ক্লেনো ফ্র্যাগমেন্ট এবং ডিএনএ পলিমারেজ 1 এর মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে ক্লেনো ফ্র্যাগমেন্ট হল ডিএনএ পলিমারেজ 1 এর একটি বড় অংশ যার মধ্যে 5′ থেকে 3′ এক্সোনিউক্লিজ অ্যাক্টিভিটি নেই যেখানে ডিএনএ পলিমারেজ হল ই. কলির একটি এনজাইম যার তিনটিই রয়েছে 5′ থেকে 3′ exonuclease কার্যকলাপ সহ ডোমেন।
ডিএনএ পলিমারেজ হল জীবন্ত প্রাণীর ডিএনএ প্রতিলিপিতে জড়িত অন্যতম প্রধান এনজাইম। আকার এবং আকৃতির উপর ভিত্তি করে ইউক্যারিওটস এবং প্রোক্যারিওটে ডিএনএ পলিমারেজ এনজাইমের বিভিন্ন রূপ পাওয়া যায়। ডিএনএ পলিমারেজ 1, 2 এবং 3 শুধুমাত্র প্রোক্যারিওটিক জীবগুলিতে পাওয়া যায় এবং তারা ডিএনএ প্রতিলিপিতে বিভিন্ন ভূমিকা পালন করে।ডিএনএ পলিমারেজ 1 এর তিনটি ডোমেন রয়েছে যেখানে 5′ থেকে 3′ পলিমারেজ, 3′ থেকে 5′ এক্সোনিউক্লিজ অ্যাক্টিভিটি এবং 5′ থেকে 3′ এক্সোনিউক্লিজ অ্যাক্টিভিটি রয়েছে। ক্লেনো ফ্র্যাগমেন্ট হল ডিএনএ পলিমারেজ 1 এর একটি প্রোটিওলাইটিক পণ্য। এটিতে 5 থেকে 3′ পলিমারেজ এবং 3′ থেকে 5′ অক্ষত ডিএনএ পলিমারেজ 1 এর এক্সোনিউক্লিজ ক্রিয়াকলাপ রয়েছে, তবে এতে 5′ থেকে 3′ এক্সোনুক্লিজ কার্যকলাপের অভাব রয়েছে।
ক্লেনো ফ্র্যাগমেন্ট কি?
ক্লেনো ফ্র্যাগমেন্ট হল ডিএনএ পলিমারেজ 1 এর একটি বড় অংশ। ডিএনএ পলিমারেজ 1 এর বিপরীতে, ক্লেনো ফ্র্যাগমেন্টে 5′ থেকে 3′ এক্সোনিউক্লিজ অ্যাক্টিভিটি দেখা যায় না কারণ এতে 5′ থেকে 3′ ফরোয়ার্ড এক্সনোক্লিজ ডোমেন নেই। ক্লেনো টুকরোগুলি ডিএনএ পলিমারেজ 1 হজম করে সাবটিলিসিন নামক একটি প্রোটিসের সাথে উত্পাদিত হয়, যা একটি প্রোটিন-হজমকারী এনজাইম। কিছু অ্যাপ্লিকেশনে, ক্লেনো খণ্ডের 3′ থেকে 5′ এক্সোনিউক্লিজ কার্যকলাপ অবাঞ্ছিত হয়ে ওঠে। ক্লেনো খণ্ডটিকে এনকোড করে এমন জিনে একটি মিউটেশন প্রবর্তন করে এটি অপসারণ করা যেতে পারে। ফলস্বরূপ যে এনজাইমটিতে মাত্র 5′ থেকে 3′ পলিমারেজ ক্রিয়াকলাপ রয়েছে তা এক্সো-ক্লেনো ফ্র্যাগমেন্ট নামে পরিচিত।আকৃতিগতভাবে, ক্লেনো খণ্ডটি মানুষের ডান হাতের অনুরূপ। এটির এন-টার্মিনাল 3′-5′ এক্সোনুক্লিজ ডোমেন এবং সি-টার্মিনাল পলিমারেজ ডোমেনটি প্রায় 30 এ দ্বারা পৃথক করা হয়েছে।
চিত্র 01: ক্লেনো ফ্র্যাগমেন্ট এবং ডিএনএ পলিমারেজ 1
ক্লেনো ফ্র্যাগমেন্ট আণবিক জৈবিক কৌশলগুলির একটি গুরুত্বপূর্ণ হাতিয়ার। Klenow খণ্ডের একাধিক ব্যবহার রয়েছে। ভোঁতা টুকরা তৈরি করার জন্য এগুলি ব্লন্ট-এন্ড ক্লোনিংয়ে অত্যন্ত গুরুত্বপূর্ণ। ক্লেনো টুকরা 3′ ওভারহ্যাংগুলি সরিয়ে দিতে পারে বা 5′ ওভারহ্যাংগুলিকে ভোঁতা প্রান্ত তৈরি করতে পারে। তদুপরি, ক্লেনো টুকরোগুলি একক স্ট্র্যান্ড থেকে ডাবল-স্ট্র্যান্ডেড ডিএনএ সংশ্লেষণ করতে ব্যবহৃত হয়। উপরন্তু, তারা 5’ থেকে 3′ ডিএনএ নির্ভর ডিএনএ পলিমারেজ কার্যকলাপ ব্যবহার করে তেজস্ক্রিয়ভাবে লেবেলযুক্ত প্রোব প্রস্তুত করতে ব্যবহৃত হয়।
DNA পলিমারেজ 1 কি?
