মূল পার্থক্য - ব্যাকটেরিয়া ট্রান্সপোসেস বনাম রেট্রোভাইরাল ইন্টিগ্রেসস
পরিবহনযোগ্য জেনেটিক উপাদান দুটি প্রধান কৌশলের সাথে বিকশিত হয়েছে একটি অঞ্চল থেকে জিনোমের মধ্যে এবং মধ্যবর্তী অঞ্চলে যাওয়ার জন্য। একটি পদ্ধতি হল একটি ডিএনএ অণু গঠনের আগে একটি আরএনএ অণুর মাধ্যমে স্থানচ্যুত করা যখন অন্য পথটি ডিএনএ মধ্যবর্তী অংশকে জড়িত করে। ট্রান্সপোসেস এবং ভাইরাল ইন্টিগ্রেসগুলি এই ধরনের ট্রান্সপোজেবল জেনেটিক উপাদানের উদাহরণ। ব্যাকটেরিয়াল ট্রান্সপোসেসগুলি ট্রান্সপোসনের শেষের সাথে আবদ্ধ হয় এবং বিভিন্ন প্রক্রিয়ার মাধ্যমে জিনোমের অন্য অংশে ট্রান্সপোসন চলাচলের অনুঘটককে সহজতর করে।রেট্রোভাইরাল ইন্টিগ্রেসগুলি হল এনজাইম যা রেট্রোভাইরাসের জেনেটিক উপাদান যেমন এইচআইভি সংক্রামিত হোস্ট কোষের জেনেটিক উপাদান (ডিএনএ) এর সাথে একীভূত করতে সহায়তা করে। এটি ব্যাকটেরিয়া ট্রান্সপোসেস এবং রেট্রোভাইরাল ইন্টিগ্রেসের মধ্যে মূল পার্থক্য।
ব্যাকটেরিয়াল ট্রান্সপোজেস কি?
ট্রান্সপোজেসকে ট্রান্সপোসনের শেষে আবদ্ধ একটি এনজাইম হিসাবে সংজ্ঞায়িত করা যেতে পারে যা বিভিন্ন প্রক্রিয়ার মাধ্যমে জিনোমের অন্য অংশে ট্রান্সপোসন চলাচলের অনুঘটককে সহজতর করে। এই ধরনের প্রক্রিয়ার মধ্যে রয়েছে 'কাট অ্যান্ড পেস্ট মেকানিজম' এবং 'রিপ্লেটিভ ট্রান্সপোজিশন মেকানিজম'। Tn3 ট্রান্সপোসনের স্থানান্তরের জন্য প্রয়োজনীয় এনজাইমের ক্লোনিংয়ের মাধ্যমে ট্রান্সপোজেস প্রথম চালু করা হয়েছিল। জিনোমের মধ্যে বা এক সাইট থেকে অন্য জায়গায় স্থানচ্যুতির জন্য ট্রান্সপোজেবল জেনেটিক উপাদানগুলির দ্বারা দুটি গুরুত্বপূর্ণ কৌশল ব্যবহার করা হয়েছে। একটি ডিএনএ অনুলিপি সংশ্লেষণের আগে আরএনএর একটি মধ্যবর্তী মাধ্যমে পরিবহন একটি কৌশল যখন অন্যটি কেবল ডিএনএ মধ্যস্থতায় আবদ্ধ।উভয় উপাদানের একীকরণের সাথে জড়িত পুনর্মিলন প্রতিক্রিয়াগুলি উপাদান-নির্দিষ্ট এনজাইমের কারণে সংঘটিত হয়। এইভাবে, ডিএনএ উপাদানগুলির একটি উদাহরণে, এই এনজাইমগুলি ট্রান্সপোসেস হিসাবে পরিচিত এবং আরএনএ উপাদানগুলির একটি দৃষ্টান্তে, এগুলি সংহত হিসাবে পরিচিত হয়৷
