CGH এবং অ্যারে CGH-এর মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে CGH হল একটি প্রথাগত আণবিক সাইটোজেনেটিক পদ্ধতি যা একটি পরীক্ষার নমুনার ডিএনএ-তে কপি নম্বরের বৈচিত্র্য বিশ্লেষণ করার জন্য যার রেজোলিউশন কম, অন্যদিকে অ্যারে CGH হল একটি সম্পূর্ণ স্বয়ংক্রিয় আণবিক সাইটোজেনেটিক পদ্ধতি। উচ্চতর রেজোলিউশনের একটি পরীক্ষার নমুনার ডিএনএ-তে কপি নম্বরের বৈচিত্র্য বিশ্লেষণ করা।
CGH এবং অ্যারে CGH ব্যক্তিদের মধ্যে অনুলিপি নম্বর বৈচিত্র্য সনাক্ত করার দুটি কৌশল। অনুলিপি নম্বর বৈচিত্র জিনোমের বিভাগগুলিকে বোঝায় যা পুনরাবৃত্তি হয়। কপি নম্বর ব্যক্তিদের মধ্যে পরিবর্তিত হয়। অনুলিপি সংখ্যা বৈচিত্র সাধারণত দুটি গ্রুপে শ্রেণীবদ্ধ করা হয়: সংক্ষিপ্ত পুনরাবৃত্তি এবং দীর্ঘ পুনরাবৃত্তি।সংক্ষিপ্ত অনুলিপি সংখ্যার পরিবর্তনের জন্য সবচেয়ে সুপরিচিত উদাহরণগুলির মধ্যে একটি হল হান্টিংটিন জিনে CAG ট্রিনিউক্লিওটাইডের পুনরাবৃত্তি। এটি হান্টিংটিন নামে একটি স্নায়বিক ব্যাধি সৃষ্টি করে। দীর্ঘ পুনরাবৃত্তি অনুলিপি সংখ্যা পরিবর্তনের জন্য সর্বোত্তম উদাহরণ হল আলফা অ্যামাইলেজ জিন, যা ইনসুলিন প্রতিরোধের কারণ। FISH, CGH, এবং অ্যারে CGH এর মতো কৌশল দ্বারা কপি নম্বরের বৈচিত্র্য সনাক্ত করা যেতে পারে।
CGH কি?
CGH হল একটি প্রথাগত আণবিক সাইটোজেনেটিক পদ্ধতি যা একটি রেফারেন্স নমুনার তুলনায় একটি পরীক্ষার নমুনার ডিএনএ-তে অনুলিপি সংখ্যার বৈচিত্র্য বিশ্লেষণ করার জন্য। স্বয়ংক্রিয় কৌশলগুলির তুলনায় এটির রেজোলিউশন কম। এই কৌশলটির উদ্দেশ্য হল দ্রুত এবং দক্ষতার সাথে দুটি জিনোমিক ডিএনএ নমুনার তুলনা করা যা বিভিন্ন উত্স থেকে উদ্ভূত হয়৷
চিত্র 01: CGH
এই পদ্ধতিতে দুটি উৎস থেকে ডিএনএ বিচ্ছিন্ন করা জড়িত: পরীক্ষা এবং রেফারেন্স। তারপরের পরের ধাপটি হল পরীক্ষার স্বাধীন লেবেলিং এবং বিভিন্ন রঙের ফ্লুরোফোর সহ ডিএনএ নমুনার রেফারেন্স। পরে, সিঙ্গেল-স্ট্র্যান্ডেড ডিএনএ নমুনা পাওয়ার জন্য দুটি ডিএনএ নমুনা বিকৃত করা হয়েছিল। অবশেষে, ক্রোমোজোমের স্বাভাবিক মেটাফেজ স্প্রেডের সাথে 1:1 অনুপাতে দুটি ফলস্বরূপ ডিএনএ নমুনার সংকরায়ন করা হয়েছিল। একটি ফ্লুরোসেন্স মাইক্রোস্কোপ এবং কম্পিউটার সফ্টওয়্যার ব্যবহার করে দুটি উত্সের মধ্যে ক্রোমোসোমাল পার্থক্য সনাক্ত করা যেতে পারে। উপরন্তু, CGH কৌশল শুধুমাত্র ভারসাম্যহীন ক্রোমোসোমাল অস্বাভাবিকতা সনাক্ত করতে সক্ষম।
অ্যারে CGH কি?
