প্রাইমার এবং প্রোমোটারের মধ্যে মূল পার্থক্য হল প্রাইমার হল একটি বাণিজ্যিকভাবে সংশ্লেষিত সংক্ষিপ্ত ডিএনএ সিকোয়েন্স যা পিসিআর-এ একটি টার্গেট ডিএনএ সিকোয়েন্সের পরিবর্ধনের জন্য ব্যবহার করা হয় যখন প্রোমোটার হল একটি নির্দিষ্ট ডিএনএ সিকোয়েন্স যা আরএনএর জন্য একটি সুরক্ষিত প্রারম্ভিক বাইন্ডিং সাইট প্রদান করে। ট্রান্সক্রিপশন শুরু করার জন্য পলিমারেজ এবং ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর।
প্রাইমার এবং প্রোমোটার দুই ধরনের ডিএনএ সিকোয়েন্স। প্রাইমার হল পলিমারেজ চেইন রিঅ্যাকশনের (পিসিআর) জন্য প্রয়োজনীয় ডিএনএর একটি ছোট খণ্ড। এটিতে ছোট নিউক্লিওটাইড সিকোয়েন্স রয়েছে যা ডিএনএ স্ট্র্যান্ডের পার্শ্ববর্তী প্রান্তের পরিপূরক। দুটি ধরণের প্রাইমার রয়েছে এবং তারা নতুন ডিএনএ স্ট্র্যান্ডের সংশ্লেষণের জন্য শুরুর পয়েন্ট হিসাবে কাজ করে।বিপরীতে, একটি প্রবর্তক হল একটি নির্দিষ্ট ডিএনএ ক্রম যা একটি জিনের ট্রান্সক্রিপশন সূচনা সাইটের উপরে অবস্থিত। এটি ডিএনএ ট্রান্সক্রিপশন নিয়ন্ত্রণ করার জন্য আরএনএ পলিমারেজ এবং ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টরগুলির মতো ট্রান্সক্রিপশন প্রক্রিয়া উপাদানগুলির সাথে সরাসরি যোগাযোগ করে। অতএব, আরএনএ পলিমারেজ এবং অন্যান্য ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর প্রমোটার সিকোয়েন্সের সাথে আবদ্ধ হয় এবং ট্রান্সক্রিপশন শুরু করে।
প্রাইমার কি?
প্রাইমার হল ছোট ডিএনএ সিকোয়েন্স যা লক্ষ্য ডিএনএ সিকোয়েন্সের পরিবর্ধনের জন্য ডিজাইন করা হয়েছে। কাঠামোগতভাবে, তারা ডিএনএ ডাবল স্ট্র্যান্ডের ফ্ল্যাঙ্কিং প্রান্তের পরিপূরক সংক্ষিপ্ত নিউক্লিওটাইড ক্রম ধারণ করে। এগুলি সাধারণত প্রায় 20 নিউক্লিওটাইড লম্বা হয়। পিসিআর-এর সময়, টাক পলিমারেজ পূর্বে বিদ্যমান নিউক্লিওটাইড ক্রমানুসারে নিউক্লিওটাইডের সংযোজন অনুঘটক করে। তাই, প্রাইমারগুলি নতুন স্ট্র্যান্ডের সংশ্লেষণের জন্য শুরুর পয়েন্ট হিসাবে কাজ করে। Taq পলিমারেজ শুধুমাত্র 5’ থেকে 3’ দিকে কাজ করে। তাই, ডিএনএ সংশ্লেষণও একই 5’ থেকে 3’ দিকে সঞ্চালিত হয়। যেহেতু ডিএনএ ডাবল-স্ট্র্যান্ডড, তাই পিসিআর-এ দুই ধরনের প্রাইমার প্রয়োজন।ডিএনএ সংশ্লেষণের সময় প্রাইমারের প্রসারণের দিকের উপর ভিত্তি করে এগুলি ফরোয়ার্ড প্রাইমার এবং রিভার্স প্রাইমার নামে পরিচিত।
চিত্র 01: প্রাইমার
