মূল পার্থক্য - ক্রোমোজোম হাঁটা বনাম জাম্পিং
ক্রোমোজোম হাঁটা এবং ক্রোমোজোম জাম্পিং হল দুটি প্রযুক্তিগত সরঞ্জাম যা আণবিক জীববিজ্ঞানে ক্রোমোজোমে জিন সনাক্তকরণ এবং জিনোমের শারীরিক ম্যাপিংয়ের জন্য ব্যবহৃত হয়। ক্রোমোজোম হাঁটা এমন একটি কৌশল যা জিনোমিক লাইব্রেরিতে জিনোমিক লাইব্রেরির সংলগ্ন ক্লোনগুলির বারবার বিচ্ছিন্নতা এবং ক্লোনিংয়ের মাধ্যমে একটি লক্ষ্য জিনকে ক্লোন করতে ব্যবহৃত হয়। ক্রোমোসোমাল জাম্পিং ক্রোমোসোমাল হাঁটার একটি বিশেষ সংস্করণ যা ক্রোমোজোমাল হাঁটার বিরতিগুলিকে অতিক্রম করে। ক্রোমোসোমাল হাঁটা শুধুমাত্র ক্রোমোজোমের ছোট দৈর্ঘ্যের ক্রম এবং ম্যাপ করতে পারে যখন ক্রোমোসোমাল জাম্পিং ক্রোমোজোমের বড় অংশগুলির সিকোয়েন্সিং সক্ষম করে।এটি ক্রোমোসোমাল হাঁটা এবং ক্রোমোসোমাল জাম্পিংয়ের মধ্যে মূল পার্থক্য।
ক্রোমোজোম হাঁটা কি?
ক্রোমোজোম ওয়াকিং একটি টুল যা ওভারল্যাপিং সীমাবদ্ধতা টুকরা ব্যবহার করে ক্রোমোজোমের অজানা ক্রম অঞ্চলগুলি অন্বেষণ করে। ক্রোমোজোমের হাঁটার ক্ষেত্রে, একটি পরিচিত জিনের একটি অংশকে প্রোব হিসাবে ব্যবহার করা হয় এবং ক্রোমোজোমের পূর্ণ দৈর্ঘ্যকে ম্যাপ বা ক্রমানুসারে চিহ্নিত করার সাথে অব্যাহত থাকে। এটি মার্কার থেকে লক্ষ্য দৈর্ঘ্যে যায়। ক্রোমোজোম ওয়াকিংয়ে, প্রতিটি ওভারল্যাপিং টুকরোগুলির প্রান্ত পরবর্তী ক্রম সনাক্ত করতে সংকরকরণের জন্য ব্যবহৃত হয়।
ক্লোন করা ডিএনএর শেষ টুকরো থেকে প্রোবগুলি প্রস্তুত করা হয় এবং সেগুলি সাবক্লোন করা হয়। তারপরে তারা পরবর্তী ওভারল্যাপিং খণ্ডটি খুঁজে পেতে ব্যবহৃত হয়। এই সমস্ত ওভারল্যাপিং ক্রমগুলি ক্রোমোজোমের জেনেটিক মানচিত্র তৈরি করতে এবং লক্ষ্য জিনগুলি সনাক্ত করতে ব্যবহৃত হয়। এটি পুনর্গঠিত জিনোমিক লাইব্রেরি থেকে ছোট ওভারল্যাপিং টুকরা দ্বারা ডিএনএর দীর্ঘ প্রসারিত বিশ্লেষণ করার একটি পদ্ধতি।
ক্রোমোজোম হাঁটার কৌশল – ধাপ
-
একটি ডিএনএ খণ্ডের বিচ্ছিন্নতা যেখানে লক্ষ্য জিনের কাছাকাছি পরিচিত জিন বা মার্কার রয়েছে
- নির্বাচিত খণ্ডটির সীমাবদ্ধতা মানচিত্র প্রস্তুত করা এবং একটি অনুসন্ধান হিসাবে ব্যবহার করার জন্য খণ্ডটির শেষ অঞ্চলটিকে সাবক্লোন করা হচ্ছে
- পরবর্তী ওভারল্যাপিং ফ্র্যাগমেন্টের সাথে প্রোবের হাইব্রিডাইজেশন
- পরবর্তী ওভারল্যাপিং ফ্র্যাগমেন্ট সনাক্তকরণের জন্য একটি অনুসন্ধান হিসাবে ব্যবহার করার জন্য খণ্ড 1 এর সীমাবদ্ধতা মানচিত্র এবং 1 খণ্ডের শেষ অঞ্চলের সাবক্লোনিং।
