মূল পার্থক্য – RNASE A বনাম RNASE H
রাইবোনিউক্লিজ হল নিউক্লিয়াস যা বিশেষভাবে RNA কে ছোট এককে পরিণত করে। তাদের দুই ভাগে ভাগ করা যায়; এন্ডোরিবোনিউক্লেজ এবং এক্সোরিবোনুক্লিজ। এন্ডোরিবোনুক্লিজ হল একটি এন্ডোনিউক্লিজ যা হয় একক স্ট্র্যান্ডেড বা ডাবল স্ট্র্যান্ডেড আরএনএকে অবনমিত করতে পারে। এটি একটি আরএনএ পলিনিউক্লিওটাইড চেইনের মধ্যে ফসফোডিস্টার বন্ধনগুলিকে ছিন্ন করে। উদাহরণ হল RNase A, RNase III, RNase T1, RNase P এবং RNase H. Exoribonuclease হল একটি exonuclease যা RNA অণুর 5’প্রান্ত বা 3’প্রান্ত থেকে টার্মিনাল নিউক্লিওটাইডগুলিকে অপসারণ করে আরএনএকে ক্ষয় করে। উদাহরণ হল RNase R, RNase II, RNase D এবং RNase PH।RNASE A এবং RNASE H এর মধ্যে মূল পার্থক্য হল RNase A হল একটি অগ্ন্যাশয় রাইবোনিউক্লিজ যা বিশেষভাবে একক-স্ট্রেন্ডেড RNA কে ছোট ছোট উপাদানে পরিণত করে যখন RNase H হল একটি অ-নির্দিষ্ট এনজাইম যা RNA-DNA হাইব্রিডের RNA কে ছোট ইউনিটে বিভক্ত করে। হাইড্রোলাইটিক মেকানিজম।
RNASE A কি?
RNase A হল একটি অগ্ন্যাশয় রাইবোনিউক্লিজ যা বিশেষভাবে একক-স্ট্র্যান্ডেড RNA-এর 3’ প্রান্তে জোড়াবিহীন সাইটোসিন এবং ইউরাসিল অবশিষ্টাংশগুলিকে ক্লিভ করে। RNase H একটি উচ্চতর লবণের ঘনত্বে (0.3M বা উচ্চতর NaCl ঘনত্ব) কাজ করে। হাইড্রোলাইটিক প্রতিক্রিয়া দুটি ধাপ। এটি 2', 3' সাইক্লিক মনোফসফেট ইন্টারমিডিয়েটের মাধ্যমে একটি 3’ ফসফরিলেটেড পণ্য গঠন করে। যদিও এটি উচ্চতর লবণের ঘনত্বে একক-স্ট্রেন্ডেড RNA-এর জন্য নির্দিষ্ট, তবে এটি নিম্ন NaCl ঘনত্বে (0.3M NaCl-এর চেয়ে কম) RNA-DNA হাইব্রিড-এ ডাবল-স্ট্র্যান্ডেড RNA এবং RNA-কে ক্ষয় করতে পারে।
ব্রুস মেরিফিল্ড প্রথম এই এনজাইম সংশ্লেষিত করেন। RNase A আণবিক গবেষণায় একটি খুব জনপ্রিয় এনজাইম।বোভাইন প্যানক্রিয়াটিক RNase A হল RNase A এর একটি উদাহরণ। এবং এটি পরীক্ষাগারে ব্যবহৃত সবচেয়ে কঠিন এনজাইমগুলির মধ্যে একটি। এই এনজাইমের কার্যকলাপের জন্য কোফ্যাক্টরের প্রয়োজন নেই। এটি একটি অত্যন্ত থার্মোস্টেবল এনজাইম। RNase A হল প্রথম এনজাইম এবং তৃতীয় প্রোটিন যার একটি সঠিক অ্যামিনো অ্যাসিড ক্রম সনাক্ত করা হয়েছিল। এই এনজাইমটি 124 অ্যামিনো অ্যাসিড এবং 12600da এর আণবিক ভর সহ খুব ছোট। এবং এর চারটি হিস্টিডিন অবশিষ্টাংশ রয়েছে (তার 12 এবং তার 119 যা অনুঘটক বিক্রিয়ায় জড়িত)।
চিত্র 01: RNase A
RNase A একটি অপরিশোধিত নমুনা ফুটিয়ে আলাদা করা যেতে পারে। যখন ফোঁড়া হয়, তখন অন্যান্য সমস্ত এনজাইম অবশিষ্ট RNase A ক্ষয় করে। RNase A একটি আশ্চর্যজনকভাবে স্থিতিশীল এনজাইম। এই এনজাইম রিবোনিউক্লিজ ইনহিবিটর প্রোটিন, ভারী ধাতু এবং ইউরিডিন ভ্যানাডেট কমপ্লেক্সের সাথে বাধা দেয়।
RNase H কি?
