কী পার্থক্য - জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস বনাম এসডিএস পৃষ্ঠা
জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস এমন একটি কৌশল যা একটি বৈদ্যুতিক ক্ষেত্রের ম্যাক্রোমোলিকিউলকে আলাদা করে। এটি আণবিক জীববিজ্ঞানের একটি সাধারণ পদ্ধতি যা ডিএনএ, আরএনএ এবং প্রোটিনকে তাদের আণবিক আকার অনুযায়ী মিশ্রণ থেকে আলাদা করা। এসডিএস পেজ হল এক ধরনের জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস যা প্রোটিনকে তাদের আকারের উপর ভিত্তি করে প্রোটিন মিশ্রণ থেকে আলাদা করতে ব্যবহৃত হয়। জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস একটি শব্দ যা ডিএনএ, আরএনএ এবং প্রোটিন পৃথকীকরণের জন্য প্রয়োগ করা সাধারণ কৌশল বোঝাতে ব্যবহৃত হয় যখন এসডিএস পৃষ্ঠা হল এক ধরনের জেল ইলেক্ট্রোফোরসিস। এটি জেল ইলেক্ট্রোফোরসিস এবং এসডিএস পৃষ্ঠার মধ্যে মূল পার্থক্য।
জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস কি?
জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস হল একটি সাধারণ কৌশল যা পরীক্ষাগারে চার্জযুক্ত অণু যেমন ডিএনএ, আরএনএ, প্রোটিন ইত্যাদিকে তাদের মিশ্রণ থেকে আলাদা করতে ব্যবহৃত হয়। জেল ইলেক্ট্রোফোরসিসে একটি জেল ব্যবহার করা হয়। এটি একটি আণবিক চালনী হিসাবে কাজ করে। জেল ইলেক্ট্রোফোরসিসে অ্যাগারোজ এবং পলিঅ্যাক্রিলামাইড নামে দুটি ধরণের জেল ব্যবহৃত হয়। জেলের নির্বাচন এবং জেল প্রস্তুতি জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিতে বিবেচনা করা গুরুত্বপূর্ণ কারণ কারণ জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস এর মাধ্যমে অণুগুলির একটি ভাল বিভাজনের জন্য জেলের ছিদ্রের আকার সাবধানে ম্যানিপুলেট করা উচিত। জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস জেলের দুটি প্রান্তের সাথে সংযুক্ত একটি বৈদ্যুতিক ক্ষেত্র রয়েছে। জেলের এক প্রান্ত ইতিবাচক চার্জ দেখায় যখন অন্য প্রান্তটি ঋণাত্মক চার্জযুক্ত।
DNA এবং RNA হল ঋণাত্মক চার্জযুক্ত অণু। একবার তারা জেলের নেতিবাচক প্রান্ত থেকে জেলে লোড হয়ে গেলে এবং বৈদ্যুতিক ক্ষেত্রে প্রয়োগ করা হলে, তারা জেলের ছিদ্রের মধ্য দিয়ে জেলের ইতিবাচক চার্জযুক্ত প্রান্তের দিকে স্থানান্তরিত হয়।মাইগ্রেশনের গতি চার্জ এবং অণুর আকারের উপর নির্ভর করে। ছোট অণুগুলি বড় অণুর চেয়ে জেল ছিদ্রের মাধ্যমে সহজেই স্থানান্তরিত হয়। সুতরাং, ছোট অণুগুলি জেলের মধ্য দিয়ে দীর্ঘ দূরত্ব ভ্রমণ করে এবং বড় অণুগুলি অল্প দূরত্বে ভ্রমণ করে। জেলে অণুর ভ্রমণ পর্যবেক্ষণ করতে, বিশেষ ধরনের রঞ্জক ব্যবহার করা হয়। বৈদ্যুতিক ক্ষেত্রটি একটি নির্দিষ্ট সময়ের জন্য প্রয়োগ করা হয় এবং অণুগুলির ক্ষতি রোধ করতে এবং অণুগুলিকে তাদের ভ্রমণের অবস্থানে রাখতে থামিয়ে দেওয়া হয়। জেলে বিভিন্ন ব্যান্ড লক্ষ্য করা যায়। এই ব্যান্ডগুলি বিভিন্ন আকারের অণুগুলির প্রতিনিধিত্ব করে। তাই, জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস অণুকে তাদের আকার অনুসারে আলাদা করতে কার্যকর।
জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিসকে আণবিক জীববিজ্ঞানের একটি প্রস্তুতিমূলক কৌশল হিসাবে বিভিন্ন কৌশলে অন্তর্ভুক্ত করা হয়েছে যেমন পিসিআর, আরএফএলপি, ক্লোনিং, ডিএনএ সিকোয়েন্সিং, সাউদার্ন ব্লটিং, জিনোম ম্যাপিং ইত্যাদি।
চিত্র 01: অ্যাগারোজ জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস
এসডিএস পৃষ্ঠা কী?