উভয় স্থানান্তর কৌশলের মধ্যে পার্থক্য তুলনা করার সময়, সন্নিবেশের প্রক্রিয়াটি রাসায়নিকভাবে অভিন্ন বলে মনে হয়। কিন্তু, সাম্প্রতিক প্রমাণগুলি প্রস্তাব করে যে একীকরণ প্রক্রিয়ার নির্দিষ্ট মিলগুলি অ্যামিনো অ্যাসিড ক্রমগুলির অঞ্চলগুলিতে দেখা যায় যা একটি সক্রিয় সাইট গঠন করে; DDE মোটিফ। ট্রান্সপোসেসের পাঁচটি পরিবার বর্তমানে শ্রেণীবদ্ধ করা হচ্ছে কিন্তু, নতুন ট্রান্সপোজেস অক্ষরের সাথে পরিবারের সংখ্যা এখনও বাড়তে পারেনি। পরিবারগুলির মধ্যে রয়েছে ডিডিই ট্রান্সপোজেস, টাইরোসিন (ওয়াই) ট্রান্সপোজেস, সেরিন (এস) ট্রান্সপোজেস, রোলিং সার্কেল ট্রান্সপোসেস, রিভার্স ট্রান্সক্রিপ্টেস/এন্ডোনিউক্লিস (আরটি/এন) ইত্যাদি। এই পরিবারগুলি ডিএনএ ভাঙার এবং পুনরায় যোগ করার জন্য অনন্য অনুঘটক প্রক্রিয়া ব্যবহার করে।ডিডিই ট্রান্সপোজেস মূল ট্রান্সপোসনের কাট এবং পেস্ট প্রক্রিয়ার সাথে জড়িত এবং তিনটি সংরক্ষিত অ্যামিনো অ্যাসিড বহন করে; অ্যাসপার্টেট (ডি), অ্যাসপার্টেট (ডি) এবং গ্লুটামেট (ই)। টাইরোসিন ট্রান্সপোসেসগুলি টাইরোসিন অবশিষ্টাংশ ব্যবহার করে কাটা এবং পেস্ট করার পদ্ধতিতেও জড়িত, যা সাইট-নির্দিষ্ট।
চিত্র 01: ব্যাকটেরিয়াল ট্রান্সপোসেস
সেরিন ট্রান্সপোসেসগুলি বৃত্তাকার ডিএনএর একটি মধ্যবর্তী অংশকে জড়িত করে এবং উপরের পরিবারগুলির মতোই কাট এবং পেস্ট প্রক্রিয়া চালায়। রোলিং সার্কেল ট্রান্সপোজেস কপি-ইন মেকানিজমের সাথে জড়িত যেখানে একটি একক স্ট্র্যান্ড ডিএনএ প্রতিলিপির মাধ্যমে লক্ষ্যস্থলে সরাসরি অনুলিপি করা হয়। এটি নিশ্চিত করে যে টেমপ্লেট স্ট্র্যান্ড এবং কপি করা স্ট্র্যান্ডের একটি স্ট্র্যান্ড রয়েছে যা নতুনভাবে সংশ্লেষিত হয়েছে।বিপরীত ট্রান্সক্রিপ্টেস/এন্ডোনিউক্লিজ ট্রান্সপোজেসের স্থানান্তরের জন্য বিভিন্ন প্রক্রিয়া রয়েছে।
রেট্রোভাইরাল ইন্টিগ্রেস কি?
