উদ্ভিদ এবং প্রাণীর ডিএনএ নিষ্কাশনের মধ্যে মূল পার্থক্য হল উদ্ভিদের ডিএনএ নিষ্কাশনের সময়, প্রাণীর ডিএনএ নিষ্কাশনের সময় কোষের উপাদানগুলিকে মুক্ত করার জন্য শুকনো বরফ বা তরল নাইট্রোজেনে টিস্যু পিষে কোষ প্রাচীর ভেঙ্গে ফেলা প্রয়োজন।, এই পদক্ষেপটি চালানোর প্রয়োজন নেই কারণ প্রাণী কোষের কোষ প্রাচীর নেই।
জিনোমিক ডিএনএ হল উদ্ভিদ ও প্রাণী কোষের জেনেটিক উপাদান। জিনোমিক ডিএনএ প্রতিটি পৃথক উদ্ভিদ বা প্রাণীর জন্য অনন্য। ভালো মানের ডিএনএ নিষ্কাশন আণবিক গবেষণার পূর্বশর্ত। জীবের ডিএনএ সনাক্তকরণ, রোগ নির্ণয়, নির্দিষ্ট জিন এবং ক্রম সনাক্তকরণ, ফরেনসিক উদ্দেশ্যে, পিতৃত্ব পরীক্ষা, জিনোম সিকোয়েন্সিং এবং ওষুধের বিকাশ ইত্যাদির জন্য নিষ্কাশন করা হয়।ডিএনএ নিষ্কাশন পদ্ধতি কোষের প্রকারের উপর নির্ভর করে পরিবর্তিত হয় - তা প্রাণী কোষ বা উদ্ভিদ কোষ।
প্ল্যান্ট ডিএনএ নিষ্কাশন কি?
উদ্ভিদ কোষে ডিএনএ বিভিন্ন আণবিক গবেষণার জন্য বের করা হয়। এটি অক্ষত, বিশুদ্ধ জিনোমিক ডিএনএ নিষ্কাশন করা প্রয়োজন. সুতরাং, বিভিন্ন ধরণের ডিএনএ নিষ্কাশন প্রোটোকল রয়েছে যা প্রাণী কোষ থেকে ডিএনএ নিষ্কাশন প্রোটোকল থেকে আলাদা। এর কারণ হল উদ্ভিদ কোষের একটি কোষ প্রাচীর থাকে যা সেলুলার সামগ্রী বের করার জন্য ভেঙ্গে দেওয়া উচিত।
নিষ্কাশন সাধারণত শুষ্ক বরফ বা তরল নাইট্রোজেনে গাছের টিস্যু পিষে একটি মর্টার এবং মটর ব্যবহার করে করা হয়। তারপর কোষ ঝিল্লি ব্যাহত হয়, এবং সেলুলার বিষয়বস্তু একটি নিষ্কাশন বাফার মধ্যে নেওয়া হয়. এটি সাধারণত একটি ডিটারজেন্ট ব্যবহার করে করা হয়; SDS (সোডিয়াম ডোডেসিল সালফেট) বা CTAB (cetyltrimethylammonium bromide) বাফার। মুক্তিপ্রাপ্ত ডিএনএ EDTA-এর মতো চেলেটিং এজেন্ট ব্যবহার করে অন্তঃসত্ত্বা নিউক্লিয়াস থেকে সুরক্ষিত থাকে। তাছাড়া, ক্লোরোফর্ম বা ফেনল ব্যবহার করে ডিএনএ থেকে প্রোটিন আলাদা করা হয়।
চিত্র ০১: উদ্ভিদের ডিএনএ নিষ্কাশন
উদ্ভিদ পলিস্যাকারাইড এবং পলিফেনল সংশ্লেষণ করে, যার মধ্যে ফ্ল্যাভোনয়েড এবং অন্যান্য গৌণ বিপাক রয়েছে। এই যৌগগুলি বিশুদ্ধ জিনোমিক ডিএনএ নিষ্কাশনে হস্তক্ষেপ করে। তাই, বেশিরভাগ উদ্ভিদের ডিএনএ নিষ্কাশন প্রোটোকলের সাথে এই যৌগগুলিকে নির্মূল করার জন্য সিজিয়াম ক্লোরাইড ঘনত্বের গ্রেডিয়েন্ট কৌশলের মতো আরেকটি পদক্ষেপ জড়িত থাকে৷
ডিএনএ নিষ্কাশন প্রোটোকলের বেশিরভাগই ডিএনএ নিষ্কাশনের জন্য তাজা পাতার নমুনা ব্যবহার করার পরামর্শ দেয়। কিছু পদ্ধতিতে বিপজ্জনক রাসায়নিক যেমন তরল নাইট্রোজেন এবং ফেনল অন্তর্ভুক্ত থাকে না। CTAB (Cetyl trimethylammonium bromide) প্রোটোকল হল একটি জনপ্রিয় উদ্ভিদ DNA নিষ্কাশন প্রোটোকল যা উচ্চ-মানের উদ্ভিদ জিনোমিক ডিএনএ নিষ্কাশনকে সহজতর করে। এটি উদ্ভিদ ডিএনএ নিষ্কাশনের জন্য একটি সহজ, নিরাপদ, নির্ভরযোগ্য এবং খরচ-দক্ষ পদ্ধতি।অন্যান্য পদ্ধতির অধিকাংশই CTAB পদ্ধতির পরিবর্তিত সংস্করণ।
পশুর ডিএনএ নিষ্কাশন কি?
