এলোমেলো প্রাইমার এবং অলিগো ডিটি-এর মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে র্যান্ডম প্রাইমার হল সমস্ত সম্ভাব্য হেক্সামার অলিগোনিউক্লিওটাইড সিকোয়েন্সের মিশ্রণ, যখন অলিগো ডিটি প্রাইমারে 12-18 ডিঅক্সিথাইমিডিনগুলির একক-স্ট্রেন্ডযুক্ত প্রসারিত হয়৷
রিভার্স ট্রান্সক্রিপশন হল একটি মেকানিজম যেখানে mRNA বা RNA এর যেকোন প্রজাতি ব্যবহার করে সিডিএনএ সংশ্লেষিত করা যায়। সিডিএনএ তৈরি করার জন্য, বিপরীত ট্রান্সক্রিপ্টেজ এনজাইম এবং অন্যান্য প্রয়োজনীয় উপাদান প্রদান করা উচিত, বিশেষ করে টেমপ্লেট এবং প্রাইমার। প্রাইমার হল সংক্ষিপ্ত ডিএনএ সিকোয়েন্স যা বিশেষভাবে টার্গেট সিকোয়েন্সের পরিবর্ধনের জন্য ডিজাইন করা হয়েছে। র্যান্ডম প্রাইমার এবং অলিগো ডিটি প্রাইমার হল দুটি সাধারণ ধরণের প্রাইমার যা বিপরীত প্রতিলিপিতে ব্যবহৃত হয়।অতএব, র্যান্ডম প্রাইমার বা অলিগো ডিটি প্রাইমার হল সংক্ষিপ্ত ডিএনএ অলিগোনিউক্লিওটাইড সিকোয়েন্স যা রিভার্স ট্রান্সক্রিপ্টেজ রিভার্স ট্রান্সক্রিপশন শুরু করার জন্য প্রয়োজন। RNA টেমপ্লেটের উপর নির্ভর করে, এই দুটি প্রাইমারের মধ্যে থেকে উপযুক্ত প্রাইমার নির্বাচন করা যেতে পারে।
এলোমেলো প্রাইমার কি?
এলোমেলো প্রাইমার হল অলিগোনিউক্লিওটাইডের একটি মিশ্রণ যা সমস্ত সম্ভাব্য হেক্সামার সিকোয়েন্সের প্রতিনিধিত্ব করে। এলোমেলো প্রাইমারের প্রাইমার সিকোয়েন্স হল 5´ – d (NNNNNN) –3´ N=G, A, T বা C। তাই, র্যান্ডম প্রাইমারগুলি DNA পলিমারেজ বা বিপরীত ট্রান্সক্রিপ্টেজ দ্বারা একক-স্ট্র্যান্ডেড ডিএনএ বা আরএনএর পরিবর্ধনের জন্য ব্যবহার করা যেতে পারে, যথাক্রমে এছাড়াও, এলোমেলো প্রাইমার মিশ্রণটি সিডিএনএ তৈরি করতে আরএনএর সমস্ত অঞ্চলকে প্রশস্ত করতে সক্ষম। এইভাবে, এটি বিভিন্ন দৈর্ঘ্যের cDNA উৎপন্ন করে।
চিত্র 01: র্যান্ডম প্রাইমার
সবচেয়ে গুরুত্বপূর্ণ, র্যান্ডম প্রাইমার মিশ্রণটি টেমপ্লেটের নির্দিষ্টতা দেখায় না। এটি mRNA এবং অন্যান্য RNA প্রজাতির মধ্যে পার্থক্য করতে অক্ষম। এবং, এটি নমুনায় যেকোন প্রজাতির আরএনএর সাথে মিলিত হয়। যাইহোক, র্যান্ডম প্রাইমার মিশ্রণটি পলি(A) টেইল ছাড়া RNA-এর বিপরীত ট্রান্সক্রিপশনের জন্য উপযুক্ত, যেমন rRNA, tRNA, নন-কোডিং RNA, ছোট RNA, প্রোক্যারিওটিক mRNA ইত্যাদি, অবনমিত RNA, এবং পরিচিত গৌণ কাঠামো সহ RNA।
Oligo dT কি?
Oligo dT প্রাইমার হল 12 – 18 deoxythymine (dT) এর একটি প্রসারিত। প্রাইমার সিকোয়েন্স 5´-d (TTT TTT TTT TTT TTT TTT)-3 হিসাবে উপস্থাপন করা যেতে পারে। এটি পলি(A) লেজ ধারণকারী mRNA থেকে cDNA উৎপাদনের জন্য ব্যবহৃত হয়। মূলত, এটি বিপরীত ট্রান্সক্রিপ্টেজ দ্বারা অনুঘটক প্রতিক্রিয়ার জন্য একটি প্রাইমার হিসাবে কাজ করে। বিপরীত ট্রান্সক্রিপশনের সময়, অলিগো ডিটি প্রাইমার বেশিরভাগ ইউক্যারিওটিক এমআরএনএ-এর 3´ প্রান্তে পাওয়া পলি-অ্যাডিনিলেটেড লেজের সাথে অ্যানিল করে এবং প্রক্রিয়া শুরু করে।
চিত্র 02: অলিগো ডিটি প্রাইমার ব্যবহার করে বিপরীত ট্রান্সক্রিপশন
এলোমেলো প্রাইমারের বিপরীতে, অলিগো ডিটি প্রাইমার অবক্ষয়িত আরএনএ বা আরএনএর জন্য উপযুক্ত নয় যেখানে প্রোক্যারিওটিক আরএনএ এবং মাইক্রোআরএনএ সহ পলি(এ) লেজের অভাব রয়েছে৷
র্যান্ডম প্রাইমার এবং অলিগো ডিটি-এর মধ্যে মিল কী?
