MLVA এবং MLST-এর মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে MLVA অণুজীব প্রজাতির বৈশিষ্ট্য চিহ্নিত করতে টেন্ডেমলি বারবার ডিএনএ সিকোয়েন্সের পলিমরফিজম ব্যবহার করে, যেখানে MLST একাধিক হাউসকিপিং জিনের অভ্যন্তরীণ খণ্ডের ডিএনএ সিকোয়েন্সের পলিমরফিজম ব্যবহার করে মাইক্রোবিয়াল প্রজাতিকে চিহ্নিত করতে।
মাইক্রোবিয়াল টাইপিং সাধারণত সংক্রমণের উৎস এবং পথ নির্ণয় করতে ব্যবহৃত হয়। এটি প্রাদুর্ভাব নিশ্চিত করে বা নিয়ম করে। মাইক্রোবিয়াল টাইপিং এছাড়াও স্বাস্থ্যসেবা-সম্পর্কিত প্যাথোজেনের ক্রস-ট্রান্সমিশন সনাক্ত করে এবং ভাইরাসজনিত স্ট্রেনের স্বীকৃতি দেয়। তাছাড়া, মাইক্রোবিয়াল টাইপিং প্যাথোজেনিক মাইক্রোবিয়াল প্রজাতির নিয়ন্ত্রণ ব্যবস্থার কার্যকারিতা মূল্যায়ন করে।MLVA এবং MLST হল দুটি আণবিক জৈবিক কৌশল যা মাইক্রোবিয়াল টাইপিংয়ে ব্যবহৃত হয়।
MLVA কি?
মাল্টিপল লোকি ভিএনটিআর বিশ্লেষণ (এমএলভিএ) হল একটি আণবিক জৈবিক পদ্ধতি যা অণুজীব প্রজাতিকে চিহ্নিত করার জন্য বারবার পুনরাবৃত্ত ডিএনএ সিকোয়েন্সের পলিমারফিজম ব্যবহার করে। এটি একটি পদ্ধতি যা নির্দিষ্ট জীবাণু প্রজাতির জেনেটিক বিশ্লেষণের জন্য ব্যবহৃত হয়।
MLVA-এর প্রথম ধাপে, প্রতিটি লক্ষ্যবস্তু VNTR লোকাসকে PCR দ্বারা ফ্ল্যাঙ্কিং অঞ্চল-নির্দিষ্ট প্রাইমারের সাহায্যে প্রশস্ত করা হয়। তারপরে প্রাপ্ত টুকরোগুলি কৈশিক সিকোয়েন্সারে ইলেক্ট্রোফোরেসিস দ্বারা পৃথক করা হয়। প্রতিটি লোকাসের জিনোটাইপিং এবং প্রতিটি নমুনা থেকে সংকলিত ফলাফলগুলি একটি অণুজীবের বৈশিষ্ট্য চিহ্নিত করতে দেয় যার প্রজাতি পরিচিত। এটি অ্যালিল টাইপিং এবং MLVA ডেটাবেসের সাথে তুলনার মাধ্যমে উপ-প্রজাতি সনাক্ত করার অনুমতি দেয়।
চিত্র 01: MLVA
এই MLVA পদ্ধতিটি MLST পদ্ধতির চেয়ে বেশি নির্বাচনী। অধিকন্তু, MLVA পদ্ধতিতে DNA সিকোয়েন্সিং ধাপের প্রয়োজন হয় না। সুতরাং, এটি ঘনিষ্ঠ উপ-প্রজাতি বা ক্লোনাল প্রজাতির পার্থক্য করা সম্ভব করে তোলে।
MLST কি?
