Coomassie এবং সিলভার স্টেনিং এর মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে coomassie staining হল একটি প্রোটিন স্টেনিং কৌশল যা একটি coomassie উজ্জ্বল নীল দাগ ব্যবহার করে, যখন স্লাইভার স্টেনিং হল একটি প্রোটিন স্টেনিং কৌশল যা একটি রূপালী দাগ ব্যবহার করে৷
প্রোটিন বিচ্ছেদ এবং সনাক্তকরণ প্রোটিওম বিশ্লেষণের গুরুত্বপূর্ণ পদক্ষেপ। জেল ইলেক্ট্রোফোরসিসের পরে তাদের উচ্চ-রেজোলিউশন প্রোটিন চরিত্রায়ন প্রয়োজন। অসংখ্য দাগ দেওয়ার কৌশল রয়েছে যার মধ্যে রয়েছে বিভিন্ন দাগ যেমন অ্যানিওনিক রঞ্জক (কুম্যাসি ব্রিলিয়ান্ট ব্লু), ধাতব ক্যাশন (ইমিডাজল-জিঙ্ক), সিলভার স্টেন এবং ফ্লুরোসেন্ট রঞ্জক ইত্যাদি। কখনও কখনও তেজস্ক্রিয় প্রোবগুলিও ব্যবহার করা যেতে পারে।স্টেনিং কৌশলের পছন্দ সরলতা, পরীক্ষাগারে ইমেজিং সরঞ্জামের প্রাপ্যতা ইত্যাদির উপর নির্ভর করে।
Coomassie স্টেনিং কি?
Coomassie স্টেনিং হল একটি প্রোটিন স্টেনিং কৌশল যা একটি coomassie উজ্জ্বল নীল দাগ ব্যবহার করে। এটিকে সাধারণত coomassie blue কৌশল বলা হয়। Coomassie ব্রিলিয়ান্ট ব্লু হল সবচেয়ে জনপ্রিয় অ্যানিওনিক প্রোটিন-ডাই। এই দাগটি সাধারণত মাঝারি সংবেদনশীলতায় ভাল পরিমাণগত রৈখিকতার সাথে প্রায় সমস্ত প্রোটিনকে দাগ দেয়। Coomassie উজ্জ্বল নীল দাগ অ-বিশেষভাবে প্রায় সমস্ত প্রোটিনের সাথে আবদ্ধ করে। দুটি ভিন্ন coomassie উজ্জ্বল নীল দাগের রূপ আছে: R-250 এবং G-250। R-250 কম দাগ দেওয়ার সময় অফার করে, যখন G-250 আরও সংবেদনশীল এবং পরিবেশ বান্ধব ফর্মুলেশনে পাওয়া যায়।
চিত্র 01: কুমাসি স্টেনিং
Coomassie রঞ্জকগুলি ভর স্পেকট্রোমেট্রি অধ্যয়ন এবং প্রোটিন সনাক্তকরণ গবেষণায় খুব জনপ্রিয়। তাছাড়া, জৈব-নিরাপদ কুম্যাসি স্টেইন হল কুম্যাসি ব্লু জি-250-এর একটি অ-বিপজ্জনক ফর্মুলেশন যা বর্তমানে বাজারে পাওয়া যাচ্ছে। এই ফর্মুলেশনের সুবিধা হল এটি ধুয়ে ফেলার জন্য শুধুমাত্র জল প্রয়োজন। জৈব-নিরাপদ কুমাসি দাগ প্রচলিত কুম্যাসি ব্লু জি-250-এর সমতুল্য সংবেদনশীলতা প্রদান করে কিন্তু কোম্যাসি স্টেইন R-250-এর চেয়ে ভাল। তদ্ব্যতীত, এটিতে প্রচলিত Coomassie নীল G-250 এর চেয়ে সহজ এবং দ্রুত স্টেনিং প্রোটোকল রয়েছে। কুম্যাসি ব্লু স্টেনিংয়ের ত্রুটি হল যে এটি রূপালী দাগের তুলনায় কম সংবেদনশীল। Coomassie ব্লু স্টেনিং রূপালী দাগের চেয়ে প্রায় 50-গুণ কম সংবেদনশীল। যাইহোক, বাঁধাই এর সরলতার কারণে, এটি অনেক গবেষণায় পছন্দ করা হয়।
সিলভার স্টেনিং কি?
