পুরো জিনোম সিকোয়েন্সিং এবং এক্সোম সিকোয়েন্সিং এর মধ্যে মূল পার্থক্য হল পুরো জিনোম সিকোয়েন্সিং একটি জীবের সমগ্র জিনোমকে সিকোয়েন্স করে যেখানে এক্সোম সিকোয়েন্সিং সিকোয়েন্সিং শুধুমাত্র এক্সোম বা জীবের প্রোটিন-কোডিং জিনকে সাজায়।
সিকোয়েন্সিং এমন একটি কৌশল যা একটি নির্দিষ্ট ডিএনএ অণুতে নিউক্লিওটাইডের সুনির্দিষ্ট ক্রম নির্ধারণ করে। এটি কেবল চারটি ভিত্তির সঠিক ক্রম প্রতিফলিত করে; ডিএনএ খণ্ডে অ্যাডেনিন (এ), গুয়ানিন (জি), সাইটোসিন (সি) এবং থাইমিন (টি)। স্যাঙ্গার সিকোয়েন্সিং, পরবর্তী প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং ইত্যাদির মতো বেশ কিছু সিকোয়েন্সিং পদ্ধতি রয়েছে। উপরন্তু, হয় একটি জীবের সম্পূর্ণ জিনোম (পুরো জিনোম সিকোয়েন্সিং) অথবা শুধুমাত্র জিনোমের প্রোটিন-কোডিং জিন (এক্সোম সিকোয়েন্সিং) সিকোয়েন্সিং করা যেতে পারে।
পুরো জিনোম সিকোয়েন্সিং কি?
মানব জিনোমে প্রায় তিন বিলিয়ন বেস জোড়া ডিএনএ রয়েছে। পুরো জিনোম সিকোয়েন্সিং এমন একটি পদ্ধতি যা একটি জীবের সম্পূর্ণ জিনোমকে সিকোয়েন্স করে। তাই, পুরো জিনোম সিকোয়েন্সিং-এ, এক্সোমস, ইন্ট্রোন, ইন্টারজেনিক স্পেস ইত্যাদি সহ ডিএনএ অণুর সম্পূর্ণ সংগ্রহের উপর বিবেচনা করা হয়। তাছাড়া, পুরো জিনোম সিকোয়েন্সিং সিকোয়েন্স শুধুমাত্র নিউক্লিয়াসের ভিতরে থাকা জিনোমই নয়, মাইটোকন্ড্রিয়াল ডিএনএও।.
চিত্র 01: পুরো জিনোম সিকোয়েন্সিং
এই সিকোয়েন্সিংয়ের প্রস্তুতির প্রথম ধাপ হল পুরো ডিএনএ বের করা। তারপরে, নিষ্কাশিত ডিএনএ একটি উপযুক্ত সিকোয়েন্সিং পদ্ধতি ব্যবহার করে সিকোয়েন্সিং পদ্ধতির মধ্য দিয়ে যায়।একটি বায়োইনফরমেটিক্স টুল ব্যবহার করে ফলাফলের ক্রম বিশ্লেষণ করে, আমরা বিরল রোগ, ক্যান্সার, সংক্রামক রোগ ইত্যাদি জানতে পারি।
Exome সিকোয়েন্সিং কি?
Exome হল জিনোমের একটি অংশ যা জিনোমের প্রায় 1.5% ধারণ করে এবং এটি এক্সনগুলির সংগ্রহ। এক্সন হল সেই ক্রম যা mRNA এবং তারপর চূড়ান্ত প্রোটিন পণ্যে প্রতিলিপি করা হয়। তাই, এক্সোম সিকোয়েন্সিং জিনোমের পুরো প্রোটিন-কোডিং সিকোয়েন্সগুলিকে সিকোয়েন্স করে। এক্সোম সিকোয়েন্সিং জেনেটিক ডিসঅর্ডার প্রকাশ করে যেহেতু বেশিরভাগ জিনগত ব্যাধি প্রোটিন-কোডিং জিনের মিউটেশনের কারণে উদ্ভূত হয়। তাই, জেনেটিক ডিসঅর্ডারের ডায়গনিস্টিক প্রক্রিয়াগুলি প্রায়শই রোগ নির্ণয়ের পদ্ধতি হিসাবে এক্সোম সিকোয়েন্সিং ব্যবহার করে। এছাড়াও, জিনগত পরীক্ষার জন্য সম্পূর্ণ জিনোম সিকোয়েন্সিং অ্যাপ্লিকেশনের সাথে তুলনা করার সময়, এক্সোম সিকোয়েন্সিং নিয়োগে কম সময় নেয় এবং কম ব্যয়বহুল।
চিত্র 02: এক্সোম সিকোয়েন্সিং
এক্সোম সিকোয়েন্সিং-এ, প্রথমে মোট ডিএনএ থেকে শুধুমাত্র প্রোটিন কোডিং সিকোয়েন্স নির্বাচন করা প্রয়োজন। মনে রাখবেন যে মানুষের প্রায় 180000 প্রোটিন-কোডিং ক্রম রয়েছে। তারপর, এক্সোম একটি উচ্চ থ্রুপুট সিকোয়েন্সিং পদ্ধতি ব্যবহার করে সিকোয়েন্স করা হয়৷
পুরো জিনোম সিকোয়েন্সিং এবং এক্সোম সিকোয়েন্সিংয়ের মধ্যে মিল কী?
