কী পার্থক্য – এসডিএস পৃষ্ঠা বনাম ওয়েস্টার্ন ব্লট
ওয়েস্টার্ন ব্লটিং একটি কৌশল যা প্রোটিন নমুনা থেকে একটি নির্দিষ্ট প্রোটিন সনাক্ত করে। এই কৌশলটি বিভিন্ন মূল ধাপের মাধ্যমে সঞ্চালিত হয়: জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস, ব্লটিং এবং হাইব্রিডাইজেশন। সোডিয়াম ডোডেসিল সালফেট পলিঅ্যাক্রিলামাইড জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস (এসডিএস পেজ) হল এক ধরনের জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস কৌশল যা প্রোটিনকে তাদের আকার (আণবিক ওজন) অনুযায়ী আলাদা করতে ব্যবহৃত হয়। ওয়েস্টার্ন ব্লট হল ব্লটিং মেমব্রেনের একটি বিশেষ শীট যা এসডিএস পৃষ্ঠায় প্রোটিনের একই প্যাটার্ন স্থানান্তর করতে ব্যবহৃত হয়। এসডিএস পেজ এবং ওয়েস্টার্ন ব্লটের মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে এসডিএস পেজ একটি মিশ্রণে প্রোটিনকে আলাদা করার অনুমতি দেয় যখন ওয়েস্টার্ন ব্লট একটি মিশ্রণ থেকে একটি নির্দিষ্ট প্রোটিন সনাক্তকরণ এবং পরিমাণ নির্ধারণ করতে দেয়।উভয়ই প্রোটিন বিশ্লেষণ গবেষণায় দরকারী৷
এসডিএস পৃষ্ঠা কী?
SDS পেজ হল একটি জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস কৌশল যা প্রোটিন বিভাজনের জন্য ব্যবহৃত হয়। এটি সাধারণত জৈব রসায়ন, জেনেটিক্স, ফরেনসিক এবং আণবিক জীববিজ্ঞানে ব্যবহৃত হয়। একবার নমুনা থেকে প্রোটিন বের করা হলে, সেগুলি এসডিএস এবং পলিঅ্যাক্রিলামাইড দিয়ে তৈরি জেলে চালানো হয়। এসডিএস হল একটি অ্যানিওনিক ডিটারজেন্ট যা প্রোটিনকে লিনিয়ারাইজ করতে (ডিনেচার প্রোটিন) এবং তাদের আণবিক ভরের সমানুপাতিক লিনিয়ারাইজড প্রোটিনগুলিতে নেতিবাচক চার্জ দিতে ব্যবহৃত হয়। Polyacrylamide জেলের জন্য শক্ত সমর্থন হয়ে ওঠে। বিকৃত প্রোটিন যা নেতিবাচকভাবে চার্জ করা হয় জেলের মাধ্যমে যন্ত্রপাতির ইতিবাচক প্রান্তের দিকে স্থানান্তরিত হয়। প্রোটিনের আকার অনুসারে, স্থানান্তরের গতি প্রোটিনের মধ্যে আলাদা হয় এবং বিচ্ছেদ ঘটে। অতএব, এসডিএস পৃষ্ঠা তাদের আকারের উপর ভিত্তি করে পৃথক প্রোটিন পৃথক করার জন্য দরকারী৷
প্রোটিনের ভগ্নাংশের জন্য পলিঅ্যাক্রিলামাইড জেলের প্রস্তুতি এসডিএস পৃষ্ঠার একটি গুরুত্বপূর্ণ পদক্ষেপ।পলিঅ্যাক্রিলামাইডের সঠিক ঘনত্ব এবং ব্যবহৃত ক্রস-লিংকিং এজেন্ট জেলের শারীরিক বৈশিষ্ট্যকে দৃঢ়ভাবে প্রভাবিত করে, যা বিভিন্ন প্রোটিনের প্রকৃত বিচ্ছেদ ঘটায়। কার্যকর পৃথকীকরণের জন্য জেলের ছিদ্রের আকার সঠিকভাবে পরিচালনা করা উচিত। যাইহোক, এসডিএস পৃষ্ঠাকে উচ্চ-রেজোলিউশন প্রোটিন পৃথকীকরণ কৌশল হিসাবে বিবেচনা করা হয়৷
এসডিএস পেজ টেকনিকের প্রোটিন বিশ্লেষণে একটি বড় সীমাবদ্ধতা রয়েছে। যেহেতু এসডিএস পৃথকীকরণের আগে প্রোটিনগুলিকে অস্বীকার করে, তাই এটি এনজাইমেটিক কার্যকলাপ, প্রোটিন বাঁধাই মিথস্ক্রিয়া, প্রোটিন কোফ্যাক্টর ইত্যাদি সনাক্তকরণের অনুমতি দেয় না।
চিত্র 01: SDS পৃষ্ঠা
ওয়েস্টার্ন ব্লট কি?
