আগারোজ এবং পলিঅ্যাক্রিলামাইড জেল ইলেক্ট্রোফোরসিসের মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে অ্যাগারোজ জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস অনুভূমিকভাবে ঢেলে দেওয়া অ্যাগারোজ জেল ব্যবহার করে ডিএনএর তুলনামূলকভাবে বড় টুকরোগুলিকে আলাদা করতে, যখন পলিঅ্যাক্রিলামাইড জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস উল্লম্বভাবে ঢেলে দেওয়া পলিঅ্যাক্রাইলামাইড জেল ব্যবহার করে ডিএনএর ছোট অংশকে আলাদা করতে।
ইলেক্ট্রোফোরেসিস হল এক ধরণের কৌশল যা ডিএনএ, আরএনএ এবং প্রোটিনের মতো জৈব অণুগুলিকে আলাদা করতে জেল ম্যাট্রিক্স জুড়ে একটি বৈদ্যুতিক ক্ষেত্র ব্যবহার করে। ইলেক্ট্রোফোরসিসের মাধ্যমে ডিএনএ, আরএনএ এবং প্রোটিনের মতো জৈব অণুগুলির এই বিচ্ছেদ চার্জ এবং আকারের উপর ভিত্তি করে।নমুনাগুলি জেলের কূপে লোড করা হয়। পরে, জেল জুড়ে বৈদ্যুতিক ক্ষেত্র প্রয়োগ করা হয়। ক্ষেত্রটি নেতিবাচক চার্জযুক্ত অণুগুলিকে ধনাত্মক ইলেক্ট্রোডের দিকে যেতে দেয়। জেল ম্যাট্রিক্স একটি আণবিক চালনী হিসাবে কাজ করে যার মাধ্যমে ক্ষুদ্রতম অণুগুলি দ্রুত চলে যায় বা দ্রুত ভ্রমণ করে যখন বড় অণুগুলি ধীরে ধীরে চলে। এটি চার্জ এবং আকারের উপর ভিত্তি করে অণুগুলির পৃথকীকরণকে সক্ষম করে। অতএব, অ্যাগারোজ এবং পলিঅ্যাক্রাইলামাইড জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস হল দুই ধরনের জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস কৌশল যা প্রধানত তাদের আকার এবং চার্জের উপর ভিত্তি করে অণুকে আলাদা করতে সাহায্য করে৷
আগারোজ জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস কি?
আগারোজ জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস এমন একটি কৌশল যা ডিএনএ এবং আরএনএর মতো জৈব অণুগুলিকে আলাদা করতে অ্যাগারোজ জেল ব্যবহার করে। এটি একটি কৌশল যা নিউক্লিক অ্যাসিডকে প্রাথমিকভাবে আকার অনুসারে আলাদা করতে ব্যবহৃত হয়। এই কৌশলে ব্যবহৃত অ্যাগারোজ নামক প্রধান যৌগটি একটি পলিস্যাকারাইড। এটি সামুদ্রিক শৈবাল থেকে আসে। আগারোজ ফুটন্ত বাফারে দ্রবীভূত করা যেতে পারে এবং তারপরে অনুভূমিকভাবে রাখা ট্রেতে ঢেলে দেওয়া যেতে পারে।ট্রেতে, যখন এটি ঠান্ডা হয়ে স্ল্যাব তৈরি করে তখন এটি শক্ত হয়ে যায়। Agarose জেলগুলিকে একটি চিরুনি দিয়ে ঢেলে কূপ তৈরি করা হয় যেখানে জেলটি শক্ত হয়ে গেলে ডিএনএ বা আরএনএর মতো নিউক্লিক অ্যাসিড লোড করা হয়৷
চিত্র 01: অ্যাগারোজ জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস
জেলটি পরে একটি উপযুক্ত বাফারে নিমজ্জিত হয় এবং জেল জুড়ে একটি কারেন্ট প্রয়োগ করা হয়। ডিএনএ-তে একটি অভিন্ন ঋণাত্মক চার্জ রয়েছে যা অণুর ক্রম গঠন থেকে স্বাধীন। অতএব, ডিএনএ অণুগুলি ক্যাথোড (-) থেকে অ্যানোড (+) এর দিকে স্থানান্তরিত হবে। স্থানান্তরের হার সরাসরি অণুর আকারের উপর নির্ভর করে। সবচেয়ে বড় ম্যাক্রোমোলিকিউলস জেলের মাধ্যমে নেভিগেট করতে সবচেয়ে কঠিন সময় পায়। অন্যদিকে, ছোট ম্যাক্রোমোলিকিউলস জেলের মধ্য দিয়ে দ্রুত এবং বেশ সহজে স্লিপ করে।
পলিঅ্যাক্রিলামাইড জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস কি?
