মেটাজেনোমিক্স এবং মেটাট্রান্সক্রিপ্টমিক্সের মধ্যে মূল পার্থক্য প্রতিটি এলাকায় অধ্যয়ন করা জৈব অণুর প্রকারের উপর নির্ভর করে। মেটাজেনমিক্স ডিএনএ, এর ক্রম এবং জীবের আচরণ অধ্যয়ন করে, যখন মেটাট্রান্সক্রিপ্টমিক্স প্রতিলিপিকৃত ডিএনএ অধ্যয়ন করে, প্রধানত এমআরএনএ সিকোয়েন্স এবং জীবের মধ্যে এর আচরণ।
মেটাজেনমিক্স এবং মেটাট্রান্সক্রিপ্টমিক্স হল দুটি ক্ষেত্র যা মাইক্রোবায়াল সম্প্রদায়ের সাথে সম্পর্কযুক্ত বছরের পর বছর ধরে অনেক জনপ্রিয়তা অর্জন করেছে। তারা স্বাস্থ্যসেবা, শিল্প এবং কৃষি জৈবপ্রযুক্তিতে গুরুত্বপূর্ণ। মেটাজেনোমিক্স এবং মেটাট্রান্সক্রিপ্টমিক্স উভয়ই একটি সম্প্রদায়ের পৃথক জীব এবং তাদের কার্যকরী ভূমিকাগুলি অধ্যয়নের অনুমতি দেয় যা হয় উপকারী বা ক্ষতিকারক।
মেটাজেনমিক্স কি?
মেটাজেনমিক্স হল অধ্যয়নের ক্ষেত্র যা ডিঅক্সিরাইবোনিউক্লিক অ্যাসিড (ডিএনএ) অন্বেষণ করে। এটি মাইক্রোবায়াল সম্প্রদায়ের জন্য সবচেয়ে প্রাসঙ্গিক। এছাড়াও, এটি জিনোমিক্সের তুলনায় আরও উন্নত ক্ষেত্র। জিনোমিক্সে, একটি নির্দিষ্ট জীবের ডিএনএ বিশ্লেষণ করা হয়। যাইহোক, মেটাজেনোমিক্সে জীবের একটি সম্প্রদায় জুড়ে জেনেটিক উপাদানের বিশ্লেষণ জড়িত। সুতরাং, এটি একটি অবস্থা বা একটি পরিবেশের সাথে সম্পর্কিত জীবের সম্প্রদায়ের আচরণ অধ্যয়ন করার অনুমতি দেয়৷
চিত্র 01: মেটাজেনমিক্স
মেটাজেনোমিক্স স্টাডিতে জড়িত প্রধান কৌশলটি হল নেক্সট জেনারেশন সিকোয়েন্সিং (এনজিএস) যা মাইক্রো-অ্যারে প্রযুক্তি ব্যবহার করে। নির্দিষ্ট ডিএনএ সিকোয়েন্সের উপস্থিতি বা অনুপস্থিতির জন্য এনজিএস পদ্ধতিগুলি একক প্রতিক্রিয়ায় একাধিক জীবকে বিশ্লেষণ করতে পারে।এই ডিএনএ ক্রমগুলি একটি একক রোগের অবস্থা বা পরিবেশগত অবস্থার জন্য দায়ী হতে পারে। অতএব, মেটাজেনমিক জ্ঞান ব্যবহার করে, জীবের স্ক্রীনিং সহজে এবং সঠিকভাবে করা যেতে পারে। এনজিএস চলাকালীন সিকোয়েন্সিং সংক্ষিপ্ত পাঠে সঞ্চালিত হয় এবং জীবের ডিএনএর প্রোফাইলিং ঘটে। 16s ডিএনএ সিকোয়েন্স হল একটি জনপ্রিয় ক্রম যা অণুজীব সম্পর্কিত মেটাজেনোমিক্সে অধ্যয়ন করা হয়।
জীবের সম্প্রদায়ের অনুক্রম অনুসরণ করে, ক্রমগুলির প্রান্তিককরণ করা উচিত। বেসিক লোকাল অ্যালাইনমেন্ট সিকোয়েন্স টুল (ব্লাস্ট) এর মতো টুলগুলি সারিবদ্ধকরণের কাজটি পূরণ করতে ব্যবহৃত হয়। সারিবদ্ধকরণ অনুসরণ করে, একটি ফাইলোজেনেটিক গাছ সম্প্রদায়ের প্রতিটি জীবের সম্পর্ক এবং তার আচরণ সম্পর্কিত বিশদ প্রদান করে।
মেটাট্রান্সক্রিপ্টমিক্স কি?
