সংকেত ক্রম এবং সংকেত প্যাচের মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে সংকেত ক্রম হল প্রোটিনের একটি অ্যামিনো অ্যাসিড ক্রম যা একটি কোষকে প্রোটিনগুলিকে অর্গানেল বা সেলুলার মেমব্রেনে স্থানান্তর করতে প্রম্পট করতে সাহায্য করে, যখন সিগন্যাল প্যাচটি একটি অ্যামিনো অ্যাসিড ক্রম প্রোটিন যা একটি কোষকে সাইটোসল থেকে নিউক্লিয়াসে প্রোটিন স্থানান্তর করতে সাহায্য করে।
প্রোটিন টার্গেটিং বা বাছাই হল জৈবিক প্রক্রিয়া যার মাধ্যমে প্রোটিনগুলি কোষের ভিতরে বা বাইরে তাদের উপযুক্ত স্থানে পরিবহণ করা হয়। প্রোটিনের মধ্যে যে তথ্য রয়েছে তা এই প্রসব প্রক্রিয়াকে নির্দেশ করে। কোষের জন্য সঠিক প্রোটিন বাছাই অত্যন্ত গুরুত্বপূর্ণ।বাছাইয়ে ত্রুটি বা কর্মহীনতা একাধিক রোগের কারণ হতে পারে। সিগন্যাল সিকোয়েন্স এবং সিগন্যাল প্যাচ হল দুটি সিকোয়েন্স যা প্রোটিনের অ্যামিনো অ্যাসিড দিয়ে তৈরি যা প্রোটিন টার্গেটিং বা বাছাইয়ে অংশগ্রহণ করে৷
সংকেত ক্রম কি?
সংকেত ক্রম হল প্রোটিনের একটি অ্যামিনো অ্যাসিড ক্রম যা কোষকে প্রোটিন স্থানান্তর করতে অনুরোধ করে, সাধারণত অর্গানেল বা সেলুলার মেমব্রেনে। একটি সংকেত ক্রম একটি সংকেত পেপটাইড হিসাবেও পরিচিত। এটি একটি ছোট পেপটাইড যাতে 16 থেকে 30 অ্যামিনো অ্যাসিড থাকে। এটি বেশিরভাগ নতুন সংশ্লেষিত প্রোটিনের N টার্মিনাসে (কখনও কখনও সি টার্মিনাস) উপস্থিত থাকে। সিগন্যাল সিকোয়েন্স প্রোটিনকে সিক্রেটরি পাথওয়ের দিকে সাহায্য করে। যেসব প্রোটিন সিগন্যাল সিকোয়েন্স ধারণ করে সেগুলি অন্তর্ভুক্ত করে যেগুলি অর্গানেলের ভিতরে থাকে (এন্ডোপ্লাজমিক রেটিকুলাম, গলগি যন্ত্রপাতি বা এন্ডোসোম), কোষ থেকে নিঃসৃত হয় বা বেশিরভাগ সেলুলার মেমব্রেনে ঢোকানো হয়।
চিত্র 01: সংকেত ক্রম
সাধারণত, বেশিরভাগ টাইপ আই মেমব্রেন-বাউন্ড প্রোটিনের সিগন্যাল সিকোয়েন্স থাকে। যাইহোক, বেশিরভাগ টাইপ II এবং মাল্টিস্প্যানিং মেমব্রেন-বাউন্ড প্রোটিন তাদের প্রথম ট্রান্সমেমব্রেন ডোমেন দ্বারা সিক্রেটরি পাথওয়ের দিকে লক্ষ্য করা হয় যা "টার্গেট পেপটাইড" নামে পরিচিত। অধিকন্তু, প্রোক্যারিওটে, সিগন্যাল সিকোয়েন্সগুলি নতুন সংশ্লেষিত প্রোটিনগুলিকে প্লাজমা মেমব্রেনে উপস্থিত SecYEG প্রোটিন পরিচালনাকারী চ্যানেলে নির্দেশ করে। অধিকন্তু, ইউক্যারিওটে, একটি সমজাতীয় সিস্টেম বিদ্যমান, যেখানে সংকেত ক্রমগুলি নতুন সংশ্লেষিত প্রোটিনগুলিকে Sec61 চ্যানেলে নির্দেশ করে। যদিও এই চ্যানেলটি SecYEG-এর সাথে স্ট্রাকচারাল এবং সিকোয়েন্স হোমোলজি শেয়ার করে, এটি এন্ডোপ্লাজমিক রেটিকুলামে উপস্থিত রয়েছে।
সংকেত প্যাচ কি?
