FISH এবং CGH-এর মধ্যে মূল পার্থক্য হল FISH হল একটি আণবিক কৌশল যা ফ্লুরোসেন্টলি লেবেলযুক্ত প্রোব ব্যবহার করে একটি ক্রোমোজোমের নির্দিষ্ট ডিএনএ ক্রম সনাক্ত করে, অন্যদিকে CGH হল আরেকটি আণবিক সাইটোজেনেটিক কৌশল যা জিনোমিক ডিএনএ-তে পরিবর্তন সনাক্ত করে৷
সাইটোজেনেটিক বিশ্লেষণ ওষুধে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে যখন ক্রোমোজোমাল অস্বাভাবিকতা যেমন অ্যানিউপ্লয়েডিস, মুছে ফেলা, অনুলিপি এবং পুনর্বিন্যাস ইত্যাদি সনাক্ত করা যায়। ক্রোমোসোমাল অস্বাভাবিকতা অবশেষে ক্যান্সার, বন্ধ্যাত্ব, ডাউন সিনড্রোম, ক্লাইন সিনড্রোম, ক্লাইনারেলের মতো জেনেটিক রোগের দিকে পরিচালিত করে। সিন্ড্রোম, লিউকেমিয়া ইত্যাদি। উপরে উল্লিখিত ত্রুটি এবং রোগ সনাক্ত করার জন্য বিভিন্ন আণবিক সাইটোজেনেটিক পদ্ধতি রয়েছে।তাদের মধ্যে, FISH (সিটু হাইব্রিডাইজেশনে ফ্লুরোসেন্ট) এবং CGH (তুলনামূলক জিনোমিক হাইব্রিডাইজেশন) দুটি শক্তিশালী হাইব্রিডাইজেশন কৌশল। যাইহোক, উভয় পদ্ধতিরই ভালো-মন্দ আছে।
মাছ কি?
FISH হল একটি নিউক্লিক অ্যাসিড হাইব্রিডাইজেশন কৌশল যা টিস্যুর একটি অংশ বা অংশে, সমগ্র টিস্যু বা কোষে সঞ্চালিত হয়। এটি একটি প্রোব-ভিত্তিক পদ্ধতি। কৌশলটি ওয়াটসন ক্রিক পরিপূরক বেস পেয়ারিং তত্ত্বের উপর নির্ভর করে, যার ফলে হয় DNA – DNA হাইব্রিড বা DNA – RNA হাইব্রিড, যা এইভাবে পরিবর্তিত জিন সনাক্ত করতে পারে বা আগ্রহের জিন সনাক্ত করতে পারে। আরও, এই কৌশলটি সিঙ্গেল-স্ট্র্যান্ডেড ডিএনএ সিকোয়েন্স, ডাবল-স্ট্র্যান্ডেড ডিএনএ সিকোয়েন্স, সিঙ্গেল-স্ট্র্যান্ডেড আরএনএ সিকোয়েন্স বা সিন্থেটিক অলিগোনিউক্লিওটাইড ব্যবহার করে নিক ট্রান্সলেশন ব্যবহার করে প্রোব হিসেবে তৈরি করা হয় যা আগ্রহের জিন সিকোয়েন্সের পরিপূরক। এছাড়াও, এই কৌশলটির সবচেয়ে গুরুত্বপূর্ণ বৈশিষ্ট্য হল ফ্লুরোসেন্স রঞ্জকগুলির সাথে প্রোবের লেবেলিং। এইভাবে, প্রোবগুলি ক্রোমোজোমের পরিপূরক অংশগুলির সাথে আবদ্ধ হয় এবং এটি সনাক্তকরণের জন্য সহজ করে তোলে।
আরও, মাছ একটি অত্যন্ত সংবেদনশীল এবং নির্দিষ্ট পদ্ধতি। অতএব, এটি হেমাটোলজিকাল ম্যালিগন্যান্সি এবং কঠিন টিউমারের গবেষণা এবং নির্ণয় উভয় ক্ষেত্রেই একটি সাধারণ কৌশল। কিন্তু, FISH কম রেজোলিউশন দেখায়। প্রোব সিকোয়েন্স ডিজাইন করার জন্য লক্ষ্য অস্বাভাবিকতার পূর্ব জ্ঞানও প্রয়োজন।
চিত্র 01: মাছ
ফিশের অনেক প্রয়োগ রয়েছে, প্রধানত সংক্রামক রোগের আণবিক ডায়গনিস্টিকগুলিতে প্যাথোজেনের উপস্থিতি সনাক্ত করতে এবং আণবিক ডায়গনিস্টিকসের মাধ্যমে প্যাথোজেন নিশ্চিত করতে। অধিকন্তু, FISH হল উন্নয়নমূলক জীববিজ্ঞান, ক্যারিওটাইপিং এবং ফাইলোজেনেটিক বিশ্লেষণ এবং ক্রোমোজোমের শারীরিক ম্যাপিংয়ের ক্ষেত্রে একটি সাধারণভাবে ব্যবহৃত কৌশল৷
CGH কি?
