শাইন ডালগার্নো এবং কোজাক সিকোয়েন্সের মধ্যে মূল পার্থক্য হল শাইন ডালগার্নো সিকোয়েন্স হল ব্যাকটেরিয়া এবং আর্চিয়াল মেসেঞ্জার RNA-তে একটি রাইবোসোমাল বাইন্ডিং সাইট, যখন কোজাক সিকোয়েন্স হল বেশিরভাগ ইউক্যারিওটিক মেসেঞ্জার RNA-তে প্রোটিন অনুবাদ সূচনা সাইট।
Shine Dalgarno এবং Kozak ক্রম দুটি ঐকমত্যের ক্রম যা অনুবাদ শুরুর জন্য খুবই গুরুত্বপূর্ণ। আণবিক জীববিজ্ঞানে, অনুবাদ হল সেই প্রক্রিয়া যার মাধ্যমে সাইটোপ্লাজমের রাইবোসোমগুলি ট্রান্সক্রিপশন প্রক্রিয়ার পরে প্রোটিন সংশ্লেষিত করে। অনুবাদে, নিউক্লিয়াসের বাইরে একটি নির্দিষ্ট অ্যামিনো অ্যাসিড শৃঙ্খল তৈরি করার জন্য একটি এমআরএনএ (মেসেঞ্জার আরএনএ) একটি রাইবোসোমে ডিকোড করা হয়।সাধারণত, একটি রাইবোসোম এমআরএনএ কোডনের পরিপূরক টিআরএনএ অ্যান্টিকোডন সিকোয়েন্সের আবদ্ধতাকে সহজতর করে ডিকোডিং প্রক্রিয়াকে প্ররোচিত করে। অনুবাদ তিনটি পর্যায়ে চলে: দীক্ষা, প্রসারণ এবং সমাপ্তি৷
শাইন ডালগারনো সিকোয়েন্স কি?
শাইন ডালগারনো সিকোয়েন্স হল ব্যাকটেরিয়া এবং আর্চিয়াল মেসেঞ্জার RNA-তে রাইবোসোমাল বাইন্ডিং সাইট। এটি সাধারণত স্টার্ট কোডন AUG এর প্রায় 8 বেস আপস্ট্রিমে অবস্থিত। এই RNA ক্রমটি mRNA স্টার্ট কোডনের সাথে রাইবোসোম সারিবদ্ধ করে মেসেঞ্জার RNA-তে রাইবোসোম নিয়োগ করতে সাহায্য করে। এইভাবে, এটি প্রোটিন সংশ্লেষণ শুরু করে। একবার নিয়োগের পরে, tRNA এমআরএনএ কোডন দ্বারা নির্দেশিত ক্রম অনুসারে অ্যামিনো অ্যাসিড যোগ করতে পারে। এই বিশেষ ক্রমটি ব্যাকটেরিয়ায় সাধারণ কিন্তু আর্কিয়ায় বিরল। তদুপরি, এটি ক্লোরোপ্লাস্ট এবং মাইটোকন্ড্রিয়াল ট্রান্সক্রিপ্টগুলিতেও উপস্থিত রয়েছে। শাইন ডালগারনো সিকোয়েন্স প্রথম প্রস্তাব করেছিলেন অস্ট্রেলিয়ান বিজ্ঞানী জন শাইন এবং লিন ডালগারনো। ছয়টি বেস কনসেনসাস সিকোয়েন্স হল AGGAGG। উদাহরণস্বরূপ, Escherichia coli-এ ক্রমটি হল AGGAGGU।
চিত্র 01: শাইন ডালগারনো সিকোয়েন্স
দীক্ষা স্থান নির্বাচন (AUG) নির্ভর করে রাইবোসোম এবং mRNA টেমপ্লেটের 30S সাবইউনিটের মধ্যে মিথস্ক্রিয়ার উপর। 30S সাবইউনিটের 16srRNA উপাদানের পাইরিমিডিন সমৃদ্ধ অঞ্চলটি পিউরিন-সমৃদ্ধ অঞ্চলের সাথে আবদ্ধ হয় যা mRNA-তে AUG ইনিশিয়েশন কোডনের শাইন ডালগার্নো সিকোয়েন্স আপস্ট্রিম নামে পরিচিত। তদ্ব্যতীত, ইনিশিয়েশন কমপ্লেক্স গঠনের সময়, এই সম্পূরক নিউক্লিওটাইড সিকোয়েন্সগুলি জোড়ায় জোড়ায় জোড়ায় জোড়ায় জোড়ায় জোড়ায় RNA কাঠামো তৈরি করে। এটি এমআরএনএ-কে রাইবোসোমের সাথে এমনভাবে আবদ্ধ করতে সহায়তা করে যাতে ইনিশিয়েশন কোডনটি রাইবোসোমের P সাইটে স্থাপন করা হয়।
কোজাক সিকোয়েন্স কি?
