অলিগোপেপটাইড এবং পলিপেপটাইডের মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে অলিগোপেপটাইডে কয়েকটি অ্যামিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশ থাকে, যেখানে পলিপেপটাইডগুলিতে প্রচুর পরিমাণে অ্যামিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশ থাকে৷
অলিগোপেপটাইডস এবং পলিপেপটাইড শব্দগুলি প্রোটিনের বিভাগের অধীনে আসে। পেপটাইড হল অ্যামিনো অ্যাসিডের ছোট চেইন। অ্যামিনো অ্যাসিড পেপটাইড বন্ধনের মাধ্যমে একে অপরের সাথে আবদ্ধ হয়। অতএব, আমরা এই পেপটাইডগুলিতে উপস্থিত অ্যামিনো অ্যাসিডের সংখ্যা অনুসারে এই পেপটাইডগুলিকে শ্রেণিবদ্ধ করতে পারি। যেমন, ডিপেপটাইডস, ট্রিপেপটাইডস, টেট্রাপেপটাইডস, অলিগোপেপটাইডস এবং পলিপেপটাইডস।
Oligopeptide কি?
একটি অলিগোপেপটাইড হল অ্যামিনো অ্যাসিডের একটি চেইন যাতে প্রতি অণুতে অল্প সংখ্যক অ্যামিনো অ্যাসিড থাকে।আমরা প্রায়ই এই অণুগুলিকে একটি সাধারণ শব্দ হিসাবে "পেপটাইডস" বলি। এই পেপটাইড অণুতে উপস্থিত অ্যামিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশের সংখ্যা দুই থেকে বিশটি অ্যামিনো অ্যাসিডের মধ্যে হতে পারে। অলিগোপেপটাইডের মধ্যে কিছু ছোট পেপটাইড ফর্মও অন্তর্ভুক্ত থাকতে পারে যেমন ডিপেপটাইড, ট্রিপেপটাইড ইত্যাদি। প্রাকৃতিকভাবে ঘটতে থাকা অলিগোপেপটাইডের কিছু সাধারণ উদাহরণের মধ্যে রয়েছে মাইক্রোভিরিডিন, সায়ানোপেপ্টোলিন, মাইক্রোসিস্টিন ইত্যাদি।
চিত্র 01: একটি ট্রিপেপটাইডের গঠন
এই অলিগোপেপটাইডগুলি ননরাইবোসোমাল পেপটাইড সিনথেস বা NRPS দ্বারা উত্পাদিত হয়। কিন্তু কিছু ব্যতিক্রম আছে। যেমন, সাইক্লামাইড এবং মাইক্রোভিরিডিন রাইবোসোমিক পথের মাধ্যমে সংশ্লেষিত হয়। অলিগোপেপটাইডের বিচ্ছিন্নকরণ প্রক্রিয়ার মধ্যে রয়েছে অলিগোপেপটাইড সমৃদ্ধকরণ, পরিশোধন এবং সনাক্তকরণ। সনাক্তকরণ প্রক্রিয়ার জন্য, আমরা জেল ক্রোমাটোগ্রাফি, HPLC, HPLC- ভর স্পেকট্রোস্কোপি, আয়ন-এক্সচেঞ্জ ক্রোমাটোগ্রাফি ইত্যাদি ব্যবহার করতে পারি।
পলিপেপটাইড কি
একটি পলিপেপটাইড হল অ্যামিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশের একটি চেইন যাতে প্রচুর পরিমাণে অ্যামিনো অ্যাসিড থাকে। একটি প্রোটিনে এক বা একাধিক পলিপেপটাইড চেইন থাকে। এই পলিপেপটাইড চেইনে, অ্যামিনো অ্যাসিডগুলি একে অপরের সাথে পেপটাইড বন্ধনের মাধ্যমে সংযুক্ত থাকে, যা এক ধরনের সমযোজী রাসায়নিক বন্ধন। প্রতিটি পলিপেপটাইড চেইনে দুটি টার্মিনাল থাকে: এন-টার্মিনাল এবং সি-টার্মিনাল। এন-টার্মিনাল হল অ্যামিনো-টার্মিনাল, যা একটি মুক্ত অ্যামিনো গ্রুপ দিয়ে শেষ হয়, অন্যদিকে সি-টার্মিনাল হল কার্বক্সিল-টার্মিনাল যা একটি মুক্ত কার্বক্সিল গ্রুপ দিয়ে শেষ হয়। একটি পেপটাইডে উপস্থিত অ্যামিনো অ্যাসিডের ক্রম mRNA-এর কোডন দ্বারা নির্ধারিত হয় যা টেমপ্লেট স্ট্র্যান্ড অনুবাদের মাধ্যমে পলিপেপটাইড বা প্রোটিন উৎপাদনের সাথে জড়িত।
