কী পার্থক্য - T4 বনাম T7 ডিএনএ লিগ্যাস
DNA ligase হল একটি গুরুত্বপূর্ণ এনজাইম যা আণবিক জীববিজ্ঞানের কৌশলগুলিতে ব্যবহৃত হয়। এটি নিউক্লিওটাইডগুলির মধ্যে ফসফোডিস্টার বন্ধন তৈরি করে নিউক্লিওটাইডে যোগদানের জন্য একটি আণবিক আঠা হিসাবে কাজ করে। ফসফোডিস্টার বন্ডগুলি চিনির আধিকাংশের 3’ হাইড্রক্সিল প্রান্ত এবং 5’ শেষ ফসফেট গ্রুপের মধ্যে গঠিত হয়। ল্যাগিং স্ট্র্যান্ডের ওকাজাকি খণ্ডের সাথে যোগদানের জন্য এবং ডিএনএ মেরামত প্রক্রিয়ার সময় এবং ভেক্টর জিনোমের আগ্রহের পছন্দসই জিনের সাথে যোগদানের জন্য ভিট্রো ক্লোনিং পরীক্ষা-নিরীক্ষার সময় প্রতিলিপি প্রক্রিয়ায় ডিএনএ লিগেস গুরুত্বপূর্ণ। বর্তমানে আণবিক জীববিজ্ঞানীদের দ্বারা ব্যবহৃত দুটি প্রধান ডিএনএ লিগাস রয়েছে: T4 এবং T7 ডিএনএ লিগাসেস।T4 DNA ligase হল T4 ব্যাকটেরিওফেজ থেকে বিচ্ছিন্ন হওয়া প্রথম এনজাইমগুলির মধ্যে একটি। T7 DNA ligase, যা একটি ছোট প্রোটিন, T7 ব্যাকটেরিওফেজ থেকে বিচ্ছিন্ন একটি এনজাইম। এটি T4 এবং T7 ডিএনএ লিগাসের মধ্যে মূল পার্থক্য।
DNA Ligase এর ক্রিয়া কী?
DNA বন্ধন একটি তিন-পদক্ষেপ বিক্রিয়ায় ঘটে। প্রথম ধাপ হল ATP-এর আলফা-ফসফরাসের উপর নিউক্লিওফিলিক আক্রমণ যা একটি সমযোজী এনজাইম-অ্যাডিনাইলেট ইন্টারমিডিয়েট তৈরি করে যাতে এএমপি লাইসিনের টার্মিনাল সাইড-চেইন নাইট্রোজেনের সাথে যুক্ত থাকে। দ্বিতীয় ধাপে, 5’-ফসফেট-সমাপ্ত ডিএনএ সাবস্ট্রেট দ্বারা এনজাইম-অ্যাডেনিলেটের ফসফরাসের উপর একটি নিউক্লিওফিলিক আক্রমণ ঘটে, লাইসিন মুক্ত করে এবং ডিএনএ-অ্যাডিনাইলেট গঠন করে। চূড়ান্ত ধাপে, ডিএনএ-অ্যাডিনাইলেট অন্য একটি ডিএনএ স্ট্র্যান্ডের 3’- OH দ্বারা আক্রান্ত হয়, এএমপি মুক্ত করে এবং পলিনিউক্লিওটাইডে যোগ দেয়।
T4 DNA Ligase কি?
T4 Ligase ছিল মেসেলসন, ওয়েইগেল এবং কেলেনবার্গার দ্বারা বিচ্ছিন্ন এবং শনাক্ত করা প্রথম লিগেজ এবং এটিই প্রথম বাণিজ্যিক লিগেজ তৈরি করা হয়েছিল।T4 DNA ligase হল একটি ATP নির্ভর এনজাইম যা ফসফোডিস্টার বন্ড গঠনকে অনুঘটক করে। এটি 487টি অ্যামিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশ সহ একটি একক পলিপেপটাইড চেইন এবং প্রায় 77 kDa এর আণবিক ওজন রয়েছে। এর কার্যকলাপের জন্য সর্বোত্তম pH 7.5 - 8.
চিত্র 01: T4 DNA Ligase
T4 DNA Ligase, যেমন এর নাম থেকে বোঝা যায়, ব্যাকটেরিওফেজ T4-এ উপস্থিত এবং E. coli-এর সংক্রমণে ফেজ যখন এনজাইম তৈরি করে তখন বিচ্ছিন্ন হয়। এনজাইম লাইগেট ডাবল স্ট্র্যান্ডড ডিএনএ ডুপ্লেক্সগুলিকে ভোঁতা প্রান্ত দিয়ে এবং আবদ্ধ করা টুকরোগুলি একে অপরের কাছাকাছি হওয়া উচিত।
T7 DNA Ligase কি?
