CRISPR এবং CRISPR Cas9-এর মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে CRISPR (ক্লাস্টারড রেগুলার ইন্টারস্পেসড শর্ট প্যালিন্ড্রোমিক রিপিট) হল একটি প্রাকৃতিকভাবে ঘটমান প্রোক্যারিওটিক ইমিউন ডিফেন্স মেকানিজম যেখানে CRISPR cas9 হল একটি RNA-নির্দেশিত Cas9 নিউক্লিয়াস যা CRISPR অ্যাডাপ্টিভের একটি অংশ। ইমিউন সিস্টেম।
CRISPR হল একটি অ্যান্টিভাইরাল ডিফেন্স ইমিউন সিস্টেম যা ব্যাকটেরিয়া এবং আর্কিয়াতে পাওয়া যায়। এটি ব্যাকটেরিয়া জিনোমে পাওয়া ডিএনএ সিকোয়েন্সের একটি পরিবার। এটি স্পেসারের ক্রম নিয়ে গঠিত যা ব্যাকটিরিওফেজের ডিএনএ টুকরো থেকে উদ্ভূত হয় যা আগে তাদের সংক্রমিত করেছিল। পরবর্তী ভাইরাল সংক্রমণে, ব্যাকটেরিয়া ভাইরাল ডিএনএ ধ্বংস করতে এই ক্রমগুলি ব্যবহার করে।CRISPR সিকোয়েন্সে ছোট প্যালিনড্রোমিক রিপিট এবং স্পেসার সিকোয়েন্স থাকে। অধিকন্তু, CRISPR পুনরাবৃত্তি স্পেসারের ক্রমগুলিতে প্রায়ই যুক্ত জিন থাকে যা ক্যাস প্রোটিনের জন্য কোড করে। Cas9 হল একটি RNA গাইডেড এন্ডোনিউক্লিজ। CRISPR সিকোয়েন্সের সাথে, Cas9 প্রোটিন ব্যাকটেরিয়াতে ব্যাকটেরিয়ার বিরুদ্ধে একটি অভিযোজিত প্রতিরোধ ব্যবস্থা হিসেবে কাজ করে।
CRISPR কি?
CRISPR মানে ক্লাস্টারড রেগুলারলি ইন্টারস্পেসড শর্ট প্যালিনড্রোমিক রিপিটস। এটি ব্যাকটেরিয়া জিনোমে পাওয়া ডিএনএ সিকোয়েন্সের একটি ক্লাস্টার। এটি ব্যাকটেরিয়াতে একটি প্রাকৃতিক প্রতিরক্ষা ব্যবস্থা হিসাবে কাজ করে এবং এটি প্রথম E. coli তে সনাক্ত করা হয়েছিল। ব্যাকটেরিয়াতে, এটি অভিযোজিত প্রতিরক্ষা সুরক্ষা হিসাবে কাজ করে, বিশেষত ব্যাকটেরিওফাজের বিরুদ্ধে। অতএব, এটি একটি ক্রম-নির্দিষ্ট প্রক্রিয়া৷
চিত্র 01: CRISPR
CRISPR সিস্টেমে বেশ কয়েকটি সংক্ষিপ্ত-বিভক্ত ডিএনএ পুনরাবৃত্তি ক্রম রয়েছে।এই পুনরাবৃত্তিগুলি প্যালিনড্রোমিক, 5’ থেকে 3’ পড়ার সময় একই বেস সিকোয়েন্স থাকে এবং অন্যটি 3’ থেকে 5’ পড়ার সময় একই ক্রম দেয়। তাছাড়া, পুনরাবৃত্তি অভিন্ন। এগুলি ছোট "স্পেসার" ডিএনএ সিকোয়েন্সগুলির মধ্যে অবস্থিত যা অভিন্ন নয়। কিন্তু এই স্পেসার ডিএনএ সিকোয়েন্সগুলি বিদেশী ব্যাকটেরিওফেজ ডিএনএর সাথে একই রকম বা মিলে যায়। CRISPR এর সাথে যুক্ত জিনগুলি CRISPR সম্পর্কিত জিন বা Cas জিন নামে পরিচিত। ক্যাস প্রোটিনের জন্য ক্যাস জিন কোড যা হেলিকেস বা নিউক্লিয়াস। হেলিকেস ডিএনএ আনওয়ান্ড করে যখন নিউক্লিয়াস ডিএনএ কেটে দেয়। সামগ্রিকভাবে, CRISPR বিবেচনা করার সময়, এটি ব্যাকটেরিয়ার একটি প্রতিরোধ ব্যবস্থা যা ব্যাকটেরিওফেজের বিরুদ্ধে কাজ করে (ব্যাকটেরিয়া ভাইরাস সংক্রমিত করে)।
CRISPR Cas9 কি?
