CRRNA tracrRNA এবং gRNA এর মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে crRNA হল CRISPR-এর RNA-এর দুই ধরনের একটি, যা লক্ষ্য DNA ক্রম-এর পরিপূরক, অন্যদিকে tracrRNA হল CRISPR-এর দ্বিতীয় ধরনের RNA, যা কাজ করে ক্যাস নিউক্লিজ এবং জিআরএনএর জন্য একটি বাঁধাই স্ক্যাফোল্ড হল CRISPR-Cas9 সিস্টেমের ব্যাকটেরিয়া এবং আর্কিয়ার দুটি প্রধান উপাদানের একটি যা লক্ষ্য ডিএনএকে চিনতে পারে এবং ক্যাস প্রোটিনকে লক্ষ্য ডিএনএ-তে ডাবল-স্ট্র্যান্ড ব্রেক করতে গাইড করে।
CRISPR মানে ক্লাস্টারড রেগুলার ইন্টারস্পার্সড ছোট প্যালিনড্রোমিক পুনরাবৃত্তি। এটি ব্যাকটেরিয়া এবং আর্কিয়াতে প্রতিরোধ ব্যবস্থাগুলির মধ্যে একটি। ব্যাকটেরিয়া এবং আর্কিয়া ভাইরাল প্যাথোজেন থেকে নিজেদের রক্ষা করার জন্য এই সিস্টেম ব্যবহার করে।এটি সবচেয়ে আশ্চর্যজনক প্রক্রিয়াগুলির মধ্যে একটি যা একটি সফল জেনেটিক পরিবর্তন জড়িত। এই প্রক্রিয়াটি (CRISPR-Cas9) বায়োটেকনোলজিতে একটি অভিনব জিন-সম্পাদনা সরঞ্জাম হিসাবে ব্যবহৃত হয়। এটি বায়োটেকনোলজিতে নতুন অগ্রগতি এনেছে, বিশেষ করে জেনেটিক ইঞ্জিনিয়ারিংয়ের ক্ষেত্রে৷
CRISPR-Cas9 সিস্টেমের দুটি প্রধান উপাদান রয়েছে। তারা গাইড RNA (gRNA) এবং CRISPR-সংশ্লিষ্ট (Cas) নিউক্লিয়াস। গাইড আরএনএ হল একটি নির্দিষ্ট আরএনএ সিকোয়েন্স যা ক্যাস প্রোটিনকে লক্ষ্য ডিএনএ ক্লিভ করার জন্য গাইড করে। গাইড RNA দুই ধরনের RNA নিয়ে গঠিত। তারা হল crispr RNA (crRNA) এবং tracrRNA। সিআরআইএসপিআর-সম্পর্কিত (ক্যাস) নিউক্লিয়াসগুলি অ-নির্দিষ্ট এন্ডোনিউক্লিজ যা লক্ষ্য ডিএনএ-তে ডাবল-স্ট্র্যান্ড ব্রেক তৈরি করে। টার্গেট ডিএনএ-তে ডাবল-স্ট্র্যান্ড ব্রেক করে, ব্যাকটেরিয়া এবং আর্কিয়া ভাইরাল ডিএনএ নিষ্ক্রিয় করার জন্য তাদের অন্তঃসত্ত্বা মেরামত প্রক্রিয়াকে নির্দেশ করে।
CRRNA কি?
crRNA বা Crispr RNA হল দুই ধরনের গাইড RNA এর মধ্যে একটি। কাঠামোগতভাবে, এটি একটি 17-20 নিউক্লিওটাইড ক্রম। CRRNA এর সবচেয়ে মূল্যবান বৈশিষ্ট্য হল এটি লক্ষ্য DNA এর পরিপূরক।অতএব, ভাইরাল ডিএনএ সিকোয়েন্সের সাথে crRNA মিলে যায়। CRISPR-Cas 9 সিস্টেমের নির্দিষ্টতা CRRNA এর উপর নির্ভর করে। ব্যাকটেরিয়াতে, crRNA tracrRNA অনুক্রমের সাথে মিশে থাকে, যা CRISPR আরএনএর দ্বিতীয় প্রকার। একটি ভাইরাসে ব্যাকটেরিয়া পুনরায় এক্সপোজার দ্বারা crRNA উত্পাদন শুরু হয়। উন্মুক্ত হলে, CRRNA-এর জন্য কোডিং করা জিনের ট্রান্সক্রিপশন ঘটে। তারপর, ভাইরাসের বিরুদ্ধে প্রতিরক্ষা ব্যবস্থা শুরু হয়।
চিত্র 01: CRISPR-Cas9 সিস্টেম
tracrRNA কি?
ট্রান্স-অ্যাক্টিভেটিং crRNA বা tracrRNA হল গাইডআরএনএ বা CRISPR আরএনএর দ্বিতীয় অংশ। এটি ট্রেসার আরএনএ হিসাবে উচ্চারিত হয়। tracrRNA এন্ডোনিউক্লিজ ক্যাস 9 প্রোটিনের জন্য বাঁধাই স্ক্যাফোল্ড হিসাবে কাজ করে। অন্য কথায়, TracrRNA Cas9 কে লক্ষ্য DNA এর দিকে পরিচালিত করতে হ্যান্ডেল হিসাবে কাজ করে।কাঠামোগতভাবে, tracrRNA এর 42 টি নিউক্লিওটাইড রয়েছে। এটি CRRNA-এর সাথে একত্রে বিদ্যমান।
gRNA কি?
