লক্ষ্যযুক্ত এবং অলক্ষ্যিত প্রোটিওমিক্সের মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে লক্ষ্যবস্তু প্রোটিওমিক্সের লক্ষ্য একটি নির্দিষ্ট প্রোটিনের প্রাচুর্য পরিমাপ করা যখন লক্ষ্যহীন প্রোটিওমিক্স একটি নির্দিষ্ট প্রোটিনকে লক্ষ্য করে না৷
প্রোটিওমিক্স হল প্রোটিন, তাদের গঠন এবং কার্যাবলীর বড় আকারের অধ্যয়ন। এটি নির্দিষ্ট অবস্থার অধীনে একটি কোষ, টিস্যু বা একটি জীবের সম্পূর্ণ প্রোটিন পরিপূরক অধ্যয়ন করে। টার্গেটেড প্রোটিওমিক্স এবং আনটার্গেটেড প্রোটিওমিক্স হিসাবে দুটি ধরণের প্রোটিওমিক্স রয়েছে৷
লক্ষ্যযুক্ত প্রোটিওমিক্স কি?
যার নাম ইঙ্গিত করে, লক্ষ্যযুক্ত প্রোটিওমিক্স বিশ্লেষণের জন্য প্রোটিনের জটিল মিশ্রণে একটি নির্দিষ্ট প্রোটিন বা একটি পেপটাইডকে লক্ষ্য করে।তারপরে এটি সেই পূর্বনির্বাচিত নির্দিষ্ট প্রোটিনের উপস্থিতি এবং পরিমাণ বিশ্লেষণ করে। এই পদ্ধতিটি শুধুমাত্র একটি নমুনা বা একাধিক নমুনার জন্য সম্ভব। এই পদ্ধতিটি প্রোটিনের একটি নির্দিষ্ট গ্রুপের জন্যও উপযুক্ত। এর ফলে আরও সুনির্দিষ্ট, পরিমাণগত এবং সংবেদনশীল তথ্য পাওয়া যায়। অধিকন্তু, লক্ষ্যযুক্ত প্রোটিওমিক্সের সাথে মিলিত ভর স্পেকট্রোমেট্রি আরও সঠিক নির্ভরযোগ্য পরিমাপ তৈরি করে। এই পদ্ধতিটি এর বিশ্লেষণের জন্য ট্রিপল কোয়াড্রপোল ভর স্পেকট্রোমিটার (QQQ) ব্যবহার করে।
চিত্র 01: প্রোটিওমিক্স
লক্ষ্যযুক্ত প্রোটিওমিক্স একটি উপযুক্ত পদ্ধতি যদি আপনি যাচাই করতে চান যে নকডাউন টার্গেট আসলেই ছিটকে গেছে কিনা বা যখন আপনি রক্তের সিরাম, সেরিব্রাল ফ্লুইড বা সেল লাইসেট ইত্যাদিতে একটি নির্দিষ্ট প্রোটিন/পেপটাইডের পরিমাণ নির্ধারণ করতে চান। এটি ব্যবহার করুন যদি আপনি পরীক্ষা করতে চান যে একটি নির্দিষ্ট প্রোটিন নমুনা জুড়ে আলাদাভাবে প্রকাশ করা হয়েছে বা একটি সময় কোর্স পরীক্ষার সময়।
আনটার্গেটেড প্রোটিওমিক্স কি?
অলক্ষ্যবিহীন প্রোটিওমিক্স, যেমন নাম উল্লেখ করেছে, তার বিশ্লেষণের জন্য একটি নির্দিষ্ট প্রোটিন বা পেপটাইডকে লক্ষ্য করে না। ডিসকভারি প্রোটিওমিক্স আনটার্গেটেড প্রোটিওমিক্সের অপর নাম। আসলে, এটি একটি আরও 'বিশ্বব্যাপী' বিশ্লেষণ। সাধারণত, লক্ষ্যবিহীন প্রোটিওমিক্স সম্পাদন করা হল "এই নমুনা বা একাধিক নমুনায় কোন প্রোটিন বা প্রোটিন রয়েছে?" প্রশ্নের উত্তর দেওয়া। এই পদ্ধতিটি লক্ষ্যযুক্ত প্রোটিওমিক্স হিসাবে সংবেদনশীল নয়। কিন্তু এটি অভিনব প্রোটিন সহ অনেক প্রোটিন সনাক্ত এবং পরিমাপ করতে পারে। লক্ষ্যহীন প্রোটিওমিক্স পরিমাণগত এবং গুণগত উভয় পরিমাপ তৈরি করতে পারে।
লক্ষ্যযুক্ত এবং লক্ষ্যবিহীন প্রোটিওমিক্সের মধ্যে মিল কী?
- লক্ষ্যযুক্ত এবং লক্ষ্যবিহীন উভয় প্রোটিওমিক্স নমুনায় প্রোটিন পরিমাপ করে।
- এগুলি প্রোটিওম বিশ্লেষণে গুরুত্বপূর্ণ৷
- এই পদ্ধতিতে ভর স্পেকট্রোমেট্রি ব্যবহার করা হয়।
লক্ষ্যযুক্ত এবং লক্ষ্যবিহীন প্রোটিওমিক্সের মধ্যে পার্থক্য কী?
প্রথমত, লক্ষ্যযুক্ত প্রোটিওমিক্স হল প্রোটিনের জটিল মিশ্রণে একটি নির্দিষ্ট প্রোটিন বা পেপটাইডের উপস্থিতি এবং পরিমাণ নির্ধারণ করা। বিপরীতে, লক্ষ্যহীন প্রোটিওমিক্স হল একটি নির্দিষ্ট প্রোটিনকে লক্ষ্য না করে একটি নমুনা বা নমুনায় উপস্থিত প্রোটিনের পরিমাণগত এবং গুণগত অধ্যয়ন। লক্ষ্যযুক্ত প্রোটিওমিক্স পূর্বনির্বাচিত বা লক্ষ্যযুক্ত প্রোটিনগুলির সাথে সঞ্চালিত হয় যখন এই নমুনায় প্রোটিনের প্রকারগুলি খুঁজে বের করার জন্য লক্ষ্যবিহীন প্রোটিওমিক্স সঞ্চালিত হয়। তাছাড়া, টার্গেটেড প্রোটিওমিক্স টার্গেটেড প্রোটিওমিক্সের চেয়ে বেশি সংবেদনশীল৷
সারাংশ - টার্গেটেড বনাম অলক্ষ্যিত প্রোটিওমিক্স
সংক্ষেপে বলতে গেলে, লক্ষ্যবস্তু এবং লক্ষ্যবিহীন প্রোটিওমিক্স হল দুই ধরনের প্রোটিন অধ্যয়ন। তাদের নাম অনুসারে, লক্ষ্যযুক্ত প্রোটিওমিক্স একটি নির্দিষ্ট প্রোটিনকে লক্ষ্য করে যখন লক্ষ্যহীন প্রোটিওমিক্স একটি নির্দিষ্ট প্রোটিনকে লক্ষ্য করে না।এটি লক্ষ্যবস্তু এবং লক্ষ্যবিহীন প্রোটিওমিক্সের মধ্যে পার্থক্য৷