মূল পার্থক্য – প্রোব বনাম প্রাইমার
আণবিক প্রোব হল একটি ছোট ডিএনএ বা আরএনএ খণ্ড যা ডিএনএ বা আরএনএ-তে পরিপূরক ক্রমগুলিকে স্বীকৃতি দেয় এবং লক্ষ্য ক্রম সনাক্ত করতে দেয়। প্রাইমার হল ডিএনএ বা আরএনএর একটি ছোট প্রসারিত যা ডিএনএ সংশ্লেষণের সূচনা বিন্দু হিসেবে কাজ করে। প্রাইমার এবং প্রোবগুলি টেমপ্লেট ডিএনএ বা লক্ষ্য ডিএনএর পরিপূরক নিউক্লিওটাইডগুলির সাথে হাইব্রিডাইজ করে। যাইহোক, প্রোব এবং প্রাইমারের মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে প্রাইমারগুলি ডিএনএ প্রতিলিপির জন্য প্রয়োজনীয় যখন নমুনা ডিএনএ-তে নির্দিষ্ট ক্রম সনাক্তকরণের জন্য প্রোবগুলি প্রয়োজনীয়৷
প্রোব কি?
প্রোব হল ডিএনএ বা আরএনএর একটি ছোট খণ্ড যা আণবিক সংকরায়নের মাধ্যমে নমুনায় লক্ষ্য ডিএনএ বা আরএনএ সনাক্ত করতে ব্যবহৃত হয়।তারা আণবিক মার্কার হিসাবেও পরিচিত। প্রোবের দৈর্ঘ্য পরিবর্তিত হতে পারে (100 থেকে 1000 ঘাঁটি), এবং প্রোব নিউক্লিওটাইডগুলি লক্ষ্য অনুক্রমের অংশের পরিপূরক। সনাক্তকরণের সহজতার জন্য, প্রোবগুলিকে তেজস্ক্রিয় আইসোটোপ বা ফ্লুরোসেন্ট রঞ্জক বা অ্যান্টিবডি দিয়ে লেবেল করা হয়। প্রোবগুলি লক্ষ্য অনুক্রমের পরিপূরক বেসের সাথে আবদ্ধ হয় এবং নমুনায় লক্ষ্য ডিএনএ বা আরএনএর উপস্থিতি প্রকাশ করে। লেবেলিং প্রোবের দুটি প্রধান পদ্ধতি রয়েছে: শেষ লেবেলিং এবং নিক অনুবাদ। প্রোবগুলিকে ডিএনএ প্রোব, আরএনএ প্রোব, সিডিএনএ প্রোব এবং সিন্থেটিক অলিগোনিউক্লিওটাইড প্রোব সহ বিভিন্ন প্রকারে শ্রেণীবদ্ধ করা হয় এবং সেগুলি বিভিন্ন কৌশল ব্যবহার করে প্রস্তুত করা হয়৷
প্রোবগুলি অনেক মাইক্রোবায়াল এবং আণবিক ক্ষেত্রে গুরুত্বপূর্ণ হাতিয়ার যেমন ভাইরোলজি, ফরেনসিক প্যাথলজি, পিতৃত্ব পরীক্ষা, ডিএনএ ফিঙ্গারপ্রিন্টিং, জেনেটিক রোগ সনাক্তকরণ, আরএফএলপি, আণবিক সাইটোজেনেটিক্স, সিটু হাইব্রিডাইজেশন ইত্যাদি।
চিত্র 01: প্যাথোজেন সনাক্তকরণের জন্য ফিশ-এ ব্যবহৃত ফ্লুরোসেন্টলি লেবেলযুক্ত প্রোব
প্রাইমার কি?
