ক্রম সারিবদ্ধকরণে সাদৃশ্য এবং পরিচয়ের মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে সাদৃশ্য হল তুলনামূলকভাবে দুটি অনুক্রমের মধ্যে সাদৃশ্য (সাদৃশ্য) যখন পরিচয় হল দুটি ভিন্ন অনুক্রমের মধ্যে হুবহু মিলে যাওয়া অক্ষরের সংখ্যা।
বায়োইনফরমেটিক্স হল বিজ্ঞানের একটি আন্তঃবিষয়ক ক্ষেত্র যেখানে প্রধানত আণবিক জীববিদ্যা এবং জেনেটিক্স, কম্পিউটার বিজ্ঞান, গণিত এবং পরিসংখ্যান জড়িত। সিকোয়েন্স অ্যালাইনমেন্ট বায়োইনফরমেটিক্সের একটি প্রধান শব্দ। এটি এমন একটি পদ্ধতি যেখানে ডিএনএ, আরএনএ বা প্রোটিনের ক্রমগুলি সাদৃশ্যের অঞ্চলগুলি সনাক্ত করার জন্য সাজানো হয় যা ক্রমগুলির মধ্যে কার্যকরী, কাঠামোগত বা বিবর্তনীয় সম্পর্কের ফলাফল।প্রান্তিককরণের শেষে, তারা একটি ম্যাট্রিক্সের মধ্যে সারি হিসাবে উপস্থাপন করা হবে। ক্রমাগত কলামগুলিতে অভিন্ন অক্ষরগুলি সারিবদ্ধ করার জন্য, অবশিষ্টাংশগুলির মধ্যে সন্নিবেশিত ফাঁক উপস্থিত রয়েছে৷
সাদৃশ্য কি?
অনুক্রম সারিবদ্ধকরণের সাদৃশ্য হল তুলনা করার সময় দুটি অনুক্রমের মধ্যে সাদৃশ্য। এই সত্যটি সিকোয়েন্সের পরিচয়ের উপর নির্ভরশীল। সাদৃশ্যতা বর্ণনা করে যে পরিমাণে অবশিষ্টাংশগুলি সারিবদ্ধ করা হয়। সুতরাং, অনুরূপ ক্রম অনুরূপ বৈশিষ্ট্য ধারণ করে. বায়োইনফরমেটিক্সে, সাদৃশ্য হল দুটি প্রোটিনের মধ্যে সাদৃশ্য মূল্যায়ন করার একটি হাতিয়ার।
চিত্র 01: সিকোয়েন্স অ্যালাইনমেন্টে সাদৃশ্য
সিকোয়েন্স অ্যালাইনমেন্ট প্রক্রিয়ার দুটি প্রধান ধাপ রয়েছে। প্রাথমিক ধাপ হল জোড়া-ভিত্তিক প্রান্তিককরণ, যা BLAST, FastA এবং LALIGN-এর মতো অ্যালগরিদম ব্যবহার করে দুটি সিকোয়েন্সের মধ্যে সর্বোত্তম প্রান্তিককরণ খুঁজে পেতে সাহায্য করে (গ্যাপ সহ)।ম্যাচিং অ্যালগরিদম ন্যূনতম সংখ্যা সম্পাদনা অপারেশন খুঁজে পায়; ইন-ডেল এবং প্রতিস্থাপন যাতে একটি সিকোয়েন্সকে অন্য সিকোয়েন্সের সাথে সারিবদ্ধ করা যায়। জোড়া-ভিত্তিক প্রান্তিককরণের পরে, প্রতিটি জোড়া-ভিত্তিক তুলনা থেকে দুটি পরিমাণগত পরামিতি প্রাপ্ত করা প্রয়োজন। তারা হল পরিচয় এবং মিল।
পরিচয় কি?
