মূল পার্থক্য – CRISPR বনাম RNAi
জিনোম সম্পাদনা এবং জিন পরিবর্তন হল জেনেটিক্স এবং আণবিক জীববিজ্ঞানের আগ্রহের আসন্ন ক্ষেত্র। জিন পরিবর্তন জিন থেরাপি অধ্যয়নের জন্য ব্যাপকভাবে প্রযোজ্য এবং জিনের বৈশিষ্ট্য, জিনের কার্যকারিতা এবং জিনের মিউটেশন কীভাবে এর কার্যকারিতাকে প্রভাবিত করতে পারে তা সনাক্ত করতেও ব্যবহৃত হয়। জীবিত কোষের জিনোমে সুনির্দিষ্ট, লক্ষ্যযুক্ত পরিবর্তন করার জন্য দক্ষ এবং নির্ভরযোগ্য উপায়গুলি বিকাশ করা গুরুত্বপূর্ণ। CRISPR এবং RNAi-এর মতো কৌশলগুলি উচ্চ নির্ভুলতার সাথে জিন পরিবর্তন করতে ব্যবহৃত হয়। সিআরআইএসপিআর বা ক্লাস্টারড রেগুলারলি ইন্টারস্পেসড শর্ট প্যালিন্ড্রোমিক রিপিটস হল একটি প্রাকৃতিকভাবে ঘটতে থাকা প্রোক্যারিওটিক ইমিউন ডিফেন্স মেকানিজম যা সম্প্রতি ইউক্যারিওটিক জিন সম্পাদনা এবং পরিবর্তনের জন্য ব্যবহৃত হয়েছে।আরএনএআই বা আরএনএ হস্তক্ষেপ হল একটি ক্রম-নির্দিষ্ট পদ্ধতি যা জিনকে নীরব করার জন্য ছোট ডাবল-স্ট্র্যান্ডেড আরএনএ প্রবর্তন করে যা নিউক্লিক অ্যাসিডের সাথে মধ্যস্থতা করে এবং জিনের অভিব্যক্তি নিয়ন্ত্রণ করে। এটি CRISPR এবং RNAi এর মধ্যে মূল পার্থক্য।
CRISPR কি?
সিআরআইএসপিআর সিস্টেম হল একটি প্রাকৃতিক প্রক্রিয়া যা ই. কোলাই এবং আর্চিয়া সহ কিছু ব্যাকটেরিয়াতে উপস্থিত থাকে। এটি বিদেশী ডিএনএ ভিত্তিক আক্রমণের বিরুদ্ধে একটি অভিযোজিত প্রতিরোধী সুরক্ষা। এটি একটি ক্রম-নির্দিষ্ট প্রক্রিয়া। CRISPR সিস্টেমে বেশ কিছু DNA পুনরাবৃত্তি উপাদান রয়েছে। এই উপাদানগুলি বিদেশী ডিএনএ এবং একাধিক ক্যাস জিন থেকে প্রাপ্ত সংক্ষিপ্ত "স্পেসার" ক্রমগুলির সাথে ছেদযুক্ত। কিছু ক্যাস জিন নিউক্লিয়াস। সুতরাং, সম্পূর্ণ রোগ প্রতিরোধ ব্যবস্থাকে CRISPR/Cas সিস্টেম বলা হয়।
চিত্র 01: CRISPR/ Cas সিস্টেম
CRISPR/Cas সিস্টেম চারটি ধাপে কাজ করে।
- সিস্টেমটি জিনগতভাবে আক্রমণকারী ফেজ এবং প্লাজমিড ডিএনএ সেগমেন্টগুলিকে (স্পেসার) সিআরআইএসপিআর লোকি (স্পেসারের অধিগ্রহণের ধাপ বলে) মধ্যে সংযুক্ত করছে।
- crRNA পরিপক্কতার ধাপ – হোস্ট CRISPR লোকি ট্রান্সক্রিপ করে এবং প্রক্রিয়া করে পরিপক্ক CRISPR আরএনএ (crRNA) তৈরি করে যাতে CRISPR পুনরাবৃত্তি উপাদান এবং সমন্বিত স্পেসার উপাদান উভয়ই রয়েছে।
