লাইন এবং SINE-এর মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে লাইনগুলি (দীর্ঘ ছেদযুক্ত পারমাণবিক উপাদানগুলি) হল এক ধরনের দীর্ঘ নন-LTR রেট্রোট্রান্সপোসন যেখানে SINEs (সংক্ষিপ্ত ছেদযুক্ত পারমাণবিক উপাদানগুলি) হল অনেক ছোট নন-LTR রেট্রোট্রান্সপোসন।
Non-LTR রেট্রোট্রান্সপোসনে লং টার্মিনাল রিপিট (LTR) থাকে না। যাইহোক, তাদের মধ্যে রিভার্স ট্রান্সক্রিপ্টেজ, আরএনএ বাইন্ডিং প্রোটিন, নিউক্লিজ এবং রিবোনুক্লিজ এইচ ডোমেনের জন্য জিন রয়েছে। নন-এলটিআর রেট্রোট্রান্সপোসনের সংক্ষিপ্ত পুনরাবৃত্তি রয়েছে। এই পুনরাবৃত্তিগুলির একে অপরের পাশে ঘাঁটির একটি উল্টানো ক্রম রয়েছে। তা ছাড়া, নন-এলটিআর রেট্রোট্রান্সপোসনগুলিরও সরাসরি পুনরাবৃত্তি এলআরটি ট্রান্সপোসনে পাওয়া যায়।নন-এলটিআর রেট্রোট্রান্সপোসনগুলি লাইন এবং সাইন হিসাবে দুটি বিভাগে পড়ে৷
লাইন কি?
লাইনগুলি (দীর্ঘ ছেদযুক্ত পারমাণবিক উপাদানগুলি) দীর্ঘতর নন-LTR রেট্রোট্রান্সপোসন। এগুলি ইউক্যারিওটসের জিনোমে বিস্তৃত। তারা সাধারণত মানুষের জিনোমের 21.1% তৈরি করে। প্রতিটি লাইন প্রায় 7000 বেস জোড়া লম্বা। লাইনগুলি mRNA তে প্রতিলিপি করতে পারে এবং একটি প্রোটিনে অনুবাদ করতে পারে যা একটি বিপরীত ট্রান্সক্রিপ্টেজ এনজাইম হিসাবে কাজ করতে পারে। এই বিপরীত ট্রান্সক্রিপ্টেজ লাইনের আরএনএর ডিএনএ কপি তৈরি করে। এই ডিএনএ কপিগুলি একটি নতুন সাইটে জিনোমে একত্রিত করা যেতে পারে৷
চিত্র 01: লাইন এবং সাইন
মানুষের জিনোমে শুধুমাত্র একটি প্রচুর লাইন আছে যাকে লাইন-1 বলা হয়। লাইন-1 উপাদানটি প্রায় 6000 বেস জোড়া লম্বা। মানুষের জিনোমে প্রায় 100, 000টি কাটা লাইন-1 উপাদান রয়েছে।লাইনে এলোমেলো মিউটেশন ঘটতে পারে। এলোমেলো মিউটেশনের কারণে, লাইনগুলি ক্ষয় হতে পারে। তারা আর প্রতিলিপি বা অনুবাদ করা হয় না. উপরন্তু, লাইনগুলিকে পাঁচটি প্রধান গ্রুপে বিভক্ত করা হয়েছে যেমন L1, RTE, R2, I এবং জকি। এই পাঁচটি দল আরও 28টি শ্রেণীতে বিভক্ত।
লাইনগুলি সাধারণত টার্গেট প্রাইমড রিভার্স ট্রান্সক্রিপশন মেকানিজম (TPRT) নামে একটি প্রক্রিয়ার মাধ্যমে প্রচারিত হয়। লাইন ঢোকানোর ফলে হিমোফিলিয়া এ, ক্যান্সার, মেন্ডেলিয়ান ডিজঅর্ডার ইত্যাদির মতো মানুষের রোগ হয়। লাইনের হাইপোমেথিলেশনও নির্দিষ্ট ধরনের ক্যান্সারের কারণ হয়।
SINE কি?
