কী পার্থক্য – YAC বনাম M13 ফেজ ভেক্টর
ডিএনএ ক্লোনিং একটি গুরুত্বপূর্ণ প্রক্রিয়া যা জীবের গুরুত্বপূর্ণ ডিএনএ খণ্ডের বংশবিস্তারকে সক্ষম করে। রিকম্বিন্যান্ট ডিএনএ তৈরি করতে ভেক্টর ডিএনএর সাথে নির্দিষ্ট ডিএনএর যোগদান প্রয়োজন যা হোস্ট জীবে রূপান্তরিত হয়। একটি ভেক্টর হল একটি ডিএনএ অণু যা অন্য কোষ বা জীবের মধ্যে বিদেশী জেনেটিক উপাদান বহন করার জন্য একটি বাহন হিসাবে আচরণ করে। এটি হোস্ট জীবের ভিতরে প্রতিলিপি তৈরি করতে এবং রিকম্বিন্যান্ট ডিএনএর একাধিক কপি তৈরি করতে সক্ষম হওয়া উচিত। ডিএনএ ক্লোনিংয়ে বিভিন্ন ধরনের ভেক্টর ব্যবহার করা হয়। এদের মধ্যে ইস্ট কৃত্রিম ক্রোমোজোম (YAC) এবং M13 ফেজ ভেক্টর দুই প্রকার।YAC এবং M13 ফেজ ভেক্টরের মধ্যে মূল পার্থক্য হল YAC হল একটি কৃত্রিম ক্রোমোজোম যা ইস্ট কোষে প্রতিলিপি তৈরি করে যখন M13 ফেজ ভেক্টর হল ব্যাকটিরিওফেজ M13 এর একটি একক স্ট্র্যান্ডেড বৃত্তাকার ডিএনএ যা ই কোলি কোষে প্রতিলিপি করে৷
YAC ভেক্টর কি?
YAC হল একটি কৃত্রিমভাবে নির্মিত ক্রোমোজোম যা বিদেশী ডিএনএর একটি বড় অংশ বহন করার এবং খামির কোষের মধ্যে প্রতিলিপি করার ক্ষমতা রাখে। এটিতে সেন্ট্রোমিয়ার, টেলোমেয়ার এবং স্বায়ত্তশাসিতভাবে প্রতিলিপিকরণ এবং স্থিতিশীলতার জন্য প্রয়োজনীয় অনুক্রম রয়েছে। YAC এর একটি কার্যকরী ক্লোনিং ভেক্টর করার জন্য একটি নির্বাচনী মার্কার বা মার্কার এবং সীমাবদ্ধতা সাইটগুলিও বহন করা উচিত। 1000 kb থেকে 2000 kb পর্যন্ত বড় ক্রমগুলি YAC-তে ঢোকানো যেতে পারে এবং খামিরে স্থানান্তরিত হতে পারে৷
চিত্র 01: YAC ভেক্টর
M13 ফেজ ভেক্টর কি?
ব্যাকটেরিওফেজ এম13 একটি ভাইরাস যা ই কোলাইতে সংক্রামিত হয় এবং প্রতিলিপি তৈরি করে। M13 ব্যাকটেরিওফেজের জিনোম আকারে ছোট, প্রায় 6.7 কেবি। এটি একটি একক-স্ট্রেন্ডেড, বৃত্তাকার এবং ইতিবাচক সেন্স ডিএনএ। এই ভাইরাস বিশেষভাবে এফ পাইলাসের মাধ্যমে ই কোলাই ব্যাকটেরিয়াকে সংক্রমিত করে। একবার এটি ব্যাকটেরিয়াতে ssDNA প্রবেশ করলে, এটি তার পরিপূরক স্ট্র্যান্ডকে সংশ্লেষিত করে এবং dsDNA বা M13 এর প্রতিলিপি রূপ (RF) হয়ে যায়। আরএফ হোস্ট জীবের মধ্যে প্লাজমিডের মতো আচরণ করতে পারে। dsDNA E Coli-এর মধ্যে প্রতিলিপি করে এবং নতুন ফেজ বহন করে ssDNA তৈরি করে। এই নতুন ফেজগুলি হোস্ট কোষকে হত্যা না করেই ই কোলি থেকে ক্রমাগত মুক্তি পায়। যাইহোক, সংক্রমণ ই কোলাই বৃদ্ধির গতি কমিয়ে দেয়। dsDNA ব্যাকটেরিয়া কোষ থেকে বের করা যায় এবং DNA ক্লোনিংয়ে ভেক্টর হিসেবে ব্যবহার করা যায়। এরা M13 ফেজ ভেক্টর নামে পরিচিত। এগুলিকে সহজেই ম্যানিপুলেট করা যায় এবং প্লাজমিড ভেক্টরের মতোই ব্যবহার করা যায়৷
