EcoRI এবং HindIII সীমাবদ্ধতা এনজাইমের মধ্যে মূল পার্থক্য হল EcoRI হল একটি টাইপ II সীমাবদ্ধতা এনজাইম যা E. coli থেকে বিচ্ছিন্ন, অন্যদিকে HindIII হল একটি টাইপ II সীমাবদ্ধতা এনজাইম যা হেমোফিলাস ইনফ্লুয়েঞ্জা থেকে বিচ্ছিন্ন।
নিষেধ এনজাইম বা সীমাবদ্ধতা এন্ডোনিউক্লিজ হল একটি এনজাইম যা ডিএনএ অণুর মধ্যে নির্দিষ্ট স্বীকৃতি স্থানগুলিতে (নিষেধাজ্ঞার স্থান) ডিএনএকে টুকরো টুকরো করে দেয়। এই সীমাবদ্ধ এনজাইমগুলি ব্যাকটেরিয়া এবং আর্কিয়াতে পাওয়া যায়। তারা আক্রমণকারী ভাইরাসের বিরুদ্ধে একটি প্রতিরক্ষা ব্যবস্থা প্রদান করে। সীমাবদ্ধতা এনজাইমগুলি সাধারণত পাঁচটি ভিন্ন প্রকারে শ্রেণীবদ্ধ করা হয়: টাইপ I, টাইপ II, টাইপ III, IV এবং টাইপ V।EcoRI এবং HindIII হল দুটি সীমাবদ্ধ এনজাইম যা টাইপ II সীমাবদ্ধতা এনজাইমগুলির গ্রুপের অন্তর্গত।
ইকোআরআই রেস্ট্রিকশন এনজাইম কি?
EcoRI হল একটি প্রকার II সীমাবদ্ধতা এনজাইম যা E.coli প্রজাতি থেকে বিচ্ছিন্ন। এটি একটি নিষেধাজ্ঞা এনজাইম যা নির্দিষ্ট স্থানে ডিএনএ ডাবল হেলিসকে টুকরো টুকরো করে দেয়। EcoRI এছাড়াও সীমাবদ্ধতা-পরিবর্তন ব্যবস্থার একটি অংশ। EcoRI হল প্রথম এনজাইম যা মূলত E. coli প্রজাতির RY13 স্ট্রেন থেকে বিচ্ছিন্ন ছিল। এটি আণবিক জীববিজ্ঞানে একটি সীমাবদ্ধতা এনজাইম হিসাবে ব্যবহৃত হয়। EcoRI AATT এর 5’ প্রান্তের ওভারহ্যাং সহ 4টি নিউক্লিওটাইড স্টিকি প্রান্ত তৈরি করে। EcoRI নির্দিষ্ট স্বীকৃতি ক্রম G↓AATTC এ DNA কাটে। এটিতে CTTAA↓G এর প্যালিনড্রোমিক পরিপূরক ক্রম রয়েছে। তদুপরি, এই সীমাবদ্ধতা এনজাইমটি II P (প্যালিন্ড্রোমিক নির্দিষ্টতা) উপশ্রেণীর অন্তর্গত। এর প্রাথমিক কাঠামোতে, EcoRI এর সক্রিয় সাইটের মধ্যে PD. D/EXK মোটিফ রয়েছে, অন্যান্য অনেক সীমাবদ্ধ এনজাইমের মতো।
চিত্র 01: EcoRI
EcoRI সীমাবদ্ধতা এনজাইম একটি 31 kDa এর একটি হোমোডিমার। এটিতে α/β আর্কিটেকচারের একটি গ্লোবুলার ডোমেন রয়েছে। প্রতিটি সাবইউনিটে একটি লুপ থাকে যা গ্লোবুলার ডোমেন থেকে বেরিয়ে আসে এবং আবদ্ধ হলে DNA এর চারপাশে মোড়ানো হয়। এই এনজাইমটি সাধারণত যে ক্রমটি কাটে তার সাথে এই এনজাইমটি কোক্রিস্টালাইজ করা যেতে পারে। অধিকন্তু, ইকোআরআই সীমাবদ্ধতা এনজাইমটি ক্লোনিং, ডিএনএ স্ক্রীনিং এবং ডিএনএ ইন-ভিট্রো অবস্থার ডিলিট বিভাগ সহ বিভিন্ন ধরনের আণবিক জেনেটিক কৌশলে ব্যবহৃত হয়।
HindIII সীমাবদ্ধতা এনজাইম কি?