- র্যান্ডম প্রাইমার এবং অলিগো ডিটি প্রাইমার হল দুই ধরনের প্রাইমার যা বিপরীত ট্রান্সক্রিপশন এবং সিডিএনএ তৈরিতে ব্যবহৃত হয়।
- এলোমেলো প্রাইমার এবং অলিগো ডিটি প্রাইমার একসাথে ব্যবহার করলে সিডিএনএ সংশ্লেষণের সংবেদনশীলতা বৃদ্ধি পায়।
- এরা একক-স্ট্রেন্ডেড সংক্ষিপ্ত নিউক্লিওটাইড সিকোয়েন্স।
র্যান্ডম প্রাইমার এবং অলিগো ডিটি-এর মধ্যে পার্থক্য কী?
এলোমেলো প্রাইমার হল একটি সংক্ষিপ্ত অলিগোনিউক্লিওটাইড ক্রম যা একটি এলোমেলো ক্রম দ্বারা গঠিত।এদিকে, অলিগো ডিটি প্রাইমার হল একটি ছোট স্ট্র্যান্ড যা 12 থেকে 18 ডিঅক্সিথাইমিডিন দ্বারা গঠিত। সুতরাং, এটি র্যান্ডম প্রাইমার এবং অলিগো ডিটি এর মধ্যে মূল পার্থক্য। র্যান্ডম প্রাইমারের ক্রম হল 5´ – d (NNNNNN)-3´ N=G, A, T বা C। যেখানে, অলিগো dT প্রাইমারের ক্রম হল 5´-d (TTT TTT TTT TTT TTT TTT)-3´. অতএব, আমরা এটিকে এলোমেলো প্রাইমার এবং অলিগো ডিটি-এর মধ্যে আরেকটি পার্থক্য হিসাবে বিবেচনা করতে পারি।
এছাড়াও, এলোমেলো প্রাইমারগুলি টেমপ্লেটের নির্দিষ্টতা দেখায় না এবং তারা যেকোন প্রজাতির আরএনএর সাথে অ্যানিল করে, যখন অলিগো ডিটি প্রাইমারগুলি ইউক্যারিওটিক এমআরএনএর পলি(এ) লেজের জন্য নির্দিষ্টতা দেখায়৷
নীচের ইনফোগ্রাফিক এলোমেলো প্রাইমার এবং অলিগো ডিটি-এর মধ্যে পার্থক্যের সংক্ষিপ্তসার করে।
সারাংশ – র্যান্ডম প্রাইমার বনাম অলিগো ডিটি
র্যান্ডম প্রাইমার এবং অলিগো ডিটি প্রাইমার হল দুটি ধরণের প্রাইমার যা সিডিএনএ সংশ্লেষণে ব্যবহৃত হয়।র্যান্ডম প্রাইমারে অলিগোনিউক্লিওটাইডের মিশ্রণ থাকে, যা সমস্ত সম্ভাব্য হেক্সামার সিকোয়েন্সের প্রতিনিধিত্ব করে, যখন অলিগো ডিটি প্রাইমার হল 12 থেকে 18 ডিঅক্সিথাইমিডিনগুলির একটি একক স্ট্র্যান্ডেড ক্রম। সুতরাং, এটি র্যান্ডম প্রাইমার এবং অলিগো ডিটি এর মধ্যে মূল পার্থক্য। এছাড়াও, অলিগো ডিটি প্রাইমারগুলি পলি(এ) লেজের সাথে আরএনএর সম্পূর্ণ দৈর্ঘ্যের বিপরীত প্রতিলিপির জন্য উপযোগী, যখন র্যান্ডম প্রাইমারগুলি বেশিরভাগ আরএনএ প্রজাতির বিপরীত ট্রান্সক্রিপশনের জন্য উপযোগী, যার মধ্যে অবনমিত আরএনএ, আরএনএ যার মধ্যে পলি(এ) লেজ নেই এবং আরএনএ রয়েছে। গৌণ কাঠামো। অতএব, র্যান্ডম প্রাইমার টেমপ্লেটের নির্দিষ্টতা দেখায় না যখন অলিগো ডিটি প্রাইমার পলি(এ) লেজ ধারণকারী ইউক্যারিওটিক এমআরএনএর প্রতি নির্দিষ্টতা দেখায়।
