ক্লেনো এবং T4 ডিএনএ পলিমারেজের মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে ক্লেনো ফ্র্যাগমেন্ট হল ই. কোলাই ডিএনএ পলিমারেজ 1 এর একটি বড় টুকরো এবং টি4 ডিএনএ পলিমারেজ হল ব্যাকটিরিওফেজ T4-এর ডিএনএ পলিমারেজ 1৷
DNA পলিমারেজগুলি হল এনজাইম যা একটি পূর্ব-বিদ্যমান প্রাইমারের 3′-OH প্রান্তে ডিঅক্সিরাইবোনিউক্লিওটাইড যোগ করে ডিএনএ গঠনকে অনুঘটক করে। বিভিন্ন ধরণের ডিএনএ পলিমারেজ রয়েছে। আণবিক জীববিজ্ঞানে ব্যবহৃত বেশিরভাগ ডিএনএ পলিমারেজ হল প্রোক্যারিওটিক ডিএনএ পলিমারেজ। ক্লেনো ফ্র্যাগমেন্ট এবং টি 4 ডিএনএ পলিমারেজ হল দুটি ধরণের ডিএনএ পলিমারেজ যার প্রোক্যারিওটিক উত্স রয়েছে। ক্লেনো ফ্র্যাগমেন্ট হল বৃহৎ খণ্ড যা E এর ক্লিভেজ থেকে উৎপন্ন হয়।কোলাই ডিএনএ পলিমারেজ 1 ব্যাকটেরিয়া প্রোটিজ সাবটিলিসিন দ্বারা দুটি খণ্ডে বিভক্ত। T4 DNA পলিমারেজ হল ব্যাকটেরিওফেজ T4 এর DNA পলিমারেজ 1। Klenow এবং T4 DNA পলিমারেজ উভয়েরই 5′→3′ পলিমারেজ এবং 3′→5′ exonuclease কার্যকলাপ রয়েছে। তাদের উভয়েরই 5′→3′ exonuclease কার্যকলাপের অভাব রয়েছে, যা তাদেরকে আণবিক জীববিজ্ঞানের অনেক প্রয়োগের জন্য আরও উপযুক্ত করে তোলে।
ক্লেনো কি?
ক্লেনো ফ্র্যাগমেন্ট একটি ডিএনএ পলিমারেজ যা আণবিক জীববিজ্ঞানে কার্যকর। যখন ই. কোলাই ডিএনএ পলিমারেজ 1 ব্যাকটেরিয়া প্রোটিজ, সাবটিলিসিন দ্বারা প্রোটিওলাইটিক হজমের মধ্য দিয়ে যায়, তখন এটি দুটি খণ্ডে পরিণত হয়: একটি হল একটি বড় খণ্ড এবং অন্যটি একটি ছোট খণ্ড। ক্লেনো ফ্র্যাগমেন্ট হল বড় টুকরো যার আকার 68 kDa। ক্লেনো ফ্র্যাগমেন্টে DNA Pol I-এর 5′→3′ পলিমারেজ এবং 3′→5′ exonuclease (প্রুফরিডিং) কার্যক্রম রয়েছে। ক্লেনো ফ্র্যাগমেন্টের 3′→5′ এক্সোনিউক্লিজ অ্যাক্টিভিটি পলিমারাইজেশনের অগ্রগতির সাথে সাথে ভুলভাবে যুক্ত বেস অপসারণকে সহজতর করে। Klenow খণ্ডে 5′→3′ exonuclease কার্যকলাপ থাকে না, যা পূর্ণ-দৈর্ঘ্য বা অক্ষত E দ্বারা দেখানো হয়।কোলাই ডিএনএ পলিমারেজ 1. শুধুমাত্র পলিমারাইজেশন কার্যকলাপ একা প্রয়োজন হলে এটি সুবিধাজনক। ক্লেনো টুকরোগুলি 5’ ওভারহ্যাং, প্রোবের সংশ্লেষণ, ডিএনএ সিকোয়েন্সিং, ডাবল-স্ট্র্যান্ডেড ডিএনএ সংশ্লেষণ, সিডিএনএ দ্বিতীয় স্ট্র্যান্ডের সংশ্লেষণ এবং সাইট-নির্দেশিত মিউটাজেনেসিস পূরণ করতে ব্যবহৃত হয়।
চিত্র 01: ক্লেনো ফ্র্যাগমেন্ট
কিছু নির্দিষ্ট অ্যাপ্লিকেশনে, ক্লেনো ফ্র্যাগমেন্টের 3′→5′ exonuclease কার্যকলাপও অবাঞ্ছিত হয়ে ওঠে। ক্লেনো টুকরার জন্য কোড করে এমন জিনে একটি মিউটেশন প্রবর্তন করে এটি অপসারণ করা যেতে পারে। ফলস্বরূপ ক্লেনো খণ্ডটি এক্সো-ক্লেনো ফ্র্যাগমেন্ট নামে পরিচিত। অতএব, এক্সো-ক্লেনো ফ্র্যাগমেন্টে E. coli পলিমারেজ 1 এর শুধুমাত্র 5′→3′ পলিমারেজ কার্যকলাপ রয়েছে।
T4 DNA পলিমারেজ কি?
