CDS এবং ORF-এর মধ্যে মূল পার্থক্য হল CDS হল একটি জিনের প্রকৃত নিউক্লিওটাইড ক্রম যা একটি প্রোটিনে অনুবাদ করে যখন ORF হল DNA ক্রমগুলির একটি প্রসারিত যা অনুবাদ সূচনা সাইট (স্টার্ট কোডন) দিয়ে শুরু হয় এবং একটি দিয়ে শেষ হয় অনুবাদ সমাপ্তি সাইট (স্টপ কোডন)।
একটি জিনের একটি কোডিং সিকোয়েন্স (CDS) থাকে। এটি জিনের মোট এক্সন এবং একটি স্টার্ট কোডন এবং একটি স্টপ কোডন নিয়ে গঠিত। এটি জিনের প্রকৃত অংশ যা প্রোটিন অনুবাদ করে এবং উত্পাদন করে। ওপেন রিডিং ফ্রেম বা ORF হল একটি নিউক্লিওটাইড সিকোয়েন্স যা একটি স্টার্ট কোডন এবং একটি স্টপ কোডনের মধ্যে অবস্থিত। একটি ORF এর ভিতরে কোন স্টপ কোডন নেই যা জেনেটিক কোডকে বাধা দেয় যা প্রোটিনে অনুবাদ করে।প্রোক্যারিওটে, একটি জিনের সিডিএস এবং ওআরএফ একই।
সিডিএস কি?
CDS বা কোডিং সিকোয়েন্স হল জিনের অংশ যা আসলে প্রোটিনে রূপান্তরিত হয়। এটি এক্সন এবং দুটি কোডন নিয়ে গঠিত যা AUG কোডন এবং স্টপ কোডন নামে পরিচিত। CDS-এ দুটি অঅনুবাদিত অঞ্চল নেই: 5’ UTR এবং 3” UTR। তাছাড়া, ইন্ট্রোন সিডিএস-এ অন্তর্ভুক্ত নয়।
চিত্র 01: কোডিং সিকোয়েন্স
যখন একজন ব্যক্তির পুরো জিনোমের সাথে তুলনা করা হয়, কোডিং সিকোয়েন্সগুলি একটি ছোট ভগ্নাংশ। কোডিং সিকোয়েন্সে প্রোটিনের অ্যামিনো অ্যাসিড সিকোয়েন্স তৈরির জন্য প্রয়োজনীয় নিউক্লিওটাইড সিকোয়েন্স থাকে। অতএব, সিডিএস হল ঘনীভূত এক্সন যা নিউক্লিওটাইড ট্রিপলেট বা কোডনে বিভক্ত করা যেতে পারে। কোডনগুলি অ্যামিনো অ্যাসিডের জন্ম দেয়৷
একটি ORF কি?
ওপেন রিডিং ফ্রেম বা ORF হল একটি নিউক্লিওটাইড সিকোয়েন্সের ক্রমাগত প্রসারিত যা একটি স্টার্ট কোডন দিয়ে শুরু হয় এবং স্টপ কোডন দিয়ে শেষ হয়।সহজ কথায়, ORF স্টার্ট এবং স্টপ কোডনগুলির মধ্যে অবস্থিত নিউক্লিওটাইড সিকোয়েন্সের অঞ্চলকে বোঝায়। এর মধ্যে, ORF কে বাধা দেওয়ার কোন স্টপ কোডন নেই। অ্যামিনো অ্যাসিডের জন্য স্টার্ট এবং স্টপ কোডন এনকোডের মধ্যে নিউক্লিওটাইড ক্রম। সাধারণত, স্টার্ট কোডন হল ATG যখন স্টপ কোডন হল TAG, TAA এবং TGA। প্রতিলিপি এবং অনুবাদ করা হলে ORF একটি কার্যকরী প্রোটিন দেয়। তাই, ORF-এ একটি স্টার্ট কোডন, মধ্য অঞ্চলে বেশ কয়েকটি কোডন এবং একটি স্টপ কোডন অন্তর্ভুক্ত রয়েছে। মজার বিষয় হল, ORF এর একটি দৈর্ঘ্য আছে যা তিনটি দ্বারা ভাগ করা যায়।
