ZFN TALEN এবং CRISPR-এর মধ্যে মূল পার্থক্য হল ZFN হল একটি মানবসৃষ্ট জিন সম্পাদনা কৌশল যা জিঙ্ক ফিঙ্গার ডোমেন এবং একটি Fok1 এন্ডোনিউক্লিজ ডোমেনের সমন্বয়ে গঠিত জিঙ্ক ফিঙ্গার নিউক্লিয়াসের উপর ভিত্তি করে। এদিকে, TALEN হল একটি ব্যাকটেরিয়াল TALE প্রোটিন এবং Fok1 endonuclease এর সমন্বয়ে গঠিত ফিউশন প্রোটিনের উপর ভিত্তি করে একটি মানবসৃষ্ট জিন সম্পাদনা কৌশল এবং CRISPR হল একটি প্রাকৃতিক RNA ভিত্তিক ব্যাকটেরিয়াল প্রতিরক্ষা ব্যবস্থা যা দুই ধরনের RNA এবং সংশ্লিষ্ট Cas প্রোটিন দ্বারা চালিত হয়।
জিন সম্পাদনা সরঞ্জামগুলি ক্রম-নির্দিষ্ট বাঁধাই ডোমেন এবং অ-নির্দিষ্ট ডিএনএ ক্লিভেজ মডিউলগুলির সমন্বয়ে গঠিত ইঞ্জিনিয়ারড নিউক্লিয়াসের উপর ভিত্তি করে। ZFN, TALEN এবং CRISPR হল তিন ধরনের জিন সম্পাদনা কৌশল।ZEN এবং TALEN হল মনুষ্যসৃষ্ট সিস্টেম, অন্যদিকে CRISPR হল ব্যাকটেরিয়ায় ঘটে যাওয়া একটি প্রাকৃতিক ব্যবস্থা। তিনটি সিস্টেমই সিকোয়েন্স এবং ক্লিভ টার্গেট ডিএনএ চিনতে পারে। দস্তা আঙুলের নিউক্লিয়াসগুলি একটি দস্তা আঙুলের ডোমেন এবং Fok1 এন্ডোনিউক্লিজের সমন্বয়ে গঠিত। TALENs একটি ব্যাকটেরিয়া TALE প্রোটিন এবং Fok1 endonuclease দ্বারা গঠিত। CRISPR দুটি RNA (ট্রান্স-অ্যাক্টিভেটিং crRNA এবং একটি একক গাইড RNA) নিয়ে গঠিত।
ZFN কি?
ZFN জিঙ্ক-আঙ্গুলের নিউক্লিয়াসের উপর ভিত্তি করে একটি জিন সম্পাদনা করার সরঞ্জাম। দস্তা আঙুলের নিউক্লিয়াসগুলি হল কাইমেরিক নিউক্লিয়াস যা ক্রম-নির্দিষ্ট ডিএনএ-বাইন্ডিং ডোমেন এবং FokI সীমাবদ্ধতা এন্ডোনিউক্লিজ থেকে অ-নির্দিষ্ট ডিএনএ ক্লিভিং ডোমেনগুলির সমন্বয়ে গঠিত। এটি একটি মনুষ্যসৃষ্ট জিনোম এডিটিং প্রযুক্তি যা ডিএনএ-তে ডাবল-স্ট্র্যান্ড ব্রেক প্ররোচিত করে বিস্তৃত জিন পরিবর্তন করতে সক্ষম করে।
চিত্র 01: ZFN
ZFN হল একটি গুরুত্বপূর্ণ হাতিয়ার যখন গাছপালা এবং বিভিন্ন ফসলের প্রজাতির লক্ষ্যযুক্ত পরিবর্তনগুলি প্রবর্তন করা হয়। এটি গাছপালা মধ্যে মূল্যবান বৈশিষ্ট্য অন্তর্ভুক্ত করার অনুমতি দেয়. অধিকন্তু, ZFN এর একটি থেরাপিউটিক সম্ভাবনা রয়েছে কারণ এটি কার্যকরভাবে লক্ষণগুলি দূর করার জন্য সুনির্দিষ্ট জেনেটিক পরিবর্তন করতে সক্ষম।
TALEN কি?