ফরোয়ার্ড প্রাইমার অ্যান্টিসেন্স ডিএনএ স্ট্র্যান্ডের সাথে অ্যানিল করে এবং জিনের + স্ট্র্যান্ডের সংশ্লেষণকে 5’ থেকে 3’ দিকের দিকে শুরু করে। এটির একটি সংক্ষিপ্ত নিউক্লিওটাইড ক্রম রয়েছে যা অ্যান্টিসেন্স স্ট্র্যান্ডের 3’ ফ্ল্যাঙ্কিং প্রান্তের পরিপূরক। রিভার্স প্রাইমার সেন্স স্ট্র্যান্ডের সাথে অ্যানিল করে এবং কোডিং স্ট্র্যান্ডের একটি পরিপূরক স্ট্র্যান্ডের সংশ্লেষণ শুরু করে, যা হল – জিনের একটি স্ট্র্যান্ড 5’ থেকে 3’ দিকে। এইভাবে, বিপরীত প্রাইমারটি কোডিং স্ট্র্যান্ডের 3’ প্রান্তের পরিপূরক ডিজাইন করা হয়েছে। রিভার্স এবং ফরোয়ার্ড প্রাইমার উভয়ই লক্ষ লক্ষ থেকে বিলিয়ন কপি DNA এর নির্দিষ্ট অঞ্চলের জন্য গুরুত্বপূর্ণ যা লক্ষ্য বা আগ্রহী।
প্রবর্তক কি?
প্রবর্তক হল একটি ডিএনএ সিকোয়েন্স যা একটি জিনের ট্রান্সক্রিপশন ইনিশিয়েশন সাইটের উপরের দিকে বা 5′ প্রান্তে অবস্থিত। এটি জিনের প্রতিলিপি শুরু করার জন্য আরএনএ পলিমারেজ এবং কিছু নিয়ন্ত্রক উপাদানগুলির জন্য একটি বাঁধাই সাইট সরবরাহ করে। এটি একটি জিন চালু বা বন্ধ করার জন্য প্রয়োজনীয় একটি নিয়ন্ত্রক ক্রম। প্রোমোটারে একটি নির্দিষ্ট নিউক্লিওটাইড ক্রম রয়েছে। এতে 100-1000 বেস জোড়া থাকতে পারে। প্রচারক প্রতিলিপির দিক দেখায়। অধিকন্তু, এটি সেন্স স্ট্র্যান্ড নির্দেশ করে যা প্রতিলিপি করা উচিত।
চিত্র 02: একটি জিনের প্রবর্তক
কোর প্রোমোটার, প্রক্সিমাল প্রোমোটার এবং ডিস্টাল প্রোমোটার হিসাবে তিন ধরনের প্রোমোটার উপাদান রয়েছে। মূল প্রবর্তক হল ট্রান্সক্রিপশন শুরু করার জন্য প্রবর্তকের ন্যূনতম অংশ।এটি স্টার্ট কোডনের সবচেয়ে কাছাকাছি অবস্থিত। TATA বক্স হল একটি সংরক্ষিত অঞ্চল যা অনেক ইউক্যারিওটিক কোর প্রোমোটারে পাওয়া যায়। এটি ট্রান্সক্রিপশন স্টার্ট সাইটের উজানে 25 থেকে 35 বেস জোড়া পাওয়া যায়। প্রক্সিমাল প্রোমোটারকে কোর প্রোমোটার থেকে আরও উজানে পাওয়া যায়। সাধারণত, এটি স্টার্ট কোডন পর্যন্ত 250 বেস জোড়া আপস্ট্রিমে অবস্থিত এবং এতে প্রাথমিক নিয়ন্ত্রক উপাদান রয়েছে। দূরবর্তী প্রবর্তক প্রক্সিমাল প্রোমোটারের উজানে পাওয়া যায় এবং এতে অতিরিক্ত নিয়ন্ত্রক উপাদান রয়েছে। ব্যাকটেরিয়াল প্রোমোটারদের তাদের প্রোমোটারে দুটি ছোট ক্রম উপাদান থাকে। TATAAT হল ঐকমত্য ক্রম যা ব্যাকটেরিয়া প্রবর্তকের -10-এ অবস্থিত যেখানে TTGACA হল -35-এ ঐকমত্য ক্রম। এগুলি -10 উপাদান এবং -35 উপাদান হিসাবে পরিচিত৷
প্রাইমার এবং প্রমোটারের মধ্যে মিল কী?