গাইড RNA বা gRNA হল CRISPR-Cas9 ইমিউন সিস্টেমের দুটি প্রধান উপাদানের একটি। এটি একটি নির্দিষ্ট RNA ক্রম যা দুটি উপাদানের সমন্বয়ে গঠিত: crRNA এবং tracrRNA। জিআরএনএ টার্গেট ডিএনএ চিনতে পারে এবং ক্যাস প্রোটিনকে টার্গেট ডিএনএ-তে ডাবল-স্ট্র্যান্ড ব্রেক করার নির্দেশ দেয়। এটি করার জন্য, crRNA টার্গেট ডিএনএর একটি পরিপূরক ক্রম নিয়ে গঠিত যখন tracrRNA ক্যাস প্রোটিনকে একটি হ্যান্ডেল হিসাবে কাজ করে।
চিত্র 02: gRNA
সঠিক gRNA ডিজাইন করা CRISPR-Cas9 জিন-এডিটিং টুলের একটি গুরুত্বপূর্ণ পদক্ষেপ। অতএব, CRISPR সিস্টেমের সাফল্য এবং সম্পাদনা দক্ষতা gRNA এর সঠিক ক্রম উপর নির্ভর করে। জিআরএনএ একটি স্থানান্তরিত প্লাজমিড থেকে কোষে প্রকাশ করা যেতে পারে।যখন ক্লোন করা প্লাজমিডগুলি কোষে প্রবর্তিত হয়, তখন হোস্ট কোষগুলি জিআরএনএ তৈরি করে। সর্বাধিক উৎপন্ন জিআরএনএ 100টি বেস জোড়া নিয়ে গঠিত।
CRRNA tracrRNA এবং gRNA-এর মধ্যে মিল কী?
- crRNA, tracrRNA এবং gRNA হল ব্যাকটেরিয়া এবং আর্কিয়াতে পাওয়া RNA ক্রম।
- এরা সবাই CRISPR সিস্টেমের অন্তর্গত।
- gRNA তৈরি হয় crRNA এবং tracrRNA থেকে।
- তারা ব্যাকটেরিওফেজ ডিএনএ শনাক্ত করতে এবং লক্ষ্য ডিএনএর দিকে এন্ডোনিউক্লিজকে গাইড করার সাথে জড়িত৷
- অতএব, তিনটি ধরণের আরএনএ বিদেশী জিনগত পদার্থ আক্রমণ করার ক্ষেত্রে ডাবল-স্ট্র্যান্ড ব্রেক করার জন্য Cas9 নিউক্লিয়াসকে নির্দেশ করার সাথে জড়িত।
- CRISPR পরীক্ষার সাফল্য তিন ধরনের RNA এর উপর নির্ভর করে।
CRRNA tracrRNA এবং gRNA এর মধ্যে পার্থক্য কী?
crRNA হল CRISPR-এর gRNA-এর একটি অংশ যা লক্ষ্য DNA-এর পরিপূরক, যখন tracrRNA হল gRNA-এর দ্বিতীয় অংশ, যা Cas নিউক্লিয়াসের জন্য বাঁধাই স্ক্যাফোল্ড হিসেবে কাজ করে।gRNA হল crRNA এবং tracrRNA এর সংমিশ্রণ, এবং এটি CRISPR-Cas9 সিস্টেমের দুটি উপাদানের মধ্যে একটি, যা লক্ষ্য ডিএনএকে স্বীকৃতি দেয় এবং লক্ষ্য ডিএনএতে ডাবল-স্ট্র্যান্ড ব্রেক করতে নিউক্লিয়াসকে গাইড করে। সুতরাং, এটি crRNA tracrRNA এবং gRNA এর মধ্যে মূল পার্থক্য।
নিম্নলিখিত সারণী crRNA tracrRNA এবং gRNA এর মধ্যে পার্থক্য সংক্ষিপ্ত করে।
সারাংশ – crRNA বনাম tracrRNA বনাম gRNA
CRISPR-Cas9 সিস্টেম হল ব্যাকটেরিয়া এবং আর্কিয়ার একটি প্রতিরোধ ব্যবস্থা। এই সিস্টেমটি বায়োটেকনোলজিতে জিন-এডিটিং টুল হিসেবে ব্যবহৃত হয়। CRISPR দুই ধরনের RNA নিয়ে গঠিত, যথা CRISPR RNA (crRNA) এবং transactivating CRISPR RNA (tracrRNA)। তারা সম্মিলিতভাবে গাইডআরএনএ বা জিআরএনএ নামে পরিচিত। এই আরএনএ আক্রমণকারী প্যাথোজেনগুলির লক্ষ্য ক্রমগুলিকে স্বীকৃতি দেয় এবং লক্ষ্য ডিএনএতে ডাবল-স্ট্র্যান্ড ব্রেক করতে এন্ডোনিউক্লিজগুলিকে গাইড করে। একবার বিদেশী জেনেটিক উপাদানে ডাবল-স্ট্র্যান্ড ব্রেক তৈরি হয়ে গেলে, অন্তঃসত্ত্বা মেরামত প্রক্রিয়া (ননহোমোলোগাস এন্ড জয়েনিং; এনএইচইজে) মিউটেশন প্রবর্তনের মাধ্যমে বিদেশী ডিএনএকে নিষ্ক্রিয় করে।সুতরাং, এটি CRRNA tracrRNA এবং gRNA এর মধ্যে পার্থক্যকে সংক্ষিপ্ত করে।