মাল্টিলোকাস সিকোয়েন্স টাইপিং (এমএলএসটি) এমন একটি কৌশল যা মাইক্রোবিয়াল প্রজাতির বৈশিষ্ট্য চিহ্নিত করতে একাধিক হাউসকিপিং জিনের অভ্যন্তরীণ খণ্ডের ডিএনএ সিকোয়েন্সের পলিমরফিজম ব্যবহার করে। MLST হল একাধিক লোকি টাইপ করার জন্য জেনেটিক বিশ্লেষণের একটি কৌশল।
চিত্র 02: MLST
এটি এক ধরনের সিকোয়েন্সিং টাইপিং যা মাইক্রোবিয়াল প্রজাতির বিভিন্ন স্ট্রেনকে আলাদা করার জন্য একটি রেফারেন্স কৌশল হিসাবে ব্যবহৃত হয়। এই পদ্ধতিটি হাউসকিপিং জিন সিকোয়েন্সিং এর উপর ভিত্তি করে।গৃহস্থালির জিনগুলি সাধারণত ব্যাকটেরিয়ামের মতো মাইক্রোবিয়াল এজেন্টগুলির প্রয়োজনীয় প্রোটিনগুলিকে এনকোড করে। হাউসকিপিং জিনের এই ক্রমগুলি সময়ের সাথে সাথে একটি স্থিতিশীল পলিমারফিজম উপস্থাপন করার বিশেষত্ব রয়েছে। অতএব, হাউসকিপিং জিনের ক্রমগুলির পার্থক্যগুলি একে অপরের থেকে স্ট্রেনগুলিকে আলাদা করার জন্য যথেষ্ট। তদ্ব্যতীত, প্রথম এমএলএসটি স্কিমটি তৈরি করা হয়েছিল নিসেরিয়া মেনিনজিটিডিস, যা মেনিনোকোকাল মেনিনজাইটিস এবং সেপ্টিসেমিয়ার কার্যকারক। এর প্রবর্তনের পর থেকে, MLST শুধুমাত্র মানুষের রোগজীবাণুর জন্যই নয়, উদ্ভিদের রোগজীবাণুগুলির জন্যও ব্যবহৃত হয়েছে৷
MLVA এবং MLST-এর মধ্যে মিল কী?
- MLVA এবং MLST হল দুটি আণবিক জৈবিক কৌশল যা মাইক্রোবিয়াল টাইপিংয়ে ব্যবহৃত হয়৷
- অণুজীব ফাইলোজেনেটিক বিশ্লেষণের জন্য উভয় কৌশলই ব্যবহার করা যেতে পারে।
- উভয় কৌশলই জেনেটিক পলিমারফিজমের উপর ভিত্তি করে।
- এগুলি মাইক্রোবিয়াল প্যাথোজেন সৃষ্টিকারী মানুষের রোগ সনাক্তকরণের জন্য ব্যবহার করা যেতে পারে।
- উভয় কৌশলই দক্ষ আণবিক জীববিজ্ঞানীদের দ্বারা সঞ্চালিত হওয়া উচিত।
MLVA এবং MLST-এর মধ্যে পার্থক্য কী?
MLVA হল একটি কৌশল যা অণুজীব প্রজাতির বৈশিষ্ট্যগুলিকে চিহ্নিত করার জন্য বারবার পুনরাবৃত্ত ডিএনএ সিকোয়েন্সের পলিমারফিজম ব্যবহার করে। এদিকে, এমএলএসটি এমন একটি কৌশল যা মাইক্রোবিয়াল প্রজাতির বৈশিষ্ট্যের জন্য একাধিক হাউসকিপিং জিনের অভ্যন্তরীণ টুকরোগুলির ডিএনএ সিকোয়েন্সের পলিমারফিজম ব্যবহার করে। সুতরাং, এটি MLVA এবং MLST এর মধ্যে মূল পার্থক্য। উপরন্তু, MLVA পদ্ধতি MLST পদ্ধতির চেয়ে বেশি নির্বাচনী।
নীচের ইনফোগ্রাফিক MLVA এবং MLST-এর মধ্যে পার্থক্যগুলিকে সারণী আকারে পাশাপাশি তুলনার জন্য উপস্থাপন করে৷
সারাংশ – MLVA বনাম MLST
MLVA এবং MLST হল দুটি আণবিক জৈবিক কৌশল যা মাইক্রোবিয়াল টাইপিংয়ে ব্যবহৃত হয়। MLVA অণুজীব প্রজাতির বৈশিষ্ট্য চিহ্নিত করতে টেন্ডেমলি বারবার ডিএনএ সিকোয়েন্সের পলিমরফিজম ব্যবহার করে, যখন MLST মাইক্রোবিয়াল প্রজাতির বৈশিষ্ট্য চিহ্নিত করতে একাধিক হাউসকিপিং জিনের অভ্যন্তরীণ টুকরোগুলির ডিএনএ সিকোয়েন্সের পলিমরফিজম ব্যবহার করে।সুতরাং, এটি হল MLVA এবং MLST-এর মধ্যে মূল পার্থক্য।