- প্রাইমার এবং প্রোমোটার দুই ধরনের ডিএনএ সিকোয়েন্স।
- এরা নিউক্লিওটাইড ক্রম নিয়ে গঠিত।
- প্রাইমার এবং প্রোমোটার উভয়ই জিনের প্রকাশের জন্য গুরুত্বপূর্ণ।
প্রাইমার এবং প্রমোটারের মধ্যে পার্থক্য কী?
প্রাইমার হল একটি সংক্ষিপ্ত নিউক্লিওটাইড ক্রম যা লক্ষ্য ডিএনএ এর পরিবর্ধনের জন্য ডিজাইন করা হয়েছে। বিপরীতে, প্রবর্তক হল একটি নির্দিষ্ট নিয়ন্ত্রক ডিএনএ সিকোয়েন্স যা একটি জিনের ট্রান্সক্রিপশন ইনিশিয়েশন সাইটের উজানে পাওয়া যায়। সুতরাং, এটি প্রাইমার এবং প্রবর্তকের মধ্যে মূল পার্থক্য। প্রাইমারগুলি প্রায় 20 বেস জোড়া লম্বা হয় যখন প্রবর্তকের 100 -1000 বেস জোড়া থাকতে পারে। কার্যকরীভাবে, প্রাইমারগুলিকে নতুন স্ট্র্যান্ড সংশ্লেষণের শুরুর ক্রম হিসাবে পরিবেশন করা হয় যখন প্রোমোটাররা আরএনএ পলিমারেজ এবং অন্যান্য ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টরগুলির জন্য বাইন্ডিং সাইট প্রদান করে জিন ট্রান্সক্রিপশন নিয়ন্ত্রণ করে৷
এছাড়াও, একজন প্রবর্তককে ট্রান্সক্রিপশনের দিক হিসাবে সংজ্ঞায়িত করা হয় এবং একটি জিনের সেন্স স্ট্র্যান্ড নির্দেশ করে। কাঠামোগতভাবে, প্রাইমার হল একটি সংক্ষিপ্ত, একক-স্ট্রেন্ডেড ডিএনএ সিকোয়েন্স যেখানে প্রবর্তক হল একটি দীর্ঘ ডাবল-স্ট্র্যান্ডেড ডিএনএ সিকোয়েন্স।
নিচের তথ্য-গ্রাফিকটি প্রাইমার এবং প্রমোটারের মধ্যে পার্থক্য সম্পর্কিত আরও তুলনা করে।
সারাংশ – প্রাইমার বনাম প্রচারক
প্রাইমার হল ছোট নিউক্লিওটাইড সিকোয়েন্স যা লক্ষ্য ডিএনএ ডাবল-স্ট্র্যান্ডের ফ্ল্যাঙ্কিং প্রান্তের পরিপূরক। পিসিআর-এ দুই ধরনের প্রাইমার ব্যবহার করা হয়। তারা নতুন স্ট্র্যান্ডের সংশ্লেষণের জন্য শুরুর ক্রম হিসাবে কাজ করে। প্রাইমারগুলি বাণিজ্যিকভাবে ডিজাইন করা হয়েছে, এবং তারা তাপমাত্রা স্থিতিশীল ক্রম। অন্যদিকে, প্রবর্তক হল ট্রান্সক্রিপশন ইনিশিয়েশন সাইটের উজানে অবস্থিত একটি জিনের একটি নিয়ন্ত্রক ক্রম। প্রচারকারীরা জিনের প্রতিলিপি নিয়ন্ত্রণ করে। তারা ট্রান্সক্রিপশন শুরু করার জন্য RNA পলিমারেজ এবং ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টরগুলির জন্য বাঁধাই সাইটগুলি প্রদান করে। সুতরাং, এটি হল প্রাইমার এবং প্রোমোটারের মধ্যে পার্থক্যের সারাংশ।
