Benzonase এবং DNase এর মধ্যে পার্থক্য

2024 লেখক: Alex Aldridge | [email protected]. সর্বশেষ পরিবর্তিত: 2023-12-17 13:33

মূল পার্থক্য – বেনজোনেস বনাম ডিএনসে

নিউক্লিক অ্যাসিডের অবক্ষয় অনেক আণবিক জীববিজ্ঞান কৌশলের জন্য গুরুত্বপূর্ণ। এটি ডিএনএ এবং আরএনএর অবাঞ্ছিত টুকরো থেকে পরিত্রাণ পেতে রিকম্বিন্যান্ট ডিএনএ প্রযুক্তিতে ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত হয়। নিউক্লিক অ্যাসিড অবক্ষয়কারী এনজাইমগুলিকে নিউক্লিয়াস হিসাবে উল্লেখ করা হয় এবং প্রয়োজনীয় ফাংশনের উপর ভিত্তি করে এগুলি বিভিন্ন ধরণের হতে পারে। নিউক্লিয়াসগুলি যেগুলি ডিএনএকে অবনমিত করে সেগুলিকে ডিএনএস হিসাবে পরিচিত এবং যেগুলি আরএনএকে হ্রাস করে সেগুলিকে আরএনএজ বলা হয়। এই এনজাইমগুলি বেশিরভাগই ভিট্রো পরীক্ষায় ব্যবহৃত হয় যেখানে বিশুদ্ধ ডিএনএ, আরএনএ বা প্রোটিনগুলিকে বিচ্ছিন্ন করার জন্য ভিট্রো আণবিক পরীক্ষা করা হয়। বেনজোনাসিস হল এক ধরনের নিউক্লিয়াস যা ডিএনএ এবং আরএনএ উভয়েরই অবনতি করে যেখানে ডিএনএগুলি শুধুমাত্র ডিএনএকে অবনমিত করে।এটি বেনজোনেস এবং ডিএনএসের মধ্যে মূল পার্থক্য।

বেনজোনেস কি?

বেনজোনেস হল সেরাটিয়া মার্সেসেন্সের একটি জেনেটিক্যালি ইঞ্জিনিয়ারড এন্ডোনিউক্লিজ। এই এনজাইমটি শিল্প স্কেলে ই. কোলাই হোস্টে উত্পাদিত হয়। বেনজোনেস ডাবল-স্ট্র্যান্ডেড ডিএনএ, রৈখিক ডিএনএ, বৃত্তাকার ডিএনএ এবং সিঙ্গেল-স্ট্র্যান্ডেড আরএনএ ক্লিভ করতে সক্ষম। এইভাবে বেনজোনেস বাণিজ্যিকভাবে গুরুত্বপূর্ণ। বেনজোনেজ এনজাইম হল একটি প্রোটিন ডাইমার যার 245টি অভিন্ন অ্যামিনো অ্যাসিড, ~30 kDa সাবইউনিট দুটি অপরিহার্য ডিসালফাইড বন্ধন রয়েছে। বেনজোনেস তার 5’ প্রান্তে নিউক্লিক অ্যাসিড ছিঁড়ে ফেলে এবং এর ফলে মুক্ত 5’ প্রান্তে খণ্ডিত হয়। বেনজোনেস যেকোনো ক্রমানুসারে নিউক্লিক অ্যাসিড ছিঁড়ে ফেলতে পারে কিন্তু GC সমৃদ্ধ অঞ্চল পছন্দ করে।

বেনজোনেস -20 ^{0C এ সংরক্ষণ করা হয়। এনজাইম কার্যকলাপের জন্য সর্বোত্তম pH 8.0 - 9.2 পাওয়া যায়। বেনজোনেসের প্রয়োগের মধ্যে রয়েছে প্রোটিন 2D জেল ইলেক্ট্রোফোরসিসের নমুনা প্রস্তুতি যেখানে বেনজোনেস আবদ্ধ নিউক্লিক অ্যাসিড অপসারণ করে এবং রিকম্বিন্যান্ট প্রোটিন প্রস্তুতি থেকে নিউক্লিক অ্যাসিড দূষক অপসারণ করে।এটি প্রোটিন নির্যাসের সান্দ্রতা কমাতে এবং কোষের মিশ্রণে কোষের জমাট বাঁধা প্রতিরোধ করতেও ব্যবহৃত হয়।}

DNase কি?