Polyacrylamide জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস (PAGE) হল একটি কৌশল যা জৈব অণুগুলিকে আলাদা করতে পলিঅ্যাক্রিলামাইড জেল ব্যবহার করে। এটি এমন একটি কৌশল যা তাদের ইলেক্ট্রোফোরেটিক গতিশীলতা অনুসারে জৈবিক ম্যাক্রোমোলিকিউলস, সাধারণত প্রোটিন এবং নিউক্লিক অ্যাসিডগুলিকে আলাদা করতে ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত হয়। অ্যাক্রিলোনিট্রাইলের হাইড্রেশনের ফলে নাইট্রিল হাইড্রেটেজ দ্বারা অ্যাক্রিলামাইড অণু তৈরি হয়। অ্যাক্রিলামাইড পানিতে দ্রবণীয়, এবং ফ্রি র্যাডিক্যাল ইনিশিয়েটর যোগ করলে অ্যাক্রিলামাইড পলিমারাইজ হয়, যার ফলে পলিঅ্যাক্রিলামাইড জেল তৈরি হয়। সাধারণত, অ্যাক্রিলামাইডের ঘনত্ব বৃদ্ধির ফলে জেলের ছিদ্রের আকার কমে যায়। পলিঅ্যাক্রিলামাইড জেল উল্লম্বভাবে ঢেলে দেওয়া হয়, অ্যাগারোজ জেলের বিপরীতে।
চিত্র 02: পলিঅ্যাক্রিলামাইড জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস
পলিঅ্যাক্রিলামাইড জেল ইলেক্ট্রোফোরসিসে, অণুগুলি তাদের স্থানীয় অবস্থায় চলতে পারে, অণুর উচ্চ-ক্রমের কাঠামো সংরক্ষণ করে। এই পদ্ধতিকে স্থানীয় PAGE বলা হয়। বিকল্পভাবে, একটি রাসায়নিক ডিনাচুরেন্টও যোগ করা যেতে পারে উচ্চ-ক্রমের কাঠামোটি অপসারণ করতে এবং অণুটিকে একটি অসংগঠিত অণুতে পরিণত করতে যার গতিশীলতা শুধুমাত্র তার দৈর্ঘ্যের উপর নির্ভর করে। এই ধরনের SDS-PAGE বলা হয়।
Agarose এবং Polyacrylamide জেল ইলেক্ট্রোফোরসিসের মধ্যে মিল কি?
- Agarose এবং polyacrylamide জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস দুই ধরনের জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস কৌশল।
- আসলে, এগুলো আণবিক জৈবিক কৌশল।
- উভয় কৌশলই ডিএনএ এবং প্রোটিনের মতো জৈবিক ম্যাক্রোমোলিকিউল সনাক্ত করতে ব্যবহৃত হয়।
- এই কৌশলগুলি দক্ষ প্রযুক্তিবিদ বা গবেষকদের দ্বারা করা হয়৷
- উভয় কৌশলেই, ম্যাক্রোমোলিকিউলস আলাদা করা হয় চার্জ এবং আকারের উপর ভিত্তি করে।
- উভয় কৌশলই ডিএনএ এবং আরএনএর মতো নিউক্লিক অ্যাসিডকে আলাদা করার অনুমতি দেয়৷
Agarose এবং Polyacrylamide জেল ইলেক্ট্রোফোরসিসের মধ্যে পার্থক্য কী?
আগারোজ জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস এমন একটি কৌশল যা জৈব অণুগুলিকে আলাদা করতে অনুভূমিকভাবে ঢেলে দেওয়া অ্যাগারোজ জেল ব্যবহার করে, যখন পলিঅ্যাক্রিলামাইড জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস এমন একটি কৌশল যা জৈব অণুগুলিকে আলাদা করতে উল্লম্বভাবে ঢেলে দেওয়া পলিঅ্যাক্রিলামাইড জেল ব্যবহার করে। এটি অ্যাগারোজ এবং পলিঅ্যাক্রিলামাইড জেল ইলেক্ট্রোফোরসিসের মধ্যে মূল পার্থক্য। তদ্ব্যতীত, অ্যাগারোজ জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস ডিএনএ এবং আরএনএ আলাদা করার জন্য ব্যবহৃত হয়, যখন পলিঅ্যাক্রিলামাইড জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস ব্যবহার করা হয় ডিএনএ, আরএনএ বা প্রোটিনের মতো নিউক্লিক অ্যাসিডগুলিকে পৃথক করার জন্য।
নিম্নলিখিত সারণীটি অ্যাগারোজ এবং পলিঅ্যাক্রাইলামাইড জেল ইলেক্ট্রোফোরসিসের মধ্যে পার্থক্য সংক্ষিপ্ত করে।
সারাংশ – অ্যাগারোজ বনাম পলিঅ্যাক্রিলামাইড জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস
Agarose এবং polyacrylamide জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস হল দুই ধরনের জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস কৌশল যা আণবিক জীববিজ্ঞান পরীক্ষাগারে ব্যবহৃত হয়।অ্যাগারোজ জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস জৈব অণুগুলিকে আলাদা করতে অ্যাগারোজ জেল ব্যবহার করে। Agarose সাধারণত মানুষের জন্য বিষাক্ত নয়, যখন polyacrylamide মানুষের জন্য বিষাক্ত। তদুপরি, অ্যাগারোজ জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস কম রেজোলিউশন দেখায় যখন পলিঅ্যাক্রিলামাইড জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস আরও রেজোলিউশন দেখায়। পলিঅ্যাক্রিলামাইড জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস জৈব অণুগুলিকে আলাদা করতে একটি পলিঅ্যাক্রিলামাইড জেল ব্যবহার করে। এটি অ্যাগারোজ এবং পলিঅ্যাক্রাইলামাইড জেল ইলেক্ট্রোফোরসিসের মধ্যে পার্থক্যকে সংক্ষিপ্ত করে
