SF1 এবং SF2 এর মধ্যে মূল পার্থক্য হল নিউক্লিক অ্যাসিডগুলিকে মুক্ত করার ক্ষমতা। যেখানে SF1 শুধুমাত্র DNA কে আনওয়াইন্ড করে, SF2 DNA এবং RNA উভয়কেই আনওয়াইন্ড করে।
হেলিকেস হল একটি মূল এনজাইম যা ডিএনএ প্রতিলিপি প্রক্রিয়ার পাশাপাশি ডিএনএ মেরামত প্রক্রিয়ায় অংশ নেয়। হেলিকেসের প্রাথমিক ভূমিকা হল ডাবল-স্ট্র্যান্ডেড ডিএনএ অণুগুলির পৃথকীকরণের সুবিধার্থে অনিয়ন্ত্রিত প্রক্রিয়ায় অংশ নেওয়া। ডিএনএ প্রতিলিপির সূচনা পর্যায়ে এনজাইমের কার্যকলাপ অপরিহার্য। হেলিকেসগুলি মূলত তাদের কাঠামোগত পার্থক্যের উপর ভিত্তি করে সুপার ফ্যামিলি 1 এবং সুপার ফ্যামিলি 2 হিসাবে বিভক্ত। প্রতিটি সুপার ফ্যামিলির মধ্যে, আরও বিভিন্ন ধরনের হেলিকেস রয়েছে।
SF1 কি?
সুপার ফ্যামিলি 1 হেলিকেস হল এক ধরনের হেলিকেস যা অভ্যন্তরীণ মূল প্রোটিনের পাশাপাশি একটি হেক্সামেরিক গঠন নিয়ে গঠিত, যা হেলিকেসের কার্যকলাপকে চিত্রিত করে। SF1 হেলিকেস হল হেলিকেসের বৃহত্তম শ্রেণীগুলির মধ্যে একটি এবং SF1A হেলিকেস এবং SF1B হেলিকেস হিসাবে আরও শ্রেণীবদ্ধ করা যেতে পারে। প্রোটিন যেমন PcrA, Rep এবং UvrD, SF1A হেলিকেসের শ্রেণীর অন্তর্গত। তুলনায়, RecA এবং Dda এর মতো প্রোটিনগুলি SF1B হেলিকেসের শ্রেণীর অন্তর্গত। SF1 হেলিকাসের কার্যাবলী ব্যাপকভাবে পরিবর্তিত হয়। SF1 হেলিকেসের কিছু গুরুত্বপূর্ণ কাজগুলির মধ্যে রয়েছে ডিএনএ প্রতিলিপিকরণ, ডিএনএ পুনর্মিলন, ওকাজাকি ফ্র্যাগমেন্ট প্রসেসিং, টেলোমেয়ার গঠন এবং ডিএনএ ক্ষতির নিউক্লিওটাইড এক্সিশন মেরামত। কিছু ব্যাকটেরিয়া প্রজাতিতে, SF1 ধরনের হেলিকেসগুলি অনুভূমিক জিন স্থানান্তরকে সাহায্য করতেও অংশ নেয়। উপরন্তু, ভাইরাসে, SF1 হেলিকেস ভাইরাল প্রতিলিপিতে সাহায্য করে।
চিত্র 01: হেলিকেস অ্যাকশন
SF1 হেলিকেসের গঠনের সাথে যুক্ত অনেকগুলি ভিন্ন মোটিফ রয়েছে। এগুলি বিভিন্ন ধরণের SF1 হেলিকেসের (Q, I, Ia, II, III, IV, V, এবং VI) মধ্যে কমপক্ষে 7টি সংরক্ষিত মোটিফ ধারণ করে। SF1 হেলিকেসের গঠন একটি স্ফটিক, যেখানে মোটিফগুলি একসাথে গুচ্ছবদ্ধ করা হয়। মোটিফ এবং ডিএনএ বাইন্ডিং সাইটের মধ্যে একটি বৈশিষ্ট্যযুক্ত এটিপি বাইন্ডিং পকেট রয়েছে। হেলিকেস অণুর কাঠামোগত অখণ্ডতা বজায় রাখার জন্য অ-সংরক্ষিত ডোমেনগুলি বিতরণ করা হয়। এই ডোমেনগুলি SF1A হেলিকেস এবং SF1B হেলিকেসের মধ্যে পরিবর্তিত হতে পারে৷
SF2 কি?
সুপার ফ্যামিলি 2 হেলিকেস হল হেলিকেস সুপার ফ্যামিলির সবচেয়ে বৈচিত্র্যময় গ্রুপগুলির মধ্যে একটি। অনেক ধরনের SF2 হেলিকেস রয়েছে যেমন RecQ-এর মতো হেলিকেস, RecG-এর মতো হেলিকেস, Rad3/XPD এবং NS3 হেলিকেস। কিছু সীমাবদ্ধতা এনজাইম, যেমন টাইপ I সীমাবদ্ধতা এনজাইমগুলিও এই শ্রেণীর অধীনে পড়ে।SF2 হেলিকেসের সাধারণ কাজ হল ডাবল-স্ট্র্যান্ডেড ডিএনএ-এর আনওয়াইন্ডিং। যাইহোক, কিছু ধরণের SF2 হেলিকেসের সম্পূর্ণরূপে হেলিকেস এনজাইম হিসাবে কাজ করার ক্ষমতা নেই। SF2 helicases ব্যাপকভাবে RNA প্রক্রিয়াকরণেও ব্যবহৃত হয়। ট্রান্সক্রিপশন, স্প্লিসিং, ট্রান্সলেশন প্রসেসিং এবং আরএনএ-প্রোটিন কমপ্লেক্স অ্যাসেম্বলি সহ SF2 হেলিকেসের ডেড-বক্স পরিবার RNA প্রক্রিয়াকরণে অংশ নেয়।
চিত্র 02: হেলিকেস
SF2 হেলিকেসের কাঠামোতে সংরক্ষিত মোটিফও রয়েছে। যাইহোক, কিছু ডোমেইন SF1 হেলিকেসের থেকে কিছুটা আলাদা। এগুলিতে DNA বাইন্ডিং ডোমেন ছাড়াও একটি ATP বাইন্ডিং ডোমেন রয়েছে৷
SF1 এবং SF2 এর মধ্যে মিল কি?
