কী পার্থক্য - মাইক্রোয়ারে বনাম নেক্সট জেনারেশন সিকোয়েন্সিং
ডিএনএ সিকোয়েন্সিং প্রক্রিয়াগুলি জৈবপ্রযুক্তি, ভাইরোলজি, চিকিৎসা নির্ণয় এবং ফরেনসিক বিজ্ঞানের ক্ষেত্রে ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত হয়। এটি একটি প্রক্রিয়া যা একটি ডিএনএ অণুর মধ্যে উপস্থিত নিউক্লিওটাইডস, অ্যাডেনিন, গুয়ানিন, থাইমিন এবং সাইটোসিনের সঠিক ক্রম নির্ধারণ করে। ডিএনএ সিকোয়েন্সিং পদ্ধতি চিকিৎসা ও জৈবিক গবেষণায় অলৌকিক আবিষ্কারের জন্য একটি ত্বরান্বিত হয়ে উঠেছে। এই সিকোয়েন্সিং পদ্ধতিগুলি মানুষ এবং অন্যান্য জীবিত প্রজাতি সহ পৃথক জীবের সম্পূর্ণ জিনোম সিকোয়েন্স করার জন্য বিবর্তিত হয়েছে। মাইক্রোয়ারে এবং নেক্সট জেনারেশন সিকোয়েন্সিং হল আধুনিক ডিএনএ সিকোয়েন্সিং পদ্ধতি।মাইক্রোয়ারে কৌশলটি বিশেষভাবে হাইব্রিডাইজেশনের উপর ভিত্তি করে যা পরিচিত লক্ষ্যগুলির একটি সেট ধারণ করে। পরবর্তী প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং সংশ্লেষণের উপর ভিত্তি করে (যা নিউক্লিওটাইডগুলিকে অন্তর্ভুক্ত করার জন্য ডিএনএ পলিমারেজ ব্যবহার করে) এবং পূর্বে নির্বাচিত লক্ষ্যগুলি থেকে সম্পূর্ণ জিনোম ক্রম করার ক্ষমতা রাখে। এটি মাইক্রোয়ারে এবং নেক্সট জেনারেশন সিকোয়েন্সিংয়ের মধ্যে মূল পার্থক্য৷
মাইক্রোয়ারে কি?
ডিএনএ মাইক্রোয়ারে একই সময়ে হাজার হাজার ভিন্ন জিনের অভিব্যক্তি সনাক্ত করার জন্য একটি পরীক্ষাগার সরঞ্জাম হিসাবে ব্যবহার করা হয়। এটি একটি কঠিন পৃষ্ঠ, অর্থাৎ, মাইক্রোস্কোপ স্লাইড, এতে মুদ্রিত মাইক্রোস্কোপিক ডিএনএ দাগের একটি সংগ্রহ রয়েছে। প্রতিটি মুদ্রিত স্থানে একটি পরিচিত জিন ক্রম বা একটি জিন থাকে। স্লাইডে মুদ্রিত এই পরিচিত প্রোবগুলি জিনের অভিব্যক্তি সনাক্ত করার জন্য প্রোব হিসাবে কাজ করে। এটি একটি ট্রান্সক্রিপ্টোম হিসাবে পরিচিত। দুটি ডিএনএ স্ট্র্যান্ডের মধ্যে হাইব্রিডাইজেশন প্রাথমিক নীতি মাইক্রোয়ারের উপর ভিত্তি করে। এটি হাইড্রোজেন বন্ড গঠনের সাথে নিউক্লিক অ্যাসিড সিকোয়েন্সের পরিপূরক বেস পেয়ারিং।
চিত্র 01: মাইক্রোয়ারে
