জাইলিন সায়ানোল এবং ব্রোমোফেনল ব্লু-এর মধ্যে পার্থক্য কী

2024 লেখক: Alex Aldridge | [email protected]. সর্বশেষ পরিবর্তিত: 2023-12-17 13:33

জাইলিন সায়ানল এবং ব্রোমোফেনল নীলের মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে 1% অ্যাগারোজ জেলে, জাইলিন সায়ানল ধীরে ধীরে স্থানান্তরিত হয়, যেখানে ব্রোমোফেনল নীল দ্রুত স্থানান্তরিত হয়।

জাইলিন সায়ানোল এবং ব্রোমোফেনল নীল রঙ চিহ্নিতকারী হিসাবে গুরুত্বপূর্ণ যা অ্যাগারোজ জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস এবং পলিঅ্যাক্রিলামাইড জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস প্রক্রিয়া পর্যবেক্ষণে ব্যবহার করা যেতে পারে৷

জাইলিন সায়ানোল কি?

জাইলিন সায়ানল একটি ইলেক্ট্রোফোরেটিক রঙ চিহ্নিতকারী বা একটি ট্র্যাকিং ডাই। এটি অ্যাগারোজ জেল ইলেক্ট্রোফোরসিস এবং পলিঅ্যাক্রিলামাইড জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস প্রক্রিয়া পর্যবেক্ষণে কার্যকর। যখন এই পদার্থটি নমুনার সাথে মিশ্রিত হয়, তখন এই পদার্থের ঘনত্ব সাধারণত প্রায় 0 হয়ে যায়।005% থেকে 0.03%। কিছু প্রতিশব্দ যা আমরা xylene cyanol-এর জন্য ব্যবহার করতে পারি তার মধ্যে রয়েছে Acid Blue 147, xylene cyanole, xylene cyanol FF, xylene cyanole FF, ইত্যাদি।

এই যৌগের রাসায়নিক সূত্র হল C₂₅H₂₇N₂NaO 6_S2 _{জাইলিন সায়ানোলের মোলার ভর 538.61 গ্রাম/মোল। এই পদার্থটি 1% অ্যাগারোজ জেলে প্রায় 4 - 5 কিলোবেস জোড়া DNA খণ্ডের হারে স্থানান্তর করতে পারে। যাইহোক, এটি আমরা যে বাফার ব্যবহার করি তার উপর নির্ভর করে। সাধারণত, 6% পলিঅ্যাক্রাইলামাইড জেলের জাইলিন সায়ানল প্রায় 140 বেস পেয়ার ডিএনএ টুকরার গতিতে স্থানান্তর করতে পারে। অন্যদিকে, এটি 25 বেস অলিগোনিউক্লিওটাইডের হারে 20% ডিনেচারিং পলিঅ্যাক্রাইলামাইড জেল ইলেক্ট্রোফোরসিসে স্থানান্তর করতে পারে।}

জাইলিন সায়ানোলের হাইড্রোজেন বন্ড দাতার সংখ্যা 2m, এবং হাইড্রোজেন বন্ড গ্রহণকারীর সংখ্যা 8। এই যৌগের ঘূর্ণনযোগ্য বন্ডের সংখ্যা 7 হিসাবে দেওয়া যেতে পারে। জাইলিন সায়ানোলের জটিলতা 1120 ডিগ্রি হিসাবে বর্ণনা করা যেতে পারে। এটির একটি সংজ্ঞায়িত বন্ড স্টেরিওসেন্টার গণনা 1.

ব্রোমোফেনল ব্লু কী?

