হেলিক্স-লুপ-হেলিক্স এবং হেলিক্স-টার্ন-হেলিক্সের মধ্যে মূল পার্থক্য হল হেলিক্স-লুপ-হেলিক্স প্রোটিন ডাইমারাইজেশনের মধ্যস্থতা করে যখন হেলিক্স-টার্ন-হেলিক্স ডিএনএ বাইন্ডিংয়ের মাধ্যমে জিনের প্রকাশকে নিয়ন্ত্রণ করে।
একটি প্রোটিন মোটিফ হল একটি স্বল্প-সংরক্ষিত ক্রম যা DNA এর স্বতন্ত্র ফাংশনের সাথে যুক্ত। এটি প্রধানত একটি অনন্য রাসায়নিক বা জৈবিক ফাংশন সহ একটি বিশেষ কাঠামোগত সাইটের সাথে যুক্ত। এই মোটিফগুলিতে বিভিন্ন প্রোটিন অণু সহ অ্যামিনো অ্যাসিডের ত্রি-মাত্রিক কাঠামোর ছোট অঞ্চল রয়েছে। সাধারণত, পৃথক মোটিফগুলিতে শুধুমাত্র কয়েকটি উপাদান থাকে। হেলিক্স-লুপ-হেলিক্স এবং হেলিক্স-টার্ন-হেলিক্স তিনটি উপাদান ধারণ করে।তাদের প্রোটিন স্ট্রাকচারাল মোটিফগুলির মধ্যে রয়েছে বিভিন্ন দৈর্ঘ্য এবং অনির্দিষ্ট কাঠামো সহ লুপ।
হেলিক্স-লুপ-হেলিক্স কি?
A helix-loop-helix (HLH) হল একটি প্রোটিন স্ট্রাকচারাল মোটিফ যা ডাইমারাইজিং ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টরগুলির বৃহত্তম পরিবারগুলির মধ্যে একটিকে সংজ্ঞায়িত করে৷ এই ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টরগুলিতে ডিএনএ বাইন্ডিং মেকানিজমের সুবিধার্থে অ্যামিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশ থাকে এবং সেগুলি ডাইমেরিক। প্রোটিন স্ট্রাকচারাল মোটিফটিতে দুটি α-হেলিস থাকে এবং তারা একটি লুপ দ্বারা সংযুক্ত থাকে। দুটি হেলিক্স থেকে একটি হেলিক্স ছোট দেখায় এবং লুপের নমনীয়তা অন্য হেলিক্সের বিপরীতে প্যাকিং এবং ভাঁজ করে ডাইমারাইজেশনের অনুমতি দেয়। যে হেলিক্সটি বড় দেখায় তাতে সাধারণত ডিএনএ-বাইন্ডিং অঞ্চল থাকে। এইচএলএইচ প্রোটিন একটি ঐক্যমত্য অনুক্রমের সাথে আবদ্ধ হয় যা ই-বক্স নামে পরিচিত। একটি সম্মত ক্রম হল একটি গণনাকৃত ক্রম যাতে নিউক্লিওটাইড বা অ্যামিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশ থাকে। ই-বক্স হল কিছু ইউক্যারিওটে ডিএনএ-তে সাড়া দেয় এমন একটি উপাদান যা প্রোটিন-বাইন্ডিং সাইট হিসেবে কাজ করে এবং জিনের প্রকাশকে নিয়ন্ত্রণ করে।
চিত্র 01: হেলিক্স-লুপ-হেলিক্স মোটিফ
HLH ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টরগুলি বিকাশ এবং কোষের কার্যকলাপের জন্য অপরিহার্য। HLH প্রোটিন প্রধানত ছয়টি গ্রুপের অন্তর্গত, যেগুলি A থেকে F অক্ষর থেকে নির্দেশিত। প্রতিটি গ্রুপে অন্তর্ভুক্ত ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টরগুলি হল:
গ্রুপ A: MyoD, Myf5, Beta2/NeuroD1, Scl, p-CaMK, NeuroD, এবং Neurogenins, গ্রুপ B: MAX, C-Myc, N-Myc এবং TCF4
গ্রুপ সি: AhR, BMAL-1-CLOCK, HIF, NPAS1, NPAS3, এবং MOP5
গ্রুপ ডি; EMC
গ্রুপ ই: HEY1 এবং HEY2
গ্রুপ F: EBF1
যেহেতু HLH-এর বেশিরভাগ ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর হেটেরোডিমেরিক, তাই ডাইমারাইজেশন প্রায়শই তাদের নিয়ন্ত্রণ করে।
হেলিক্স-টার্ন-হেলিক্স কি?