- পরবর্তী ওভারল্যাপিং ফ্র্যাগমেন্ট 2 এর সাথে প্রোবের হাইব্রিডাইজেশন
- পরবর্তী ওভারল্যাপিং ফ্র্যাগমেন্টের সনাক্তকরণের জন্য একটি প্রোব হিসাবে কাজ করার জন্য খণ্ড 2-এর সীমাবদ্ধতা মানচিত্র প্রস্তুত করা এবং খণ্ড 2-এর শেষ অঞ্চলের সাবক্লোনিং
উপরের পদক্ষেপগুলি লক্ষ্য জিন পর্যন্ত বা ক্রমটির মোট দৈর্ঘ্যের 3’ শেষ পর্যন্ত চালিয়ে যেতে হবে।
চিত্র 01: ক্রোমোজোম হাঁটার কৌশল
ক্রোমোজোম হাঁটা অনেক জীবের SNP খুঁজে বের করতে এবং জেনেটিকালি ট্রান্সমিটেড ডিজিজ বিশ্লেষণ করতে এবং প্রাসঙ্গিক জিনের মিউটেশন খুঁজে বের করতে সাইটোজেনেটিকের একটি গুরুত্বপূর্ণ দিক।
ক্রোমোজোম জাম্পিং কি?
ক্রোমোসোমাল জাম্পিং একটি কৌশল যা জীবের জিনোমের শারীরিক ম্যাপিংয়ের জন্য আণবিক জীববিজ্ঞানে ব্যবহৃত হয়। এই কৌশলটি ক্রোমোসোমাল হাঁটার একটি বাধা অতিক্রম করার জন্য চালু করা হয়েছিল যা ক্লোনিং প্রক্রিয়া চলাকালীন পুনরাবৃত্তিমূলক ডিএনএ অঞ্চলগুলি খুঁজে পাওয়ার পরে উদ্ভূত হয়েছিল। অতএব, ক্রোমোজোম জাম্পিং টেকনিককে ক্রোমোসোমাল হাঁটার একটি বিশেষ সংস্করণ হিসাবে বিবেচনা করা যেতে পারে। এটি ক্রোমোজোমাল হাঁটার তুলনায় একটি দ্রুত পদ্ধতি এবং পুনরাবৃত্তিমূলক ডিএনএ ক্রমগুলিকে বাইপাস করতে সক্ষম করে যা ক্রোমোজোমাল হাঁটার সময় ক্লোন হওয়ার সম্ভাবনা থাকে না।ক্রোমোসোমাল জাম্পিং টার্গেট জিন এবং জিনোম ম্যাপিংয়ের জন্য উপলব্ধ পরিচিত মার্কারগুলির মধ্যে ব্যবধানকে সংকুচিত করে৷
ক্রোমোজোম জাম্পিং টুলটি একটি নির্দিষ্ট ডিএনএ কাটার মাধ্যমে শুরু হয় বিশেষ সীমাবদ্ধতার এন্ডোনিউক্লিজ এবং টুকরোগুলোকে বৃত্তাকার লুপে আটকানোর মাধ্যমে। তারপর একটি পরিচিত ক্রম থেকে ডিজাইন করা একটি প্রাইমার সার্কুলারাইজড লুপগুলিকে ক্রম করতে ব্যবহৃত হয়। এই প্রাইমারটি বিকল্প পদ্ধতিতে জাম্পিং এবং সিকোয়েন্সিং সক্ষম করে। তাই, এটি পুনরাবৃত্ত ডিএনএ ক্রমগুলিকে বাইপাস করতে পারে এবং লক্ষ্য জিনের সন্ধানের জন্য দ্রুত ক্রোমোজোমের মধ্য দিয়ে যেতে পারে৷
ক্রোমোসোমাল জাম্পিং টুল ব্যবহার করে সিস্টিক ফাইব্রোসিস রোগের জন্য জিন এনকোড আবিষ্কার করা হয়েছিল। একত্রে, ক্রোমোসোমাল জাম্পিং এবং হাঁটা জিনোম ম্যাপিং প্রক্রিয়াকে উন্নত করতে পারে৷
চিত্র 02: ক্রোমোজোম জাম্পিং
ক্রোমোজোম হাঁটা এবং লাফানোর মধ্যে পার্থক্য কী?
