প্রোটিন সাবুনিট এবং ডোমেনের মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে একটি প্রোটিন সাবুনিট হল একটি প্রোটিনের একটি পৃথক পলিপেপটাইড চেইন যা অন্যান্য পলিপেপটাইড চেইনের সাথে একত্রিত হয়ে একটি প্রোটিন কমপ্লেক্স তৈরি করে যখন, একটি প্রোটিন ডোমেন হল পলিপেপটাইড চেইনের একটি সংলগ্ন অঞ্চল। একটি প্রোটিনের যা প্রায়শই একটি কমপ্যাক্ট, স্থানীয় এবং আধা-স্বাধীন ইউনিটে স্বাধীনভাবে ভাঁজ করে৷
প্রোটিন সাবুনিট এবং ডোমেন একটি মাল্টিমেরিক প্রোটিনের অত্যন্ত গুরুত্বপূর্ণ অংশ। প্রোটিন হল পলিপেপটাইড থেকে তৈরি পলিমার। প্রতিটি পলিপেপটাইড চেইন একটি অ্যামিনো অ্যাসিড নামে পরিচিত একটি মনোমার থেকে তৈরি হয়। একটি জটিল প্রোটিনে স্বতন্ত্র কাঠামোগত একক থাকে যেমন সাবুনিট, ডোমেন, মোটিফ এবং ভাঁজ।একটি জটিল প্রোটিনের এই কাঠামোগত এককগুলি এর গঠন এবং শেষ পর্যন্ত এর কাজের জন্য অত্যন্ত গুরুত্বপূর্ণ।
প্রোটিন সাবুনিট কি?
একটি প্রোটিন সাবুনিট একটি প্রোটিনের একটি পৃথক পলিপেপটাইড চেইন যা অন্যান্য পলিপেপটাইড চেইনের সাথে একত্রিত হয়ে একটি প্রোটিন কমপ্লেক্স তৈরি করে। স্ট্রাকচারাল বায়োলজিতে, একটি প্রোটিন সাবুনিট হল একটি একক প্রোটিন অণু যা অন্যান্য প্রোটিন অণুর সাথে একত্রিত হয়ে একটি প্রোটিন কমপ্লেক্স তৈরি করে। প্রাকৃতিকভাবে উৎপন্ন প্রোটিনে তুলনামূলকভাবে অল্প সংখ্যক সাবুনিট থাকে, যেমন হিমোগ্লোবিন এবং ডিএনএ পলিমারেজ। অতএব, তাদের অলিগোমেরিক বলা হয়। অন্যান্য প্রোটিনগুলিতে প্রচুর পরিমাণে সাবুনিট থাকে, তাই তাদের মাল্টিমেরিক হিসাবে বর্ণনা করা হয়। উদাহরণস্বরূপ, মাইক্রোটিউবুলস এবং অন্যান্য সাইটোস্কেলটন প্রোটিন মাল্টিমেরিক। মাল্টিমেরিক প্রোটিনের সাবইউনিটগুলি অভিন্ন (সমজাতীয়) বা সম্পূর্ণ ভিন্ন (হেটেরোলগাস) হতে পারে।
চিত্র 01: প্রোটিন সাবুনিট
কিছু মাল্টিমেরিক প্রোটিনে, একটি সাবুনিট একটি অনুঘটক সাবুনিট হতে পারে। অন্যদিকে, অন্যটি একটি নিয়ন্ত্রক সাবইউনিট। অনুঘটক সাবুনিটের কাজটি এনজাইমেটিক প্রতিক্রিয়াকে অনুঘটক করছে যেখানে, নিয়ন্ত্রক সাবুনিটের কাজটি এর কার্যকলাপকে সহজতর বা বাধা দিচ্ছে। একটি এনজাইম যা অনুঘটক এবং নিয়ন্ত্রক সাবইউনিট উভয়ই নিয়ে গঠিত যখন একত্রিত হয় তাকে সাধারণত হলোএনজাইম হিসাবে উল্লেখ করা হয়। উদাহরণস্বরূপ, এনজাইম ক্লাস I phosphoinositide 3-kinase এর একটি p110 অনুঘটক সাবুনিট এবং একটি p85 নিয়ন্ত্রক সাবুনিট রয়েছে। অধিকন্তু, একটি প্রোটিনের প্রতিটি সাবুনিটের জন্য একটি জিন থাকতে হবে। এর কারণ হল একটি সাবুনিট একটি পৃথক পলিপেপটাইড চেইন দিয়ে গঠিত যার একটি কোডিং জিন রয়েছে৷
প্রোটিন ডোমেন কি?