প্রাথমিকভাবে, mRNA অণুগুলি পরীক্ষামূলক নমুনা এবং একজন সুস্থ ব্যক্তির কাছ থেকে প্রাপ্ত রেফারেন্স নমুনা থেকে সংগ্রহ করা হয়। পরীক্ষামূলক নমুনা অসুস্থ ব্যক্তিদের থেকে প্রাপ্ত করা হয়; উদাহরণস্বরূপ, একজন ব্যক্তি ক্যান্সারে আক্রান্ত। একবার প্রাপ্ত হলে, উভয় mRNA নমুনা সিডিএনএ (পরিপূরক ডিএনএ) রূপান্তরিত হয়। এর পরে, প্রতিটি নমুনা একটি ফ্লুরোসেন্ট প্রোব ব্যবহার করে লেবেল করা হয়। রেফারেন্স সিডিএনএ থেকে নমুনা সিডিএনএকে আলাদা করতে ফ্লুরোসেন্ট প্রোবগুলি বিভিন্ন রঙের হয়। মাইক্রোয়ারে স্লাইডে সিডিএনএ অণুগুলির বাঁধন শুরু করার জন্য, দুটি নমুনা একসাথে মিশ্রিত হয়। হাইব্রিডাইজেশন হল সেই প্রক্রিয়া যার মাধ্যমে সিডিএনএ অণুগুলি মাইক্রোয়ারে স্লাইডে ডিএনএ প্রোবের সাথে সংযুক্ত হয়। হাইব্রিডাইজেশন সম্পন্ন হলে, প্রকাশ করা জিনের পরিমাণ অনুযায়ী বিভিন্ন রঙের উপস্থিতি সহ প্রতিটি জিনের অভিব্যক্তি সনাক্ত এবং পরিমাপ করার জন্য প্রতিক্রিয়াগুলির একটি সিরিজ সঞ্চালিত হয়।মাইক্রোয়ারের ফলাফলগুলি একটি জিন এক্সপ্রেশন প্রোফাইল তৈরিতে ব্যবহার করা হয় যা বিভিন্ন রোগের অবস্থা সনাক্ত করতে ব্যবহার করা যেতে পারে৷
নেক্সট জেনারেশন সিকোয়েন্সিং কি?
নেক্সট জেনারেশন সিকোয়েন্সিং (এনজিএস) হল জেনেটিক সিকোয়েন্সিংয়ের একটি উন্নত পদ্ধতি। এর নীতিটি সেঞ্জার সিকোয়েন্সিংয়ের মতো, যা কৈশিক ইলেক্ট্রোফোরসিসের উপর নির্ভর করে। এনজিএস-এ, জিনোমিক স্ট্র্যান্ডটি খণ্ডিত এবং একটি টেমপ্লেট স্ট্র্যান্ডের সাথে সংযুক্ত থাকে। প্রতিটি স্ট্র্যান্ডের ভিত্তিগুলি তার বন্ধন প্রক্রিয়া চলাকালীন নির্গত সংকেত দ্বারা চিহ্নিত করা হয়। সেঞ্জার সিকোয়েন্সিং পদ্ধতিতে, তিনটি পৃথক ধাপ, সিকোয়েন্সিং, বিচ্ছেদ এবং সনাক্তকরণ জড়িত। এই পৃথক পদক্ষেপের কারণে, নমুনা প্রস্তুতির অটোমেশন থ্রুপুটে সীমিত। এনজিএস-এ, স্যাঞ্জার সিকোয়েন্সিং পদ্ধতির ধাপগুলির সংমিশ্রণের সাথে অ্যারে ভিত্তিক সিকোয়েন্সিং ব্যবহার করে কৌশলটি তৈরি করা হয় যা একই সময়ে লক্ষ লক্ষ প্রতিক্রিয়া সিরিজ সমান্তরালভাবে পরিচালিত হতে পারে; এর ফলে কম খরচে উচ্চ গতি এবং থ্রুপুট হয়।
চিত্র 02: NGS এর উন্নয়ন
NGS তিনটি ধাপ নিয়ে গঠিত; লাইব্রেরি প্রস্তুতি (ডিএনএ-এর র্যান্ডম ফ্র্যাগমেন্টেশন ব্যবহার করে লাইব্রেরি তৈরি করা), অ্যামপ্লিফিকেশন (ক্লোনাল অ্যামপ্লিফিকেশন এবং পিসিআর ব্যবহার করে লাইব্রেরির পরিবর্ধন) এবং সিকোয়েন্সিং। স্যাঞ্জার সিকোয়েন্সিং পদ্ধতি ব্যবহার করে অত্যন্ত দীর্ঘ সময়ের জন্য পরিচালিত জিনোম সিকোয়েন্সিং প্রক্রিয়াগুলি NGS ব্যবহার করে কয়েক ঘন্টার মধ্যে সম্পন্ন করা যেতে পারে।
মাইক্রোয়ারে এবং নেক্সট জেনারেশন সিকোয়েন্সিংয়ের মধ্যে সাদৃশ্য কী?
