পলিসোম প্রোফাইলিং এবং রাইবোসোম প্রোফাইলিংয়ের মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে পলিসোম প্রোফাইলিং অনুবাদের সময় রাইবোসোম এবং এমআরএনএ (পলিসোম) উভয় ব্যবহার করে রাইবোসোম আচরণ বিশ্লেষণ করে, যখন রাইবোসোম প্রোফাইলিং শুধুমাত্র অনুবাদের সময় mRNA ক্রম ব্যবহার করে রাইবোসোম আচরণ বিশ্লেষণ করে।
অনুবাদ হল প্রোটিন সংশ্লেষণের দ্বিতীয় পর্যায় যা mRNA-এর তথ্যকে একটি অ্যামিনো অ্যাসিড ক্রমানুসারে রূপান্তরিত করে। Translatomics হল ORFs (ওপেন রিডিং ফ্রেম) এর একটি অধ্যয়ন যা জীবের একটি কোষে সক্রিয়ভাবে অনুবাদ করা হয়। পলিসোম এবং রাইবোসোম প্রোফাইলিং কৌশল হল আণবিক জীববিজ্ঞানের ক্ষেত্রে ট্রান্সল্যাটোম বিশ্লেষণের প্রেক্ষাপটে বিভিন্ন পরামিতি মূল্যায়ন এবং অনুমান করার জন্য দুটি ধরণের কৌশল।
পলিসোম প্রোফাইলিং কি?
পলিসোম প্রোফাইলিং এমন একটি কৌশল যা রাইবোসোম এবং এমআরএনএ (পলিসোম) উভয়ের আচরণ বিশ্লেষণ করে একটি নির্দিষ্ট এমআরএনএর অনুবাদের অবস্থা অনুমান করে। অন্য কথায়, এই কৌশলটি রাইবোসোমের সাথে mRNA-এর সংযোগের উপর তথ্য এবং উপসংহার প্রদান করে। পলিসোম বলতে বোঝায় রাইবোসোমের গ্রুপকে বোঝায় একটি mRNA এর সাথে আবদ্ধ যা অনুবাদের প্রসারণ পর্যায়ে উপস্থিত থাকে।
চিত্র 01: পলিসোম প্রোফাইলিং
পলিসোম প্রোফাইলিংয়ের জন্য সেল লাইসেট প্রয়োজন, যা পরে সেন্ট্রিফিউজ করা হয়। রাইবোসোমের ছোট ও বড় সাবুনিট এবং পলিসোম গঠনের সাথে জড়িত সংশ্লিষ্ট এমআরএনএ চিহ্নিত করার জন্য সেন্ট্রিফিউজড নমুনাকে তাদের ঘনত্বের ভিত্তিতে আলাদা করা হয়।তদ্ব্যতীত, প্রক্রিয়াটিতে অপটিক্যাল ঘনত্ব পরিমাপ করাও জড়িত। পলিসোম প্রোফাইলিং করার জন্য বিশেষজ্ঞদের প্রয়োজন৷
পলিসোম প্রোফাইলিং কৌশল অনেক অ্যাপ্লিকেশনের জন্য একটি গুরুত্বপূর্ণ হাতিয়ার। বিজ্ঞানীরা কোষে অনুবাদের ডিগ্রি অধ্যয়ন করতে এই কৌশলটি ব্যবহার করেন। আরও নির্দিষ্টভাবে, এটি পৃথক প্রোটিন এবং তাদের নির্দিষ্ট এমআরএনএগুলির অধ্যয়নের উপর সঠিক তথ্য সরবরাহ করার একটি সরঞ্জাম। একটি নির্দিষ্ট mRNA এর অনুবাদের ডিগ্রি অধ্যয়নের প্রেক্ষাপটে, পলিসোম প্রোফাইলিং কৌশলটি গুরুত্বপূর্ণ। এখানে, একটি mRNA এর 3’ এবং 5’ ক্রম উত্পাদিত mRNA এর পরিমাণ এবং অনুবাদের স্তরের উপর তাদের প্রভাবের রেফারেন্স দিয়ে তদন্ত করা যেতে পারে।
রাইবোসোম প্রোফাইলিং কি?
রাইবোসোম প্রোফাইলিং এমন একটি কৌশল যা অনুবাদের সময় রাইবোসোমের এমআরএনএ-র সাথে সম্পর্কিত আচরণ বিশ্লেষণ করে। এই কৌশলটি জোয়ান স্টিটজ এবং মেরিলিন কোজাক দ্বারা পাওয়া যায় এবং বিকশিত হয়েছিল। পরবর্তীতে এই প্রযুক্তিটি পরবর্তী প্রজন্মের সিকোয়েন্সিংয়ের সমন্বয়ে দুই বিজ্ঞানী, নিকোলাস এবং জোনাথন দ্বারা আরও বিকশিত হয়েছিল, যা ট্রান্সলেটিং রাইবোসোম অ্যাফিনিটি পিউরিফিকেশন (ট্র্যাপ) পদ্ধতির মতো বিভিন্ন সম্পর্কিত কৌশলগুলির বিকাশের দিকে পরিচালিত করেছিল।
চিত্র 02: রাইবোসোম সিকোয়েন্সিং
রাইবোসোম প্রোফাইলিংয়ের পদ্ধতিতে এমআরএনএকে বিচ্ছিন্ন করা, রাইবোসোমের সাথে আবদ্ধ নয় এমন আরএনএ অপসারণ করা এবং রাইবোসোমের সাথে আবদ্ধ এমআরএনএকে আলাদা করা জড়িত। এই পদ্ধতি অনুসরণ করে, এমআরএনএ আইসোলেট বিপরীত প্রতিলিপি করা হয় এবং সিডিএনএ সংশ্লেষণ হয়। অবশেষে, এমআরএনএ-র ক্ষেত্রে রাইবোসোম আচরণের বৈশিষ্ট্যগুলি বের করার জন্য অনুক্রমের ডেটা অনুবাদমূলক প্রোফাইলের সাথে সারিবদ্ধ করা যেতে পারে৷
রাইবোসোম প্রোফাইলিং অনেক গবেষককে অনুবাদের স্টার্ট সাইটগুলির অবস্থান সনাক্ত করতে এবং অনুমান করতে সাহায্য করে, একটি কোষ বা টিস্যুতে অনুবাদিত ওপেন রিডিং ফ্রেম (ORFs) এর পরিপূরক, mRNA-তে রাইবোসোমগুলির বিতরণ এবং এর হার রাইবোসোম অনুবাদ করা।রাইবোসোম প্রোফাইলিং রাইবোসোম ফুটপ্রিন্টিং বা রিবো সেক নামেও পরিচিত।
পলিসোম প্রোফাইলিং এবং রাইবোসোম প্রোফাইলিংয়ের মধ্যে মিল কী?