- SF1 এবং SF2 হেলিকেস কার্যকলাপ দেখায়৷
- এছাড়াও, উভয়ই ডিএনএ প্রতিলিপি এবং পুনর্মিলনে অংশ নেয়।
- SF1 এবং SF2 সংরক্ষিত মোটিফের সমন্বয়ে গঠিত।
- উভয়েরই একটি ATP বাইন্ডিং ডোমেন এবং একটি DNA বাইন্ডিং ডোমেন রয়েছে৷
- এই ফর্মগুলি মাল্টি-ডোমেন প্রোটিন।
- এছাড়াও, যদি যেকোন প্রকারেই মিউটেশন ঘটে, তাহলে এর ফলে ক্ষতিকর প্রভাব পড়বে।
- কোষ চক্রের ধারাবাহিকতা নিশ্চিত করতে SF1 এবং SF2 উভয়ই গুরুত্বপূর্ণ৷
- SF1 এবং SF2 প্রোক্যারিওটের পাশাপাশি ইউক্যারিওটে পাওয়া যায়।
SF1 এবং SF2 এর মধ্যে পার্থক্য কী?
SF1 এবং SF2 হল হেলিকেসের দুটি সুপার পরিবার। তারা বিস্তৃত বৈচিত্র্য দেখায়। SF1 এবং SF2 এর মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে SF1 প্রাথমিকভাবে DNA এর আনওয়াইন্ডিংয়ের সাথে জড়িত, যখন SF2 ট্রান্সক্রিপশন এবং অনুবাদের সময় RNA প্রক্রিয়াকরণে অংশ নেয়। প্রোটিনের বিভিন্ন মোটিফের তুলনা করার সময়, SF1 এবং SF2 প্রাথমিকভাবে মোটিফ III এবং মোটিফ IV এর উপর ভিত্তি করে আলাদা। যদিও তাদের কাঠামোগত সাদৃশ্য রয়েছে, SF1 হেলিকেসগুলি টরয়েডাল হেক্সামেরিক কাঠামো গঠন করে যখন SF2 এই কাঠামোগত বিন্যাস গঠন করে না।
SF1 এবং SF2 এর মধ্যে আরেকটি পার্থক্য হল যে SF1 হেলিকেসগুলি অ্যাডেনাইন নিউক্লিওটাইডগুলিকে বেশি পছন্দ করে, যখন SF2 হেলিকেসগুলি খোলার জন্য লক্ষ্য করার জন্য পাঁচটি নিউক্লিওটাইডকে পছন্দ করে। আনওয়াইন্ডিং দিক তুলনা করার সময়, SF1 হেলিকেসগুলি শুধুমাত্র 5’ থেকে 3’ দিকে স্থানান্তরিত হয়, যখন SF2 হেলিকেসগুলি উভয় দিকের নিউক্লিক অ্যাসিডের সাথে স্থানান্তর করার ক্ষমতা রাখে৷
নীচের ইনফোগ্রাফিকটি পাশাপাশি তুলনা করার জন্য সারণী আকারে SF1 এবং SF2 এর মধ্যে পার্থক্য উপস্থাপন করে৷
সারাংশ – SF1 বনাম SF2
হেলিকাসেস হল একটি অত্যন্ত গুরুত্বপূর্ণ এবং বিচিত্র এনজাইমের গ্রুপ যা ডিএনএ প্রতিলিপিতে অংশ নেয়। যাইহোক, এর উচ্চ বৈচিত্র্যের কারণে, এনজাইমগুলি সুপারফ্যামিলিতে শ্রেণীবদ্ধ করা হয়। SF1 এবং SF2 হল হেলিকেসের দুটি বৃহত্তম সুপার পরিবার। যদিও SF1 প্রাথমিকভাবে DNA এর সাথে সম্পর্কিত প্রক্রিয়াকরণের সাথে যুক্ত, SF2 DNA এবং RNA উভয় প্রক্রিয়াকরণের সাথে যুক্ত। সুতরাং, এটি SF1 এবং SF2 এর মধ্যে মূল পার্থক্য। তদুপরি, SF1 এবং SF2 তাদের কাঠামোগত বিন্যাসেও ভিন্ন কারণ SF2 হেক্সামেরিক কাঠামো গঠন করে না।SF1 এবং SF2 হেলিকেসে মিউটেশনগুলি কোষ চক্রের অনিয়ন্ত্রিতকরণ এবং ডিএনএ মেরামতের মতো অন্যান্য গুরুত্বপূর্ণ প্রক্রিয়াগুলির পরে ক্যান্সারের বিকাশের দিকে পরিচালিত করবে৷