ওয়েস্টার্ন ব্লটিং কৌশল প্রোটিন মিশ্রণ থেকে একটি নির্দিষ্ট প্রোটিন সনাক্ত করতে এবং প্রোটিনের পরিমাণ এবং আণবিক ওজন পরিমাপ করতে সক্ষম করে।ওয়েস্টার্ন ব্লট হল ব্লটিং পদ্ধতির সময় ব্যবহৃত ঝিল্লি যা SDS- polyacrylamide জেলে প্রোটিন প্যাটার্নের মিরর ইমেজ পেতে। ওয়েস্টার্ন ব্লটিং এর জন্য যে মেমব্রেন ব্যবহার করা হয় তা বেশিরভাগ নাইট্রোসেলুলোজ বা পলিভিনাইলিডিন ডিফ্লুরাইড (PVDF) দিয়ে তৈরি। স্থানান্তরিত প্রোটিন সহ ঝিল্লিটি পছন্দসই প্রোটিন সনাক্ত করতে ব্যবহার করা যেতে পারে। হাইব্রিডাইজেশন দ্বারা পছন্দসই প্রোটিন সনাক্তকরণের জন্য এটির জন্য উচ্চ-মানের অ্যান্টিবডি প্রয়োজন। অ্যান্টিবডি তার নির্দিষ্ট অ্যান্টিজেনের সাথে আবদ্ধ হয় এবং পছন্দসই অ্যান্টিজেনের উপস্থিতি প্রকাশ করে যা একটি প্রোটিন।
এসডিএস পলিঅ্যাক্রিলামাইড জেল থেকে ওয়েস্টার্ন ব্লটে প্রোটিন স্থানান্তর ইলেক্ট্রোব্লটিং দ্বারা সঞ্চালিত হয়। এটি একটি কার্যকর এবং দ্রুত পদ্ধতি যার ফলে প্রোটিনগুলি জেল থেকে ইলেক্ট্রোফোরেস হয়ে নাইট্রোসেলুলোজ ঝিল্লিতে (ওয়েস্টার্ন ব্লট) চলে যায়।
চিত্র 02: ওয়েস্টার্ন ব্লট
এসডিএস পৃষ্ঠা এবং ওয়েস্টার্ন ব্লটের মধ্যে পার্থক্য কী?
SDS পেজ বনাম ওয়েস্টার্ন ব্লট |
|
| SDS পৃষ্ঠা হল একটি জেল ইলেক্ট্রোফোরসিস কৌশল৷ | ওয়েস্টার্ন ব্লট একটি কৌশল যা একটি মিশ্রণ থেকে একটি নির্দিষ্ট প্রোটিন সনাক্ত করার জন্য একটি ঝিল্লির উপর সঞ্চালিত হয়। |
| ব্যবহার করুন | |
| এসডিএস পৃষ্ঠা তাদের আকার অনুযায়ী প্রোটিন পৃথক করার অনুমতি দেয়৷ | ওয়েস্টার্ন ব্লট তার প্যাটার্ন পরিবর্তন না করেই এসডিএস পেজ জেলে প্রোটিন স্থানান্তর করতে দেয় এবং নির্দিষ্ট অ্যান্টিবডিগুলির সাথে হাইব্রিডাইজেশনের অনুমতি দেয়৷ |
| অসুবিধা | |
| প্রোটিন ডিনাচুরেশন, উচ্চ-মূল্য এবং নিউরোটক্সিন রাসায়নিকের উপস্থিতি এই প্রযুক্তির অসুবিধা। | এই কৌশলটি সময়সাপেক্ষ এবং এর জন্য একটি ভাল অভিজ্ঞ ব্যক্তিগত এবং নির্দিষ্ট নিয়ন্ত্রিত অবস্থার প্রয়োজন৷ |
সারাংশ – এসডিএস পৃষ্ঠা বনাম ওয়েস্টার্ন ব্লট
এসডিএস পৃষ্ঠা এবং ওয়েস্টার্ন ব্লট প্রোটিন বিশ্লেষণের সাথে জড়িত দুটি পদ্ধতি। এসডিএস পেজ জেলে প্রোটিনকে তাদের আণবিক ওজন অনুযায়ী সহজে আলাদা করার অনুমতি দেয়। ওয়েস্টার্ন ব্লট নির্দিষ্ট অ্যান্টিবডির সাথে হাইব্রিডাইজেশনের মাধ্যমে একটি নির্দিষ্ট প্রোটিনের উপস্থিতি এবং পরিমাণ নিশ্চিত করতে সাহায্য করে। এটি এসডিএস পৃষ্ঠা এবং ওয়েস্টার্ন ব্লটের মধ্যে পার্থক্য৷