একটি প্রোটিন ডোমেন হল একটি প্রোটিনের পলিপেপটাইড চেইনের একটি সংলগ্ন অঞ্চল যা ঘন ঘন একটি কমপ্যাক্ট, স্থানীয় এবং আধা-স্বাধীন ইউনিটে স্বাধীনভাবে ভাঁজ করে।প্রোটিনের ডোমেইনটি প্রোটিনের পলিপেপটাইড চেইনের একটি অঞ্চল হিসাবেও পরিচিত যা স্ব-স্থিতিশীল এবং বাকি অংশ থেকে স্বাধীনভাবে ভাঁজ করে। এগুলি একটি প্রোটিনের একটি স্বতন্ত্র কাঠামোগত এবং কার্যকরী একক। সাধারণত, ডোমেনগুলি একটি নির্দিষ্ট ফাংশন বা একটি মিথস্ক্রিয়া যা প্রোটিনের সামগ্রিক ভূমিকাতে অবদান রাখে তার জন্য দায়ী। উদাহরণস্বরূপ, SH3 ডোমেনে প্রায় 50টি অ্যামিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশ রয়েছে। এগুলি অ্যাডাপ্টার প্রোটিন, phophatidylinositol3-kinases, phospholipases, এবং myosins সহ বিভিন্ন প্রোটিনের মধ্যে ঘটে। এই SH3 ডোমেইনগুলি প্রোটিন-প্রোটিন মিথস্ক্রিয়ায় জড়িত৷
চিত্র 02: প্রোটিন ডোমেন
ডোমেনগুলির দৈর্ঘ্য 50 অ্যামিনো অ্যাসিড থেকে 250 অ্যামিনো অ্যাসিড পর্যন্ত পরিবর্তিত হয়৷ দস্তা আঙুলের মতো সংক্ষিপ্ততম ডোমেনগুলি ধাতব আয়ন এবং ডিসালফাইড ব্রিজ দ্বারা স্থিতিশীল হয়।একটি ডোমেইন প্রায়শই ক্যালমোডুলিনের ক্যালসিয়াম-বাইন্ডিং EF-হ্যান্ড ডোমেনের মতো কার্যকরী ইউনিট তৈরি করে। অধিকন্তু, চিমেরিক প্রোটিন তৈরির জন্য ডোমেনগুলি জেনেটিক ইঞ্জিনিয়ারিংয়ের মাধ্যমে একটি প্রোটিনের মধ্যে অন্য প্রোটিনের মধ্যে অদলবদল করা যেতে পারে৷
প্রোটিন সাবুনিট এবং ডোমেনের মধ্যে মিল কী?
- প্রোটিন সাবইউনিট এবং ডোমেন হল মাল্টিমেরিক প্রোটিনের কাঠামোগত একক।
- দুটিই অ্যামিনো অ্যাসিড দিয়ে তৈরি।
- এগুলি "পলিপেপটাইড চেইন" শব্দটির সাথে সংযুক্ত।
- এছাড়াও, এগুলি উভয়ই প্রোটিনের সামগ্রিক কার্যকারিতার জন্য অত্যন্ত গুরুত্বপূর্ণ৷
প্রোটিন সাবুনিট এবং ডোমেনের মধ্যে পার্থক্য কী?
একটি প্রোটিন সাবুনিট একটি প্রোটিনের একটি পৃথক পলিপেপটাইড চেইন যা অন্যান্য পলিপেপটাইড চেইনের সাথে একত্রিত হয়ে একটি প্রোটিন কমপ্লেক্স তৈরি করে। অন্যদিকে, একটি প্রোটিন ডোমেন হল একটি প্রোটিনের পলিপেপটাইড চেইনের একটি সংলগ্ন অঞ্চল যা ঘন ঘন একটি কমপ্যাক্ট, স্থানীয় এবং আধা-স্বাধীন ইউনিটে স্বাধীনভাবে ভাঁজ করে।সুতরাং, এটি প্রোটিন সাবুনিট এবং ডোমেনের মধ্যে মূল পার্থক্য। অধিকন্তু, একটি প্রোটিন সাবুনিট একটি প্রোটিন ডোমেনের চেয়ে আকারে বড়৷
নিম্নলিখিত সারণীটি সারণী আকারে প্রোটিন সাবুনিট এবং ডোমেনের মধ্যে পার্থক্য সংক্ষিপ্ত করে৷
সারাংশ – প্রোটিন সাবুনিট বনাম ডোমেন
প্রোটিনের বিল্ডিং ব্লক হল অ্যামিনো অ্যাসিড। অ্যামিনো অ্যাসিডের ঘনীভবনের মাধ্যমে প্রোটিন তৈরি হয়। প্রোটিন গঠনের আকার দশ থেকে কয়েক হাজার অ্যামিনো অ্যাসিড পর্যন্ত। একটি প্রোটিন গঠন অ-সমযোজী মিথস্ক্রিয়া যেমন হাইড্রোজেন বন্ড, আয়নিক বন্ধন, ভ্যান ডার ওয়ালস বাহিনী, হাইড্রোফোবিক বন্ধন এবং ডাইসলফাইড বন্ডের মতো সমযোজী মিথস্ক্রিয়া দ্বারা স্থিতিশীল হয়। একটি জটিল প্রোটিনে স্বতন্ত্র কাঠামোগত একক থাকে যেমন সাবুনিট, ডোমেন, মোটিফ এবং ভাঁজ। একটি প্রোটিন সাবুনিট হল একটি প্রোটিনের একটি পৃথক পলিপেপটাইড চেইন যা অন্যান্য পলিপেপটাইড চেইনের সাথে একত্রিত হয়ে একটি প্রোটিন কমপ্লেক্স তৈরি করে। অন্যদিকে, প্রোটিন ডোমেইন হল প্রোটিনের পলিপেপটাইড চেইনের একটি অঞ্চল যা স্ব-স্থিতিশীল এবং বাকি অংশ থেকে স্বাধীনভাবে ভাঁজ করে।সুতরাং, এটি হল প্রোটিন সাবইউনিট এবং ডোমেনের মধ্যে পার্থক্যের সারাংশ।