ITS1 এবং ITS2 এর মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে ITS1 হল একটি স্পেসার ডিএনএ যা ইউক্যারিওটে 18S এবং 5.8S rRNA জিনের মধ্যে অবস্থিত, অন্যদিকে ITS2 হল একটি স্পেসার ডিএনএ যা ইউক্যারিওটে 5.8S এবং 28S rRNA জিনের মধ্যে অবস্থিত৷
ইন্টারনাল ট্রান্সক্রিপ্টড স্পেসার (ITS) হল স্পেসার ডিএনএ সাধারণত ছোট সাবুনিট রাইবোসোমাল আরএনএ এবং বৃহৎ সাবইউনিট রাইবোসোমাল আরএনএ জিনের মধ্যে ক্রোমোজোমে বা পলিসিস্ট্রোনিক আরআরএনএ প্রিকারসার ট্রান্সক্রিপ্ট অণুতে সংশ্লিষ্ট প্রতিলিপিকৃত অঞ্চলে অবস্থিত। ব্যাকটেরিয়া এবং আর্কিয়াতে, 16S এবং 23S rRNA জিনের মধ্যে শুধুমাত্র একটি আইটিএস আছে। কিন্তু ইউক্যারিওটে, দুটি আইটিএস স্পেসার ডিএনএ রয়েছে: আইটিএস 1 (18 এস এবং 5 এর মধ্যে।8S rRNA জিন) এবং ITS2 (5.8S এবং 28S rRNA এর মধ্যে)। অতএব, ITS1 এবং ITS2 হল দুটি স্পেসার ডিএনএ যা ইউক্যারিওটে rRNA জিনের মধ্যে পাওয়া যায়।
ITS1 কি?
ITS1 হল একটি স্পেসার ডিএনএ যা ইউক্যারিওটে 18S এবং 5.8S rRNA জিনের মধ্যে অবস্থিত। আইটিএস বলতে rRNA জিনের মধ্যে অবস্থিত নন-ফাংশনাল স্পেসার ডিএনএর একটি অংশকে বোঝায়। ITS1-এর ITS2-এর তুলনায় দৈর্ঘ্যের একটি বড় বৈচিত্র্য রয়েছে। ITS1 এর দৈর্ঘ্যের বৈচিত্র প্রায় (200-300bp)। ITS মার্কার যেমন ITS1 বিভিন্ন ট্যাক্সার মধ্যে ফাইলোজেনেটিক সম্পর্ক ব্যাখ্যা করার ক্ষেত্রে তাদের দক্ষতা প্রমাণ করেছে। অধিকন্তু, ITS1 স্পেসার ডিএনএ ITS2 স্পেসার ডিএনএর চেয়ে কম সংরক্ষিত। ITS1 কাঠামো শুধুমাত্র অনেক ছোট শ্রেণীবিন্যাস ইউনিটে সংরক্ষিত হয়। প্রতিটি ইউক্যারিওটিক রাইবোসোমাল ক্লাস্টারে এক্সটার্নাল ট্রান্সক্রাইবড স্পেসার (5’ এবং 3’ ETS) নামক অঞ্চলও থাকে।
চিত্র 01: ITS1 অঞ্চল
ITS1 স্পেসার ডিএনএ 5’বহিরাগত প্রতিলিপিকৃত স্পেসারের (5’ ETS) খুব কাছাকাছি। তদ্ব্যতীত, যদি কেউ ফাইলোজেনেটিক সম্পর্ক অধ্যয়নের জন্য ITS1 অঞ্চলকে প্রসারিত করতে চায়, তবে তাদের এই উদ্দেশ্যে একটি নির্দিষ্ট প্রাইমার জোড়া (রিভার্স এবং ফরোয়ার্ড প্রাইমার) ব্যবহার করতে হবে। ITS1 অঞ্চলকে প্রশস্ত করার জন্য, দুটি প্রাইমার সেট সাধারণত পরীক্ষাগারগুলির পিসিআর প্রোটোকলগুলিতে ব্যবহৃত হয়। সেগুলো হল ITS1 ফরোয়ার্ড এবং ITS2 রিভার্স বা ITS1 ফরোয়ার্ড এবং ITS4 রিভার্স।
ITS2 কি?