অ্যারে CGH হল একটি সম্পূর্ণ স্বয়ংক্রিয় আণবিক সাইটোজেনেটিক পদ্ধতি যা একটি রেফারেন্স নমুনার তুলনায় একটি পরীক্ষার নমুনার ডিএনএ-তে কপি নম্বরের বৈচিত্র্য বিশ্লেষণ করার জন্য। এটির একটি উচ্চতর রেজোলিউশন রয়েছে এবং এটি ঐতিহ্যগত CGH-এর সীমাবদ্ধতা কমানোর জন্য তৈরি করা হয়েছিল। অ্যারে CGH মাইক্রোয়ারের ব্যবহারের সাথে CGH-এর নীতিগুলিকে একত্রিত করে।মেটাফেজ ক্রোমোজোম স্প্রেড ব্যবহার করার পরিবর্তে, এই পদ্ধতিটি লক্ষ্য হিসাবে ডিএনএ-র ছোট অংশগুলির সাথে সজ্জিত স্লাইডগুলি ব্যবহার করে। এই মাইক্রোয়ারেগুলি একটি কঠিন কাচের সমর্থনে অল্প পরিমাণ ডিএনএ (প্রোব) জমা এবং স্থির করে তৈরি করা হয়েছিল। প্রোবের আকার অলিগোনিউক্লিওটাইড থেকে ব্যাকটেরিয়া কৃত্রিম ক্রোমোসোমে পরিবর্তিত হতে পারে।
চিত্র 02: অ্যারে CGH
প্রোব নির্বিশেষে, অ্যারের CGH-এর মৌলিক পদ্ধতি CGH-এর মতোই। একবার মাইক্রোয়ারে সমন্বিত প্রোবগুলি প্রস্তুত করা হলে, বিভিন্ন রঙের ফ্লুরোফোরের লেবেলযুক্ত দুটি ডিএনএ নমুনা (পরীক্ষা এবং রেফারেন্স) একসাথে মিশ্রিত করা হয় এবং মাইক্রোয়ারে যুক্ত করা হয়। যেহেতু নমুনাগুলির ডিএনএ বিকৃতকরণের কারণে একক-স্ট্রেন্ডেড, তাই এই ডিএনএ অ্যারেযুক্ত একক-স্ট্রেন্ডেড প্রোবের সাথে সংকরিত হয়। একটি ডিজিটাল ইমেজিং সিস্টেম ব্যবহার করে, দুটি উত্সের মধ্যে ক্রোমোসোমাল পার্থক্য সনাক্ত করা সম্ভব।
CGH এবং অ্যারে CGH-এর মধ্যে মিল কী?
- CGH এবং অ্যারে CGH কপি নম্বর বৈচিত্র্য সনাক্ত করার দুটি কৌশল।
- এগুলি আণবিক সাইটোজেনেটিক পদ্ধতি।
- উভয় পদ্ধতিই ভারসাম্যহীন ক্রোমোসোমাল অস্বাভাবিকতা নির্ণয় করে।
- ফ্লুরোফোরস উভয় পদ্ধতিতে জড়িত।
- কপি সংখ্যার তারতম্যের কারণে জিনগত ব্যাধি সনাক্ত করতে উভয় পদ্ধতিই ব্যবহার করা যেতে পারে।
- এগুলি তুলনামূলক জিনোমিক বিশ্লেষণে ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত হয়।
CGH এবং Array CGH-এর মধ্যে পার্থক্য কী?
CGH হল একটি প্রথাগত আণবিক সাইটোজেনেটিক পদ্ধতি যা একটি পরীক্ষার নমুনার ডিএনএ-তে কপি সংখ্যার বৈচিত্র্য বিশ্লেষণ করার জন্য যার রেজোলিউশন কম থাকে, অন্যদিকে অ্যারে CGH হল একটি সম্পূর্ণ স্বয়ংক্রিয় আণবিক সাইটোজেনেটিক পদ্ধতি যা একটি পরীক্ষার নমুনার ডিএনএ-তে অনুলিপি সংখ্যার বৈচিত্র্য বিশ্লেষণ করার জন্য। যে একটি উচ্চ রেজল্যুশন আছে. সুতরাং, এটি CGH এবং অ্যারে CGH এর মধ্যে মূল পার্থক্য।অধিকন্তু, সিজিএইচ-এ, পরীক্ষা এবং রেফারেন্স ডিএনএ নমুনাগুলি ক্রোমোজোমের একটি সাধারণ মেটাফেজ স্প্রেডের সাথে হাইব্রিডাইজ করে, কিন্তু অ্যারে সিজিএইচে, পরীক্ষা এবং রেফারেন্স ডিএনএ নমুনাগুলি মাইক্রোয়ারে ধারণকারী স্থির ডিএনএ প্রোবের সাথে হাইব্রিডাইজ করে৷
নীচের ইনফোগ্রাফিকটি পাশাপাশি তুলনা করার জন্য সারণী আকারে CGH এবং অ্যারে CGH-এর মধ্যে পার্থক্যগুলি তালিকাভুক্ত করে৷
সারাংশ – CGH বনাম অ্যারে CGH
CGH এবং অ্যারে CGH হল দুটি আণবিক সাইটোজেনেটিক কৌশল যাতে ভারসাম্যহীন ক্রোমোজোম অস্বাভাবিকতা সনাক্ত করা যায়। এগুলি তুলনামূলক জিনোমিক বিশ্লেষণে ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত হয়। CGH হল একটি প্রথাগত আণবিক সাইটোজেনেটিক পদ্ধতি যা একটি পরীক্ষার নমুনার ডিএনএ-তে অনুলিপি সংখ্যার বৈচিত্র্য বিশ্লেষণ করার জন্য যার রেজোলিউশন কম থাকে। বিপরীতে, অ্যারে CGH হল একটি সম্পূর্ণ স্বয়ংক্রিয় আণবিক সাইটোজেনেটিক পদ্ধতি যা উচ্চতর রেজোলিউশনযুক্ত একটি পরীক্ষার নমুনার ডিএনএ-তে কপি নম্বরের বৈচিত্র্য বিশ্লেষণের জন্য। এইভাবে, এটি CGH এবং অ্যারে CGH এর মধ্যে পার্থক্যকে সংক্ষিপ্ত করে।