ব্রোমোফেনল নীল একটি দরকারী pH সূচক যা একটি ইলেক্ট্রোফোরেটিক রঙ চিহ্নিতকারী এবং একটি রঞ্জক হিসাবে কার্যকর। এর রাসায়নিক নাম 3’, 3”, 5’, 5”-টেট্রাব্রোমোফেনলসালফোনফথালিন, বিপিবি। এই যৌগের রাসায়নিক সূত্র হল C₁₉H₁₀Br₄O_{5 এস এই যৌগের মোলার ভর হল 669.96 গ্রাম/মোল। এটি গন্ধহীন, এবং এর ঘনত্ব 2.2 g/mL হিসাবে দেওয়া যেতে পারে। এর গলনাঙ্ক 273 ডিগ্রি সেলসিয়াস এবং এর স্ফুটনাঙ্ক 279 ডিগ্রি সেলসিয়াস। আমরা ধীরে ধীরে হিমবাহী অ্যাসিটিক অ্যাসিডের ফেনোলসালফোনফথালিনের গরম দ্রবণে অতিরিক্ত ব্রোমিন যোগ করে এটি প্রস্তুত করতে পারি।}

ব্রোমোফেনল নীল পিএইচ 3.0 থেকে 4.6 এর মধ্যে একটি অ্যাসিড-বেস নির্দেশক হিসাবে কার্যকর। এটি pH 3.0 এ হলুদ থেকে pH 4.6 এ পরিবর্তন করতে সক্ষম। অধিকন্তু, এটি একটি বিপরীত প্রতিক্রিয়া। কাঠামোগতভাবে, ব্রোমোফেনল নীল ফেনোলফথালিনের অনুরূপ।

এছাড়া, অ্যাগারোজ জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস এবং পলিঅ্যাক্রিলামাইড জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস প্রক্রিয়া নিরীক্ষণ করতে আমরা এটিকে রঙ চিহ্নিতকারী হিসাবে ব্যবহার করতে পারি। এই পদার্থটি মাঝারি pH-এ নেতিবাচক চার্জ বহন করতে পারে, যেখানে এটি জেলের ডিএনএ বা প্রোটিনের মতো একই দিকে স্থানান্তর করতে পারে। মাইগ্রেশন হার জেল ঘনত্ব এবং বাফার রচনা অনুযায়ী পরিবর্তিত হতে পারে। যাইহোক, 1 টাইম TAE বাফার বা TBE বাফারে একটি সাধারণ 1% অ্যাগারোজ জেলে, এই পদার্থটি প্রায় 300 বেস জোড়ার ডিএনএ খণ্ডের মতো একই হারে স্থানান্তরিত হয়৷

জাইলিন সায়ানোল এবং ব্রোমোফেনল ব্লু-এর মধ্যে পার্থক্য কী?

জাইলিন সায়ানোল এবং ব্রোমোফেনল নীল গুরুত্বপূর্ণ রঙ চিহ্নিতকারী। জাইলিন সায়ানোল এবং ব্রোমোফেনল নীলের মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে 1% অ্যাগারোজ জেলে, জাইলিন সায়ানল ধীরে ধীরে স্থানান্তরিত হয়, যেখানে ব্রোমোফেনল নীল দ্রুত স্থানান্তরিত হয়।

পাশাপাশি তুলনা করার জন্য নীচে জাইলিন সায়ানোল এবং ব্রোমোফেনল নীলের মধ্যে সারণী আকারে পার্থক্যের সংক্ষিপ্তসার দেওয়া হল৷

সারাংশ – জাইলিন সায়ানোল বনাম ব্রোমোফেনল ব্লু

এগারোজ জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস এবং পলিঅ্যাক্রিলামাইড জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস প্রক্রিয়া পর্যবেক্ষণে ব্যবহৃত রঙ চিহ্নিতকারী হিসাবে জাইলিন সায়ানোল এবং ব্রোমোফেনল নীল গুরুত্বপূর্ণ। জাইলিন সায়ানোল এবং ব্রোমোফেনল নীলের মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে 1% অ্যাগারোজ জেলে, জাইলিন সায়ানোল ধীরে ধীরে স্থানান্তরিত হয় যেখানে ব্রোমোফেনল নীল দ্রুত স্থানান্তরিত হয়।