SINEs (সংক্ষিপ্ত ছেদযুক্ত পারমাণবিক উপাদানগুলি) হল এক প্রকারের অনেক খাটো নন-এলটিআর রেট্রোট্রান্সপোসন। এগুলি দৈর্ঘ্যে প্রায় 100 থেকে 700 বেস জোড়া। SINEs হল DNA উপাদান যা RNA মধ্যবর্তীগুলির মাধ্যমে ইউক্যারিওটিক জিনোম জুড়ে নিজেদেরকে প্রসারিত করে। SINEs স্তন্যপায়ী জিনোমের প্রায় 13% তৈরি করে। SINE-এর অভ্যন্তরীণ অঞ্চলগুলি tRNA থেকে উদ্ভূত হয়। এটি অত্যন্ত সংরক্ষিত থাকে।এরা প্রায়শই মেরুদন্ডী এবং অমেরুদণ্ডী প্রাণীর অনেক প্রজাতির মধ্যে উপস্থিত থাকে। SINE-তে অনুলিপি সংখ্যার বৈচিত্র্য এবং মিউটেশনগুলি প্রজাতির ফাইলোজেনি-ভিত্তিক শ্রেণিবিন্যাস গঠনের জন্য একত্রিত করা যেতে পারে।
সাইনগুলিকে তিনটি প্রধান প্রকারে বিভক্ত করা যেতে পারে: কোর-সাইন, ভি-সাইন এবং অ্যামনসাইন। প্রাইমেটদের মধ্যে অ্যালু উপাদান সবচেয়ে সাধারণ SINE। অধিকন্তু, SINE-এর সন্নিবেশের সাথে যুক্ত 50 টিরও বেশি মানুষের রোগ রয়েছে। যখন তারা এক্সনগুলির মধ্যে বা কাছাকাছি সন্নিবেশ করে, তখন তারা অনুপযুক্ত স্প্লিসিং ঘটাতে পারে বা পড়ার ফ্রেম পরিবর্তন করতে পারে। এটি স্তন ক্যান্সার, কোলন ক্যান্সার, লিউকেমিয়া, হিমোফিলিয়া, সিস্টিক ফাইব্রোসিস, কোলন ক্যান্সার, ডেন্টস ডিজিজ, নিউরোফাইব্রোমাটোসিস ইত্যাদি রোগের ফিনোটাইপের দিকে নিয়ে যায়।
লাইন এবং সাইনের মধ্যে মিল কী?
- লাইন এবং সাইন হল দুই ধরনের নন-এলটিআর রেট্রোট্রান্সপোসন।
- উভয়েরই দীর্ঘ টার্মিনাল অঞ্চল (LTR) নেই।
- দুটিই প্রধানত শুধুমাত্র ইউক্যারিওটে পাওয়া যায়।
- এরা উভয়ই অ-স্বায়ত্তশাসিত৷
লাইন এবং সাইনের মধ্যে পার্থক্য কী?
লাইনগুলি দীর্ঘতর নন-LTR রেট্রোট্রান্সপোসন, যখন SINEগুলি অনেক ছোট নন-LTR রেট্রোট্রান্সপোসন। সুতরাং, এটি লাইন এবং SINE এর মধ্যে মূল পার্থক্য। উপরন্তু, বিপরীত ট্রান্সক্রিপ্টেজ এনজাইমের জন্য LINES কোড, যখন SINE বিপরীত ট্রান্সক্রিপ্টেজ এনজাইমের জন্য কোড করে না। সুতরাং, এটি লাইন এবং সাইনের মধ্যে আরেকটি পার্থক্য।
লাইন এবং SINE-এর মধ্যে আরও পার্থক্যগুলি পাশাপাশি তুলনা করার জন্য নীচে সারণী আকারে তালিকাভুক্ত করা হয়েছে৷
সারাংশ – লাইন বনাম SINEs
রেট্রোট্রান্সপোসন প্রধানত সকল ইউক্যারিওটে পাওয়া যায় কিন্তু প্রোক্যারিওটে অনুপস্থিত। আনুমানিক, মানুষের জিনোমের 37% রেট্রোট্রান্সপোসন রয়েছে। রেট্রোট্রান্সপোসন প্রধানত দুই প্রকার: এলটিআর এবং নন-এলটিআর রেট্রোট্রান্সপোসন। নন-এলটিআর রেট্রোট্রান্সপোসনে লং টার্মিনাল রিপিট (এলটিআর) থাকে না, যা এলটিআর রেট্রোট্রান্সপোসনে উপস্থিত থাকে।নন-এলটিআর রেট্রোট্রান্সপোসনগুলি আরও দুটি বিভাগে বিভক্ত: লাইন এবং সাইন। লাইনগুলি লম্বা নন-LTR রেট্রোট্রান্সপোসন, যখন SINEগুলি অনেক ছোট নন-LTR রেট্রোট্রান্সপোসন। সুতরাং, এটি লাইন এবং SINE-এর মধ্যে পার্থক্যের সারাংশ।