এই M13 ফেজগুলির সংক্রমণের সহজাত ক্ষমতা জিন ক্লোনিংয়ে ভেক্টর হিসাবে ব্যবহার করার জন্য একটি ভাল যোগ্যতা হিসাবে কাজ করে।M13 কে একটি ভেক্টরে বিকশিত করার সময়, এর জিনোমে বেশ কয়েকটি উপাদান অন্তর্ভুক্ত করা উচিত। এগুলি হল, ল্যাক রিপ্রেসার (ল্যাক আই) প্রোটিনের জন্য একটি জিন, ল্যাক জেড জিনের অপারেটর-প্রক্সিমাল অঞ্চল, একটি লক্ষ প্রবর্তক এবং একটি একাধিক ক্লোনিং সাইট (পলিলিংকার)। যখন M13 এর dsDNA ভেক্টর হিসাবে ব্যবহার করা হয়, তখন এটি একটি প্লাজমিড ভেক্টর হিসাবে বিবেচিত হতে পারে। যাইহোক, ডিএনএ সিকোয়েন্সিং এবং সাইট-নির্দেশিত মিউটাজেনেসিসে ssDNA M13 ব্যবহারের সুবিধা রয়েছে।
যেহেতু M13 ফেজ ভেক্টর ল্যাকজেড অঞ্চলে একাধিক ক্লোনিং সাইট বহন করে, আইপিটিজি এবং এক্স-গাল সম্বলিত আগর প্লেটের নীল/সাদা কলোনি স্ক্রীনিং দ্বারা পুনরায় সংযুক্ত ভেক্টরগুলি সহজেই সনাক্ত করা যায়। প্লেটগুলিতে উত্পাদিত নীল ফলকগুলিতে পুনরায় সংযুক্ত ফেজ থাকে না। অতএব, ক্লোনিংয়ের উদ্দেশ্যে সন্নিবেশ সহ ফেজগুলি নির্বাচন করা যেতে পারে৷
চিত্র 02: ব্যাকটেরিওফেজ M13
YAC এবং M13 ফেজ ভেক্টরের মধ্যে পার্থক্য কী?
YAC বনাম M13 ফেজ ভেক্টর |
|
| YAC হল একটি জেনেটিক্যালি ইঞ্জিনিয়ারড ক্রোমোজোম যা বিদেশী ডিএনএ-এর একটি বড় অংশ বহন করার এবং ইস্ট কোষের মধ্যে প্রতিলিপি তৈরি করার ক্ষমতা রাখে। | M13 ফেজ ভেক্টর হল একটি ভাইরাল ভেক্টর যা ব্যাকটেরিওফেজ M13 দ্বারা তৈরি করা হয় যা ই কোলাইতে বিদেশী DNA ঢোকানোর জন্য ব্যবহৃত হয়। |
| উদ্দেশ্য | |
| YACs ডিজাইন করা হয়েছিল জিনোমিক ডিএনএর বড় অংশকে খামিরে ক্লোন করার জন্য। | M13 ফেজ ভেক্টর ই কোলাইতে বিদেশী DNA ঢোকানোর জন্য ব্যবহার করা হয়। |
| দৈর্ঘ্য ঢোকান | |
| YAC-তে মেগাবেস-আকারের জিনোমিক ইনসার্ট থাকতে পারে (1000 kb – 2000 kb)। | সন্নিবেশের আকার প্রায় 1, 500 bps। |
| নির্মাণ | |
| YAC ডিএনএ অক্ষত বিশুদ্ধ করা কঠিন এবং YAC ভেক্টর সিস্টেম তৈরির জন্য উচ্চ ঘনত্বের প্রয়োজন৷ | এটি চক্রাকার সালোকসংশ্লেষী ইলেক্ট্রন চেইনের মাধ্যমে ঘটে। |
| স্থিরতা | |
| YAC অস্থির। | M13 ফেজ সহজেই বের করা যায়। |
| আকার | |
| এনজাইমগুলি বড় অণু। | M13 ফেজ YAC এর চেয়ে স্থিতিশীল। |
সারাংশ – YAC বনাম M13 ফেজ ভেক্টর
YAC হল একটি কৃত্রিমভাবে নির্মিত ভেক্টর সিস্টেম যা ইস্ট ক্রোমোজোমের একটি নির্দিষ্ট অঞ্চল ব্যবহার করে খামির কোষে জেনেটিক উপাদানের বড় অংশ প্রবেশ করানো হয়।M13 ফেজ ভেক্টর হল ব্যাকটেরিওফেজ M 13 থেকে উদ্ভূত একটি ভেক্টর সিস্টেম যা হোস্ট জীব হিসাবে ই কোলাই ব্যবহার করে। এটি YAC এবং M13 ফেজ ভেক্টরের মধ্যে প্রধান পার্থক্য। উভয়ই রিকম্বিন্যান্ট ডিএনএ প্রযুক্তি এবং জিন ক্লোনিংয়ের ক্ষেত্রে সমানভাবে কার্যকর৷