HindIII হল একটি প্রকার II সীমাবদ্ধতা এনজাইম যা হিমোফিলাস ইনফ্লুয়েঞ্জা প্রজাতি থেকে বিচ্ছিন্ন। এটি হাইড্রোলাইসিসের মাধ্যমে কোফ্যাক্টর Mg2+ এর উপস্থিতিতে ডিএনএ প্যালিনড্রোমিক সিকোয়েন্স AACCTT কে ক্লিভ করে।AA’S (5’A↓ACCTT3’ এবং 3’TTCGA↓A5’) এর মধ্যে এই বিশেষ ক্রমটির বিভাজনের ফলে স্টিকি এন্ড নামক ডিএনএ অণুর উপর 5’ ওভারহ্যাং হয়। এই এনজাইমটি ব্যাকটেরিয়ার মতো প্রোক্যারিওটিক জীবের মধ্যে পাওয়া যায়। ব্যাকটেরিয়া এই এনজাইমকে ব্যাকটেরিওফেজের মতো ভাইরাসের বিরুদ্ধে প্রতিরক্ষা ব্যবস্থা হিসেবে ব্যবহার করে।
চিত্র 02: হিন্দIII
গঠনগতভাবে, HindIII একটি হোমোডিমার। এটিতে অন্যান্য ধরনের II সীমাবদ্ধতা এনজাইমের মতো চারটি β শীট এবং একটি একক α হেলিস সমন্বিত একটি সাধারণ কাঠামোগত কোর রয়েছে। এই এনজাইমের আণবিক ভর হল 34.9 kDa। অধিকন্তু, হিন্দআইআই আধুনিক আণবিক জৈবিক বিজ্ঞান পরীক্ষায় যেমন ডিএনএ সিকোয়েন্সিং এবং ম্যাপিংয়ের ক্ষেত্রে খুবই উপযোগী৷
EcoRI এবং HindIII সীমাবদ্ধতা এনজাইমের মধ্যে মিল কী?
- EcoRI এবং HindIII হল দুটি সীমাবদ্ধতা এনজাইম যা টাইপ II সীমাবদ্ধতা এনজাইম গ্রুপের অন্তর্গত।
- EcoRI এবং HindIII 1970 এর দশকের গোড়ার দিকে পাওয়া গিয়েছিল।
- EcoRI এবং HindIII উভয়েই PD.. D/EXK অ্যামিনো অ্যাসিড সিকোয়েন্স মোটিফ রয়েছে৷
- উভয় সীমাবদ্ধ এনজাইম খুব নির্দিষ্ট ডিএনএ ক্লিভিং সম্পাদন করে।
- এই নিষেধাজ্ঞার এনজাইমগুলির তাদের নির্দিষ্ট কার্যকলাপের জন্য একটি কোফ্যাক্টর হিসাবে Mg2+ প্রয়োজন।
- এরা ডিএনএ কাটার পরে আঠালো প্রান্ত তৈরি করে।
- এগুলি আধুনিক আণবিক জৈবিক গবেষণায় খুবই দরকারী উপাদান৷
EcoRI এবং HindIII সীমাবদ্ধতা এনজাইমের মধ্যে পার্থক্য কী?
EcoRI হল একটি প্রকার II সীমাবদ্ধতা এনজাইম যা E.coli প্রজাতি থেকে বিচ্ছিন্ন, অন্যদিকে HindIII হল একটি প্রকার II সীমাবদ্ধতা এনজাইম যা হেমোফিলাস ইনফ্লুয়েঞ্জা প্রজাতি থেকে বিচ্ছিন্ন। সুতরাং, এটি EcoRI এবং HindIII এর মধ্যে মূল পার্থক্য।অধিকন্তু, EcoRI নির্দিষ্ট স্বীকৃতি ক্রম G↓AATTC-তে DNA কাটে, যখন HindIII নির্দিষ্ট স্বীকৃতি ক্রম A↓ACCTT-তে DNA কাটে।
নীচের ইনফোগ্রাফিকটি পাশাপাশি তুলনা করার জন্য ইকোআরআই এবং হিন্দআইআই-এর মধ্যে পার্থক্যগুলিকে সারণী আকারে উপস্থাপন করে৷
সারাংশ – EcoRI বনাম HindIII সীমাবদ্ধতা এনজাইম
EcoRI এবং HindIII হল দুটি সীমাবদ্ধ এনজাইম যা টাইপ II p সাবক্লাসের অন্তর্গত। তারা ডিএনএ-র খুব নির্দিষ্ট ক্লিভিং সঞ্চালন করে। EcoRI হল একটি টাইপ II সীমাবদ্ধতা এনজাইম যা E.coli প্রজাতি থেকে বিচ্ছিন্ন, অন্যদিকে HindIII হল একটি টাইপ II সীমাবদ্ধতা এনজাইম যা হেমোফিলাস ইনফ্লুয়েঞ্জা প্রজাতি থেকে বিচ্ছিন্ন। সুতরাং, এটি EcoRI এবং HindIII এর মধ্যে পার্থক্যকে সংক্ষিপ্ত করে।