মেটাট্রান্সক্রিপ্টমিক্স হল অধ্যয়নের ক্ষেত্র যা একটি জীবের ট্রান্সক্রিপ্টোম নিয়ে কাজ করে। ট্রান্সক্রিপ্টোম ডিএনএ ট্রান্সক্রিপশনের সময় প্রতিলিপিকৃত সমগ্র আরএনএ সিকোয়েন্স গঠন করে।ট্রান্সক্রিপ্টোমে উপস্থিত mRNA ক্রমগুলি জেনেটিক অভিব্যক্তির তথ্য প্রদান করে। মেটাট্রান্সক্রিপ্টমিক্স হল জনসংখ্যা বা সম্প্রদায়ের একাধিক ট্রান্সক্রিপ্টোমের বিশ্লেষণ।
চিত্র 02: ট্রান্সক্রিপ্টোম বিশ্লেষণ
মেটাট্রান্সক্রিপ্টমিক্স অধ্যয়নগুলি ছোট পঠিত ক্রমগুলির ক্রমগুলি খুঁজে পেতে মাইক্রোয়ারে প্রযুক্তি ব্যবহার করে। তদুপরি, মেটাট্রান্সক্রিপ্টমিক্স এলাইনমেন্ট টুলস এবং ট্রি ডিজাইনিং পদ্ধতি ব্যবহার করে একটি পুঙ্খানুপুঙ্খ বায়োইনফরমেটিক্স বিশ্লেষণও জড়িত। যাইহোক, মেটাজেনোমিক্সের তুলনায় মেটাট্রান্সক্রিপ্টমিক্সের ক্ষেত্রটি অনেক কঠিন। সামগ্রিকভাবে mRNA বা RNA নিষ্কাশন যতটা সহজ বলে মনে হচ্ছে ততটা সহজ নয়। যেহেতু আরএনএ অত্যন্ত ধ্বংসের প্রবণতা এবং এর জীবনকাল খুব কম, তাই এর রক্ষণাবেক্ষণ এবং সঞ্চয়স্থান একটি সম্ভাব্য প্রশ্ন হতে পারে।
মেটাজেনমিক্স এবং মেটাট্রান্সক্রিপ্টমিক্সের মধ্যে মিল কী?
- মেটাজেনমিক্স এবং মেটাট্রান্সক্রিপ্টমিক্স হল উচ্চ থ্রুপুট কৌশল যা জীবের সম্প্রদায়গুলি, প্রধানত মাইক্রোবায়াল সম্প্রদায়গুলিকে বিশ্লেষণ করার জন্য৷
- উভয় কৌশলই ফলাফল বের করতে মাইক্রোয়ারে প্রযুক্তি ব্যবহার করে।
- প্রাপ্ত ফলাফলগুলি প্রায়শই BLAST অ্যালাইনমেন্ট এবং ফাইলোজেনেটিক ট্রি ব্যবহার করে বিশ্লেষণ করা হয়৷
- এছাড়াও, উভয় কৌশলই একটি জীবের উপর ফোকাস করে না, বরং একটি গোষ্ঠী বা সম্প্রদায়ের জীবের উপর ফোকাস করে।
- এছাড়া, উভয় ধারণাই অধ্যয়ন করা হয় বেশিরভাগ জীবাণুর সাথে সম্পর্কিত - প্রধান কারণ তাদের বিভিন্ন ভূমিকা পালন করা হয়।
মেটাজেনমিক্স এবং মেটাট্রান্সক্রিপ্টমিক্সের মধ্যে পার্থক্য কী?
মেটাজেনমিক্স এবং মেটাট্রান্সক্রিপ্টমিক্স জীবের একটি সম্প্রদায়ের জেনেটিক পদার্থের বিশ্লেষণের সাথে জড়িত। এইভাবে, মেটাজেনোমিক্স ডিএনএর প্যাটার্ন এবং সিকোয়েন্স নিয়ে উদ্বিগ্ন যেখানে মেটাট্রান্সক্রিপ্টমিক্স এমআরএনএ বা প্রতিলিপিকৃত ডিএনএর বিশ্লেষণকে নির্দেশ করে।সুতরাং, এটি মেটাজেনোমিক্স এবং মেটাট্রান্সক্রিপ্টমিক্সের মধ্যে মূল পার্থক্য।
এছাড়াও, নিষ্কাশন পদ্ধতি উভয় কৌশলেই আলাদা; মেটাজেনোমিক্স ডিএনএ নিষ্কাশন পদ্ধতি এবং মেটাট্রান্সক্রিপ্টমিক্স আরএনএ নিষ্কাশন পদ্ধতি জড়িত। অতএব, এটিও মেটাজেনোমিক্স এবং মেটাট্রান্সক্রিপ্টমিক্সের মধ্যে একটি উল্লেখযোগ্য পার্থক্য।
নিচের ইনফোগ্রাফিক মেটাজেনোমিক্স এবং মেটাট্রান্সক্রিপ্টমিক্সের মধ্যে পার্থক্য সংক্ষিপ্ত করে:
সারাংশ – মেটাজেনমিক্স বনাম মেটাট্রান্সক্রিপ্টমিক্স
মেটাজেনমিক্স এবং মেটাট্রান্সক্রিপ্টমিক্স হল অধ্যয়নের অভিনব ক্ষেত্র যা একটি নির্দিষ্ট অবস্থার জন্য জীবের একটি সম্প্রদায়কে বিশ্লেষণ করে। সুতরাং, মেটাজেনোমিক্স বলতে ডিএনএ সিকোয়েন্সের বিশ্লেষণকে বোঝায়। বিপরীতে, মেটাট্রান্সক্রিপ্টমিক্স বলতে আরএনএ সিকোয়েন্স বা প্রতিলিপিকৃত ডিএনএ পণ্যের বিশ্লেষণ বোঝায়।এই বিষয়ে, মেটাট্রান্সক্রিপ্টমিক্স একটি নির্দিষ্ট ক্ষেত্রে জিনের অভিব্যক্তি সনাক্ত করতে সক্ষম করে। উভয়ই মিউটেশন এবং তাদের প্রভাব বিশ্লেষণে গুরুত্বপূর্ণ। এগুলি দ্রুত এবং আরও নির্ভরযোগ্য কৌশল যা অগ্রিম নির্ণয়ের জন্য ব্যবহৃত হয়। সুতরাং, এটি মেটাজেনোমিক্স এবং মেটাট্রান্সক্রিপ্টমিক্সের মধ্যে পার্থক্যের সারাংশ।