- CRRNA সনাক্তকরণ - এটি পরিপূরক বেস পেয়ারিং দ্বারা সহজতর হয়। এটি গুরুত্বপূর্ণ যখন একটি সংক্রমণ উপস্থিত থাকে এবং একটি সংক্রামক এজেন্ট উপস্থিত থাকে৷
- লক্ষ্য হস্তক্ষেপ পদক্ষেপ - crRNA বিদেশী DNA সনাক্ত করে, বিদেশী DNA এর সাথে একটি জটিল গঠন করে এবং হোস্টকে বিদেশী DNA থেকে রক্ষা করে।
বর্তমানে, CRISPR/Cas সিস্টেমটি ট্রান্সক্রিপশন রিপ্রেশন বা অ্যাক্টিভেশনের মাধ্যমে স্তন্যপায়ী জিনোম পরিবর্তন বা পরিবর্তন করতে ব্যবহৃত হয়। স্তন্যপায়ী কোষগুলি মেরামত পদ্ধতি অবলম্বন করে CRISPR/Cas9 মধ্যস্থতাকারী ডিএনএ বিরতিতে প্রতিক্রিয়া জানাতে পারে।এটি হয় নন-হোমোলোগাস এন্ড জয়েনিং মেথড (NHEJ) অথবা হোমোলজি ডিরেক্টরেড রিপেয়ার (HDR) ব্যবহার করে করা যেতে পারে। এই উভয় মেরামতের প্রক্রিয়া ডাবল স্ট্র্যান্ডেড বিরতি প্রবর্তনের মাধ্যমে সঞ্চালিত হয়। এর ফলে স্তন্যপায়ী জিনের সম্পাদনা হয়। এইভাবে বর্তমানে CRISPR/ Cas সিস্টেম থেরাপিউটিক, বায়োমেডিকাল, কৃষি এবং গবেষণা অ্যাপ্লিকেশনের ক্ষেত্রে ব্যবহৃত হয়।
RNAi কি?
RNA হস্তক্ষেপ হল একটি ডবল-স্ট্র্যান্ডেড RNA মধ্যস্থতা কৌশল, যা জিনের অভিব্যক্তি নিয়ন্ত্রণ করতে ব্যবহৃত হয়। জড়িত প্রধান যৌগ হল ছোট হস্তক্ষেপকারী RNAs (siRNAs)। siRNA হল একটি বিশেষ ধরনের ডবল-স্ট্র্যান্ডেড RNA যার একটি 3’ ওভারহ্যাং দুটি নিউক্লিওটাইড এবং একটি 5’ ফসফেট গ্রুপ। RNA ইনডিউসড সাইলেন্সিং কমপ্লেক্স (RISC) RNA হস্তক্ষেপের সময় গঠিত হয় যার ফলে siRNA এর সাথে আবদ্ধ জিনের অবক্ষয় ঘটে।
চিত্র 02: RNAi
RNAi এর পদ্ধতি নিম্নরূপ।
- ডাবল-স্ট্র্যান্ডেড আরএনএ সাইটোপ্লাজমের মধ্যে একটি RNase III-টাইপ এন্ডোরিবোনুক্লিজ দ্বারা প্রক্রিয়া করা হবে যাকে Dicer বলা হয় ~21 নিউক্লিওটাইড দীর্ঘ siRNAs তৈরি করতে।
- ডাবল-স্ট্র্যান্ডেড আরএনএ বাইন্ডিং প্রোটিন (dsRNABP) এর সাহায্যে siRNA আবদ্ধ ডিসারের আর্গোনাউটে স্থানান্তর।
- ডুপ্লেক্সের (গাইড স্ট্র্যান্ড) এক স্ট্র্যান্ডে আর্গোনাউটের বাঁধন। এটি অন্য স্ট্র্যান্ডকে স্থানচ্যুত করবে। এর ফলে একটি সম্পূর্ণ প্রোটিন – RNA কমপ্লেক্স যাকে RISC বলা হয়।
- আরআইএসসি কমপ্লেক্সের জোড়া একক-অসস্থিত গাইড আরএনএর সাথে আর্গোনাউটের সাথে আবদ্ধ৷
- গাইড আরএনএর সাথে সমজাতীয় আরএনএ লক্ষ্যের জোড়া।
- আর্গোনট সক্রিয়করণের ফলে লক্ষ্য RNA এর অবক্ষয় ঘটে
CRISPR এবং RNAi-এর মধ্যে মিল কী?