প্রাইমার হল একটি সংক্ষিপ্ত ডিএনএ বা আরএনএ খণ্ড যা ডিএনএ সংশ্লেষণের সূচনাকারী হিসাবে কাজ করে। ডিএনএ পলিমারেজ এনজাইম প্রাইমার সিকোয়েন্সের 3’ OH গ্রুপে নিউক্লিওটাইড যোগ করে এবং টেমপ্লেট ডিএনএর পরিপূরক নতুন স্ট্র্যান্ডকে সংশ্লেষ করে। প্রাইমারগুলি 18 থেকে 20 নিউক্লিওটাইডের দৈর্ঘ্য সহ খুব ছোট টুকরা। এগুলি ইন ভিট্রো ডিএনএ অ্যামপ্লিফিকেশন (পিসিআর) এর জন্য পরীক্ষাগারে রাসায়নিকভাবে সংশ্লেষিত হয়। প্রাইমারগুলিতে নিউক্লিওটাইডের যেকোন ক্রম থাকতে পারে যেহেতু সেগুলি ব্যবহারকারী দ্বারা ডিজাইন করা হয়েছে। এগুলি টেমপ্লেট ডিএনএর পরিপূরক ঘাঁটির সাথে মেলে সংশ্লেষিত হয়। অতএব, এটিতে নিউক্লিওটাইডের যেকোনো ক্রম থাকতে পারে। প্রাইমারগুলি ডিএনএ প্রতিলিপির জন্য অত্যন্ত গুরুত্বপূর্ণ কারণ ডিএনএ পলিমারেজ ডিএনএ-এর পূর্বে বিদ্যমান টুকরো ছাড়া নতুন ডিএনএ সংশ্লেষণ করতে পারে না। পিসিআর-এর জন্য প্রাইমার ডিজাইন করার সময়, নিম্নলিখিত বিষয়গুলি বিবেচনা করা প্রয়োজন:
- প্রাইমারগুলিতে পরিপূরক নিউক্লিওটাইড থাকা উচিত ডিএনএর প্রান্তের প্রান্তে যা প্রশস্ত করতে চায়৷
- প্রাইমারদের গলার তাপমাত্রা 55 - 65 এর মধ্যে থাকা উচিত 0C
- G এবং C সামগ্রী 50 থেকে 60% এর মধ্যে হওয়া উচিত।
নমুনা ডিএনএর উভয় স্ট্র্যান্ডকে প্রতিলিপি করতে পিসিআর-এ দুটি প্রাইমার ফরওয়ার্ড এবং রিভার্স হিসেবে ব্যবহার করা হয়। প্রাইমারগুলি সাধারণত পিসিআর এবং ডিএনএ সিকোয়েন্সিং সঞ্চালনের জন্য ব্যবহৃত হয়৷
চিত্র 02: পিসিআরে প্রাইমার অ্যানিলিং
প্রোব এবং প্রাইমারের মধ্যে পার্থক্য কী?
প্রোব বনাম প্রাইমার |
|
| প্রোব হল ডিএনএ/আরএনএর একটি ছোট খণ্ড যা আণবিক সংকরকরণের মাধ্যমে একটি নমুনায় লক্ষ্য ক্রমটির উপস্থিতি সনাক্ত করতে ব্যবহৃত হয়। | প্রাইমার হল ডিএনএ বা আরএনএর একটি ছোট প্রসারিত যা ডিএনএ প্রতিলিপির সূচনা বিন্দু হিসেবে কাজ করে। |
| ফাংশন | |
| এটি ডিএনএ বা আরএনএর নমুনায় একটি নির্দিষ্ট অনুক্রমের উপস্থিতি সনাক্ত করে৷ | এটি ডিএনএ সংশ্লেষণের একটি সূচনা বিন্দু হিসেবে কাজ করে। |
| দৈর্ঘ্য | |
| দৈর্ঘ্য 100 - 1000 বেসের মধ্যে হতে পারে | দৈর্ঘ্য সাধারণত ১৮ – ২০ বেস হয় |
| পরিপূরক অনুক্রমের সাথে বাঁধাই | |
| প্রোব টার্গেট সিকোয়েন্সের পরিপূরক বেসের সাথে হাইব্রিডাইজ হয় | প্রাইমার ডিএনএ স্ট্র্যান্ডের পরিপূরক ঘাঁটির সাথে অ্যানিল করে। |
| লেবেলিং | |
| প্রোবগুলি সনাক্তকরণের সহজতার জন্য লেবেল করা হয়েছে | প্রাইমার সাধারণত লেবেল করা হয় না |
| PCR এ ব্যবহার করুন | |
| PCR এ প্রোব ব্যবহার করা হয় না | PCR এ প্রাইমার ব্যবহার করা হয় |
সারাংশ – প্রোব বনাম প্রাইমার
প্রোব হল ডিএনএ বা আরএনএ সিকোয়েন্সের একটি ছোট খণ্ড যা নমুনায় একটি লক্ষ্য ক্রম শনাক্ত করতে পরিপূরক নিউক্লিওটাইড দিয়ে সংকর করা যেতে পারে। লক্ষ্য অনুক্রমের উপস্থিতি দেখতে প্রোবগুলিকে তেজস্ক্রিয়ভাবে, ইমিউনোলজিক্যালি বা ফ্লুরোসেন্টলি লেবেল করা হয়। প্রাইমার হল একটি খুব ছোট ডিএনএ বা আরএনএ খণ্ড যা ইন ভিট্রো ডিএনএ পরিবর্ধনের সূচনা বিন্দু হিসেবে কাজ করে। ডিএনএ পলিমারেজ 3’ OH গ্রুপ প্রাইমার সনাক্ত করে এবং টেমপ্লেটের পরিপূরক নতুন স্ট্র্যান্ড তৈরির সূচনা করে। প্রোব এবং প্রাইমারগুলি সম্পূরক নিউক্লিওটাইডের সাথে হাইব্রিডাইজ করে একইভাবে কাজ করে।সুতরাং, প্রোব এবং প্রাইমারের মধ্যে মূল পার্থক্য হল তাদের প্রধান কাজ৷
