QTL এবং GWAS এর মধ্যে মূল পার্থক্য বিশ্লেষণে ব্যবহৃত সিকোয়েন্সের ধরনের উপর নির্ভর করে। QTL পলিজেনিক উত্তরাধিকারের সাথে যুক্ত ফেনোটাইপিক বৈশিষ্ট্য বিশ্লেষণ করতে লিঙ্কেজ জিন লোকি ব্যবহার করে যখন GWAS একটি নির্দিষ্ট অবস্থার একক নিউক্লিওটাইড পলিমরফিজম বিশ্লেষণ করতে পুরো জিনোম সিকোয়েন্স ব্যবহার করে৷
QTL মানচিত্র এবং GWAS বিভিন্ন বৈশিষ্ট্যের জন্য জেনেটিক বিশ্লেষণে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে। তদ্ব্যতীত, তারা অজানা এটিওলজি সহ বিভিন্ন রোগের অবস্থার বিশ্লেষণে গুরুত্বপূর্ণ। উপরন্তু, সিকোয়েন্সিং উভয় কৌশলে একটি মূল ভূমিকা পালন করে। এই কৌশলগুলি আরও সঠিকতা এবং নির্ভুলতার জন্য অন্যান্য উচ্চ থ্রুপুট কৌশলগুলির সাথে মিলিত হতে পারে।
QTL কি?
QTL মানে পরিমাণগত বৈশিষ্ট্য লোকাস। এটি একটি ফেনোটাইপিক বৈশিষ্ট্যের সাথে যুক্ত ডিএনএর একটি অঞ্চল। সাধারণত, একটি QTL পলিজেনিক প্রভাবের জন্ম দেয়। QTL-এর বন্টন পরিবর্তিত হয়, এবং QTL-এর সংখ্যা একটি নির্দিষ্ট ফিনোটাইপিক বৈশিষ্ট্যের পরিবর্তনের মাত্রা নির্দেশ করে। উপরন্তু, তারা সাধারণত অবিচ্ছিন্ন বৈশিষ্ট্যগুলির জন্য কোড করে এবং পৃথক বৈশিষ্ট্য নয়।
QTL অঞ্চলগুলির সনাক্তকরণের উপর, একটি নির্দিষ্ট QTL এলাকা ক্রম করা গুরুত্বপূর্ণ৷ তদুপরি, তদন্ত এবং গবেষণাকে সহজ করার জন্য, সাধারণ QTL অঞ্চলের সিকোয়েন্স ডেটা সিকোয়েন্সিং এবং সংরক্ষণ করা হয় বায়োইনফরমেটিক্সের সাথে জড়িত। আমরা এই কৌশলটিকে QTL ম্যাপিং বলি। পরবর্তীকালে, QTL অঞ্চলের ক্রমগুলির সাথে একটি ডাটাবেস তৈরি হয়৷
চিত্র 01: QTL স্ক্যান
উপরন্তু, QTL সিকোয়েন্সের প্রয়োগগুলি মূলত BLAST টুলের উপর নির্ভর করে, যেখানে অনুক্রমের মিল নির্ধারণ করা যায়। এটি জীবের মধ্যে সম্পর্ক নির্ণয়ের ক্ষেত্রে গুরুত্বপূর্ণ। তদ্ব্যতীত, একটি নির্দিষ্ট পলিজেনিক ফেনোটাইপের জটিলতা নির্ধারণে এটি গুরুত্বপূর্ণ। এটি একটি নির্দিষ্ট বৈশিষ্ট্যের বিবর্তনও নির্ধারণ করে৷
বর্তমানে, QTL বিশ্লেষণ অন্যান্য উচ্চ থ্রুপুট কৌশল যেমন DNA মাইক্রোয়ারের সাথে মিলিত হয়। ফেনোটাইপের এক্সপ্রেশন বিশ্লেষণে এটি গুরুত্বপূর্ণ। বর্তমানে, বিজ্ঞানীরা QTL ডাটাবেস তৈরিতে অনেক আগ্রহী কারণ QTL অঞ্চলগুলি বিভিন্ন প্রজাতির অনেক গুরুত্বপূর্ণ বৈশিষ্ট্যের জন্য দায়ী৷
GWAS কি?