DNase হল একটি নিউক্লিয়াস, হাইড্রোলাইটিক এনজাইম যা শুধুমাত্র ডাবল-স্ট্র্যান্ডেড ডিএনএ ক্লিভ করতে সক্ষম। DNase এর দুটি প্রধান প্রকার রয়েছে: DNase I এবং DNase II। DNase I 5’ মুক্ত প্রান্ত সহ পলিনিউক্লিওটাইড তৈরি করতে ডাবল-স্ট্র্যান্ডেড ডিএনএ ক্লিভিংয়ে অংশগ্রহণ করে। DNase II 3’ মুক্ত প্রান্ত বা ওভারহ্যাং সহ পলিনিউক্লিওটাইড স্ট্র্যান্ড তৈরি করতে ডাবল-স্ট্র্যান্ডেড ডিএনএ ক্লিভ করার সাথে জড়িত৷

DNase I

DNase I 7.0 – 8.0 এর মধ্যে সর্বোত্তম pH-এ কাজ করে। এনজাইমের ক্রিয়াকলাপ অনেক আয়নিক কোফ্যাক্টরের উপর নির্ভর করে যার মধ্যে রয়েছে, Ca²⁺, Mg²⁺ বা Mn^2+Mg2+ ^{এবং Mn}2+ ^{DNase I এর কার্যকারিতা নির্ধারণ করে। Mg} এর উপস্থিতিতে 2+^{, DNase I dsDNA-এর প্রতিটি স্ট্র্যান্ডকে স্বাধীনভাবে ছিঁড়ে ফেলে। এটি একটি র্যান্ডম পদ্ধতিতে সঞ্চালিত হয়. বিপরীতে, Mn}2+, ^{এর উপস্থিতিতে এনজাইমটি প্রায় একই সাইটে উভয় ডিএনএ স্ট্র্যান্ডকে বিচ্ছিন্ন করে।এই ফাটলের ফলে দুই ধরনের ডিএনএ খণ্ড তৈরি হবে; এক প্রকার ভোঁতা শেষ এবং অন্য প্রকার এক বা দুটি নিউক্লিওটাইড ওভারহ্যাং সহ।}

চিত্র 02: DNase

DNase II

DNase II 4.5-5.0 এর সর্বোত্তম pH এ কাজ করে এবং ডিভালেন্ট ধাতব আয়ন এর কার্যকলাপের জন্য প্রয়োজন, DNase I এর মতো। DNase II এর প্রক্রিয়াটি তিনটি প্রধান ধাপ নিয়ে গঠিত বলে জানা যায়।

1. ডিএনএ মেরুদণ্ডের মধ্যে একাধিক একক স্ট্র্যান্ড ব্রেক প্ররোচিত হয়৷
2. অ্যাসিড দ্রবণীয় নিউক্লিওটাইড এবং অলিগোনিউক্লিওটাইড উৎপন্ন হয়।
3. নন-লিনিয়ার হাইপারক্রোমিক শিফট শেষ পর্যায়ে ঘটে।

DNase এনজাইমের প্রধান ইনহিবিটারগুলির মধ্যে রয়েছে মেটাল চেলেটর, ট্রানজিশন ধাতু এবং রাসায়নিক পদার্থ যেমন সোডিয়াম ডোডেসিল সালফেট এবং β – মারকাপটোথেনল৷

DNase-এর প্রধান অ্যাপ্লিকেশনগুলির মধ্যে রয়েছে ডিএনএ-মুক্ত আরএনএ নির্যাস এবং প্রোটিন নির্যাস তৈরি করা, এবং ইন ভিট্রো ট্রান্সক্রিপশন পরীক্ষার সময় টেমপ্লেট ডিএনএ অপসারণ৷

বেনজোনেস এবং DNase-এর মধ্যে মিল কী?