ট্রান্সক্রিপশন অ্যাক্টিভেটর-লাইক নিউক্লিয়াস (TALEN) হল একটি জিন এডিটিং টুল যা ZFN এর অনুরূপ কাইমেরিক নিউক্লিয়াসের উপর ভিত্তি করে। এটি একটি মানবসৃষ্ট জিনোম এডিটিং প্রযুক্তিও। TALEN DNA-তে ডাবল-স্ট্র্যান্ড ব্রেক প্ররোচিত করে জিন পরিবর্তন করে। TALENগুলি একটি অ-নির্দিষ্ট ডিএনএ ক্লিভেজ মডিউলের সাথে মিশ্রিত ক্রম-নির্দিষ্ট ডিএনএ-বাইন্ডিং ডোমেনগুলির সমন্বয়ে গঠিত। অতএব, এতে FokI ক্লিভেজ ডোমেন এবং TALE প্রোটিন থেকে প্রাপ্ত ডিএনএ-বাইন্ডিং ডোমেন রয়েছে।
চিত্র 02: TALEN
টেল প্রোটিন স্বাভাবিকভাবেই ব্যাকটেরিয়া জেনাস জ্যান্থোমোনাসে পাওয়া যায়। এই প্রোটিনগুলিতে 33-35টি অ্যামিনো অ্যাসিড পুনরাবৃত্তি ডোমেনগুলির একটি সিরিজের সমন্বয়ে গঠিত ডিএনএ বাইন্ডিং ডোমেন রয়েছে। ZFN-এর উপর TALEN-এর একটি বড় সুবিধা হল যে DNA বাইন্ডিং ডোমেনের বাইন্ডিং স্পেসিফিকটি TALEN-এ 33-34 অ্যামিনো অ্যাসিডের পুনরাবৃত্তিতে পরিবর্তন করে পরিবর্তন করা যেতে পারে।
CRISPR কি?
CRISPR মানে ক্লাস্টারড রেগুলেটরি ইন্টারস্পেসড শর্ট প্যালিনড্রোমিক রিপিটস। এটি একটি প্রাকৃতিক আরএনএ ভিত্তিক প্রতিরক্ষা ব্যবস্থা যা ব্যাকটেরিয়ায় কার্যকর হয়। প্রকৃতপক্ষে, এটি একটি জিনোম সম্পাদনা পদ্ধতি যা বিশেষ করে ভাইরাসের বিরুদ্ধে ব্যবহৃত হয়। একটি ভাইরাস বা একটি বিদেশী আক্রমণকারী ব্যাকটেরিয়া এই সিস্টেম সক্রিয় করতে পারেন. CRISPR CRISPR-সংশ্লিষ্ট প্রোটিন (Cas9) এর সাথে একসাথে কাজ করে।
CRISPR দুটি RNA নিয়ে গঠিত: ট্রান্স-অ্যাক্টিভেটিং crRNA এবং একটি একক গাইড RNA। অতএব, CRISPR-এর স্বীকৃতি এই উভয় RNA-এর উপর নির্ভরশীল।যখন ভাইরাল ডিএনএ একটি ব্যাকটেরিয়া কোষে প্রবেশ করে, তখন CRISPR লোকাস গাইড আরএনএ তৈরি করে, যা ক্যাস প্রোটিনকে ভাইরাল ডিএনএ এবং একটি নির্দিষ্ট স্থানে ক্লিভের সাথে পৌঁছাতে এবং আবদ্ধ করতে সহায়তা করে। একবার ভাইরাল ডিএনএ ক্লিভ হয়ে গেলে, প্যাথোজেনিক ডিএনএ নীরব হওয়ার কারণে এটি নিষ্ক্রিয় হয়ে যায়। তাই, CRISPR সিস্টেম ক্যাস প্রোটিনের সাহায্যে ভাইরাসকে ক্যাপচার করে, ক্লিভ করে এবং নিষ্ক্রিয় করে।
চিত্র 03: CRISPR/Cas9
CRISPR/Cas9 একটি জিনোম এডিটিং সিস্টেম হিসেবে ব্যবহৃত হয়। এটি একটি সাম্প্রতিক প্রযুক্তি। অন্যান্য জিনোম সম্পাদনা কৌশলগুলির তুলনায় এই প্রযুক্তিটি খুব সহজ, দক্ষ এবং সাশ্রয়ী। ZFN এবং TALEN-এর তুলনায়, CRISPR/Cas9 সিস্টেম টার্গেটেড জিনোম পরিবর্তনের জন্য একটি দক্ষ হাতিয়ার।
ZFN TALEN এবং CRISPR-এর মধ্যে মিল কী?
