shRNA বনাম siRNA
RNA হস্তক্ষেপ (RNAi) প্রক্রিয়া চলাকালীন, একটি লক্ষ্য জিনের অভিব্যক্তি উচ্চ নির্দিষ্টতা এবং নির্বাচনযোগ্যতার সাথে ছিটকে যায়। RNAi একটি প্রাকৃতিক প্রক্রিয়া, এবং এতে ছোট হস্তক্ষেপকারী RNA (siRNA) এবং ছোট হেয়ারপিন RNA (shRNA) এবং দ্বি-কার্যকর shRNA জড়িত। বর্তমানে, RNAi ব্যক্তিগতকৃত ক্যান্সার থেরাপির জন্য একটি হাতিয়ার হিসাবে ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত হয়। RNAi এর প্রয়োগগুলি মূলত রাসায়নিকভাবে সংশ্লেষিত ডাবল-স্ট্র্যান্ডেড siRNA এবং ভেক্টর ভিত্তিক shRNA অণুগুলির সাথে করা হয়। যদিও এই দুটি অণুর একই রকম কার্যকরী ফলাফল রয়েছে, তবে তারা তাদের গঠনে ভিন্ন; এইভাবে, কর্মের আণবিক প্রক্রিয়া, RNA পথ, এবং এই দুটি অণুর লক্ষ্যবহির্ভূত প্রভাবও আলাদা।
shRNA
shRNA হল ছোট RNA অণুর একটি ক্রম যা একটি টাইট হেয়ারপিন ঘুরিয়ে দেয় যা RNAi এর সময় লক্ষ্য জিনের অভিব্যক্তিকে নীরব করতে ব্যবহার করা যেতে পারে। shRNA এর অভিব্যক্তি একটি ভেক্টর দ্বারা অর্জিত হয়, যা হয় ভাইরাস বা ব্যাকটেরিয়াম হতে পারে অথবা প্লাজমিড সরবরাহ করে। এগুলি কোষের নিউক্লিয়াসে সংশ্লেষিত হয় এবং পরবর্তী প্রক্রিয়ার জন্য সাইটোপ্লাজমে স্থানান্তরিত হয়। এই অণুগুলির miRNA-এর অনুরূপ পরিপক্কতার পথ রয়েছে; এইভাবে miRNA এর সংশ্লেষণ shRNA সংশ্লেষণ বোঝার জন্য ভিত্তি প্রদান করেছে। RNA পলিমারেজ II বা III RNA পলিমারেজ II বা III প্রোমোটারগুলির মাধ্যমে shRNA প্রতিলিপি করতে পারে। shRNA-এর ব্যবহারের সুবিধা হল যে তাদের অবক্ষয় এবং টার্নওভারের হার তুলনামূলকভাবে কম। অসুবিধা হল এটির একটি এক্সপ্রেশন ভেক্টর প্রয়োজন, যা কিছু নিরাপত্তা সমস্যা সৃষ্টি করতে পারে৷
siRNA
siRNA হল ডবল স্ট্র্যান্ডেড RNA অণু যা 20-25 বেস জোড়া দৈর্ঘ্যে গঠিত। এগুলি RNAi পাথওয়েতে পরিপূরক নিউক্লিওটাইড ক্রম সহ যেকোন জিনকে নীরব করে জিন দমনের জন্য ব্যবহৃত হয়।siRNA ট্রান্সফেকশনের মাধ্যমে জিন নকডাউন প্রায়ই ক্ষণস্থায়ী প্রভাবের কারণে ব্যর্থ হয়; বিশেষ করে দ্রুত বিভাজন কোষে এবং দমন আর স্থায়ী হয় না। এই সমস্যাটি কাটিয়ে উঠতে, একটি ছোট হেয়ারপিন গঠন প্রবর্তন করে siRNA পরিবর্তন করা হয়। এই পরিবর্তিত অণুটি তখন shRNA নামে পরিচিত। shRNA এর স্বাভাবিক কাজ চালিয়ে যাওয়ার জন্য একটি Dicer দ্বারা siRNA তে রূপান্তর করা উচিত।
shRNA এবং siRNA এর মধ্যে পার্থক্য কি?
• siRNA এর বিপরীতে, shRNA এর একটি অতিরিক্ত হেয়ারপিন গঠন রয়েছে। shRNA হল siRNA এর একটি পরিবর্তিত সংস্করণ।
• shRNA এর জন্য একটি এক্সপ্রেশন ভেক্টর প্রয়োজন, যেখানে siRNA এর প্রয়োজন নেই।
• shRNA দীর্ঘমেয়াদী নকডাউনের জন্য ব্যবহার করা যেতে পারে যখন siRNA শুধুমাত্র জিনের স্বল্পমেয়াদী নকডাউনের জন্য ব্যবহার করা যেতে পারে।
• siRNA-এর জিন দমনের বিপরীতে, shRNA-এর দমন দীর্ঘস্থায়ী, এবং যদি এটি একটি উপযুক্ত ভাইরাল ভেক্টরের মাধ্যমে ঢোকানো হয়, তাহলে এটি স্থায়ী জিন সাইলেন্সিং প্রভাব তৈরি করতে পারে৷
• ডাইসারের প্রয়োজন shRNA কে আবার siRNA অণুতে রূপান্তর করার জন্য তার স্বাভাবিক ফাংশনগুলি চালানোর জন্য৷
