ORF এবং exon-এর মধ্যে মূল পার্থক্য হল ORF বা ওপেন রিডিং ফ্রেম হল DNA সিকোয়েন্সের একটি প্রসারিত যা ট্রান্সলেশন ইনিশিয়েশন সাইট (স্টার্ট কোডন) দিয়ে শুরু হয় এবং এক্সন থাকাকালীন ট্রান্সলেশন টার্মিনেশন সাইট (স্টপ কোডন) দিয়ে শেষ হয়। একটি জিনের মধ্যে একটি নিউক্লিওটাইড ক্রম যা অ্যামিনো অ্যাসিডের জন্য এনকোড করে৷
একটি খোলা পড়ার ফ্রেম একটি পড়ার ফ্রেমের একটি অংশ। রিডিং ফ্রেমগুলি প্রোটিন তৈরি করার জন্য রাইবোসোম দ্বারা পড়া হয়। ORF হল কোডনগুলির একটি ক্রমাগত প্রসারিত যা একটি সম্পূর্ণ কার্যকরী প্রোটিন দেয়। এটি একটি স্টার্ট কোডন দিয়ে শুরু হয় এবং একটি স্টপ কোডন দিয়ে শেষ হয়। ORF-এর অভ্যন্তরে, কোডন সিকোয়েন্সে কোনো স্টপ কোডন বাধা দেয় না।অনুবাদ শুরু কোডন এ শুরু হয় এবং স্টপ কোডনে শেষ হয়। এক্সন হল একটি জিনের নিউক্লিওটাইড ক্রম। এটি প্রোটিনের অ্যামিনো অ্যাসিডের জন্য এনকোড করে। অতএব, এক্সন হল একটি জিনের কোডিং অঞ্চল।
একটি ORF কি?
ওপেন রিডিং ফ্রেম বা ORF হল একটি নিউক্লিওটাইড সিকোয়েন্সের ক্রমাগত প্রসারিত যা একটি স্টার্ট কোডন দিয়ে শুরু হয় এবং স্টপ কোডন দিয়ে শেষ হয়। সহজ কথায়, ORF স্টার্ট এবং স্টপ কোডনগুলির মধ্যে অবস্থিত নিউক্লিওটাইড সিকোয়েন্সের অঞ্চলকে বোঝায়। এর মধ্যে, ORF কে বাধা দেওয়ার কোন স্টপ কোডন নেই। অ্যামিনো অ্যাসিডের জন্য স্টার্ট এবং স্টপ কোডন এনকোডের মধ্যে নিউক্লিওটাইড ক্রম। সাধারণত, স্টার্ট কোডন হল ATG যখন স্টপ কোডন হল TAG, TAA এবং TGA। প্রতিলিপি এবং অনুবাদ করা হলে ORF একটি কার্যকরী প্রোটিন দেয়। অতএব, ORF-এ একটি স্টার্ট কোডন, মধ্য অঞ্চলে বেশ কয়েকটি কোডন এবং একটি স্টপ কোডন অন্তর্ভুক্ত রয়েছে। মজার বিষয় হল, ORF এর একটি দৈর্ঘ্য আছে যা তিনটি দ্বারা ভাগ করা যায়।
চিত্র 01: ORF
প্রোক্যারিওটে, যেহেতু কোন ইন্ট্রোন নেই, তাই ORF হল একটি জিনের কোডিং অঞ্চল যা সরাসরি mRNA তে প্রতিলিপি করে। ইউক্যারিওটে, যেহেতু ইন্ট্রোন আছে, তাই ORF হল কোডন সিকোয়েন্স যা প্রক্রিয়াকরণ বা RNA স্প্লাইসিংয়ের পরে পরিণত হয়। ORF হল একটি প্রমাণের একটি অংশ যা জিনের পূর্বাভাসকে সহায়তা করে কারণ দীর্ঘ ORFগুলি জিনের একটি অংশ হতে পারে৷
এক্সন কি?