DNA পলিমারেজ 1 (Pol 1) হল প্রোক্যারিওটে পাওয়া একটি এনজাইম যা ব্যাকটেরিয়ার ডিএনএ প্রতিলিপির জন্য প্রয়োজন। এটি 1956 সালে আর্থার কর্নবার্গের দ্বারা আবিষ্কৃত প্রথম ধরনের ডিএনএ পলিমারেজ। পল 1 হল ই. কোলাইতে সর্বাধিক প্রচুর পলিমারেজ। এটি জিন পোলা দ্বারা এনকোড করা হয় এবং 928টি অ্যামিনো অ্যাসিডের সমন্বয়ে গঠিত। এটি তিনটি ডোমেন নিয়ে গঠিত। তিনটি ডোমেইনই স্বতন্ত্র কার্য সম্পাদন করে। দুটি ডোমেন 5′ থেকে 3′ exonuclease কার্যকলাপ এবং 3′ থেকে 5′ exonuclease কার্যকলাপ পরিচালনা করে। Pol 1 এর দখলে থাকা এই কার্যকলাপের কারণে, এটি একটি DNA প্রতিলিপিকারী এনজাইমের পরিবর্তে একটি DNA মেরামতকারী এনজাইম হিসাবে জনপ্রিয়। তৃতীয় ডোমেনে টেমপ্লেট ডিএনএ প্রকাশের আগে একাধিক পলিমারাইজেশন (5′ থেকে 3′) অনুঘটক করার ক্ষমতা রয়েছে এবং নতুন ডিএনএ পূরণ করে এবং আরএনএ প্রাইমারগুলি সরিয়ে ওকাজাকি খণ্ডগুলিকে একত্রে সংযুক্ত করার ক্ষমতা রয়েছে৷
চিত্র 02: ডিএনএ পলিমারেজ
E Coli থেকে বিচ্ছিন্ন পোল 1 ব্যাপকভাবে আণবিক প্রয়োগে ব্যবহৃত হয়েছিল। যাইহোক, একবার Taq পলিমারেজ আবিষ্কৃত হলে, এটি PCR প্রযুক্তিতে E Coli Pol 1 কে প্রতিস্থাপন করে। Taq পলিমারেজ হল এক ধরনের থার্মোস্টেবল ডিএনএ পলিমারেজ যা Pol 1 এর অন্তর্গত।
ক্লেনো ফ্র্যাগমেন্ট এবং ডিএনএ পলিমারেজ 1 এর মধ্যে মিল কী?
- ক্লেনো ফ্র্যাগমেন্ট হল ডিএনএ পলিমারেজ ১ এর একটি বড় অংশ।
- তাদের 5’ থেকে 3′ ডিএনএ নির্ভরশীল ডিএনএ পলিমারেজ ক্রিয়াকলাপ এবং 3’ থেকে 5′ এক্সোনিউক্লিজ অ্যাক্টিভিটি রয়েছে যা প্রুফরিডিংয়ের মধ্যস্থতা করে।
- এগুলি একাধিক উদ্দেশ্যে ব্যবহৃত হয়৷
ক্লেনো ফ্র্যাগমেন্ট এবং ডিএনএ পলিমারেজ 1 এর মধ্যে পার্থক্য কী?
ক্লেনো ফ্র্যাগমেন্ট এবং ডিএনএ পলিমারেজ 1 এর মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে ক্লেনো ফ্র্যাগমেন্টে 5′ থেকে 3′ এক্সোনিউক্লিজ অ্যাক্টিভিটি নেই যেখানে ডিএনএ পলিমারেজ 1-এর 5′ থেকে 3′ এক্সোনিউক্লিজ অ্যাক্টিভিটি রয়েছে। অতএব, ক্লেনো ফ্র্যাগমেন্টের দুটি ডোমেন রয়েছে, যখন ডিএনএ পলিমারেজ 1 এর তিনটি ডোমেন রয়েছে।
ইনফোগ্রাফিকের নীচে ক্লেনো ফ্র্যাগমেন্ট এবং ডিএনএ পলিমারেজ 1 এর মধ্যে পার্থক্যের আরও বিশদ বিবরণ দেখায়।
সারাংশ – ক্লেনো ফ্র্যাগমেন্ট বনাম ডিএনএ পলিমারেজ 1
DNA পলিমারেজ 1 হল E. coli এর একটি এনজাইম যার তিনটি ডোমেন রয়েছে 5′ থেকে 3′ পলিমারাইজেশন ডোমেন, 3′ থেকে 5′ exonuclease ডোমেন এবং 5′ থেকে 3′ exonuclease ডোমেন। Klenow খণ্ডটি DNA পলিমারেজের একটি বড় অংশ। এটিতে ডিএনএ পলিমারেজ 1 এর একটি ডোমেনের অভাব রয়েছে, যা 5′ থেকে 3′ এক্সোনুক্লিজ ডোমেন। ক্লেনো ফ্র্যাগমেন্ট এবং ডিএনএ পলিমারেজ 1 এর মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে ক্লেনো ফ্র্যাগমেন্টে 5′ থেকে 3′ এক্সোনিউক্লিজ ডোমেন থাকে না যখন ডিএনএ পলিমারেজ 1 এর 5′ থেকে 3′ এক্সোনুক্লিজ ডোমেন থাকে৷