একটি প্রোটিনে পলিপেপটাইডের সংখ্যা ও বিন্যাস অনুসারে, চারটি প্রধান ধরনের প্রোটিন গঠন নিম্নরূপ:
- প্রাথমিক কাঠামো - একটি প্রোটিনের প্রাথমিক কাঠামোতে একটি একক পলিপেপটাইড চেইন থাকে যা একই শৃঙ্খলে কিছু অ্যামিনো অ্যাসিডের মধ্যে ডিসালফাইড সেতু থাকে, যা একটি ভাঁজ কাঠামো তৈরি করে।
- সেকেন্ডারি স্ট্রাকচার - প্রোটিনের সেকেন্ডারি স্ট্রাকচারের দুটি প্রধান রূপ রয়েছে: আলফা-হেলিক্স স্ট্রাকচার এবং বিটা-শীট স্ট্রাকচার।
চিত্র 02: আলফা হেলিক্স স্ট্রাকচার
- টারশিয়ারি স্ট্রাকচার - এটি একটি উচ্চ ভাঁজ করা নেটওয়ার্ক কাঠামো। এই গঠনটি খুবই গুরুত্বপূর্ণ কারণ এটি একটি প্রোটিনের কার্যকারিতা নির্ধারণ করে৷
- চতুর্মুখী কাঠামো - এটি দুটি বা তিনটি পলিপেপটাইড চেইনের একটি অত্যন্ত জটিল কাঠামো যা একে অপরের সাথে সংযুক্ত৷
অলিগোপেপটাইড এবং পলিপেপটাইডের মধ্যে পার্থক্য কী?
অলিগোপেপ্টাইডস এবং পলিপেপটাইড দুটি ভিন্ন শ্রেণীর প্রোটিন। প্রোটিন অণুতে উপস্থিত অ্যামিনো অ্যাসিড অবশিষ্টাংশের সংখ্যার উপর নির্ভর করে তারা একে অপরের থেকে পৃথক।অতএব, অলিগোপেপটাইড এবং পলিপেপটাইডের মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে অলিগোপেপটাইডগুলিতে কয়েকটি অ্যামিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশ থাকে, যেখানে পলিপেপটাইডগুলিতে প্রচুর পরিমাণে অ্যামিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশ থাকে৷
নীচের ইনফোগ্রাফিক অলিগোপেপটাইড এবং পলিপেপটাইডের মধ্যে পার্থক্যের সংক্ষিপ্তসার করে।
সারাংশ – অলিগোপেপটাইড বনাম পলিপেপটাইড
অলিগোপেপ্টাইডস এবং পলিপেপটাইড দুটি ভিন্ন শ্রেণীর প্রোটিন। এই প্রোটিন অণুতে উপস্থিত অ্যামিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশের সংখ্যার উপর নির্ভর করে তারা একে অপরের থেকে পৃথক। অর্থাৎ, অলিগোপেপটাইড এবং পলিপেপটাইডের মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে অলিগোপেপটাইডগুলিতে কয়েকটি অ্যামিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশ থাকে, যেখানে পলিপেপটাইডগুলিতে প্রচুর পরিমাণে অ্যামিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশ থাকে৷