সিলভার স্টেনিং হল একটি প্রোটিন স্টেনিং কৌশল যা সিলভার স্টেন ব্যবহার করে।সিলভার স্টেনিং এগারোজ এবং পলিঅ্যাক্রিলামাইড জেল উভয়ই দাগ দিতে ব্যবহৃত হয়। অ্যাগারোজ জেলে প্রোটিনের রূপালী দাগ প্রথম 1973 সালে কেরেনি এবং গ্যালিয়াস দ্বারা বিকশিত হয়েছিল। পরে, এটি এসডিএস-পেজে ব্যবহৃত পলিঅ্যাক্রিলামাইড জেলগুলিতে প্রোটিনের জন্য অভিযোজিত হয়েছিল। বর্তমানে, সিলভার স্টেনিং ডিএনএ বা আরএনএ দাগ দেওয়ার জন্যও ব্যবহৃত হয়। জেলগুলিকে দাগ দেওয়ার জন্য, এই পদ্ধতিতে জেলগুলিকে সিলভার নাইট্রেট দ্রবণ দিয়ে ইনকিউব করা হয়। বাদামী থেকে কালো পর্যন্ত প্রোটিন বিদ্যমান যেখানে সিলভার স্টেনিং সাইটগুলিকে দাগ দেয়৷
চিত্র 02: রূপালী দাগ
রূপালী দাগের তীব্রতা প্রোটিনের প্রাথমিক কাঠামোর উপর নির্ভর করে। অধিকন্তু, ব্যবহৃত পাত্রগুলির পরিচ্ছন্নতা এবং বিকারকগুলির বিশুদ্ধতাও রূপালী দাগের গুণমানকে প্রভাবিত করতে পারে।যাইহোক, সিলভার স্টেনিংয়ের ত্রুটি হল যে এটি সমস্ত প্রোটিন সনাক্ত করতে অক্ষম, বিশেষ করে গ্লাইকোপ্রোটিন এবং প্রোটিনগুলি তাদের পাশের চেইনের সাথে সংযুক্ত বড় পরিবর্তিত গোষ্ঠীগুলির সাথে৷
Coomassie এবং সিলভার স্টেনিংয়ের মধ্যে মিল কী?
- Coomassie এবং সিলভার স্টেনিং হল প্রোটিন স্টেনিংয়ে ব্যবহৃত দুটি কৌশল।
- এরা প্রোটিন এবং ডিএনএ উভয়কেই দাগ দিতে পারে।
- দাগ দেওয়ার উভয় কৌশলেরই ত্রুটি রয়েছে।
- এই কৌশলগুলির অনুরূপ পদক্ষেপ রয়েছে, যেমন ঠিক করা, দাগ দেওয়া এবং আটকানো৷
Coomassie এবং সিলভার স্টেনিংয়ের মধ্যে পার্থক্য কী?
Coomassie staining হল একটি প্রোটিন স্টেনিং কৌশল যা coomassie উজ্জ্বল নীল দাগ ব্যবহার করে, যখন স্লাইভার স্টেনিং হল একটি প্রোটিন স্টেনিং কৌশল যা রূপালী দাগ ব্যবহার করে। সুতরাং, এটি Coomassie এবং সিলভার স্টেনিংয়ের মধ্যে মূল পার্থক্য। উপরন্তু, Coomassie স্টেনিং রূপালী দাগের চেয়ে কম সংবেদনশীল।
নীচের ইনফোগ্রাফিক পাশাপাশি তুলনা করার জন্য ছক আকারে Coomassie এবং রূপালী দাগের মধ্যে পার্থক্যগুলি তালিকাভুক্ত করে৷
সারাংশ – Coomassie বনাম সিলভার স্টেনিং
প্রোটিন কল্পনা করতে, একটি প্রোটিন-নির্দিষ্ট রঞ্জক বাঁধাই বা রঙ উত্পাদনকারী রাসায়নিক বিক্রিয়া করা যেতে পারে। একে প্রোটিন স্টেনিং বলা হয়। কুমাসি এবং সিলভার স্টেনিং প্রোটিন স্টেনিংয়ে ব্যবহৃত দুটি কৌশল। Coomassie staining কৌশল coomassie ব্রিলিয়ান্ট ব্লু স্টেন ব্যবহার করে যখন স্লাইভার স্টেনিং সিলভার স্টেন ব্যবহার করে। সুতরাং, এটি Coomassie এবং সিলভার স্টেনিংয়ের মধ্যে মূল পার্থক্য৷