একটি সংকেত প্যাচ প্রোটিনের একটি অ্যামিনো অ্যাসিড ক্রম যা একটি কোষকে সাইটোসল থেকে নিউক্লিয়াসে প্রোটিন স্থানান্তর করতে অনুরোধ করে।একটি সংকেত প্যাচে কোষের নির্দেশিত স্থানে একটি প্রদত্ত প্রোটিন পাঠানোর তথ্য রয়েছে। সম্ভবত, সংকেত পথ সাইটোসল থেকে নিউক্লিয়াসে প্রোটিনকে নির্দেশ করে। এটি অ্যামিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশ দিয়ে গঠিত যা প্রাথমিক ক্রমানুসারে একে অপরের থেকে দূরে থাকে। যাইহোক, এই অ্যামিনো অ্যাসিডগুলি ভাঁজ করা প্রোটিনের তৃতীয় কাঠামোতে একে অপরের কাছাকাছি অবস্থিত।
চিত্র 02: সংকেত প্যাচ
সংকেত অনুক্রমের বিপরীতে, বাছাই প্রক্রিয়ার পরে পরিপক্ক প্রোটিন থেকে সংকেত প্যাচগুলি বিচ্ছিন্ন হয় না। সংকেত প্যাচ ভবিষ্যদ্বাণী করা খুব কঠিন. পারমাণবিক স্থানীয়করণ সংকেতগুলি সাধারণত সংকেত প্যাচ, যদিও কিছু সংকেত ক্রমও বিদ্যমান। অধিকন্তু, নিউক্লিয়াসের জন্য নির্ধারিত প্রোটিনগুলিতে সংকেত প্যাচগুলি পাওয়া যায়, যা সাইটোসল থেকে নিউক্লিয়াসে নিউক্লিয়াসে পারমাণবিক ছিদ্র কমপ্লেক্সের মাধ্যমে তাদের নির্বাচনী পরিবহন সক্ষম করে।
সিগন্যাল সিকোয়েন্স এবং সিগন্যাল প্যাচের মধ্যে মিল কী?
- সিগন্যাল সিকোয়েন্স এবং সিগন্যাল প্যাচ প্রোটিন টার্গেটিং বা সাজানোর সাথে জড়িত দুটি সিকোয়েন্স।
- উভয় ক্রমই প্রোটিনের ভিতরে উপস্থিত।
- এই সিকোয়েন্সগুলো হল ছোট অ্যামিনো অ্যাসিড সিকোয়েন্স।
- উভয় অনুক্রমের ত্রুটি প্রোটিন বাছাইয়ে কর্মহীনতার কারণ হতে পারে, যার ফলে একাধিক রোগ হয়।
সিগন্যাল সিকোয়েন্স এবং সিগন্যাল প্যাচের মধ্যে পার্থক্য কী?
সংকেত ক্রম হল একটি অ্যামিনো অ্যাসিড ক্রম যা প্রোটিনগুলিতে পাওয়া যায় যা একটি কোষকে প্রোটিনগুলিকে অর্গানেল বা সেলুলার মেমব্রেনে স্থানান্তর করতে অনুরোধ করে, যখন সংকেত প্যাচটি প্রোটিনে পাওয়া একটি অ্যামিনো অ্যাসিড ক্রম যা একটি কোষকে প্রম্পট করে সাধারণত সাইটোসল থেকে নিউক্লিয়াসে প্রোটিন স্থানান্তর করতে। সুতরাং, এটি সিগন্যাল সিকোয়েন্স এবং সিগন্যাল প্যাচের মধ্যে মূল পার্থক্য। তদ্ব্যতীত, বাছাই করার পরে সিগন্যাল ক্রম পরিপক্ক প্রোটিন দ্বারা ক্লিভ করা হয়, যখন সিগন্যাল প্যাচ বাছাই করার পরে পরিপক্ক প্রোটিন দ্বারা ক্লিভ করা হয় না।
নিম্নলিখিত সারণীটি সংকেত ক্রম এবং সংকেত প্যাচের মধ্যে পার্থক্য সংক্ষিপ্ত করে৷
সারাংশ – সিগন্যাল সিকোয়েন্স বনাম সিগন্যাল প্যাচ
সিগন্যাল সিকোয়েন্স এবং সিগন্যাল প্যাচ প্রোটিনের মধ্যে পাওয়া দুটি সিকোয়েন্স। প্রোটিন টার্গেটিং বা সাজানোর জন্য এগুলি প্রয়োজনীয়। সংকেত ক্রম একটি কোষকে প্রোটিন স্থানান্তর করতে অনুরোধ করে, সাধারণত অর্গানেল বা সেলুলার ঝিল্লিতে। অন্যদিকে, একটি সংকেত প্যাচ একটি কোষকে প্রোটিন স্থানান্তর করতে অনুরোধ করে, সাধারণত সাইটোসল থেকে নিউক্লিয়াসে। সুতরাং, এটি সিগন্যাল সিকোয়েন্স এবং সিগন্যাল প্যাচের মধ্যে মূল পার্থক্য।
