মূল পার্থক্য - এক্সোম বনাম ট্রান্সক্রিপ্টোম
একটি জিনের মধ্যে কোডিং এবং নন-কোডিং অঞ্চল রয়েছে। কোডিং সিকোয়েন্সগুলি এক্সন হিসাবে পরিচিত, এবং নন-কোডিং সিকোয়েন্সগুলি ইন্ট্রোন হিসাবে পরিচিত। একটি জিনের এক্সনগুলির নিউক্লিওটাইড ক্রমটি নির্দিষ্ট প্রোটিন সংশ্লেষণের জন্য জিনের জেনেটিক কোডকে প্রতিনিধিত্ব করে। সুতরাং, এক্সনগুলি এমআরএনএ অণুতে থাকে। জিনোমের মোট এক্সন অঞ্চলটি এক্সোম নামে পরিচিত এবং এটি জিনোমের একটি গুরুত্বপূর্ণ অংশ। জিনের জেনেটিক কোড mRNA অণুর জেনেটিক কোডে রূপান্তরিত হয়, যা প্রোটিন উৎপাদনের জন্য প্রয়োজন। একটি কোষে বা একটি কোষের জনসংখ্যায় একটি সময়ে প্রতিলিপিকৃত সম্পূর্ণ mRNA অণুগুলি একটি ট্রান্সক্রিপ্টোম হিসাবে পরিচিত।এক্সোম এবং ট্রান্সক্রিপ্টমের মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে এক্সোম জিনোমের এক্সন অঞ্চলগুলির ক্রমগুলিকে প্রতিনিধিত্ব করে যখন ট্রান্সক্রিপ্টম একটি নির্দিষ্ট সময়ে একটি কোষ বা একটি টিস্যুর মোট mRNA প্রতিনিধিত্ব করে৷
Exome কি?
জিনগুলি এক্সন, ইন্ট্রোন এবং নিয়ন্ত্রক ক্রম দ্বারা গঠিত। এক্সন হল জিন অঞ্চল যা ট্রান্সক্রিপশনের সময় mRNA সিকোয়েন্সে প্রতিলিপি করা হয়। ট্রান্সক্রিপশনের সময় ইন্ট্রোন এবং অন্যান্য নন-কোডিং অঞ্চলগুলি সরানো হয়। এক্সনগুলির নিউক্লিওটাইড ক্রমটি জিনের জেনেটিক কোড নির্ধারণ করে যা এটি কোড করা নির্দিষ্ট প্রোটিনকে সংশ্লেষ করে। একটি প্রোটিনের mRNA এর মধ্যে শুধুমাত্র এক্সন থাকে। জিনোমে exons সংগ্রহ একটি জীব exome হিসাবে পরিচিত হয়. এটি জিনোমের একটি অংশকে প্রতিনিধিত্ব করে যা জিনে প্রকাশ করা হয়। মানুষের মধ্যে, জিনোম থেকে এক্সোম অ্যাকাউন্ট 1%। এটি মানব জিনোমের প্রোটিন-কোডিং অংশ।
চিত্র 01: Exome
ট্রান্সক্রিপ্ট কি?
