মূল পার্থক্য - প্রোটোমিক্স বনাম ট্রান্সক্রিপ্টমিক্স
অমিক টেকনোলজি একটি বর্তমান প্রবণতা, যেখানে একটি জীবের বিভিন্ন জৈব অণুগুলিকে এর বৈশিষ্ট্য এবং ফাংশনগুলির বিষয়ে একটি সম্পূর্ণ সংগ্রহ হিসাবে দেখা হয়। ওমিক প্রযুক্তিতে বিস্তৃত অ্যাপ্লিকেশন রয়েছে। জৈবিক নমুনার বিভিন্ন ওমিক্সের মধ্যে রয়েছে জিনোমিক্স, প্রোটিওমিক্স, ট্রান্সক্রিপ্টমিক্স এবং মেটাবোলোমিক্স। প্রোটিওমিক্স একটি জীবন্ত জীবের সমস্ত প্রোটিনের সম্পূর্ণ অধ্যয়ন জড়িত। এটি একটি জীবের সমস্ত প্রকাশ প্রোটিনের সেট, এর কাঠামোগত এবং কার্যকরী বৈশিষ্ট্য হিসাবে সংজ্ঞায়িত করা হয়। প্রোটিনের সম্পূর্ণ সেট তাই প্রোটিওম গঠন করে।ট্রান্সক্রিপ্টমিক্স হল একটি জীবন্ত প্রাণীর মধ্যে উপস্থিত সমস্ত মেসেঞ্জার RNA (mRNA) অণুগুলির সম্পূর্ণ অধ্যয়ন। এইভাবে, ট্রান্সক্রিপ্টমিক্স সেই জিনগুলির সাথে ডিল করে যা একটি জীবন্ত জীবের মধ্যে সক্রিয়ভাবে প্রকাশ করা হয়। একটি জীবন্ত জীবের এমআরএনএর মোট সেটকে ট্রান্সক্রিপ্টোম বলা হয়। প্রোটিওমিক্স এবং ট্রান্সক্রিপ্টমিক্সের মধ্যে মূল পার্থক্য বায়োমোলিকুলের ধরণের উপর ভিত্তি করে। প্রোটিওমিক্সে, একটি জীবন্ত জীবের মোট প্রকাশ করা প্রোটিনের সমষ্টি অধ্যয়ন করা হয় যেখানে, ট্রান্সক্রিপ্টমিক্সে, একটি জীবন্ত জীবের মোট mRNA অধ্যয়ন করা হয়৷
প্রোটিওমিক্স কি?
প্রোটিওমিক্স শব্দটি 1995 সালে তৈরি করা হয়েছিল এবং প্রাথমিকভাবে একটি কোষ, টিস্যু বা একটি জীবের মোট প্রোটিন পরিপূরক হিসাবে সংজ্ঞায়িত করা হয়েছিল। প্রোটিওমিক অধ্যয়নের অগ্রগতির সাথে, এটি তখন একটি ছাতা শব্দ হিসাবে বিবেচিত হওয়ার জন্য পরিবর্তিত হয়েছিল যাতে অনেকগুলি অধ্যয়ন ক্ষেত্র অন্তর্ভুক্ত ছিল। বর্তমানে, প্রোটিওমিক্স বিষয়ের অধীনে, গঠন, ওরিয়েন্টেশন, ফাংশন, এর মিথস্ক্রিয়া, এর পরিবর্তন, এর প্রয়োগ এবং প্রোটিনের গুরুত্ব অধ্যয়ন করা হয়।অতএব, বর্তমানে প্রোটিওমিক্সের ক্ষেত্রে অনেক গবেষণা পরিচালিত হয়৷
Escherichia coli-এর প্রোটিন উপাদান সনাক্ত করার জন্য প্রথম প্রোটিওমিক গবেষণা করা হয়েছিল। মোট প্রোটিন সামগ্রীর ম্যাপিং দ্বিমাত্রিক (2D) জেল ব্যবহার করে করা হয়েছিল। এটির সাফল্যের পরে, বিজ্ঞানীরা গিনিপিগ এবং ইঁদুরের মতো প্রাণীদের মোট প্রোটিনের বিষয়বস্তু চিহ্নিত করতে এগিয়ে যান। বর্তমানে, মানুষের প্রোটিন ম্যাপিং 2D জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস ব্যবহার করে করা হয়৷
প্রোটিওমিক্সের প্রয়োগ
প্রোটিওমিক্স অধ্যয়নের অনেক সুবিধা রয়েছে, কারণ প্রোটিনের অনুঘটক বৈশিষ্ট্যের কারণে প্রোটিনগুলি বেশিরভাগ কার্যকলাপের নিয়ন্ত্রক অণু। সুতরাং, পুরো প্রোটিনের অধ্যয়ন একটি জীবের স্বাস্থ্যের অবস্থা সম্পর্কিত তথ্য প্রদান করতে পারে। কিছু অ্যাপ্লিকেশন হল;