RNase H হল একটি অনির্দিষ্ট রাইবোনিউক্লিজ এনজাইম যা হাইড্রোলাইটিক বিক্রিয়ার মাধ্যমে RNA-DNA হাইব্রিডের RNA-কে ক্ষয় করতে পারে। RNase H একটি RNA-DNA হাইব্রিডে RNA-এর 3’- O-P বন্ধনকে ছিন্ন করে। শেষ পর্যন্ত এটি 3'OH এবং 5' ফসফেট সমাপ্ত পণ্য উত্পাদন করে। ডিএনএ প্রতিলিপিতে এটি নতুন ডিএনএ স্ট্র্যান্ড তৈরি হওয়ার পরে আরএনএ প্রাইমার অপসারণ করে একটি গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে। পরীক্ষাগার অবস্থায়, এটি বিশেষভাবে RNA-DNA হাইব্রিডে RNA-কে ক্ষয় করে কিন্তু DNA এবং unhybridized RNA নয়। এবং এই এনজাইমটি সাধারণত সিডিএনএ সংশ্লেষণের সময় প্রথম পরিপূরক ডিএনএ স্ট্র্যান্ড তৈরি হওয়ার পরে আরএনএ টেমপ্লেটকে ধ্বংস করতে ব্যবহৃত হয়।
চিত্র 02: RNase H
RNase H নিউক্লিজ সুরক্ষা অ্যাসেসেও ব্যবহার করে। এটি এমআরএনএ থেকে পলি এ টেইল অপসারণের জন্যও অন্তর্ভুক্ত করা যেতে পারে। RNase H কোষের ভিতরে এবং বাইরে নন-কোডিং RNA ধ্বংস করার ক্ষমতা রাখে।এই প্রোটিন ক্রিয়াকলাপের জন্য ধাতু আয়নগুলি সহকারক হিসাবে প্রয়োজন। একটি চেলেটর (EDTA) RNase H এনজাইমকে বাধা দিতে ব্যবহার করা যেতে পারে।
RNASE A এবং RNASE H এর মধ্যে মিল কি?
- দুটিই প্রকৃতির প্রোটিন।
- দুটিই এন্ডোরিবোনুক্লিজ
- উভয়ই আরএনএ ক্ষয় করতে পারে।
- উভয়েই হাইড্রোলাইটিক প্রতিক্রিয়া সম্পাদন করে।
- আণবিক পরীক্ষাগারগুলি এই দুটিই ব্যবহার করে।
RNASE A এবং RNASE H এর মধ্যে পার্থক্য কি?