T4 ডিএনএ পলিমারেজ হল একটি ডিএনএ পলিমারেজ যা ডিএনএর সংশ্লেষণকে অনুঘটক করে।এটি ব্যাকটেরিওফেজ T4 দ্বারা কোড করা একটি প্রোটিন। কাঠামোগতভাবে, T4 DNA পলিমারেজ হল একটি 898 অ্যামিনো অ্যাসিড অবশিষ্টাংশ প্রোটিন (103.6 kDa এর আণবিক ওজন)। সংশ্লেষণকে অনুঘটক করার জন্য একটি টেমপ্লেট এবং একটি প্রাইমার প্রয়োজন৷
চিত্র 02: T4 DNA পলিমারেজ
ক্লেনো ফ্র্যাগমেন্টের অনুরূপ, T4 ডিএনএ পলিমারেজের 5′→3′ পলিমারেজ এবং 3′→5′ এক্সোনিউক্লিজ ক্রিয়াকলাপ রয়েছে। তদুপরি, এটিতে 5′→3′ exonuclease কার্যকলাপেরও অভাব রয়েছে। T4 ডিএনএ পলিমারেজ ডিএনএ খণ্ডের 5′-প্রসারিত প্রান্তগুলি পূরণ করতে কার্যকর। এটি প্রায়শই ডাবল-স্ট্র্যান্ডেড ডিএনএ-এর 5′-এন্ড বা 3′-এন্ড-লেবেলিং করতে ব্যবহৃত হয়। T4 DNA পলিমারেজ প্রায়ই ভোঁতা ক্লোনিং-এ ব্যবহৃত হয়। T4 DNA পলিমারেজের 3′→5′ exonuclease (প্রুফরিডিং) কার্যকলাপ ক্লেনো খণ্ডের চেয়ে শক্তিশালী (200 গুণেরও বেশি)। সবচেয়ে গুরুত্বপূর্ণ, T4 ডিএনএ পলিমারেজের উচ্চ প্রসেসিভিটি রয়েছে (প্রতি সেকেন্ডে 400 নিউক্লিওটাইড)।
ক্লেনো এবং T4 ডিএনএ পলিমারেজের মধ্যে মিল কী?
- ক্লেনো এবং T4 ডিএনএ পলিমারেজ দুটি প্রোক্যারিওটিক পলিমারেজ।
- উভয় পলিমারেজেই 5′→3′ পলিমারেজ এবং 3′→5′ exonuclease কার্যকলাপ রয়েছে।
- তারা 5′→3′ exonuclease কার্যকলাপ প্রদর্শন করে না।
- DNA এর সংশ্লেষণকে অনুঘটক করার জন্য উভয় এনজাইমের একটি টেমপ্লেট এবং একটি প্রাইমার প্রয়োজন।
- এই এনজাইমগুলি তাপ নিষ্ক্রিয় হতে পারে 75 0
ক্লেনো এবং T4 ডিএনএ পলিমারেজের মধ্যে পার্থক্য কী?
ক্লেনো এবং T4 ডিএনএ পলিমারেজের মধ্যে মূল পার্থক্য হল প্রতিটি এনজাইমের উৎপত্তি। Klenow খণ্ডটি একটি ব্যাকটেরিয়া থেকে উদ্ভূত হয়েছে যখন T4 DNA পলিমারেজ একটি ব্যাকটেরিওফেজ থেকে উদ্ভূত হয়েছে যা একটি ভাইরাস। T4 ডিএনএ পলিমারেজের ক্লেনো ফ্র্যাগমেন্টের তুলনায় উচ্চ প্রক্রিয়াকরণ রয়েছে। অধিকন্তু, T4 ডিএনএ পলিমারেজের ক্লেনো খণ্ডের তুলনায় একটি শক্তিশালী প্রুফরিডিং কার্যকলাপ রয়েছে।সুতরাং, এটি Klenow এবং T4 DNA পলিমারেজের মধ্যে আরেকটি পার্থক্য।
নীচের তথ্য-গ্রাফিক ছক আকারে Klenow এবং T4 DNA পলিমারেজের মধ্যে আরও পার্থক্য তালিকাভুক্ত করে।
সারাংশ – ক্লেনো বনাম T4 ডিএনএ পলিমারেজ
ক্লেনো ফ্র্যাগমেন্ট হল ই. কোলাই ডিএনএ পলিমারেজ 1 এর একটি বৃহৎ খণ্ড। এতে মাত্র 5′→3′ পলিমারেজ এবং 3′→5′ এক্সোনিউক্লিজ ক্রিয়াকলাপ রয়েছে। এটিতে 5′→3′ অক্ষত E. coli DNA pol 1 এর exonuclease কার্যকলাপের অভাব রয়েছে। অতএব, Klenow ফ্র্যাগমেন্ট হল একটি ব্যাকটেরিয়া পলিমারেজ। অন্যদিকে, T4 ডিএনএ পলিমারেজ হল ব্যাকটেরিওফেজ T4 দ্বারা কোড করা একটি পলিমারেজ। Klenow খণ্ডের অনুরূপ, এতে 5′→3′ পলিমারেজ এবং 3′→5′ exonuclease কার্যকলাপ রয়েছে এবং এতে 5′→3′ exonuclease কার্যকলাপের অভাব রয়েছে। যাইহোক, T4 ডিএনএ পলিমারেজের উচ্চ প্রসেসিভিটি এবং উচ্চ প্রুফরিডিং কার্যকলাপ রয়েছে ক্লেনো টুকরার তুলনায়।সুতরাং, এটি ক্লেনো এবং T4 ডিএনএ পলিমারেজের মধ্যে মূল পার্থক্য।