তুলনামূলক জিনোমিক হাইব্রিডাইজেশন (CGH) হল আরেকটি ডিএনএ ভিত্তিক আণবিক সাইটোজেনেটিক কৌশল যা জিনোমিক ডিএনএ সিকোয়েন্সের পরিবর্তন সনাক্ত করতে পারে।পদ্ধতিটি একটি উন্নত পদ্ধতি যা জিনোমিক ডিএনএ ক্রমগুলির পরিবর্তন বা পরিবর্তনগুলি সনাক্ত করতে ক্রোমোজোম এবং জিনের পরিবর্তনগুলি বিশ্লেষণ করতে পারে। আরও, CGH-এর জন্য পরীক্ষামূলক নমুনা এবং রেফারেন্স নমুনা থেকে DNA-এর বিচ্ছিন্নতা এবং খণ্ডিতকরণ প্রয়োজন। তারপর, নমুনা দুটি ভিন্ন ফ্লুরোসেন্ট রঞ্জক (সাধারণত লাল এবং সবুজ) ব্যবহার করে লেবেল করা উচিত। পরে, উভয় নমুনা মিশ্রিত হয় এবং প্রতিযোগিতামূলক সংকরায়নের জন্য অনুমোদিত হয়। চূড়ান্ত ধাপ হল ডিএনএ-তে পরিবর্তনের জন্য নমুনার বিশ্লেষণ যেমন জিন নকল, জিন ক্ষয় ইত্যাদি। বিশেষ করে, এটি পরীক্ষার নমুনা এবং নিয়ন্ত্রণ নমুনার মধ্যে ডিএনএ কপি নম্বরের পার্থক্য পরিমাপ করে।
চিত্র 02: CGH
CGH এর আরেকটি সংস্করণ এখন উপলব্ধ; এটি সাধারণ সিজিএইচের চেয়ে আরও উন্নত পদ্ধতি। এটি অ্যারে-ভিত্তিক CGH বা aCGH নামে একটি কৌশল। aCGH একটি একক পরীক্ষায় হাজার হাজার ক্রমানুসারে জিন বা সিকোয়েন্স মুছে ফেলার সুনির্দিষ্ট সনাক্তকরণের অনুমতি দেয়।
FISH এবং CGH-এর মধ্যে মিল কী?
- ফিশ এবং সিজিএইচ দুটি আণবিক কৌশল।
- ফিশ এবং সিজিএইচ উভয়ই নিউক্লিক অ্যাসিড সংকরকরণের উপর নির্ভর করে।
- এছাড়াও, উভয় কৌশলেরই নির্দিষ্ট ডিএনএ লক্ষ্য শনাক্ত করার জন্য ডিজাইন করা প্রোবের প্রয়োজন।
- আমরা এগুলিকে প্রসবপূর্ব এবং প্রসব পরবর্তী জেনেটিক রোগ নির্ণয়ের জন্য ব্যবহার করি।
- এছাড়াও, জিনোমিক পরিবর্তনগুলি অধ্যয়নের জন্য ফিশ এবং সিজিএইচ উভয়ই অত্যন্ত শক্তিশালী হাতিয়ার৷
- তারা প্রোবের লেবেল দিতে ফ্লুরোসেন্ট রঞ্জক ব্যবহার করে।
FISH এবং CGH-এর মধ্যে পার্থক্য কী?
FISH হল একটি ইন সিটু হাইব্রিডাইজেশন পদ্ধতি যা নির্দিষ্ট ডিএনএ সিকোয়েন্স সনাক্ত করতে ফ্লুরোসেন্ট প্রোব ব্যবহার করে, অন্যদিকে CGH হল একটি আণবিক হাইব্রিডাইজেশন কৌশল যা জিনোমিক ডিএনএ সিকোয়েন্সের পরিবর্তন সনাক্ত করে। সুতরাং, এটি হল FISH এবং CGH এর মধ্যে মূল পার্থক্য।
এছাড়াও, FISH-এর প্রোব সিকোয়েন্স ডিজাইন করার জন্য লক্ষ্য অস্বাভাবিকতা সম্পর্কে পূর্ব জ্ঞানের প্রয়োজন হয়, যখন CGH-এর পূর্ব জ্ঞানের প্রয়োজন হয় না। এছাড়াও, FISH এবং CGH এর মধ্যে আরও একটি পার্থক্য হল যে FISH সীমিত রেজোলিউশন দেখায় যখন aCGH উচ্চ রেজোলিউশন দেখায়।
নীচের ইনফোগ্রাফিক ফিশ এবং সিজিএইচ-এর মধ্যে পার্থক্য সংক্ষিপ্ত করে।
সারাংশ – FISH বনাম CGH
ফিশ এবং সিজিএইচ হল দুটি আণবিক সাইটোজেনেটিক কৌশল যা আগ্রহের জিনের ক্রম সনাক্তকরণকে সহজ করে। FISH ফ্লুরোসেন্টলি লেবেলযুক্ত প্রোব ব্যবহার করে একটি ক্রোমোজোমে নির্দিষ্ট ডিএনএ ক্রম সনাক্তকরণের সুবিধা দেয় যখন CGH জিনোমিক ডিএনএ-তে পরিবর্তন সনাক্ত করতে সহায়তা করে। সুতরাং, এটি হল FISH এবং CGH এর মধ্যে মূল পার্থক্য।