- পুরো জিনোম সিকোয়েন্সিং এবং এক্সোম সিকোয়েন্সিং হল সিকোয়েন্সিংয়ের দুটি প্রয়োগ।
- উভয় পদ্ধতিতেই নিউক্লিওটাইড সিকোয়েন্সের সঠিক ক্রম নির্ণয় করতে উভয় পদ্ধতিই কার্যকর।
- এছাড়া, বায়োইনফরমেটিক্স উভয় কৌশলেই ডেটা বিশ্লেষণ করতে সাহায্য করে।
পুরো জিনোম সিকোয়েন্সিং এবং এক্সোম সিকোয়েন্সিংয়ের মধ্যে পার্থক্য কী?
পুরো জিনোম সিকোয়েন্সিং একটি জীবের জিনোমের সম্পূর্ণ ডিএনএ সিকোয়েন্স করে, যখন এক্সোম সিকোয়েন্সিং সিকোয়েন্স জিনোম থেকে শুধুমাত্র প্রোটিন কোডিং সিকোয়েন্স করে।অতএব, এটি পুরো জিনোম সিকোয়েন্সিং এবং এক্সোম সিকোয়েন্সিংয়ের মধ্যে মৌলিক পার্থক্য। এছাড়াও, যদিও উভয় পদ্ধতিই নিউক্লিওটাইড সিকোয়েন্সের সঠিক ক্রম নির্ধারণের জন্য ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত হয়, তবে পুরো জিনোম সিকোয়েন্সিং এক্সোম সিকোয়েন্সিংয়ের তুলনায় ব্যয়বহুল এবং সময়সাপেক্ষ।
নীচের ইনফোগ্রাফিক পুরো জিনোম সিকোয়েন্সিং এবং এক্সোম সিকোয়েন্সিংয়ের মধ্যে পার্থক্য সারণী করে।
সারাংশ – পুরো জিনোম সিকোয়েন্সিং বনাম এক্সোম সিকোয়েন্সিং
সিকোয়েন্সিং একটি ডিএনএ খণ্ডের ঘাঁটির সুনির্দিষ্ট ক্রম প্রকাশ করে এবং এটি সম্পূর্ণ জিনোম সিকোয়েন্সিং বা এক্সোম সিকোয়েন্সিং হতে পারে। এখানে, পুরো জিনোম সিকোয়েন্সিং একটি জীবের সম্পূর্ণ জিনোমকে সিকোয়েন্স করে যখন এক্সোম সিকোয়েন্সিং সিকোয়েন্স জিনোমের মধ্যে শুধুমাত্র প্রোটিন-কোডিং সিকোয়েন্স করে।তাদের প্রয়োগগুলি বিবেচনা করে, পুরো জিনোম সিকোয়েন্সিং পুরো জিনোমে একক নিউক্লিওটাইড বৈচিত্র্য, মুছে ফেলা, সন্নিবেশ ইত্যাদির মতো জেনেটিক বিকৃতি বিশ্লেষণে সহায়ক যখন এক্সোম সিকোয়েন্সিং জেনেটিক রোগ সনাক্ত করতে সহায়ক। অতএব, পুরো জিনোম সিকোয়েন্সিং এবং এক্সোম সিকোয়েন্সিংয়ের মধ্যে এটাই পার্থক্য।