- জিনোম টীকা: একটি জীবের প্রোটিন সামগ্রী অধ্যয়ন করে, সক্রিয় প্রোটিন যৌগের জন্য দায়ী সঠিক জিনোমগুলি নির্ধারণ করা যেতে পারে। এই পরিস্থিতিতে সমস্ত জিনোমিক্সের ফলাফল, ট্রান্সক্রিপ্টমিক্স এবং প্রোটিওমিক্স গুরুত্বপূর্ণ৷
- রোগ শনাক্তকরণ / ডায়াগনস্টিকস: প্রোটিওমিক্স রোগের অবস্থা সনাক্তকরণে ব্যবহৃত হয়, সুস্থ এবং অসুস্থতুলনা করে
- পরীক্ষার সময় অধ্যয়ন করা প্রোটিন অভিব্যক্তি বহন করতে।
- প্রোটিন পরিবর্তন এবং মিথস্ক্রিয়া অধ্যয়ন: প্রোটিনগুলিকে ভিট্রো অবস্থায় বা এবং ভিভো অবস্থায় ব্যবহার করার জন্য, এই নিষ্কাশিত প্রোটিনগুলির স্টোরেজ অবস্থার সিদ্ধান্ত নেওয়ার জন্য এবং ইন ভিট্রো, ভিভো এবং ইন প্রোটিনের আচরণ অধ্যয়ন করতে - সিলিকো পদ্ধতি।
চিত্র 01: প্রোটিওমিক্স
প্রোটিওমিক্সের সাথে জড়িত বিভিন্ন কৌশল রয়েছে
- মোট প্রোটিন নিষ্কাশন এবং 2D জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস ব্যবহার করে প্রোটিন আলাদা করা। হাই-পারফরমেন্স লিকুইড ক্রোমাটোগ্রাফি (HPLC) ব্যবহার করেও প্রোটিন আলাদা করা যায়।
- এডমন্ডের সিকোয়েন্সিং পদ্ধতি বা ভর স্পেকট্রোমেট্রির মতো পদ্ধতি ব্যবহার করে নিষ্কাশিত প্রোটিনের সিকোয়েন্সিং।
- একবার অনুক্রমগুলি চিহ্নিত করা হলে, কম্পিউটার-ভিত্তিক সফ্টওয়্যার এবং বায়োইনফরমেটিক্স সরঞ্জামগুলি ব্যবহার করে প্রোটিন সামগ্রীর কাঠামোগত এবং কার্যকরী বৈশিষ্ট্যগুলি বিশ্লেষণ করা হয়৷
ট্রান্সক্রিপ্টমিক্স কি?
ট্রান্সক্রিপ্টোম শব্দটি সম্প্রতি তৈরি করা হয়েছে। ট্রান্সক্রিপ্টমিক্স হল একটি জীবের মোট mRNA বিষয়বস্তুর অধ্যয়ন। মোট mRNA হল একটি জীবন্ত প্রাণী বা কোষে প্রকাশিত DNA। mRNA এর সম্পূর্ণ সংগ্রহকে ট্রান্সক্রিপ্টোম বলা হয়।
ট্রান্সক্রিপ্টোম বিশ্লেষণের পদক্ষেপের মধ্যে রয়েছে,
- পলি ডিটি পুঁতি দিয়ে কলাম জেল ক্রোমাটোগ্রাফি ব্যবহার করে আরএনএ নিষ্কাশন, এমআরএনএ আলাদা করা।
- mRNA এর সিকোয়েন্সিং করা হয়েছে।
মাইক্রোয়ারে প্রযুক্তি একটি জীবের ট্রান্সক্রিপ্টম সনাক্ত করার একটি সাধারণ উপায়। মাইক্রোয়ারে কৌশলটিতে ট্রান্সক্রিপ্টোমের পরিপূরক স্ট্র্যান্ডগুলির সাথে একটি প্রোব প্লেট জড়িত। সংকরকরণের পরে, জীব বা কোষে উপস্থিত mRNA চিহ্নিত করা যেতে পারে।
চিত্র 02: ট্রান্সক্রিপ্টমিক কৌশল
ট্রান্সক্রিপ্টমিক্স এখন চিকিৎসা ক্ষেত্রে ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত হয়। রোগ নির্ণয় এবং রোগের প্রোফাইলিং হল প্রধান ক্ষেত্র যেখানে ট্রান্সক্রিপ্টমিক্স ব্যবহার করা হয়। একটি জীবের একটি ট্রান্সক্রিপ্টম বিশ্লেষণ করে, বিদেশী mRNA সনাক্ত করা যেতে পারে, এবং যদি কোন সংক্রমণ থাকে তবে এটি সনাক্ত করা যেতে পারে। নন-কোডিং আরএনএ ট্রান্সক্রিপ্টোমিক প্রযুক্তি ব্যবহার করে আলাদা করা যেতে পারে। এবং বিভিন্ন পরিবেশগত চাপের অধীনে জিনের অভিব্যক্তিও পর্যবেক্ষণ করা যেতে পারে।
প্রোটোমিক্স এবং ট্রান্সক্রিপ্টমিক্সের মধ্যে মিল কী?
