T4 DNA ligase এবং E. coli DNA ligase এর মধ্যে মূল পার্থক্য হল T4 DNA ligase হল একটি এনজাইম যা ব্যাকটেরিওফেজ T4 থেকে বিচ্ছিন্ন এবং E. coli DNA ligase হল একটি এনজাইম যা ব্যাকটেরিয়া E. coli থেকে বিচ্ছিন্ন।.
DNA ligase হল একটি নির্দিষ্ট ধরনের এনজাইম যা একটি ফসফোডিস্টার বন্ড গঠনের মাধ্যমে ডিএনএ স্ট্র্যান্ডগুলিকে একত্রে যুক্ত করতে সহায়তা করে। এটি জীবন্ত প্রাণীর ডিএনএ-তে একক-স্ট্র্যান্ড ব্রেক এবং ডাবল-স্ট্র্যান্ড ব্রেক মেরামত করে একটি গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে। তদুপরি, ডিএনএ লিগেস ডিএনএ মেরামত এবং ডিএনএ প্রতিলিপি উভয় ক্ষেত্রেই ব্যবহৃত হয়। উপরোক্ত ব্যবহারগুলি ছাড়াও, ডিএনএ লিগেসের আণবিক জীববিজ্ঞান পরীক্ষায়ও ব্যাপক ব্যবহার রয়েছে যেমন রিকম্বিন্যান্ট ডিএনএ প্রযুক্তি।T4 DNA ligase এবং E. coli DNA ligase হল দুই ধরনের DNA ligase এনজাইম।
T4 DNA Ligase কি?
T4 ligase হল একটি DNA যুক্ত এনজাইম যা ব্যাকটেরিওফেজ T4 থেকে বিচ্ছিন্ন। T4 ব্যাকটেরিওফেজ হল একটি ভাইরাস যা Escherichia coli সংক্রমিত করে। T4 ligase এনজাইম হল সবচেয়ে বেশি ব্যবহৃত DNA ligase আণবিক জৈবিক পরীক্ষাগার গবেষণায়। সাধারনত, T4 ligase সংলগ্ন নিউক্লিওটাইডের 5’ ফসফেট এবং 3’ হাইড্রক্সিল গ্রুপের মধ্যে ডাবল-স্ট্র্যান্ড ডিএনএর দুটি সমন্বিত বা ভোঁতা-শেষ স্ট্র্যান্ডের যোগদানকে অনুঘটক করে। এটি একটি ডুপ্লেক্স অণুতে একটি ডিএনএ বা আরএনএ স্ট্র্যান্ডের সাথে আরএনএ-এর যোগদানকেও অনুঘটক করতে পারে। যাইহোক, এই এনজাইম একক-স্ট্র্যান্ডেড নিউক্লিক অ্যাসিডের সাথে যোগ দেবে না। অধিকন্তু, এটি ই. কোলাই ডিএনএ লিগেসের চেয়ে অনেক বেশি দক্ষতার সাথে ভোঁতা-শেষযুক্ত ডিএনএ লিগেট করতে পারে।
চিত্র 01: T4 DNA Ligase
এই এনজাইমের কোফ্যাক্টর হিসাবে ATP প্রয়োজন। কিছু জেনেটিক ইঞ্জিনিয়ারিং গবেষণা পরীক্ষা ইতিমধ্যে বন্য ধরনের T4 ডিএনএ লিগেসের চেয়ে বেশি সক্রিয় ডিএনএ লিগেজ এনজাইম তৈরি করেছে। একটি পদ্ধতিতে, তারা T4 DNA ligase কে p50 বা NF-kB অণুর সাথে সংযুক্ত করে একটি ফিউশন এনজাইম অণু তৈরি করেছে। এই নতুন T4 লিগেজ এনজাইমটি বন্য-টাইপ T4 ডিএনএ লিগেসের চেয়ে ক্লোনিংয়ের উদ্দেশ্যে ব্লান্ট-এন্ড লাইগেশনে 160% বেশি সক্রিয় ছিল। অধিকন্তু, T4 DNA ligase-এর জন্য সর্বোত্তম তাপমাত্রা 16 °C.
E Coli DNA Ligase কি?