T7 ligase হল 41 kDa প্রোটিন যা T7 ব্যাকটেরিওফেজ দ্বারা উত্পাদিত হয় এবং ই. কোলাই কোষকে সংক্রমিত করে বিচ্ছিন্ন হয়। T7 ligase এর প্রধান কাজ হল DNA ডুপ্লেক্সগুলিকে ফসফোডিস্টার লিঙ্কেজের মাধ্যমে লিগেট করা এবং ক্লোনিং পরীক্ষার সময় DNA-এর কাছাকাছি অংশে যোগ দেওয়া।T7 DNA ligase-এর জন্য সর্বোত্তম pH 7.0 - 7.2 এর মধ্যে থাকে। T7 ligase হল ATP নির্ভর। T7 ডিএনএ লিগাসেসগুলিও ডিএনএ এবং আরএনএ হাইব্রিড অ্যানিলিং করতে সক্ষম, যা ট্রান্সক্রিপশনের সময় অস্বাভাবিক গঠনের জন্ম দেয়; যাইহোক, এই ঘটনাটি এখনও ইন ভিট্রো স্টাডিজের দ্বারা গবেষণাধীন।
T4 এবং T7 ডিএনএ লিগাসের মধ্যে মিল কী?
- T4 এবং T7 ডিএনএ লিগ্যাস ডিএনএ খণ্ডের 3’ OH প্রান্ত এবং 5’ ফসফেট প্রান্তের মধ্যে ফসফোডিস্টার বন্ড গঠনের মাধ্যমে ডিএনএ ডুপ্লেক্সগুলিকে অ্যানিল করার মাধ্যমে একটি বন্ধন বিক্রিয়ায় অংশগ্রহণ করে৷
- উভয় এনজাইম লিগেট ব্লান্ট শেষ ডিএনএ ডুপ্লেক্স যা একে অপরের কাছাকাছি থাকে।
- উভয় এনজাইম এটিপি নির্ভর।
- এই এনজাইমগুলি নির্দিষ্ট ব্যাকটেরিওফেজের সাথে ই. কোলাই কোষকে সংক্রমিত করে বিচ্ছিন্ন করা হয়।
- উভয় এনজাইমের প্রয়োগের মধ্যে রয়েছে:
- আণবিক ক্লোনিং – আগ্রহের জিনকে ভেক্টরের সাথে সংযুক্ত করতে
- DNA মেরামত - ডবল স্ট্র্যান্ডেড কুলুঙ্গি মেরামত করতে
- ইন ভিট্রো ডিএনএ প্রতিলিপি
- লিগেস চেইন প্রতিক্রিয়া
T4 এবং T7 ডিএনএ লিগাসের মধ্যে পার্থক্য কী?
T4 বনাম T7 DNA Ligase |
|
| T4 ডিএনএ লিগেস ধরনের ডিএনএ লিগেস ব্যাকটেরিওফেজ T4 থেকে বিচ্ছিন্ন এবং ফসফোডিস্টার বন্ড গঠনের মাধ্যমে সংলগ্ন ডিএনএ খণ্ডকে আটকানোর সাথে জড়িত। | T7 ডিএনএ লিগেসের প্রকারের ডিএনএ লিগেস ব্যাকটেরিওফেজ T7 থেকে বিচ্ছিন্ন এবং ফসফোডিস্টার বন্ড গঠনের মাধ্যমে সংলগ্ন ডিএনএ টুকরো বন্ধনে জড়িত। |
| প্রোটিনের আকার | |
| T4 DNA ligase এর আকার 77 kDa – T7 DNA ligase এর তুলনায় বড়। | T7 DNA ligase এর আকার হল 41 kDa। |
| সর্বোত্তম pH | |
| pH পরিসর যা T4 DNA ligase কাজ করে 7.5 – 8.0. | pH পরিসর যা T7 DNA ligase কাজ করে 7.0 – 7.2. |
সারাংশ – T4 বনাম T7 DNA Ligase
DNA ligases হল একটি গুরুত্বপূর্ণ শ্রেণির এনজাইম যা আণবিক ক্লোনিংয়ের সাথে জড়িত রিকম্বিন্যান্ট ডিএনএ অণু তৈরি করতে আগ্রহের জিন রয়েছে। লিগেশন প্রতিক্রিয়া হল একটি শক্তি ব্যবহারকারী প্রতিক্রিয়া এবং উপলব্ধ লিগ্যাসগুলিকে সংশোধন করার মাধ্যমে নির্ভুলতা উন্নত করার জন্য অভিনব গবেষণা অধ্যয়ন চলছে। T4 এবং T7 DNA ligases হল দুই ধরনের গুরুত্বপূর্ণ DNA ligase এনজাইম যা আণবিক জৈবিক কৌশলে ব্যবহৃত হয়। T7 DNA ligase এছাড়াও গবেষণার ফলাফল যা T4 সংক্রামিত E. coli থেকে বিচ্ছিন্ন প্রাথমিক ligase এর উপর ভিত্তি করে। T7 এর ছোট আকারের কারণে এর কার্য সম্পাদনে আরও দক্ষতা এবং নির্ভুলতা চিত্রিত করা হয়েছে। এটি T4 এবং T7 ligase এর মধ্যে পার্থক্য।
T4 বনাম T7 DNA Ligase এর PDF সংস্করণ ডাউনলোড করুন
আপনি এই নিবন্ধটির PDF সংস্করণ ডাউনলোড করতে পারেন এবং উদ্ধৃতি নোট অনুযায়ী অফলাইন উদ্দেশ্যে এটি ব্যবহার করতে পারেন। দয়া করে এখানে পিডিএফ সংস্করণ ডাউনলোড করুন T4 এবং T7 Ligase এর মধ্যে পার্থক্য।