পশুর ডিএনএ নিষ্কাশন হল আণবিক বিশ্লেষণের জন্য প্রাণী কোষ থেকে জিনোমিক ডিএনএ নিষ্কাশন। উদ্ভিদের ডিএনএ নিষ্কাশনের বিপরীতে, কোষ প্রাচীরের ভাঙ্গন প্রাণী কোষের জন্য প্রয়োজনীয় নয় কারণ তাদের কোষ প্রাচীরের অভাব রয়েছে। রক্তকণিকা হল সবচেয়ে সাধারণ ধরনের প্রাণী কোষ যা বিভিন্ন কাজে ব্যবহৃত হয়।
চিত্র 02: ডিএনএ নিষ্কাশন
ফেনল-ক্লোরোফর্ম পদ্ধতি রক্তের কোষের জন্য সেরা পছন্দগুলির মধ্যে একটি। এই পদ্ধতি থেকে ডিএনএ বের করার সময় ডিএনএর ফলন ও গুণমান বেশি থাকে। এটি একটি তরল-তরল ডিএনএ নিষ্কাশন প্রোটোকল, এবং এই পদ্ধতিটি ডিএনএ অণুগুলিকে তাদের অবিচ্ছিন্ন দ্রবণে দ্রবণীয়তার ভিত্তিতে আলাদা করে।ফেনল, ক্লোরোফর্ম এবং আইসোমাইল অ্যালকোহল এই পদ্ধতির শীর্ষ তিনটি উপাদান।
উদ্ভিদ ও প্রাণীর ডিএনএ নিষ্কাশনের মধ্যে মিল কী?
- উদ্ভিদ ও প্রাণী উভয়ের ডিএনএ নিষ্কাশনের সময়, কোষের ঝিল্লি অবশ্যই ব্যাহত হয়।
- ডিএনএকে অন্তঃসত্ত্বা নিউক্লিয়াস থেকে রক্ষা করতে হবে।
- এছাড়াও, ডিএনএ ছেদন রোধ করা উচিত।
- উদ্ভিদের ডিএনএ এবং প্রাণীর ডিএনএ নিষ্কাশনের জন্য বাণিজ্যিক কিট পাওয়া যায়৷
- অধিকাংশ উদ্ভিদ এবং প্রাণীর ডিএনএ নিষ্কাশন পদ্ধতিতে ক্রমাগত পরিবর্তন এবং মানককরণ প্রয়োজন।
উদ্ভিদ ও প্রাণীর ডিএনএ নিষ্কাশনের মধ্যে পার্থক্য কী?
উদ্ভিদ এবং প্রাণীর ডিএনএ নিষ্কাশনের মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে উদ্ভিদের ডিএনএ নিষ্কাশনের জন্য কোষের প্রাচীর ভাঙ্গার জন্য শুকনো বরফ বা তরল নাইট্রোজেনে উদ্ভিদের টিস্যু পিষে নেওয়ার প্রয়োজন হয় যখন প্রাণীর ডিএনএ নিষ্কাশনের জন্য এই পদক্ষেপের প্রয়োজন হয় না যেহেতু তারা প্রাণী। কোষের একটি কোষ প্রাচীর নেই।সিটিএবি পদ্ধতি হল উদ্ভিদের ডিএনএ নিষ্কাশনের জন্য সেরা পদ্ধতিগুলির মধ্যে একটি যখন ফেনল-ক্লোরোফর্ম পদ্ধতি হল প্রাণীর ডিএনএ নিষ্কাশনের সেরা পদ্ধতিগুলির মধ্যে একটি৷
ইনফোগ্রাফিকের নীচে উদ্ভিদ এবং প্রাণীর ডিএনএ নিষ্কাশনের মধ্যে পার্থক্য সারণী করা হয়েছে৷
সারাংশ – উদ্ভিদ বনাম প্রাণীর ডিএনএ নিষ্কাশন
বিভিন্ন কোষের ধরন থেকে ডিএনএ নিষ্কাশনের জন্য বিভিন্ন পদ্ধতি পাওয়া যায়। অতএব, উদ্ভিদের ডিএনএ নিষ্কাশন প্রোটোকল প্রাণী কোষের ডিএনএ নিষ্কাশন প্রোটোকল থেকে পৃথক। উদ্ভিদের ডিএনএ নিষ্কাশনের জন্য কোষের প্রাচীর, কোষের ঝিল্লি এবং পারমাণবিক ঝিল্লির ব্যাঘাত প্রয়োজন যখন প্রাণীর ডিএনএ নিষ্কাশনের জন্য কোষের ঝিল্লি এবং পারমাণবিক ঝিল্লির ভাঙ্গন প্রয়োজন। আরও গুরুত্বপূর্ণ, প্রাণী কোষের ডিএনএ নিষ্কাশনের জন্য শুষ্ক বরফ বা তরল নাইট্রোজেনে পিষে কোষের দেয়ালের ব্যাঘাতের প্রয়োজন হয় না।সুতরাং, এটি উদ্ভিদ এবং প্রাণীর ডিএনএ নিষ্কাশনের মধ্যে মূল পার্থক্য।