দুটিই জিন এক্সপ্রেশন পরিবর্তনকারী গবেষণা সরঞ্জাম হিসেবে ব্যবহৃত হয়
CRISPR এবং RNAi-এর মধ্যে পার্থক্য কী?
CRISPR বনাম RNAi |
|
| CRISPR হল একটি ইমিউন ডিফেন্স মেকানিজম যা সম্প্রতি ইউক্যারিওটিক জিন সম্পাদনা এবং পরিবর্তনের জন্য ব্যবহার করা হয়েছে৷ | RNAi হল একটি ক্রম-নির্দিষ্ট পদ্ধতি যা জিনকে নীরব করার জন্য ছোট ডাবল-স্ট্র্যান্ডেড |
| টার্গেটিং সিকোয়েন্স | |
| সিন্থেটিক RNA (গাইড RNA) হল CRISPR-এর টার্গেটিং সিকোয়েন্স। | siRNA হল RNAi-এর টার্গেটিং সিকোয়েন্স। |
| জিন দমনে কার্যকারিতা | |
| CRISPR তে কম | RNAi-তে উচ্চ |
| প্রভাব | |
| সিআরআইএসপিআর-এ জিনের নকডাউন ঘটে। | নকআউট / নীরবতা RNAi তে ঘটে। |
সারাংশ – CRISPR বনাম RNAi
CRISPR বা ক্লাস্টারড রেগুলারলি ইন্টারস্পেসড শর্ট প্যালিন্ড্রোমিক রিপিট হল একটি প্রাকৃতিকভাবে ঘটতে থাকা প্রোক্যারিওটিক ইমিউন ডিফেন্স মেকানিজম যা সম্প্রতি ইউক্যারিওটিক জিন সম্পাদনা এবং পরিবর্তনের জন্য ব্যবহার করা হয়েছে। আরএনএআই বা আরএনএ হস্তক্ষেপ হল ছোট ডাবল-স্ট্র্যান্ডেড আরএনএ প্রবর্তন করে জিনকে নীরব করার একটি ক্রম-নির্দিষ্ট পদ্ধতি যা নিউক্লিক অ্যাসিডের সাথে মধ্যস্থতা করে এবং জিনের অভিব্যক্তি নিয়ন্ত্রণ করে। এটি CRISPR এবং RNAi এর মধ্যে মৌলিক পার্থক্য হিসাবে নেওয়া যেতে পারে। উভয় কৌশল, CRISPR/Cas এবং RNAi, জিন ম্যানিপুলেশনের জন্য শক্তিশালী হাতিয়ার যদিও CRISPR/Cas অবশ্যই RNAi-এর থেকে বেশি উচ্চতর কারণ এটি সন্নিবেশ এবং মুছে ফেলা উভয়কেই প্ররোচিত করতে ব্যবহার করা যেতে পারে। CRISPR/ Cas সিস্টেমেও নির্দিষ্টতা বেশি।
CRISPR বনাম RNAi এর PDF সংস্করণটি ডাউনলোড করুন
আপনি এই নিবন্ধটির PDF সংস্করণ ডাউনলোড করতে পারেন এবং উদ্ধৃতি নোট অনুসারে অফলাইন উদ্দেশ্যে এটি ব্যবহার করতে পারেন। দয়া করে এখানে পিডিএফ সংস্করণ ডাউনলোড করুন CRISPR এবং RNAi এর মধ্যে পার্থক্য