- পলিসোম এবং রাইবোসোম প্রোফাইলিং গবেষণায় গুরুত্বপূর্ণ আণবিক জৈবিক কৌশল।
- তারা অনুবাদ প্রক্রিয়ার তথ্য প্রদান করে।
- উভয় প্রোফাইলিং প্রক্রিয়াই অনুবাদের বিশ্লেষণের মাধ্যমে ডেটা প্রদান করে।
- নিখুঁত ফলাফলের জন্য উভয় কৌশল সম্পাদন করার জন্য পেশাদার বিশেষজ্ঞের প্রয়োজন৷
- বায়োইনফরমেটিক্স টুল উভয় কৌশলেই গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে।
পলিসোম প্রোফাইলিং এবং রাইবোসোম প্রোফাইলিংয়ের মধ্যে পার্থক্য কী?
পলিসোম প্রোফাইলিং অনুবাদের সময় রাইবোসোম এবং এমআরএনএ (পলিসোম) উভয় ব্যবহার করে রাইবোসোম আচরণ বিশ্লেষণ করে, যখন রাইবোসোম প্রোফাইলিং অনুবাদের সময় শুধুমাত্র এমআরএনএ ক্রম ব্যবহার করে রাইবোসোম আচরণ বিশ্লেষণ করে।সুতরাং, এটি পলিসোম প্রোফাইলিং এবং রাইবোসোম প্রোফাইলিংয়ের মধ্যে মূল পার্থক্য। অধিকন্তু, পলিসোম প্রোফাইলিংয়ে ঘনত্ব গ্রেডিয়েন্ট সেন্ট্রিফিউগেশন এবং অপটিক্যাল ঘনত্ব পরিমাপের মতো কৌশলগুলি জড়িত, যখন রাইবোসোম প্রোফাইলিংয়ে এমআরএনএ নিষ্কাশন এবং সিকোয়েন্সিং কৌশল জড়িত। এছাড়াও, রাইবোসোম প্রোফাইলিং পলিসোম প্রোফাইলিংয়ের চেয়ে বেশি নির্ভুল৷
নিচের ইনফোগ্রাফিকটি পাশাপাশি তুলনা করার জন্য সারণী আকারে পলিসোম এবং রাইবোসোম প্রোফাইলিংয়ের মধ্যে পার্থক্য উপস্থাপন করে৷
সারাংশ – পলিসোম প্রোফাইলিং বনাম রাইবোসোম প্রোফাইলিং
অনুবাদ হল প্রোটিন সংশ্লেষণের দ্বিতীয় পর্যায় যাতে এমআরএনএ সিকোয়েন্সের তথ্যকে অ্যামিনো অ্যাসিড সিকোয়েন্সে রূপান্তর করা হয়। এই প্রক্রিয়াটির জন্য একটি mRNA টেমপ্লেট, রাইবোসোম, অ্যামিনো অ্যাসিড, tRNA এবং অন্যান্য কারণের প্রয়োজন হয়। পলিসোম এবং রাইবোসোম প্রোফাইলিং দুটি আণবিক কৌশল। পলিসোম প্রোফাইলিং অনুবাদের সময় রাইবোসোম এবং এমআরএনএ (পলিসোম) উভয় ব্যবহার করে রাইবোসোম আচরণ বিশ্লেষণ করে, যখন রাইবোসোম প্রোফাইলিং অনুবাদের সময় শুধুমাত্র এমআরএনএ ক্রম ব্যবহার করে রাইবোসোম আচরণ বিশ্লেষণ করে।পলিসোম প্রোফাইলিংয়ে ঘনত্ব গ্রেডিয়েন্ট সেন্ট্রিফিউগেশন এবং অপটিক্যাল ঘনত্ব পরিমাপের মতো কৌশল জড়িত। রাইবোসোম প্রোফাইলিংয়ে এমআরএনএ নিষ্কাশন, সিডিএনএ সংশ্লেষণ এবং সিকোয়েন্সিংয়ের মতো কৌশল জড়িত। সুতরাং, এটি পলিসোম প্রোফাইলিং এবং রাইবোসোম প্রোফাইলিংয়ের মধ্যে পার্থক্যকে সংক্ষিপ্ত করে৷