হেলিক্স-টার্ন-হেলিক্স (HTH) হল একটি প্রোটিন স্ট্রাকচারাল মোটিফ যা DNA বাঁধতে সক্ষম। প্রতিটি মনোমার দুটি α-হেলিস দিয়ে সংগঠিত হয় এবং একটি ছোট অ্যামিনো অ্যাসিড স্ট্র্যান্ড দ্বারা যুক্ত হয়। এটি ডিএনএ হেলিক্সের একটি খাঁজের সাথে আবদ্ধ হয়। HTH মোটিফগুলি সাধারণত জিনের অভিব্যক্তি নিয়ন্ত্রণ করে। এইচটিএইচ স্বীকৃতি এবং ডিএনএর সাথে বাঁধাই দুটি α-হেলিস দ্বারা সঞ্চালিত হয়। একটি হেলিক্স এন-টার্মিনালের প্রান্ত দখল করে এবং অন্যটি সি-টার্মিনাসে। বেশিরভাগ পরিস্থিতিতে, হেলিক্স ডিএনএর স্বীকৃতি বহন করে। তাই, এটি স্বীকৃতি হেলিক্স নামে পরিচিত। ডিএনএ-তে খাঁজের সাথে বাঁধাই ভ্যান ডের ওয়ালস মিথস্ক্রিয়া এবং ঘাঁটি উন্মুক্ত হাইড্রোজেন বন্ডের মাধ্যমে সঞ্চালিত হয়। অন্যান্য α-হেলিক্স প্রোটিন এবং ডিএনএ মিথস্ক্রিয়াকে স্থিতিশীল করে এবং স্বীকৃতিতে প্রধান ভূমিকা পালন করে না। যাইহোক, রিকগনিশন হেলিক্স এবং বাকি হেলিক্সের অভিযোজন একই রকম।
চিত্র 02: TetR পরিবারের হেলিক্স-টার্ন-হেলিক্স
HTH কে হেলিসের গঠন এবং স্থানিক বিন্যাস অনুসারে শ্রেণীবদ্ধ করা হয়। প্রধান প্রকারগুলি হল ডাই-হেলিকাল, ট্রাই-হেলিকাল, টেট্রা-হেলিকাল এবং উইংড এইচটিএইচ। ডাই-হেলিকাল টাইপ হল দুটি হেলিস এবং একটি স্বাধীন ফোল্ডিং প্রোটিন ডোমেন সহ সবচেয়ে সহজ প্রকার। ট্রান্সক্রিপশনাল অ্যাক্টিভেটর Myb-এ ট্রাই-হেলিকাল টাইপ পাওয়া যায়। টেট্রা-হেলিকাল টাইপের একটি অতিরিক্ত সি-টার্মিনাল হেলিক্স রয়েছে। অবশেষে, ডানাযুক্ত HTH 3- হেলিকাল বান্ডেল এবং 3- বা 4- স্ট্র্যান্ড বিটা শীট দ্বারা গঠিত হয়।
হেলিক্স-লুপ-হেলিক্স এবং হেলিক্স-টার্ন-হেলিক্সের মধ্যে মিল কী?
- হেলিক্স-লুপ-হেলিক্স এবং হেলিক্স-টার্ন-হেলিক্স হল প্রোটিন কাঠামোগত মোটিফ৷
- উভয়টিতেই বেসাল এবং নির্দিষ্ট ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টরগুলির একটি সাধারণ হর রয়েছে৷
- এরা ইউক্যারিওটে উপস্থিত।
হেলিক্স-লুপ-হেলিক্স এবং হেলিক্স-টার্ন-হেলিক্সের মধ্যে পার্থক্য কী?
