BL21 এবং DH5 আলফার মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে BL21 হল একটি প্রোটিজের অভাবজনিত জেনেটিক্যালি ইঞ্জিনিয়ারড সক্ষম ই. কোলাই কোষ যা প্রাথমিকভাবে প্রোটিন প্রকাশের জন্য ব্যবহৃত হয়, অন্যদিকে DH5 আলফা হল একটি জেনেটিকালি ইঞ্জিনিয়ারড সক্ষম ই. কোলাই কোষ যার recA1 মিউটেশন প্রাথমিকভাবে ব্যবহৃত হয়। প্লাজমিড রূপান্তরের জন্য।
E. কোলি হল রিকম্বিন্যান্ট প্রোটিন উৎপাদনের জন্য পছন্দের একটি বিখ্যাত জীব। এটি বছরের পর বছর ধরে সবচেয়ে জনপ্রিয় অভিব্যক্তি প্ল্যাটফর্ম হয়ে উঠেছে। এটি সেল ফ্যাক্টরি হিসেবেও ব্যবহৃত হয়। BL21 এবং DH5 আলফা হল দুটি জেনেটিকালি ইঞ্জিনিয়ারড ই. কোলাই কোষ যা বর্তমানে যথাক্রমে প্রোটিন এক্সপ্রেশন এবং প্লাজমিড রূপান্তরের জন্য ব্যবহৃত হয়।
BL21 কি?
BL21 হল একটি প্রোটিজের ঘাটতিজনিত জেনেটিকালি ইঞ্জিনিয়ারড সক্ষম E.coli কোষ যা প্রাথমিকভাবে প্রোটিন প্রকাশের জন্য ব্যবহৃত হয়। E. coli BL21 হল B স্ট্রেন থেকে প্রাপ্ত একটি ব্যাকটেরিয়া কোষ। এতে লন প্রোটিজ এবং ওএমপিটি আউটার মেমব্রেন প্রোটিজের ত্রুটি রয়েছে। এটি সাধারণত রিকম্বিন্যান্ট প্রোটিন এক্সপ্রেশনের জন্য ব্যবহৃত হয় কারণ এটি সাধারণত প্রকাশ করা প্রোটিনগুলিতে স্থিতিশীলতা নিয়ে আসে। BL21 pCold I-IV DNA এবং pCold TF DNA এর সাথে প্রোটিন প্রকাশের জন্য দরকারী। কিন্তু এই সক্ষম E. coli কোষটি T7 প্রোমোটার যেমন PET সিস্টেম ব্যবহার করে প্রোটিন এক্সপ্রেশন সিস্টেমের জন্য নয়। এর পেছনের কারণ হল BL21 T7 RNA পলিমারেজ প্রকাশ করে না। উপরন্তু, প্লাজমিড নির্মাণ বা প্রস্তুত করার জন্য এটি ব্যবহার করার পরামর্শ দেওয়া হয় না কারণ এতে recA মিউটেশন নেই।
চিত্র 01: BL21
BL21 প্রথম B লাইনের বিভিন্ন পরিবর্তনের পরে 1986 সালে স্টুডিয়ার দ্বারা বর্ণনা করা হয়েছিল। BL21 কোষে LON প্রোটিজের ঘাটতি রয়েছে, যা অনেক বিদেশী প্রোটিনকে ক্ষয় করে। অধিকন্তু, এটি অন্য একটি জিন অনুপস্থিত যা বাইরের ঝিল্লি প্রোটিজ (OmpT) এর জন্য কোড করে যার কাজ হল বহির্কোষী প্রোটিনগুলিকে হ্রাস করা। এই প্রোটিনের অভাব E. coli BL21 কোষে বিদেশী প্রোটিনের সফল উৎপাদন শুরু করে। তদ্ব্যতীত, এই কোষগুলিতে এইচএসডিএসবি মিউটেশন বিদেশী ডিএনএ মিথিলেশন এবং বিএল21 কোষে ব্যাঘাত রোধ করে।
DH5 আলফা কি?