Cas9 বা CRISPR সম্পর্কিত প্রোটিন 9 হল একটি ব্যাকটেরিয়া RNA-নির্দেশিত এন্ডোনিউক্লিজ। অতএব, এটি একটি এনজাইম যা নির্দেশিকা আরএনএর পরিপূরক লক্ষ্য ডিএনএ (বিশেষত ব্যাকটেরিওফেজ ডিএনএ) সনাক্ত করে এবং কেটে দেয়। এটি স্ট্র্যান্ড-নির্দিষ্ট ক্লিভেজ বহন করে। Cas9 প্রোটিন একটি CRISPR সম্পর্কিত জিন দ্বারা কোড করা হয়।CRISPR cas9 হল RNA-নির্দেশিত CRISPR-Cas9 নিউক্লিজ সিস্টেম যা জিনোম এডিটিং, ট্রান্সক্রিপশনাল পারটার্বেশন, এপিজেনেটিক মড্যুলেশন এবং জিনোম ইমেজিংয়ের জন্য RNA-প্রোগ্রামেবল ডিএনএ টার্গেটিং এবং সম্পাদনা প্ল্যাটফর্ম হিসাবে ব্যবহার করা যেতে পারে। এই CRISPR cas9 সিস্টেম বর্তমান জিনোম এডিটিং সিস্টেমে খুবই জনপ্রিয়।
চিত্র 02: CRISPR Cas9
বর্তমানে, CRISPR/Cas9 সিস্টেমটি ট্রান্সক্রিপশন রিপ্রেশন বা অ্যাক্টিভেশনের মাধ্যমে স্তন্যপায়ী জিনোম পরিবর্তন বা পরিবর্তন করতে ব্যবহৃত হয়। স্তন্যপায়ী কোষগুলি একটি মেরামত পদ্ধতি অবলম্বন করে CRISPR/Cas9 মধ্যস্থতাকারী ডিএনএ বিরতির প্রতিক্রিয়া জানাতে পারে। এটি হয় নন-হোমোলোগাস এন্ড জয়েনিং মেথড (NHEJ) বা হোমোলজি-ডিরেক্টরেড রিপেয়ার (HDR) ব্যবহার করে করা যেতে পারে। এই উভয় মেরামতের প্রক্রিয়া ডাবল-স্ট্র্যান্ডেড বিরতি প্রবর্তনের মাধ্যমে সঞ্চালিত হয়। এর ফলে স্তন্যপায়ী জিন সম্পাদনা হয়।এনএইচইজে জিন মিউটেশনের বিলুপ্তি ঘটাতে পারে এবং ফাংশন প্রভাবের ক্ষতি তৈরি করতে ব্যবহার করা যেতে পারে। HDR নির্দিষ্ট বিন্দু মিউটেশন প্রবর্তন বা বিভিন্ন দৈর্ঘ্যের ডিএনএ সেগমেন্ট প্রবর্তনের জন্য ব্যবহার করা যেতে পারে। বর্তমানে, CRISPR/ Cas সিস্টেম থেরাপিউটিক, বায়োমেডিকাল, কৃষি এবং গবেষণা অ্যাপ্লিকেশনের ক্ষেত্রে ব্যবহৃত হয়।
CRISPR এবং CRISPR Cas9-এর মধ্যে মিল কী?
- Cas9 হল CRISPR Cas সিস্টেমের একটি অংশ৷
- ক্রিসপার ক্যাস9 সিস্টেম হল একটি ইমিউন সিস্টেম যা প্রাকৃতিকভাবে ব্যাকটেরিয়ায় পাওয়া যায়।
CRISPR এবং CRISPR Cas9-এর মধ্যে পার্থক্য কী?
CRISPR হল ব্যাকটেরিয়া জিনোমে পাওয়া ডিএনএ সিকোয়েন্সের একটি ক্লাস্টার যা ব্যাকটেরিওফেজের বিরুদ্ধে প্রাকৃতিক প্রতিরক্ষা ব্যবস্থা হিসেবে কাজ করে। এটি নিয়মিতভাবে অন্তর্বর্তী সংক্ষিপ্ত প্যালিনড্রোমিক পুনরাবৃত্তি, স্পেসার এবং সংশ্লিষ্ট জিন নিয়ে গঠিত। বিপরীতে, cas9 হল একটি CRISPR যুক্ত প্রোটিন 9, যা একটি RNA নির্দেশিত এন্ডোনিউক্লিজ এনজাইম।এটি ভাইরাসের ডবল স্ট্র্যান্ড ডিএনএ সনাক্ত করে এবং ছিঁড়ে ফেলে। প্রকৃতপক্ষে, এটি CRISPR প্রতিরক্ষা ব্যবস্থার একটি অংশ। সুতরাং, এটি CRISPR এবং CRISPR cas9 এর মধ্যে মূল পার্থক্য।
সারাংশ – CRISPR বনাম CRISPR Cas9
CRISPR Cas সিস্টেম একটি মাইক্রোবিয়াল প্রতিরক্ষা ব্যবস্থা। CRISPR হল প্যালিনড্রোমিক শর্ট রিপিটস, স্পেসার সিকোয়েন্স এবং সংশ্লিষ্ট জিনের সমন্বয়ে গঠিত ডিএনএ সিকোয়েন্সের একটি ক্লাস্টার। Cas9 হল একটি Cas প্রোটিন যা একটি RNA গাইডেড এন্ডোনিউক্লিজ। CRISPR এবং Cas9 প্রোটিন একটি ইমিউন সিস্টেম তৈরি করে যা ব্যাকটেরিয়াতে ব্যাকটেরিওফেজ সংক্রমণের বিরুদ্ধে কাজ করে। Cas9 প্রোটিন বিদেশী ভাইরাল ডিএনএ ছিন্ন করতে এবং তাদের ব্যাহত করতে সক্ষম। CrRNA ভাইরাল ডিএনএ চিনতে cas9 কে গাইড করে। অতএব, CRISPR cas9 সিস্টেম হল একটি প্রাকৃতিক প্রতিরোধ ব্যবস্থা যা ভাইরাসের বিরুদ্ধে ব্যাকটেরিয়ায় পাওয়া যায়। সুতরাং, এটি CRISPR এবং CRISPR cas9 এর মধ্যে পার্থক্যের সারাংশ।