চিত্র 02: রিডিং ফ্রেম খুলুন
প্রোক্যারিওটে, যেহেতু কোন ইন্ট্রোন নেই, তাই ORF হল একটি জিনের কোডিং সিকোয়েন্স যা সরাসরি mRNA তে প্রতিলিপি করে। অতএব, প্রোক্যারিওটে সিডিএস এবং পিআরএফ একই। প্রোক্যারিওটে জিন অনুসন্ধান করার সময়, একটি ORF সনাক্ত করা এবং প্রোকারিওটে একটি জিন খুঁজে পাওয়া সহজ।ইউক্যারিওটে, যেহেতু ইন্ট্রোন আছে, তাই ORF হল কোডন সিকোয়েন্স যা প্রক্রিয়াকরণ বা RNA স্প্লিসিংয়ের পরে তৈরি হয়। ORF হল প্রমাণের একটি অংশ যা জিনের পূর্বাভাসকে সহায়তা করে যতক্ষণ পর্যন্ত ORF একটি জিনের একটি অংশ হতে পারে৷
সিডিএস এবং ওআরএফ-এর মধ্যে মিল কী?
- প্রোকারিওটে, সিডিএস এবং ওআরএফ একই।
- দুটোই কোডন শুরু করে এবং কোডন বন্ধ করে দেয়।
- এদের অনেকগুলি নিউক্লিওটাইড রয়েছে যা তিনটি দ্বারা ভাগ করা যায়।
- একবার তারা অনুবাদ করলে, তারা অ্যামিনো অ্যাসিড ক্রম তৈরি করে।
সিডিএস এবং ওআরএফ-এর মধ্যে পার্থক্য কী?
CDS হল জিনের প্রকৃত অংশ যা একটি প্রোটিনে অনুবাদ করে যখন ORF হল একটি স্টার্ট কোডন এবং একটি স্টপ কোডনের মধ্যে DNA এর প্রসারিত। সুতরাং, এটি সিডিএস এবং ওআরএফ-এর মধ্যে মূল পার্থক্য। অধিকন্তু, CDS-এ ইন্ট্রোন থাকে না, তবে ORF-এ ইন্ট্রোন থাকতে পারে। সিডিএস সম্পূর্ণভাবে একটি সম্পূর্ণ এমআরএনএ সিকোয়েন্সে প্রতিলিপি করে যখন ওআরএফ এমআরএনএ সিকোয়েন্সের একটি অংশ হতে পারে।সুতরাং, এটি CDS এবং ORF এর মধ্যে আরেকটি পার্থক্য।
নিচে ইনফোগ্রাফিক সারণী পাশাপাশি সিডিএস এবং ওআরএফ-এর মধ্যে পার্থক্য রয়েছে।
সারাংশ – CDS বনাম ORF
CDS এবং ORF একটি জিনের দুটি গুরুত্বপূর্ণ অংশ। সিডিএস বলতে ডিএনএর প্রকৃত অঞ্চলকে বোঝায় যা প্রোটিনে রূপান্তরিত হয়। ORF হল DNA এর একটি ক্রম যা স্টার্ট কোডন "ATG" দিয়ে শুরু হয় এবং তিনটি টার্মিনেশন কোডন (TAA, TAG বা TGA) এর যেকোনো একটি দিয়ে শেষ হয়। ORF একটি জিনের সম্পূর্ণ mRNA এর একটি অংশ হতে পারে। যাইহোক, একটি জিনের কোডিং সিকোয়েন্স mRNA সিকোয়েন্স সম্পূর্ণ করার জন্য প্রতিলিপি করে। সমস্ত CDS হল ORF. কিন্তু সব ORF সিডিএস নয়। সুতরাং, এটি সিডিএস এবং ওআরএফ-এর মধ্যে পার্থক্যকে সংক্ষিপ্ত করে।