রেট্রোভাইরাল ইন্টিগ্রেজের প্রেক্ষাপটে, এটি একটি রেট্রোভাইরাল এনজাইম হিসাবে বিবেচিত হয় যা সংক্রামিত কোষের জেনেটিক উপাদান (ডিএনএ) এর সাথে রেট্রোভাইরাসের জেনেটিক উপাদান যেমন এইচআইভির একীকরণে সহায়তা করে। এই রেট্রোভাইরাল ইন্টিগ্রেসগুলি প্রায়শই ফেজ ইন্টিগ্রেসের সাথে বিভ্রান্ত হয়। ফেজ ইন্টিগ্রেসের উদাহরণ হল λ ফেজ ইন্টিগ্রেস। কিন্তু এগুলি সম্পূর্ণ ভিন্ন এনজাইম এবং এর সাথে বিভ্রান্ত হওয়া উচিত নয়। রেট্রোভাইরাল প্রি-ইন্টিগ্রেশন কমপ্লেক্স গঠনের ক্ষেত্রে, রেট্রোভাইরাল ইন্টিগ্রেস একটি প্রধান ভূমিকা পালন করে। রেট্রোভাইরাল ইন্টিগ্রেজ প্রোটিন সাধারণত তিনটি (03) ক্যানোনিকাল ডোমেন নিয়ে গঠিত। এই ডোমেইনগুলি নমনীয় লিঙ্কার দ্বারা সংযুক্ত।
তিনটি ডোমেইনের মধ্যে রয়েছে একটি N টার্মিনাল জিঙ্ক-বাইন্ডিং ডোমেন যেখানে তিনটি হেলিকাল বান্ডিল সংযুক্ত থাকে এবং একটি Zn2+ ক্যাটেশন, একটি RNase H ফোল্ডের সাথে সমন্বয়ের মাধ্যমে স্থিতিশীল হয়। অনুঘটক কোর ডোমেন এবং একটি সি টার্মিনাল ডিএনএ বাইন্ডিং ডোমেন, যা একটি SH3 ভাঁজ।তদন্তের মাধ্যমে এবং জৈব রাসায়নিক এবং কাঠামোগত তথ্যের মাধ্যমে, এটি পরামর্শ দেয় যে রেট্রোভাইরাল ইন্টিগ্রেজের একটি ডাইমার অফ ডিমার (টেট্রামার) হিসাবে কাজ করার ক্ষমতা রয়েছে। মাল্টিমারাইজেশন এবং ভাইরাল ডিএনএ বাইন্ডিংয়ের প্রসঙ্গে, রেট্রোভাইরাল ইন্টিগ্রেস প্রোটিনের তিনটি ডোমেনই। রেট্রোভাইরাল ইন্টিগ্রেজের প্রধান কাজ হল ডিএনএ হোস্ট করার জন্য এর জেনেটিক উপাদান সন্নিবেশ করা। এই পদক্ষেপটি এইচআইভি ভাইরাসের ভাইরাল প্রতিলিপির সবচেয়ে গুরুত্বপূর্ণ পদক্ষেপ। একবার সফলভাবে একত্রিত হলে, এটি কোষের ক্রোমোসোমাল ডিএনএ-তে তার বাকি জীবনকাল থাকবে৷
চিত্র 02: রেট্রোভাইরাল ইন্টিগ্রেসস
অতএব, একবার একত্রিত হলে সেলের জন্য কোন রিটার্ন নেই। এই রেট্রোভাইরাল ইন্টিগ্রেসগুলি 3’ শেষ প্রক্রিয়াকরণ এবং সমযোজী বন্ধন সহ দুটি প্রধান প্রতিক্রিয়ার অনুঘটকের সাথে জড়িত।3' শেষ প্রক্রিয়াকরণের সময়, ভাইরাল ডিএনএ-এর 3' প্রান্তের উভয় প্রান্ত থেকে 2-3টি নিউক্লিওটাইডগুলিকে ভাইরাল ডিএনএর 3' প্রান্তের CA ডাইনিউক্লিওটাইডগুলি প্রকাশ করার উদ্দেশ্যে সরানো হয় এবং সমযোজী বন্ধনের সময়, প্রক্রিয়াকৃত 3' প্রান্তগুলি ভাইরাল ডিএনএ হোস্ট ক্রোমোসোমাল ডিএনএ-তে সহযোদ্ধাভাবে সংযুক্ত থাকে।
ব্যাকটেরিয়াল ট্রান্সপোসেস এবং রেট্রোভাইরাল ইন্টিগ্রেসের মধ্যে মিল কী?
ব্যাকটেরিয়াল ট্রান্সপোসেস এবং রেট্রোভাইরাল ইন্টিগ্রেস উভয়েরই একই রকম অ্যামিনো অ্যাসিড সিকোয়েন্স রয়েছে।
ব্যাকটেরিয়াল ট্রান্সপোসেস এবং রেট্রোভাইরাল ইন্টিগ্রেসের মধ্যে পার্থক্য কী?