• দুটিই হাইড্রোলাইটিক এনজাইম।
• দুটিই নিউক্লিয়াস।
• দুজনেই নিউক্লিক অ্যাসিডের ফসফোডিস্টার বন্ধন ছিন্ন করে অংশগ্রহণ করে।
• এনজাইমের ক্রিয়াকলাপ বজায় রাখার জন্য উভয়েরই একটি সর্বোত্তম পিএইচ এবং স্টোরেজ তাপমাত্রা প্রয়োজন৷
• এনজাইমের প্রতিরোধকদের মধ্যে রয়েছে চিলেটিং এজেন্ট, ট্রানজিশন মেটাল এবং ডিটারজেন্ট রাসায়নিক।
• অ্যাপ্লিকেশানগুলি মূলত ডিএনএ, আরএনএ এবং প্রোটিনের উচ্চ বিশুদ্ধতার নির্যাস প্রাপ্তির উপর দৃষ্টি নিবদ্ধ করে৷
• উভয়টি এনজাইম জেনেটিক ইঞ্জিনিয়ারিংয়ের মাধ্যমে তৈরি করা যেতে পারে।

Benzonase এবং DNase এর মধ্যে পার্থক্য কি?

বেনজোনেস বনাম DNase
বেনজোনেস একটি এনজাইম যা ডাবল-স্ট্র্যান্ডেড ডিএনএ, রৈখিক ডিএনএ, বৃত্তাকার ডিএনএ এবং আরএনএ ক্লিভ করতে সক্ষম।	DNase হল একটি এনজাইম যা ডাবল-স্ট্র্যান্ডেড ডিএনএ ক্লিভ করতে সক্ষম।
এনজাইমের জন্য সাবস্ট্রেট
DNA এবং RNA উভয়ই বেনজোনেসের সাবস্ট্রেট।	DNA হল DNase এর সাবস্ট্রেট।
গঠন
বেনজোনেসের সর্বোত্তম পিএইচ পরিসীমা হল 7.0 -8.0	DNase I-এর সর্বোত্তম pH রেঞ্জ হল 7.0 – 8.0 এবং DNase II হল 4.5 – 5.0.

সারাংশ – বেনজোনেস বনাম ডিএনসে

নিউক্লিজ এনজাইমগুলি আণবিক জীববিজ্ঞান এবং জেনেটিক ইঞ্জিনিয়ারিং সংক্রান্ত বিভিন্ন পরীক্ষামূলক পদ্ধতিতে ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত হয়।Benzonase এবং DNase হল দুই ধরনের নিউক্লিয়াস। বেনজোনেস ডিএনএ এবং আরএনএ উভয়ের অবনতিতে জড়িত যেখানে ডিএনএ ডবল-স্ট্র্যান্ডেড ডিএনএ ক্লিভ করার সাথে জড়িত। এটি বেনজোনেস এবং DNase এর মধ্যে মৌলিক পার্থক্য। বর্তমানে, এই উভয় নিউক্লিয়াস প্রকার রিকম্বিন্যান্ট ডিএনএ প্রযুক্তির মাধ্যমে উত্পাদিত হয় যা একটি উচ্চ মানের এনজাইম দেয় যা সর্বোচ্চ উৎপাদনের জন্য অপ্টিমাইজ করা হয়৷

Benzonase বনাম DNase এর PDF সংস্করণ ডাউনলোড করুন

আপনি এই নিবন্ধটির PDF সংস্করণ ডাউনলোড করতে পারেন এবং উদ্ধৃতি নোট অনুসারে অফলাইন উদ্দেশ্যে এটি ব্যবহার করতে পারেন। অনুগ্রহ করে এখানে পিডিএফ সংস্করণ ডাউনলোড করুন বেনজোনেস এবং ডিএনএসের মধ্যে পার্থক্য