ট্রান্সক্রিপ্টম হল প্রদত্ত টিস্যুতে সমস্ত প্রোটিন-কোডিং এবং নন-কোডিং ট্রান্সক্রিপ্ট (RNA) এর সংগ্রহ। ট্রান্সক্রিপ্টম একটি কোষ বা টিস্যুতে জিন দ্বারা প্রকাশিত মোট mRNA অণুর সংগ্রহকে প্রতিনিধিত্ব করে। একটি কোষের ট্রান্সক্রিপ্টম অন্য কোষের ট্রান্সক্রিপ্টোমের সাথে পরিবর্তিত হতে পারে। ট্রান্সক্রিপ্টোমটিও গতিশীল - এটি অভ্যন্তরীণ এবং বাহ্যিক উভয় উদ্দীপনার প্রতিক্রিয়ায় সময়ের সাথে পরিবর্তিত হয়। এমনকি একই টিস্যুর মধ্যে বা একই কোষের মধ্যে, ট্রান্সক্রিপ্টোম কয়েক মিনিট পরে পরিবর্তিত হতে পারে।
ট্রান্সক্রিপ্টোম একটি জীবের exome থেকে আলাদা। ট্রান্সক্রিপ্টোমে শুধুমাত্র প্রকাশিত এক্সোম সিকোয়েন্স অন্তর্ভুক্ত থাকে। যদিও একটি কোষের বহিঃপ্রকাশ একই থাকে, ট্রান্সক্রিপ্টম কোষের মধ্যে ভিন্ন হয় কারণ জিনের অভিব্যক্তি সমস্ত কোষ বা টিস্যুর জন্য এক নয়। শুধুমাত্র প্রয়োজনীয় জিনগুলি বিভিন্ন কোষ এবং টিস্যুতে প্রকাশ করা হয়।জিন এক্সপ্রেশন একটি টিস্যু বা কোষের ধরণের নির্দিষ্ট প্রক্রিয়া। এটি পরিবেশগত কারণ সহ বিভিন্ন কারণ দ্বারা নিয়ন্ত্রিত হয়। অতএব, ট্রান্সক্রিপ্টোম বাহ্যিক পরিবেশগত অবস্থার সাথে পরিবর্তিত হতে পারে।
ট্রান্সক্রিপ্টোম প্রোটিওমিক্স অধ্যয়নের অগ্রদূত হিসাবে ব্যবহৃত হয়। সমস্ত প্রোটিন এমআরএনএ সিকোয়েন্স থেকে উদ্ভূত হয়। অনুবাদমূলক পরিবর্তনের ফলে প্রোটিনের পরিবর্তন হতে পারে। যাইহোক, ট্রান্সক্রিপ্টোম প্রোটোমিক স্টাডির জন্য গুরুত্বপূর্ণ মৌলিক তথ্য প্রদান করে৷
চিত্র 02: ভ্রূণের স্টেম কোষের প্রতিলিপি
Exome এবং Transscriptome এর মধ্যে পার্থক্য কি?
এক্সোম বনাম ট্রান্সক্রিপ্টোম |
|
| Exome হল জিনের প্রোটিন-কোডিং অঞ্চলের সংগ্রহ। | Transcriptome হল mRNA সহ সমস্ত প্রতিলিপিকৃত RNA এর সংগ্রহ। |
| নমুনা | |
| Exome ডিএনএ নমুনা ব্যবহার করে অধ্যয়ন করা হয়। | Transcriptome একটি RNA নমুনা ব্যবহার করে অধ্যয়ন করা হয়। |
| অধ্যয়ন পদ্ধতি | |
| পুরো এক্সোম সিকোয়েন্সিং হল এক্সোম অধ্যয়নের পদ্ধতি। | RNA সিকোয়েন্সিং হল ট্রান্সক্রিপ্টোম অধ্যয়নের পদ্ধতি। |
সারাংশ – এক্সোম বনাম ট্রান্সক্রিপ্টোম
Exons হল জিনের কোডিং সিকোয়েন্স এবং প্রোটিনের mRNA ক্রম নির্ধারণ করে। এই কোডিং সিকোয়েন্সের (এক্সন) সংগ্রহকে জীবের এক্সোম বলা হয়। প্রোটিন তৈরির আগে জিনগুলি mRNA অণুতে প্রতিলিপি করা হয়। একটি নির্দিষ্ট সময়ে একটি কোষ বা একটি টিস্যুর মোট mRNA অণুগুলিকে ট্রান্সক্রিপ্টোম বলা হয়।ট্রান্সক্রিপ্টোম সেই জিনগুলিকে প্রতিনিধিত্ব করে যেগুলি যে কোনও নির্দিষ্ট সময়ে mRNA তে সক্রিয়ভাবে প্রকাশ করা হচ্ছে। ট্রান্সক্রিপ্টম হল কোষ এবং টিস্যু নির্দিষ্ট এবং পরিবেশগত অবস্থার সাথে প্রভাবিত করে। এটি হল এক্সোম এবং ট্রান্সক্রিপ্টমের মধ্যে পার্থক্য৷