ব্যাকটেরিয়াল ট্রান্সপোসেস বনাম রেট্রোভাইরাল ইন্টিগ্রেসস |
|
| ব্যাকটেরিয়াল ট্রান্সপোজেস একটি এনজাইম যা ট্রান্সপোসনের শেষের দিকে আবদ্ধ থাকে যখন বিভিন্ন প্রক্রিয়ার মাধ্যমে জিনোমের অন্য অংশে ট্রান্সপোসন চলাচলের অনুঘটককে সহজতর করে। | রেট্রোভাইরাল ইন্টিগ্রেসগুলিকে একটি রেট্রোভাইরাল এনজাইম হিসাবে বিবেচনা করা হয় যা রেট্রোভাইরাসের জেনেটিক উপাদান যেমন এইচআইভি সংক্রামিত কোষের জেনেটিক উপাদান (ডিএনএ) এর সাথে একীভূত করতে সহায়তা করে৷ |
| আবদ্ধ অঞ্চল | |
| ব্যাকটেরিয়াল ট্রান্সপোসেসের জন্য উচ্চ নির্দিষ্ট বাঁধাই অঞ্চলের প্রয়োজন। | বাইন্ডিংয়ের জন্য কম বা কোন নিউক্লিওটাইড সিকোয়েন্সের প্রয়োজন নেই। |
সারাংশ – ব্যাকটেরিয়াল ট্রান্সপোসেস বনাম রেট্রোভাইরাল ইন্টিগ্রেসস
ব্যাকটেরিয়াল ট্রান্সপোসেসগুলিকে একটি রেট্রোভাইরাল এনজাইম হিসাবে বিবেচনা করা হয় যা সংক্রামিত কোষের জেনেটিক উপাদান (ডিএনএ) এর সাথে এইচআইভির মতো রেট্রোভাইরাসের জেনেটিক উপাদানকে একীভূত করতে সহায়তা করে। দুটি গুরুত্বপূর্ণ কৌশল জিনোমের মধ্যে বা এক সাইট থেকে অন্য জায়গায় স্থানচ্যুতির জন্য ট্রান্সপোজেবল জেনেটিক উপাদান দ্বারা ব্যবহার করা হয়েছে।ট্রান্সপোসেসের পাঁচটি পরিবার বর্তমানে শ্রেণীবদ্ধ করা হচ্ছে কিন্তু, নতুন ট্রান্সপোজেস অক্ষরের সাথে পরিবারের সংখ্যা এখনও বাড়তে পারেনি। রেট্রোভাইরাল ইন্টিগ্রেস, এটি একটি রেট্রোভাইরাল এনজাইম হিসাবে বিবেচিত হয় যা রেট্রোভাইরাসের জেনেটিক উপাদান যেমন এইচআইভি সংক্রামিত কোষের জেনেটিক উপাদান (ডিএনএ) এর সাথে একীভূত করতে সহায়তা করে। রেট্রোভাইরাল ইন্টিগ্রেজ প্রোটিন সাধারণত তিনটি (03) ক্যানোনিকাল ডোমেন নিয়ে গঠিত। রেট্রোভাইরাল ইন্টিগ্রেজের প্রধান কাজ হল ডিএনএ হোস্ট করার জন্য এর জেনেটিক উপাদান সন্নিবেশ করা। এই পদক্ষেপটি এইচআইভি ভাইরাসের ভাইরাল প্রতিলিপির সবচেয়ে গুরুত্বপূর্ণ পদক্ষেপ। অতএব, একবার একত্রিত হলে ঘরের জন্য কোন রিটার্ন নেই। এটি হল ব্যাকটেরিয়াল ট্রান্সপোসেস এবং রেট্রোভাইরাল ইন্টিগ্রেসের মধ্যে পার্থক্য।
ব্যাকটেরিয়াল ট্রান্সপোসেস বনাম রেট্রোভাইরাল ইন্টিগ্রেসসের PDF ডাউনলোড করুন
আপনি এই নিবন্ধটির পিডিএফ সংস্করণ ডাউনলোড করতে পারেন এবং উদ্ধৃতি নোট অনুসারে অফলাইন উদ্দেশ্যে এটি ব্যবহার করতে পারেন। দয়া করে এখানে PDF সংস্করণ ডাউনলোড করুন: ব্যাকটেরিয়াল ট্রান্সপোসেস এবং রেট্রোভাইরাল ইন্টিগ্রেসের মধ্যে পার্থক্য