হেলিক্স-লুপ-হেলিক্স প্রোটিন ডাইমারাইজেশনের মধ্যস্থতা করে, যেখানে হেলিক্স-টার্ন-হেলিক্স ডিএনএ বাইন্ডিংয়ের মাধ্যমে জিনের অভিব্যক্তি নিয়ন্ত্রণ করে। সুতরাং, এটি হেলিক্স-লুপ-হেলিক্স এবং হেলিক্স-টার্ন-হেলিক্সের মধ্যে মূল পার্থক্য। এছাড়াও, এইচএলএইচ-এ কিছু প্রোটো-অনকোজিন এবং জিন রয়েছে যা পার্থক্য এনকোডিং ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টরগুলির সাথে জড়িত যেখানে এইচটিএইচ-এ অনেক হোমোটিক জিন রয়েছে যা ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টরগুলির জন্য কোড করে। তদুপরি, হেলিক্স-লুপ-হেলিক্স প্রধানত আলফা-হেলিক্স নিয়ে গঠিত যা একটি লুপ দ্বারা সংযুক্ত থাকে, যখন হেলিক্স-টার্ন-হেলিক্স প্রধানত একটি খাঁজ তৈরি করে একটি ছোট অ্যামিনো অ্যাসিড স্ট্যান্ড দ্বারা সংযুক্ত লুপগুলি নিয়ে গঠিত৷
নিচের ইনফোগ্রাফিক পাশাপাশি তুলনা করার জন্য সারণী আকারে হেলিক্স-লুপ-হেলিক্স এবং হেলিক্স-টার্ন-হেলিক্সের মধ্যে পার্থক্য উপস্থাপন করে৷
সারাংশ – হেলিক্স-লুপ-হেলিক্স বনাম হেলিক্স-টার্ন-হেলিক্স
একটি প্রোটিন মোটিফ হল একটি স্বল্প-সংরক্ষিত ক্রম যা DNA এর স্বতন্ত্র ফাংশনের সাথে যুক্ত।হেলিক্স-লুপ-হেলিক্স এবং হেলিক্স-টার্ন-হেলিক্স দুটি ধরণের প্রোটিন কাঠামোগত মোটিফ। হেলিক্স-লুপ-হেলিক্স এবং হেলিক্স-টার্ন-হেলিক্সের মধ্যে মূল পার্থক্য হল হেলিক্স-লুপ-হেলিক্স প্রোটিন ডাইমারাইজেশনের মধ্যস্থতা করে, যেখানে হেলিক্স-টার্ন-হেলিক্স ডিএনএ বাইন্ডিংয়ের মাধ্যমে জিনের অভিব্যক্তি নিয়ন্ত্রণ করে। HLH হল একটি প্রোটিন স্ট্রাকচারাল মোটিফ যা ডাইমারাইজিং ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টরগুলির বৃহত্তম পরিবারগুলির মধ্যে একটিকে সংজ্ঞায়িত করে। প্রোটিন স্ট্রাকচারাল মোটিফটিতে দুটি α-হেলিস থাকে এবং তারা একটি লুপ দ্বারা সংযুক্ত থাকে। এইচটিএইচ একটি প্রোটিন কাঠামোগত মোটিফ যা ডিএনএ বাঁধতে সক্ষম। প্রতিটি মনোমার দুটি α-হেলিস দিয়ে সংগঠিত হয় এবং একটি ছোট অ্যামিনো অ্যাসিড স্ট্র্যান্ড দ্বারা যুক্ত হয় এবং ডিএনএ হেলিক্সের একটি খাঁজের সাথে আবদ্ধ হয়। সুতরাং, এটি হেলিক্স-লুপ-হেলিক্স এবং হেলিক্স-টার্ন-হেলিক্সের মধ্যে পার্থক্যকে সংক্ষিপ্ত করে।