- ZFN, TALEN, এবং CRISPR হল জিন সম্পাদনা কৌশল।
- তিনটি টুলই অনেক রোগের পিছনে জেনেটিক কারণ সংশোধনের প্রতিশ্রুতিশীল কৌশল হবে।
- তবে, তারা টার্গেটিং, অসম্পূর্ণ নির্দিষ্টতা এবং জিন-টার্গেটিং-এ সীমাবদ্ধতা দেখায়।
- তিনটি সিস্টেমই ডাবল-স্ট্র্যান্ড ব্রেক প্ররোচিত করতে পারে।
ZFN TALEN এবং CRISPR-এর মধ্যে পার্থক্য কী?
ZFN হল জিঙ্ক আঙুলের নিউক্লিয়াসের উপর ভিত্তি করে একটি জিন সম্পাদনা কৌশল যেখানে TALEN হল একটি ব্যাকটেরিয়া TALE প্রোটিন এবং Fok1 এন্ডোনিউক্লিজের সমন্বয়ে গঠিত ফিউশন প্রোটিনের উপর ভিত্তি করে একটি জিন সম্পাদনা কৌশল এবং CRISPR হল একটি প্রাকৃতিক RNA ভিত্তিক ব্যাকটেরিয়াল প্রতিরক্ষা ব্যবস্থা যা চালিত হয়। দুই ধরনের আরএনএ এবং সংশ্লিষ্ট ক্যাস প্রোটিন দ্বারা। সুতরাং, এটি ZFN TALEN এবং CRISPR এর মধ্যে মূল পার্থক্য।
নীচের ইনফোগ্রাফিকটি পাশাপাশি তুলনা করার জন্য সারণী আকারে ZFN TALEN এবং CRISPR-এর মধ্যে পার্থক্যগুলি তালিকাভুক্ত করে৷
সারাংশ – ZFN বনাম TALEN বনাম CRISPR
ZFN, TALEN, এবং CRISPR হল জিন সম্পাদনা প্রযুক্তি। CRISPR হল সাম্প্রতিক প্রযুক্তি যা আরও ভাল দক্ষতা, সম্ভাব্যতা এবং বহু-ভূমিকা ক্লিনিকাল অ্যাপ্লিকেশন দেখায়। ZFN এবং TALEN উভয়ই মানবসৃষ্ট কৃত্রিম সরঞ্জাম, যখন CRISPR হল একটি ব্যাকটেরিয়া প্রতিরক্ষা ব্যবস্থা। ZFN এবং TALEN উভয়ই ইঞ্জিনিয়ারড নিউক্লিয়াস। CRISPR ক্যাস প্রোটিনের সাথে যুক্ত দুটি আরএনএ প্রকার নিয়ে গঠিত। সুতরাং, এটি ZFN TALEN এবং CRISPR এর মধ্যে পার্থক্যের সারাংশ।