E. কোলাই ডিএনএ লিগেজ একটি এনজাইম যা ই. কোলাই ব্যাকটেরিয়া থেকে বিচ্ছিন্ন। E. coli DNA ligase তৈরির জন্য দায়ী জিন হল lig জিন। ই. কোলাই ডিএনএ, লিগেস এবং সেইসাথে বেশিরভাগ প্রোক্যারিওট ডিএনএ লিগাসেস, ফসফোডিস্টার বন্ড তৈরি করতে এনএডি (নিকোটিনামাইড অ্যাডেনিন ডাইনিউক্লিওটাইড) দ্বারা অর্জিত শক্তি ব্যবহার করে৷
চিত্র 02: ই. কোলি ডিএনএ লিগাস
E. কোলাই ডিএনএ লিগেজ হল একটি লাইগেশন এনজাইম যা 5’ ফসফেট টার্মিনি এবং 3’ হাইড্রক্সিল টার্মিনি ধারণকারী ডবল-স্ট্র্যান্ডেড ডিএনএ টুকরোগুলির মধ্যে ফসফোডিস্টার বন্ড গঠনকে অনুঘটক করে ডিএনএ খণ্ডে যোগ দিতে পারে। অধিকন্তু, এটি পলিথিন গ্লাইকোলের সাথে আণবিক ভিড়ের মতো বিশেষ অবস্থা ছাড়া ভোঁতা-শেষ ডিএনএকে আটকায় না। এটি আরএনএ থেকে ডিএনএ-তে দক্ষতার সাথে যোগ দিতে পারে না। অধিকন্তু, সঠিক ঘনত্বে ডিএনএ পলিমারেজ 1 এর উপস্থিতি দ্বারা E. coli DNA ligase-এর কার্যকলাপ বৃদ্ধি করা যেতে পারে। যাইহোক, যখন DNA পলিমারেজ 1 এনজাইমের ঘনত্ব বেশি হয়, তখন এটি E. coli DNA ligase কার্যকলাপের উপর বিরূপ প্রভাব ফেলে।
T4 DNA Ligase এবং E Coli DNA Ligase-এর মধ্যে মিল কী?
- T4 DNA ligase এবং E-coli DNA ligase হল দুই ধরনের DNA ligase এনজাইম।
- দুটিই অ্যামিনো অ্যাসিড দিয়ে তৈরি প্রোটিন।
- এই এনজাইমগুলি ডুপ্লেক্স ডিএনএতে জুক্সটাপোজড 5’ ফসফেট এবং 3’ হাইড্রক্সিল টার্মিনির মধ্যে একটি ফসফোডিস্টার বন্ড গঠনকে অনুঘটক করে।
- আণবিক জীববিজ্ঞান পরীক্ষায় তাদের ব্যাপক ব্যবহার রয়েছে যেমন রিকম্বিন্যান্ট ডিএনএ প্রযুক্তি।
T4 DNA Ligase এবং E Coli DNA Ligase-এর মধ্যে পার্থক্য কী?
T4 DNA ligase হল একটি এনজাইম যা ব্যাকটেরিওফেজ T4 থেকে বিচ্ছিন্ন হয় যখন E. coli DNA ligase হল একটি এনজাইম যা E. coli ব্যাকটেরিয়া থেকে বিচ্ছিন্ন। এইভাবে, এটি T4 DNA ligase এবং E. coli DNA ligase এর মধ্যে মূল পার্থক্য। অধিকন্তু, T4 DNA ligase-এর শক্তির উৎস হল ATP। অন্যদিকে, E. coli DNA ligase-এর শক্তির উৎস হল NAD।
নীচের ইনফোগ্রাফিকটি পাশাপাশি তুলনা করার জন্য সারণী আকারে T4 DNA ligase এবং E coli DNA ligase এর মধ্যে পার্থক্য উপস্থাপন করে৷
সারাংশ – T4 DNA Ligase বনাম E Coli DNA Ligase
T4 DNA ligase এবং E. coli DNA ligase হল দুটি এনজাইম যা ডুপ্লেক্স DNA-তে জুক্সটাপোজড 5’ ফসফেট এবং 3’ হাইড্রক্সিল টার্মিনির মধ্যে একটি ফসফোডিস্টার বন্ড গঠনকে অনুঘটক করে। T4 ligase হল একটি এনজাইম যা ব্যাকটেরিওফেজ T4 থেকে বিচ্ছিন্ন হয় যখন E. coli DNA ligase হল একটি এনজাইম যা E. coli ব্যাকটেরিয়া থেকে বিচ্ছিন্ন। সুতরাং, এটি T4 DNA ligase এবং E coli DNA ligase এর মধ্যে মূল পার্থক্য।