সোডিয়াম ডোডেসিল সালফেট পলিঅ্যাক্রিলামাইড জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস (এসডিএস পৃষ্ঠা) হল এক ধরনের জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস যা প্রোটিন আলাদা করতে ব্যবহৃত হয়। যখন জেল ইলেক্ট্রোফোরসিস প্রোটিনকে আলাদা করতে ব্যবহার করা হয়, তখন বিশেষ চিকিত্সার প্রয়োজন হয় কারণ প্রোটিনগুলি ডিএনএ এবং আরএনএর মতো নেতিবাচকভাবে চার্জ করা হয় না এবং ইতিবাচক প্রান্ত বা নেতিবাচক প্রান্তের দিকে স্থানান্তরিত হয় না। সুতরাং, জেল ইলেক্ট্রোফোরসিসের আগে প্রোটিনগুলিকে বিকৃত করা হয় এবং নেতিবাচক চার্জ দিয়ে লেপা হয়। এটি সোডিয়াম ডোডেসিল সালফেট (এসডিএস) নামে একটি ডিটারজেন্ট ব্যবহার করে করা হয়। জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস যা এসডিএস এবং একটি পলিঅ্যাক্রিলামাইড জেল ব্যবহার করে সহায়ক মাধ্যমের জন্য এটি এসডিএস পেজ নামে পরিচিত। এই কৌশলটি সাধারণত জৈব রসায়ন, জেনেটিক্স, ফরেনসিক এবং আণবিক জীববিজ্ঞানে ব্যবহৃত হয়।
এসডিএস পৃষ্ঠা চলাকালীন, প্রোটিনগুলি এসডিএসের সাথে মিশ্রিত হয়। SDS প্রোটিনকে রৈখিক আকারে উন্মোচন করে এবং তাদের আণবিক ভরের সমানুপাতিক ঋণাত্মক চার্জ দিয়ে তাদের আবরণ করে।নেতিবাচক চার্জের কারণে, প্রোটিন অণুগুলি জেলের ধনাত্মক চার্জ প্রান্তের দিকে স্থানান্তরিত হয় এবং তাদের আণবিক ভর অনুসারে পৃথক হয়। এসডিএস পৃষ্ঠায়, পলিঅ্যাক্রিলামাইড জেলের শক্ত সমর্থন হিসাবে ব্যবহৃত হয়। প্রোটিনের প্রকৃত বিচ্ছেদ মূলত জেলের বৈশিষ্ট্যের উপর নির্ভর করে। অতএব, পলিঅ্যাক্রিলামাইড জেল প্রস্তুতি সাবধানে করা উচিত এবং পলিঅ্যাক্রিলামাইডের সঠিক ঘনত্ব ব্যবহার করা উচিত। পলিঅ্যাক্রিলামাইড জেল এগারোজ জেলের তুলনায় উচ্চ রেজোলিউশন দেখায়। তাই, এসডিএস পৃষ্ঠাকে প্রোটিন পৃথকীকরণের জন্য একটি উচ্চ-রেজোলিউশন কৌশল হিসাবে বিবেচনা করা হয়৷
এসডিএস পেজ হল এক ধরনের ডিনাচারিং জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস। প্রোটিন বিশ্লেষণে এটির একটি প্রধান সীমাবদ্ধতা রয়েছে। যেহেতু এসডিএস পৃথকীকরণের আগে প্রোটিনগুলিকে অস্বীকার করে, তাই এটি এনজাইমেটিক কার্যকলাপ, প্রোটিন বাঁধাই মিথস্ক্রিয়া, প্রোটিন কোফ্যাক্টর ইত্যাদি সনাক্তকরণের অনুমতি দেয় না।
চিত্র 02: SDS পৃষ্ঠা
জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস এবং এসডিএস পেজের মধ্যে পার্থক্য কী?
জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস বনাম এসডিএস পৃষ্ঠা |
|
| জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস হল একটি পদ্ধতি যা একটি বৈদ্যুতিক ক্ষেত্র ব্যবহার করে ম্যাক্রোমোলিকিউলগুলিকে পৃথক করার জন্য সঞ্চালিত হয়। | SDS পেজ হল একটি উচ্চ-রেজোলিউশন জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস কৌশল যা প্রোটিনকে তাদের ভরের উপর ভিত্তি করে আলাদা করতে ব্যবহৃত হয়৷ |
| জেল রান | |
| এটি অনুভূমিক বা উল্লম্ব পদ্ধতিতে সঞ্চালিত হতে পারে। | SDS পৃষ্ঠা সবসময় উল্লম্বভাবে চলে। |
| বিচ্ছেদের ভিত্তি | |
| চার্জ এবং আকার অনুযায়ী বিচ্ছেদ ঘটে। | প্রোটিন বিচ্ছেদ ঘটে ভর এবং চার্জ অনুযায়ী। |
| রেজোলিউশন | |
| আগারোজ জেল ইলেক্ট্রোফোরসিসের রেজোলিউশন কম এবং পলিঅ্যাক্রাইলামাইড জেল ইলেক্ট্রোফোরসিসের রেজোলিউশন বেশি | SDS পৃষ্ঠার একটি ভাল রেজোলিউশন আছে৷ |
| ডেনিচুরেশন | |
| জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস ডিনেচারিং এবং নন-ডেনেচারিং উভয় কৌশল অন্তর্ভুক্ত করে। | এসডিএস পৃষ্ঠা পৃথকীকরণের আগে প্রোটিনগুলিকে অস্বীকার করে৷ |
সারাংশ – জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস বনাম এসডিএস পৃষ্ঠা
জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস হল একটি সাধারণ কৌশল যা ডিএনএ, আরএনএ এবং প্রোটিনের আকার এবং চার্জের উপর ভিত্তি করে পৃথকীকরণ এবং বিশ্লেষণের জন্য ব্যবহৃত হয়। অ্যাগারোজ জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস এবং পলিঅ্যাক্রিলামাইড জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস নামে দুটি প্রধান ধরণের জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস রয়েছে। অ্যাগারোজ জেলগুলি প্রধানত নিউক্লিক অ্যাসিড পৃথকীকরণের জন্য ব্যবহৃত হয়; যখন উচ্চতর রেজোলিউশনের প্রয়োজন হয়, পলিঅ্যাক্রিলামাইড জেল ব্যবহার করা হয়।এসডিএস পেজ হল এক ধরনের জেল ইলেক্ট্রোফোরসিস যা সাধারণত প্রোটিনের জটিল মিশ্রণকে আলাদা করতে ব্যবহৃত হয়। এটি একটি উচ্চ-রেজোলিউশন প্রোটিন পৃথকীকরণ কৌশল হিসাবে বিবেচিত হয়। জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস এবং এসডিএস পৃষ্ঠার মধ্যে এটাই পার্থক্য।