Exons হল জিনের কোডিং নিউক্লিওটাইড সিকোয়েন্স যা প্রোটিনে রূপান্তরিত হয়। তারা একটি intron উভয় পাশে আছে. প্রি এমআরএনএ থেকে নন-কোডিং সিকোয়েন্সগুলি সরানোর পরে, পরিপক্ক এমআরএনএ অণু শুধুমাত্র এক্সন সিকোয়েন্স নিয়ে গঠিত। তারপর চূড়ান্ত আরএনএ অণুর নিউক্লিওটাইড সিকোয়েন্স (পরিপক্ক mRNA) একটি নির্দিষ্ট প্রোটিনের অ্যামিনো অ্যাসিড সিকোয়েন্সে রূপান্তরিত হয়।
চিত্র 02: এক্সন
প্রায় সব জিনের একটি প্রাথমিক নিউক্লিওটাইড ক্রম থাকে যা এটিকে প্রধান ডিএনএ বা আরএনএ স্ট্র্যান্ড থেকে একটি জিন হিসাবে আলাদা করে, যা ওপেন রিডিং ফ্রেম নামে পরিচিত (ORF। কিছু জিনে, দুটি ORF সমগ্র জিন এবং এক্সনকে চিহ্নিত করে। কোডিং সিকোয়েন্সের মধ্যে অবস্থিত। যদিও এটা শোনা যায় যে এক্সনগুলি সবসময় জিনে প্রকাশ করা হয়, এমন কিছু উদাহরণ রয়েছে যেখানে ইন্ট্রন সিকোয়েন্সগুলি এক্সনের সাথে মিউটেশন ঘটাতে হস্তক্ষেপ করে এবং এই প্রক্রিয়াটি এক্সোনাইজেশন নামে পরিচিত।
ORF এবং Exon-এর মধ্যে মিল কী?
- ORF এবং exon উভয়ই নিউক্লিওটাইড সিকোয়েন্স।
- লং ওআরএফ এবং এক্সন একটি জিনের অংশ।
- উভয়েরই কোডিং সিকোয়েন্স রয়েছে।
ORF এবং Exon-এর মধ্যে পার্থক্য কী?
ORF এবং exon হল নিউক্লিওটাইড অনুক্রম। ORF একটি স্টার্ট কোডন এবং একটি স্টপ কোডনের মধ্যে অবস্থিত ডিএনএ সিকোয়েন্সের যেকোনো প্রসারিতকে বোঝায়।বিপরীতে, এক্সন হল একটি জিনের কোডিং নিউক্লিওটাইড ক্রম যা অ্যামিনো অ্যাসিডের জন্য এনকোড করে। সুতরাং, এটি ORF এবং exon এর মধ্যে মূল পার্থক্য। Exons একটি জিনের অংশ যখন দীর্ঘ ORF একটি জিনের একটি অংশ হতে পারে। অধিকন্তু, একটি এক্সনের উভয় দিকেই ইন্ট্রোন থাকে যখন ORF-এ ইন্ট্রোন অন্তর্ভুক্ত থাকে না।
ইনফোগ্রাফিক সারণী আকারে ORF এবং exon-এর মধ্যে পার্থক্য সংক্ষিপ্ত করে৷
সারাংশ – ORF বনাম Exon
ওপেন রিডিং ফ্রেম (ORF) রিডিং ফ্রেমের একটি অংশ। এটি ডিএনএ সিকোয়েন্সের ক্রমাগত প্রসারিত যা একটি স্টার্ট কোডন দিয়ে শুরু হয় এবং একটি স্টপ কোডন দিয়ে শেষ হয়। এক্সন হল একটি জিনের নিউক্লিওটাইড ক্রম। এটি mRNA সিকোয়েন্সের একটি অংশের জন্য এনকোড করে। অতএব, এক্সন হল জিন সিকোয়েন্সের অংশ যা প্রোটিনে প্রকাশ করা হয়।সুতরাং, এটি ORF এবং exon-এর মধ্যে পার্থক্যকে সংক্ষিপ্ত করে৷