DH5 আলফা হল একটি জেনেটিকালি ইঞ্জিনিয়ারড সক্ষম E. coli কোষ যার recA1 মিউটেশন রয়েছে যা প্রাথমিকভাবে প্লাজমিড রূপান্তরের জন্য ব্যবহৃত হয়। DH5 আলফা ই. কোলাই কোষগুলিকে মার্কিন জীববিজ্ঞানী ডগলাস হানাহান দ্বারা রূপান্তরের দক্ষতা সর্বাধিক করার জন্য জেনেটিক্যালি ইঞ্জিনিয়ার করা হয়েছে। DH5 আলফা কোষের তিনটি স্বতন্ত্র মিউটেশন রয়েছে: recA1, endA1 এবং lacZΔM15। recA1 হল একটি একক বিন্দু পরিব্যক্তি যা glycine 160 এর সাথে প্রতিস্থাপন করে এবং recA পলিপেপটাইডে একটি অ্যাসপার্টিক অ্যাসিড অবশিষ্টাংশ।এই মিউটেশন রিকম্বিনেসের কার্যকলাপকে অক্ষম করে এবং সমজাতীয় পুনর্মিলনকে নিষ্ক্রিয় করে। endA1 মিউটেশন একটি অন্তঃকোষীয় এন্ডোনিউক্লিজ নিষ্ক্রিয় করে দেয় যা এটিকে ঢোকানো প্লাজমিডকে অবনমিত হতে বাধা দেয়।
চিত্র 02: DH5 আলফা
আরও, lacZΔM15 মিউটেশন রূপান্তরিত কোষগুলির নীল-সাদা স্ক্রীনিং সক্ষম করে। এই কোষগুলি উপযুক্ত কোষ। তারা প্রায়ই পছন্দসই প্লাজমিড সন্নিবেশ ক্যালসিয়াম ক্লোরাইড রূপান্তর সঙ্গে ব্যবহার করা হয়. সাম্প্রতিক গবেষণার মাধ্যমে এটি শনাক্ত করা হয়েছে যে হানাহান পদ্ধতির সাথে DH5 আলফা কোষটি প্লাজমিড রূপান্তরের জন্য সবচেয়ে দক্ষ যোগ্য কোষ ছিল।
BL21 এবং DH5 আলফার মধ্যে মিল কী?
- BL21 এবং DH5 আলফা দুটি জেনেটিকালি ইঞ্জিনিয়ারড ই. কোলি
- দুটিই উপযুক্ত কোষ।
- এরা স্বতন্ত্র মিউটেশন নিয়ে গঠিত।
- দুজনেরই কোনো প্রাকৃতিক আবাস নেই।
- এগুলি পরীক্ষাগারের উদ্দেশ্যে ব্যবহার করা হয় যেমন এক্সপ্রেশন স্টাডি এবং ক্লোনিং পদ্ধতি।
BL21 এবং DH5 আলফার মধ্যে পার্থক্য কী?
BL21 হল একটি প্রোটিজের ঘাটতি জিনগতভাবে ইঞ্জিনিয়ারড সক্ষম E. কোলাই কোষ যা প্রাথমিকভাবে প্রোটিন প্রকাশের জন্য ব্যবহৃত হয়। অন্যদিকে, DH5 আলফা হল একটি জেনেটিকালি ইঞ্জিনিয়ারড সক্ষম E. coli কোষ যার recA1 মিউটেশন প্রাথমিকভাবে প্লাজমিড রূপান্তরের জন্য ব্যবহৃত হয়। সুতরাং, এটি BL21 এবং DH5 আলফার মধ্যে মূল পার্থক্য। উপরন্তু, BL21 E. coli কোষে recA1 মিউটেশন নেই, যখন DH5 আলফা ই. কোলাই কোষে recA1 মিউটেশন আছে।
নিম্নলিখিত ইনফোগ্রাফিক সারণী আকারে BL21 এবং DH5 আলফার মধ্যে পার্থক্যগুলি তালিকাভুক্ত করে৷
সারাংশ – BL21 বনাম DH5 আলফা
ই. কোলাই-এর নন-প্যাথোজেনিক স্ট্রেনগুলি বিজ্ঞানীরা ল্যাবরেটরি এক্সপ্রেশন স্টাডি এবং ক্লোনিংয়ের উদ্দেশ্যে জেনেটিক্যালি তৈরি করেছেন।BL21 এবং DH5 আলফা হল দুটি জেনেটিকালি ইঞ্জিনিয়ারড ই. কোলাই কোষ। BL21 প্রাথমিকভাবে প্রোটিন এক্সপ্রেশন অধ্যয়নের জন্য ব্যবহৃত হয়। অন্যদিকে, DH5 আলফা প্রাথমিকভাবে প্লাজমিড রূপান্তরের উদ্দেশ্যে ব্যবহৃত হয়। সুতরাং, এটি BL21 এবং DH5 আলফার মধ্যে পার্থক্যের সারাংশ।