কোজাক সিকোয়েন্স হল বেশিরভাগ ইউক্যারিওটিক এমআরএনএ-তে প্রোটিন অনুবাদ শুরু করার সাইট।এই ক্রমটিকে কোজাক কনসেনসাস সিকোয়েন্সও বলা হয়। কোজাক সিকোয়েন্স হল ইউক্যারিওটে অনুবাদ শুরু করার জন্য সর্বোত্তম ক্রম। এই ক্রমটি প্রোটিন নিয়ন্ত্রণের একটি অবিচ্ছেদ্য দিক। এটি সামগ্রিক সেলুলার স্বাস্থ্যের জন্যও খুব গুরুত্বপূর্ণ। এটি রাইবোসোম সমাবেশ এবং অনুবাদের সূচনা মধ্যস্থতার মাধ্যমে জেনেটিক বার্তা থেকে প্রোটিন অনুবাদকে সঠিক করতে সাহায্য করে।
চিত্র 02: কোজাক সিকোয়েন্স
এই ক্রমটির নামকরণ করা হয়েছিল বিজ্ঞানী মেরিলিন কোজাকের নামে। তিনি ডিএনএ জিনোমিক সিকোয়েন্সের বিশদ বিশ্লেষণের মাধ্যমে এটি আবিষ্কার করেছিলেন। কোজাক সিকোয়েন্স হল 5’ (gcc) gccRccAUGG-3’। বড় হাতের অক্ষরগুলি সংরক্ষিত ঘাঁটি নির্দেশ করে, যখন ছোট হাতের অক্ষরগুলি সাধারণ পরিবর্তনশীল ঘাঁটি নির্দেশ করে। R একটি পিউরিন (অ্যাডেনাইন বা গুয়ানিন) নির্দেশ করে যা সর্বদা এই অবস্থানে থাকে।
শাইন ডালগারনো এবং কোজাক সিকোয়েন্সের মধ্যে মিল কী?
- শাইন ডালগার্নো এবং কোজাক সিকোয়েন্স হল দুটি ঐকমত্যের ক্রম যা অনুবাদ শুরুতে খুবই গুরুত্বপূর্ণ৷
- দুটিই আরএনএ সিকোয়েন্স।
- রাইবোসোমের ছোট সাবইউনিট উভয় ক্রমকে আবদ্ধ করে।
- উভয় ক্রমই সঠিক রাইবোসোম সমাবেশ এবং অনুবাদের সূচনার মধ্যস্থতা করে।
- এগুলি প্রোটিন নিয়ন্ত্রণ এবং সামগ্রিক সেলুলার স্বাস্থ্যের অবিচ্ছেদ্য দিক৷
শাইন ডালগারনো এবং কোজাক সিকোয়েন্সের মধ্যে পার্থক্য কী?
শাইন ডালগারনো সিকোয়েন্স হল একটি রাইবোসোমাল বাইন্ডিং সাইট যা ব্যাকটেরিয়া এবং আর্চিয়াল মেসেঞ্জার RNA-তে পাওয়া যায়, যখন কোজাক সিকোয়েন্স হল একটি প্রোটিন অনুবাদ সূচনা সাইট যা বেশিরভাগ ইউক্যারিওটিক মেসেঞ্জার RNA-তে পাওয়া যায়। সুতরাং, এটি শাইন ডালগারনো এবং কোজাক সিকোয়েন্সের মধ্যে মূল পার্থক্য। অধিকন্তু, শাইন ডালগারনো সিকোয়েন্স হল 5’AGGAGGU3’ যখন, কোজাক সিকোয়েন্স হল 5’ (gcc) gccRccAUGG-3’।
নিম্নলিখিত ইনফোগ্রাফিকটি পাশাপাশি তুলনা করার জন্য সারণী আকারে শাইন ডালগার্নো এবং কোজাক সিকোয়েন্সের মধ্যে পার্থক্যগুলি তালিকাভুক্ত করে৷
সারাংশ – শাইন ডালগার্নো বনাম কোজাক সিকোয়েন্স
শাইন ডালগার্নো এবং কোজাক সিকোয়েন্স হল দুটি ঐকমত্য RNA সিকোয়েন্স যা রাইবোসোম সমাবেশ এবং অনুবাদ শুরুর জন্য খুবই গুরুত্বপূর্ণ। শাইন ডালগার্নো সিকোয়েন্স হল ব্যাকটেরিয়া এবং আর্চিয়াল মেসেঞ্জার আরএনএ-তে একটি রাইবোসোমাল বাইন্ডিং সাইট, যখন কোজাক সিকোয়েন্স হল বেশিরভাগ ইউক্যারিওটিক মেসেঞ্জার আরএনএ-তে প্রোটিন অনুবাদ সূচনা সাইট। এইভাবে, এটি শাইন ডালগারনো এবং কোজাক সিকোয়েন্সের মধ্যে পার্থক্যকে সংক্ষিপ্ত করে।