ক্রোমোজোম হাঁটা বনাম জাম্পিং |
|
| ক্রোমোজোম জিনোম ম্যাপিং এবং নির্দিষ্ট জিন সনাক্ত করার জন্য আণবিক জীববিজ্ঞানে ব্যবহৃত একটি সরঞ্জাম। | ক্রোমোজোম জাম্পিং হল জিনোমের ফিজিক্যাল ম্যাপিং এবং ক্রোমোসোমে লক্ষ্য জিন দ্রুত খুঁজে বের করার জন্য ব্যবহৃত একটি টুল। |
| সিকোয়েন্সিংয়ের তুলনামূলক দৈর্ঘ্য | |
| ক্রোমোসোমাল হাঁটার মাধ্যমে শুধুমাত্র ছোট ছোট টুকরো ক্লোন করা যায়। | ক্রোমোজোমের বৃহত্তর দৈর্ঘ্য ক্রোমোসোমাল জাম্পিং দ্বারা ম্যাপ করা যেতে পারে। |
| ক্রোমোজোমে পুনরাবৃত্তিমূলক ডিএনএ ক্লোনিং | |
| ক্রোমোজোম হাঁটার কৌশলে ক্রোমোজোমে পাওয়া পুনরাবৃত্ত ডিএনএ সিকোয়েন্সের মধ্য দিয়ে হাঁটতে অসুবিধা হয়। | এটি পুনরাবৃত্তিমূলক ডিএনএ ক্রমগুলিকে বাইপাস করতে সক্ষম করে৷ তাই সিকোয়েন্সিংয়ের সময় তাদের খুঁজে পেতে কোন অসুবিধা নেই। |
| প্রসেসগুলিকে প্রভাবিত করার কারণগুলি | |
| প্রক্রিয়াটির সাফল্য নির্ভর করে জিনোমের আকার এবং একটি পরিচিত জিনোমিক অবস্থান থেকে পছন্দসই জিনের দিকে যে দূরত্বটি "হাঁটতে হবে" তার উপর। | মার্কার থেকে লক্ষ্য পর্যন্ত দূরত্বের জিনোমের আকারের উপর সাফল্য নির্ভর করে না। |
| অক্লোনড ডিএনএর প্রভাব | |
| ক্রোমোসোমাল হাঁটা বন্ধ করা যেতে পারে আনক্লোনড ডিএনএ টুকরা দ্বারা। | সবচেয়ে কম নোট পিকলো খেলতে পারে তা হল D4। |
| একটি পরিচিত ক্রম প্রয়োজন | |
| প্রক্রিয়াটি লক্ষ্যের কাছাকাছি একটি পরিচিত জিন দিয়ে শুরু হয়। | প্রাইমার ডিজাইন করার জন্য প্রক্রিয়াটির একটি পরিচিত অংশের প্রয়োজন। |
সারাংশ – ক্রোমোজোম হাঁটা বনাম জাম্পিং
ক্রোমোসোমাল ওয়াকিং প্রায়শই প্রয়োগ করা হয় যখন এটি জানা যায় যে একটি নির্দিষ্ট জিন একটি ক্রোমোজোমে পূর্বে ক্লোন করা জিনের কাছাকাছি অবস্থিত এবং এটি জিনোমিক লাইব্রেরি থেকে সংলগ্ন জিনোমিক ক্লোনগুলির বারবার বিচ্ছিন্নতার মাধ্যমে সনাক্ত করা সম্ভব। যাইহোক, যখন ক্রোমোজোমাল হাঁটার কৌশলের সময় পুনরাবৃত্তিমূলক ডিএনএ অঞ্চলগুলি পাওয়া যায়, তখন প্রক্রিয়াটি চালিয়ে যাওয়া যায় না। সুতরাং, কৌশলটি সেই বিন্দু থেকে ভেঙে যায়। ক্রোমোসোমাল জাম্পিং একটি আণবিক জৈবিক হাতিয়ার যা জিনোম ম্যাপিংয়ের জন্য এই সীমাবদ্ধতা অতিক্রম করে। এটি এই পুনরাবৃত্তিমূলক ডিএনএ অঞ্চলগুলিকে বাইপাস করে যা ক্লোন করা কঠিন এবং জিনোমের শারীরিক ম্যাপিংয়ে সহায়তা করে। এটি ক্রোমোজোমের হাঁটা এবং লাফানোর মধ্যে প্রধান পার্থক্য।