সিকোয়েন্স অ্যালাইনমেন্টে আইডেন্টিটি হল দুটি ভিন্ন সিকোয়েন্সের মধ্যে হুবহু মিলে যাওয়া অক্ষরের সংখ্যা। তাই, পরিচয় মূল্যায়ন করার সময় ফাঁক গণনা করা হয় না। পরিমাপ দুটি অনুক্রমের মধ্যে ছোট অনুক্রমের সাথে সম্পর্কযুক্ত বলে মনে করা হয়। এটি উল্লেখযোগ্যভাবে বোঝায় যে এটির প্রভাব রয়েছে যেখানে ক্রম পরিচয়টি ট্রানজিটিভ নয়। যদি X=Y এবং Y=Z, তাহলে X অপরিহার্যভাবে Z-এর সমান নয়। এটি পরিচয় দূরত্ব পরিমাপের পরিপ্রেক্ষিতে অনুমান করা হয়।
চিত্র 02: সিকোয়েন্স অ্যালাইনমেন্টে আইডেন্টিটি
উদাহরণস্বরূপ, X এর AAGGCTT এর একটি ক্রম রয়েছে, Y এর AAGGC এর একটি ক্রম রয়েছে এবং Z এর AAGGCAT এর একটি ক্রম রয়েছে। X এবং Y-এর মধ্যে পরিচয় হল 100% {5 অভিন্ন নিউক্লিওটাইড / মিনিট[দৈর্ঘ্য(X), দৈর্ঘ্য(Y)]}। Y এবং Z-এর মধ্যে পরিচয়ও 100%। কিন্তু X এবং Z-এর মধ্যে পরিচয় মাত্র 85% {(6 অভিন্ন নিউক্লিওটাইডস / 7)}।
সিকোয়েন্স অ্যালাইনমেন্টে সাদৃশ্য এবং পরিচয়ের মধ্যে মিল কী?
- সাদৃশ্য এবং পরিচয় উভয়ই দুটি শব্দ যা আমরা ক্রম সারিবদ্ধকরণে ব্যবহার করি।
- এছাড়াও, তারা দুটি অনুক্রমের মধ্যে সাদৃশ্য উল্লেখ করে।
- আরও, আমরা সেগুলিকে শতাংশের মান হিসাবে প্রকাশ করি৷
সিকোয়েন্স অ্যালাইনমেন্টে মিল এবং আইডেন্টিটির মধ্যে পার্থক্য কী?
সংখ্যাকরণে সাদৃশ্য দুটি অনুক্রমের মধ্যে সাদৃশ্যকে বলে যখন তুলনা করা হয় যখন ক্রম প্রান্তিককরণে পরিচয়টি দুটি ভিন্ন অনুক্রমের মধ্যে ঠিক মেলে এমন অক্ষরের পরিমাণ বলে।অতএব, এটি ক্রম সারিবদ্ধকরণে মিল এবং পরিচয়ের মধ্যে মূল পার্থক্য।
সারাংশ – সিকোয়েন্স অ্যালাইনমেন্টে মিল বনাম পরিচয়
সিকোয়েন্স অ্যালাইনমেন্ট ডিএনএ, আরএনএ বা প্রোটিনের সাদৃশ্যের অঞ্চলগুলি সনাক্ত করতে সহায়তা করে যা ক্রমগুলির মধ্যে কার্যকরী, কাঠামোগত বা বিবর্তনীয় সম্পর্কের কারণে ঘটে। সুতরাং, অনুক্রম সারিবদ্ধকরণের প্রসঙ্গে সাদৃশ্য এবং পরিচয় দুটি মূল পদ। এই দুটি পদের মধ্যে মূল পার্থক্য হল সাদৃশ্য হল তুলনার ক্ষেত্রে দুটি ক্রমগুলির মধ্যে সাদৃশ্য যখন পরিচয় হল দুটি ভিন্ন অনুক্রমের মধ্যে ঠিক মেলে এমন অক্ষরের সংখ্যা৷ এইভাবে, এটি ক্রম সারিবদ্ধকরণে মিল এবং পরিচয়ের মধ্যে পার্থক্যের সারাংশ।