ITS2 হল একটি স্পেসার ডিএনএ যা ইউক্যারিওটে 5.8S এবং 28S rRNA জিনের মধ্যে অবস্থিত। ITS2 অঞ্চলের ITS1 অঞ্চলের তুলনায় একটি ছোট দৈর্ঘ্যের পার্থক্য রয়েছে। ITS2 এর দৈর্ঘ্যের বৈচিত্র প্রায় (180-240bp)। যাইহোক, অনেক ট্যাক্সোনমিক ইউনিটে ITS2 অঞ্চলটি ITS1 অঞ্চলের চেয়ে বেশি সংরক্ষিত। এটি সনাক্ত করে যে সমস্ত ITS2 ক্রমগুলি সেকেন্ডারি কাঠামোর একটি সাধারণ মূল ভাগ করে। অধিকন্তু, 40% ITS2 অঞ্চল সমস্ত এনজিওস্পার্মের মধ্যে সংরক্ষণ করা হয়, যখন এটি পরিবার এবং উচ্চ স্তরে ITS2 অঞ্চলের 50% সারিবদ্ধ করা সম্ভব।
চিত্র 02: ITS2 অঞ্চল
সংরক্ষণের সুযোগ নির্বিশেষে, ITS2 অঞ্চলের ব্যবহারও খুব জনপ্রিয় যেমন ITS1 অঞ্চলের ফাইলোজেনেটিক সম্পর্ক গবেষণায়, বিশেষ করে ছত্রাকের DNA বারকোডিংয়ে। ITS2 অঞ্চলকে প্রসারিত করার জন্য, একটি নির্দিষ্ট প্রাইমার সেট সাধারণত পরীক্ষাগারগুলির পিসিআর প্রোটোকলগুলিতে ব্যবহৃত হয়। সেটি হল ITS1 foward এবং ITS4 বিপরীত। কিন্তু যখন PCR প্রোটোকল এই প্রাইমার সেটটি ব্যবহার করে, তখন এটি ITS1 অঞ্চলকে ITS2 অঞ্চলের সাথে একত্রে প্রসারিত করে। আরও, ITS2 স্পেসার ডিএনএ 3’বহিরাগত প্রতিলিপিকৃত স্পেসারের (3’ ETS) খুব কাছাকাছি।
ITS1 এবং ITS2 এর মধ্যে মিল
- ITS1 এবং ITS2 হল দুটি স্পেসার ডিএনএ যা rRNA জিনের মধ্যে অবস্থিত৷
- এরা শুধুমাত্র ইউক্যারিওটে উপস্থিত থাকে।
- উভয়টিকেই নির্দিষ্ট প্রাইমার জোড়া ব্যবহার করে বিবর্ধিত করা যায়।
- এগুলি উভয়ই rRNA পরিপক্কতায় অ-কার্যকর উপ-পণ্য হিসাবে বর্জন করা হয়৷
- ফাইলোজেনেটিক সম্পর্ক অধ্যয়নের জন্য উভয়ই অত্যন্ত গুরুত্বপূর্ণ, বিশেষ করে ছত্রাকের ডিএনএ বারকোডিংয়ের জন্য।
ITS1 এবং ITS2 এর মধ্যে পার্থক্য
ITS1 হল একটি স্পেসার ডিএনএ যা ইউক্যারিওটে 18S এবং 5.8S rRNA জিনের মধ্যে থাকে এবং ITS2 হল একটি স্পেসার ডিএনএ যা ইউক্যারিওটে 5.8S এবং 28S rRNA জিনের মধ্যে থাকে। সুতরাং, এটি ITS1 এবং ITS2 এর মধ্যে মূল পার্থক্য। অধিকন্তু, ITS2 এর তুলনায় ITS1 এর দৈর্ঘ্যের বৈচিত্র্য রয়েছে। অন্যদিকে, ITS1 এর তুলনায় ITS2 এর দৈর্ঘ্যের একটি ছোট বৈচিত্র্য রয়েছে। এটি ITS1 এবং ITS2 এর মধ্যে আরেকটি পার্থক্য।
নীচের ইনফোগ্রাফিকটি পাশাপাশি তুলনা করার জন্য ট্যাবুলার আকারে ITS1 এবং ITS2 এর মধ্যে পার্থক্যগুলি তালিকাভুক্ত করে৷
সারাংশ – ITS1 বনাম ITS2
আভ্যন্তরীণ প্রতিলিপিকৃত অঞ্চল (ITS) হল rRNA জিনের মধ্যে অবস্থিত স্পেসার ডিএনএর একটি অ-কার্যকর অংশ। ব্যাকটেরিয়া এবং আর্কিয়াতে, শুধুমাত্র একটি আইটিএস অঞ্চল রয়েছে।কিন্তু ইউক্যারিওটে, দুটি আইটিএস অঞ্চল রয়েছে: আইটিএস 1 এবং আইটিএস 2। ITS1 হল একটি স্পেসার ডিএনএ যা ইউক্যারিওটে 18S এবং 5.8S rRNA জিনের মধ্যে অবস্থিত, যখন ITS2 হল একটি স্পেসার ডিএনএ যা ইউক্যারিওটে 5.8S এবং 28S rRNA জিনের মধ্যে অবস্থিত। সুতরাং, এটি হল ITS1 এবং ITS2 এর মধ্যে পার্থক্যের সারাংশ।
