র জিনোমের ক্রম ধারণ করে। এটি সিডিএনএ এবং জিনোমিক লাইব্রেরির মধ্যে পার্থক্য৷