- উভয়ই ওমিক প্রযুক্তির ধারণার একটি অংশ গঠন করে।
- দুটিই রোগ নির্ণয় এবং জীবের রোগের বৈশিষ্ট্যে ব্যবহৃত হয়।
- অধ্যয়নের উভয় ক্ষেত্রেই জৈব অণু নিষ্কাশন, জৈব অণু পৃথকীকরণ এবং সিকোয়েন্সিং ধাপ জড়িত।
প্রটোমিক্স এবং ট্রান্সক্রিপ্টমিক্সের মধ্যে পার্থক্য কী?
প্রোটেমিক্স বনাম ট্রান্সক্রিপ্টমিক্স |
|
| প্রোটিওমিক্স একটি জীবন্ত প্রাণীর সমস্ত প্রোটিনের সম্পূর্ণ অধ্যয়ন জড়িত৷ | ট্রান্সক্রিপ্টমিক্স হল জীবন্ত প্রাণীর মধ্যে উপস্থিত সমস্ত মেসেঞ্জার RNA (mRNA) অণুর সম্পূর্ণ অধ্যয়ন। |
| অধ্যয়ন করা জৈব অণুর প্রকার | |
| প্রোটিনগুলি প্রোটিওমিক্সে অধ্যয়ন করা হয়৷ | mRNA ট্রান্সক্রিপ্টমিক্সে অধ্যয়ন করা হয়। |
| অধ্যয়ন করা ফ্যাক্টর | |
| প্রোটিনগুলির গঠন, কার্যকারিতা, মিথস্ক্রিয়া, পরিবর্তন এবং প্রয়োগগুলি প্রোটিওমিক্সে অধ্যয়ন করা হয়৷ | অনুক্রমের গঠন, পরিবেশের সাথে মিথস্ক্রিয়া এবং mRNA এর প্রয়োগগুলি ট্রান্সক্রিপ্টমিক্সে অধ্যয়ন করা হয়৷ |
সারাংশ – প্রোটিওমিক্স বনাম ট্রান্সক্রিপ্টমিক্স
জীবন বিজ্ঞানের ক্ষেত্রে ওমিক্স একটি গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে। প্রোটিওমিক্স বলতে প্রোটিমের অধ্যয়নকে বোঝায় যা একটি কোষ বা জীবের প্রোটিনের সম্পূর্ণ সংগ্রহ গঠন করে। ট্রান্সক্রিপ্টোমিক্স ট্রান্সক্রিপ্টোমের অধ্যয়নকে বোঝায় যা mRNA আকারে প্রকাশিত ডিএনএর সম্পূর্ণ সেট। দুটি অধ্যয়নের ক্ষেত্র, প্রোটিওমিক্স এবং ট্রান্সক্রিপ্টমিক্স, জিনোমিক্স প্রবর্তনের পরে উদ্ভূত হয়েছিল এবং বর্তমানে চিকিৎসা ডায়াগনস্টিকস এবং জীবের বৈশিষ্ট্য এবং স্ক্রীনিংয়ে ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত হয়। এটি হল প্রোটিওমিক্স এবং ট্রান্সক্রিপ্টমিক্সের মধ্যে পার্থক্য৷
প্রোটিওমিক্স বনাম ট্রান্সক্রিপ্টমিক্সের পিডিএফ ডাউনলোড করুন
আপনি এই নিবন্ধটির পিডিএফ সংস্করণ ডাউনলোড করতে পারেন এবং উদ্ধৃতি নোট অনুসারে অফলাইন উদ্দেশ্যে এটি ব্যবহার করতে পারেন। অনুগ্রহ করে এখানে PDF সংস্করণ ডাউনলোড করুন: প্রোটিওমিক্স এবং ট্রান্সক্রিপ্টমিক্সের মধ্যে পার্থক্য