RNASE A বনাম RNASE H |
|
RNase A হল একটি অগ্ন্যাশয়ের রাইবোনিউক্লিজ যা বিশেষভাবে উচ্চতর লবণের ঘনত্বে একক-স্ট্রেন্ডেড RNA-এর জোড়াবিহীন সাইটোসিন এবং ইউরাসিল অবশিষ্টাংশের 3’ প্রান্তকে ক্লিভ করে। | RNase H হল একটি অনির্দিষ্ট রাইবোনিউক্লিজ এনজাইম যা হাইড্রোলাইটিক বিক্রিয়ার মাধ্যমে RNA-DNA হাইব্রিডে RNA-কে অবনমিত করতে পারে। |
RNA ক্লিভিং এর প্রকৃতি | |
RNase A বিশেষভাবে উচ্চতর লবণের ঘনত্বে একক-স্ট্রেন্ডেড RNA ক্লিভ করে। | RNase H RNA- DNA হাইব্রিডে RNA ছিঁড়ে। |
ক্রিয়াকলাপের জন্য সহ-কারকের প্রয়োজন | |
RNase A এর কার্যকলাপের জন্য কোফ্যাক্টরের প্রয়োজন নেই। | RNase H এর ক্রিয়াকলাপের জন্য সহকারক হিসাবে ধাতব আয়ন প্রয়োজন৷ |
প্রোটিন কার্যকলাপ প্রতিরোধক | |
রিবোনুক্লিজ ইনহিবিটর প্রোটিন, ভারী ধাতু এবং ইউরিডিন ভ্যানাডেট কমপ্লেক্স RNAse A কার্যকলাপকে বাধা দেয়। | A chelator (EDTA) RNase H কার্যকলাপকে বাধা দেয়। |
DNA প্রতিলিপিতে RNA প্রাইমার অপসারণ | |
RNase A DNA প্রতিলিপিতে RNA প্রাইমার অপসারণের জন্য ব্যবহার করা হয় না। | RNase H DNA প্রতিলিপিতে RNA প্রাইমার অপসারণের জন্য ব্যবহৃত হয় |
পরিপূরক ডিএনএ (সি-ডিএনএ) সংশ্লেষণে ডিএনএ টেমপ্লেট অপসারণ | |
RNase A পরিপূরক DNA (C-DNA) সংশ্লেষণের সময় RNA টেমপ্লেট অপসারণের জন্য ব্যবহার করা হয় না। | RNase H পরিপূরক DNA (C-DNA) সংশ্লেষণের সময় RNA টেমপ্লেট অপসারণের জন্য ব্যবহৃত হয়। |
mRNA-তে পলি-এ-টেইল অপসারণ অলিগোতে হাইব্রিডাইজড (dt) | |
RNase A এমআরএনএ-তে "পলি-এ টেইল" অপসারণ করতে ব্যবহার করা হয় না অলিগো (dt) থেকে হাইব্রিডাইজড। | RNase H এমআরএনএতে "পলি-এ টেইল" অপসারণ করতে ব্যবহার করা হয় অলিগো (dt) থেকে হাইব্রিডাইজ করা |
সারাংশ – RNASE A বনাম RNASE H
রাইবোনিউক্লিজ হল নিউক্লিজ এনজাইম যেগুলো আরএনএকে ছোট ছোট ইউনিটে বিভক্ত করার ক্ষমতা রাখে। তারা দুই প্রকার; এন্ডোরিবোনিউক্লেজ এবং এক্সোরিবোনুক্লিজ। এন্ডোরিবোনিউক্লিজ হল একটি এন্ডোনিউক্লিজ যার একক-স্ট্রেন্ডেড বা ডাবল-স্ট্র্যান্ডেড আরএনএ হ্রাস করার ক্ষমতা রয়েছে। এবং এটি একটি RNA পলিনিউক্লিওটাইড চেইনের মধ্যে ফসফোডিস্টার বন্ধনকে ছিন্ন করে। RNase A এবং RNase H দুটি এন্ডোরিবোনুক্লিস। RNase A হল একটি অগ্ন্যাশয়ের রাইবোনিউক্লিজ যা বিশেষভাবে উচ্চতর লবণের ঘনত্বে একক-স্ট্র্যান্ডেড RNA-এর 3’ প্রান্তে জোড়াবিহীন সাইটোসিন এবং ইউরাসিল অবশিষ্টাংশগুলিকে ছিঁড়ে ফেলে। RNase H হল একটি অনির্দিষ্ট রাইবোনিউক্লিজ এনজাইম যা হাইড্রোলাইটিক বিক্রিয়ার মাধ্যমে RNA-DNA হাইব্রিডে RNA-কে অবনমিত করতে পারে। এটি RNase A এবং RNase H. এর মধ্যে পার্থক্য
PDF ডাউনলোড করুন RNASE A বনাম RNASE H
আপনি এই নিবন্ধটির PDF সংস্করণ ডাউনলোড করতে পারেন এবং উদ্ধৃতি নোট অনুসারে অফলাইন উদ্দেশ্যে এটি ব্যবহার করতে পারেন। দয়া করে এখানে পিডিএফ সংস্করণ ডাউনলোড করুন RNASE A এবং RNASE H এর মধ্যে পার্থক্য