মাইক্রোয়ারে এবং নেক্সট জেনারেশন সিকোয়েন্সিং উভয়ই অ্যারে ভিত্তিক সিকোয়েন্সিং ব্যবহার করে বিকশিত হয়৷
মাইক্রোয়ারে এবং পরবর্তী প্রজন্মের সিকোয়েন্সিংয়ের মধ্যে পার্থক্য কী?
মাইক্রোয়ারে বনাম নেক্সট জেনারেশন সিকোয়েন্সিং |
|
| মাইক্রোয়ারে হল একটি কঠিন পৃষ্ঠের সাথে সংযুক্ত মাইক্রোস্কোপিক ডিএনএ দাগের একটি সংগ্রহ, যা একই সাথে বিপুল সংখ্যক জিনের প্রকাশের মাত্রা পরিমাপ করতে ব্যবহৃত হয়। | NGS (পরবর্তী প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং) হল একটি নন-স্যাঙ্গার-ভিত্তিক হাই-থ্রুপুট ডিএনএ সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তি যা লক্ষ লক্ষ বা বিলিয়ন ডিএনএ স্ট্র্যান্ডকে সমান্তরালভাবে সিকোয়েন্স করার সুবিধা দেয়৷ |
| অ্যান্টিজেনের সাথে মিথস্ক্রিয়া | |
| মাইক্রোয়ারে হাইব্রিডাইজেশনের উপর ভিত্তি করে তৈরি করা হয়েছে যা পরিচিত লক্ষ্যগুলির একটি সেট নিয়ে গঠিত। | NGS সংশ্লেষণের উপর ভিত্তি করে তৈরি করা হয়েছে যা ডিএনএ পলিমারেজ ব্যবহার করে নিউক্লিওটাইডগুলিকে অন্তর্ভুক্ত করে এবং এটি পূর্বে নির্বাচিত লক্ষ্যগুলির থেকে স্বাধীন৷ |
সারাংশ – মাইক্রোয়ারে বনাম নেক্সট জেনারেশন সিকোয়েন্সিং
গবেষণার প্রেক্ষাপটে, ডিএনএ সিকোয়েন্সিং একটি গুরুত্বপূর্ণ ত্বরণকারী হয়ে উঠেছে। এটি জৈবপ্রযুক্তি, চিকিৎসা নির্ণয় এবং ফরেনসিক গবেষণায় ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত হয়। এটি আরও দক্ষ এবং দ্রুত সিকোয়েন্সিং পদ্ধতিতে বিকশিত এবং বিকশিত হয়েছে। মাইক্রোয়ারে এবং এনজিএস দুটি উন্নত ডিএনএ সিকোয়েন্সিং কৌশল বর্তমান। উভয়ই অ্যারে ভিত্তিক সিকোয়েন্সিং ব্যবহার করে বিকশিত হয়। মাইক্রোয়ারে কৌশল হাইব্রিডাইজেশনের উপর নির্ভর করে যখন এনজিএস সংশ্লেষণের উপর ভিত্তি করে, যা নিউক্লিওটাইডগুলিকে অন্তর্ভুক্ত করার জন্য ডিএনএ পলিমারেজ ব্যবহার করে। এটি মাইক্রোয়ারে এবং নেক্সট জেনারেশন সিকোয়েন্সিংয়ের মধ্যে প্রধান পার্থক্য৷
মাইক্রোয়ারে বনাম নেক্সট জেনারেশন সিকোয়েন্সিং এর PDF সংস্করণ ডাউনলোড করুন
আপনি এই নিবন্ধটির PDF সংস্করণ ডাউনলোড করতে পারেন এবং উদ্ধৃতি নোট অনুসারে অফলাইন উদ্দেশ্যে এটি ব্যবহার করতে পারেন। অনুগ্রহ করে এখানে পিডিএফ সংস্করণ ডাউনলোড করুন মাইক্রোয়ারে এবং নেক্সট জেনারেশন সিকোয়েন্সিংয়ের মধ্যে পার্থক্য