GWAS মানে জিনোম ওয়াইড অ্যাসোসিয়েশন স্টাডি। এটি সম্পূর্ণ জিনোম অ্যাসোসিয়েশন অধ্যয়নকেও উল্লেখ করে। এই গবেষণাগুলি মূলত পর্যবেক্ষণমূলক গবেষণায় ফোকাস করে। এটি সাধারণত একটি নির্দিষ্ট বৈশিষ্ট্যের সাথে যুক্ত বিভিন্ন ব্যক্তির জেনেটিক বৈকল্পিক বিশ্লেষণ করে। অধিকন্তু, GWAS বিশ্লেষণের জন্য পুরো জিনোম গুরুত্বপূর্ণ।
চিত্র 02: GWAS
GWAS বিভিন্ন রোগের অবস্থার সাথে যুক্ত একক নিউক্লিওটাইড পলিমারফিজম বিশ্লেষণের একটি গুরুত্বপূর্ণ হাতিয়ার। এটি একটি বিস্তৃত জনসংখ্যা জুড়ে বিভিন্ন একক নিউক্লিওটাইড পলিমারফিজমের একটি তুলনামূলক অধ্যয়ন। উপরন্তু, GWAS এর অধ্যয়ন নমুনা খুব বেশি; তাই, এটি একটি ক্রস-বিভাগীয় সমগোত্রীয় অধ্যয়নের ফর্ম্যাটও নেয়৷
এছাড়াও, প্রথম GWAS গবেষণাটি মায়োকার্ডিয়াল ইনফার্কশন এবং মায়োকার্ডিয়াল ইনফার্কশনের সাথে যুক্ত জিন বিশ্লেষণের ক্ষেত্রে হয়েছিল। বর্তমানে, জিডব্লিউএএস জটিল রোগের জেনেটিক পটভূমি নির্ধারণে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে অজানা অ্যাটিওলজির সাথে।
QTL এবং GWAS-এর মধ্যে মিল কী?
- এরা বিশ্লেষণের জন্য ডিএনএ সিকোয়েন্স ডেটার উপর নির্ভর করে।
- দুটিই বিভিন্ন চরিত্রের জেনেটিক ব্যাকগ্রাউন্ডের সাথে যুক্ত।
- এছাড়াও, ফলাফল বের করতে এবং ব্যাখ্যা করার জন্য তাদের জৈব তথ্যবিজ্ঞান সরঞ্জামের প্রয়োজন হয়৷
- এগুলি বড় জনসংখ্যার উপর করা হয়৷
QTL এবং GWAS এর মধ্যে পার্থক্য কী?
QTL লিঙ্কযুক্ত জিন লোকি ব্যবহার করে পলিজেনিক উত্তরাধিকারের সাথে যুক্ত ফেনোটাইপিক বৈশিষ্ট্যগুলি বিশ্লেষণ করে যখন GWAS সম্পূর্ণ জিনোম ক্রম ব্যবহার করে একটি নির্দিষ্ট অবস্থার একক নিউক্লিওটাইড পলিমরফিজম বিশ্লেষণ করে। সুতরাং, এটি QTL এবং GWAS এর মধ্যে মূল পার্থক্য। QTL ম্যাপিং তুলনামূলকভাবে GWAS এর তুলনায় কম জটিল কৌশল কারণ এর জন্য সম্পূর্ণ জিনোম সিকোয়েন্সিং প্রয়োজন।
নীচের ইনফোগ্রাফিকটি সারণী আকারে QTL এবং GWAS এর মধ্যে পার্থক্যকে সংক্ষিপ্ত করে।
সারাংশ – QTL বনাম GWAS
QTL ম্যাপিং এবং GWAS বিভিন্ন ফেনোটাইপিক বৈশিষ্ট্যের জেনেটিক পটভূমি নির্ধারণে একটি প্রধান ভূমিকা পালন করে। তারা বিভিন্ন রোগের জেনেটিক পটভূমি বিশ্লেষণেও সাহায্য করে। QTL ম্যাপিং ক্রমাগত বৈশিষ্ট্যগুলির জন্য দায়ী লিঙ্কেজ জিনগুলিকে ম্যাপ করে এবং পলিজেনিক উত্তরাধিকার জিনগুলির ম্যাপিংও জড়িত। অন্যদিকে, GWAS একক নিউক্লিওটাইড পলিমারফিজমের জন্য পুরো জিনোম বিশ্লেষণের সাথে সঞ্চালিত হয়। উপরন্তু, এটি একটি বৃহত্তর জনসংখ্যা জুড়ে সঞ্চালিত হয়. সুতরাং, এটি QTL এবং GWAS এর মধ্যে পার্থক্যের সারাংশ।
