অখণ্ড প্রোটিন বনাম পেরিফেরাল প্রোটিন
প্রোটিনগুলিকে ম্যাক্রো অণু হিসাবে বিবেচনা করা হয়, যা এক বা একাধিক পলিপেপটাইড চেইন নিয়ে গঠিত। পলিপেপটাইড চেইনগুলি পেপটাইড বন্ড দ্বারা একত্রিত অ্যামিনো অ্যাসিড দিয়ে তৈরি। অ্যামিনো অ্যাসিড ক্রম দ্বারা প্রোটিনের প্রাথমিক গঠন নির্ধারণ করা যেতে পারে। অনেক প্রোটিনের জন্য নির্দিষ্ট জিন কোড। এই জিনগুলি অ্যামিনো অ্যাসিডের ক্রম নির্ধারণ করে, যার ফলে তাদের প্রাথমিক গঠন নির্ধারণ করে। ইন্টিগ্রাল এবং পেরিফেরাল প্রোটিনগুলি তাদের উপস্থিতির কারণে 'প্লাজমা মেমব্রেন প্রোটিন' হিসাবে বিবেচিত হয়। এই প্রোটিনগুলি সাধারণত বাইরের পরিবেশের সাথে যোগাযোগ করার জন্য কোষের ক্ষমতার জন্য দায়ী।
অখণ্ড প্রোটিন
ইনটিগ্রাল প্রোটিনগুলি মূলত প্লাজমা ঝিল্লির ফসফোলিপিডস বিলেয়ারে সম্পূর্ণ বা আংশিকভাবে নিমজ্জিত অবস্থায় পাওয়া যায়। এই প্রোটিনগুলির উপর মেরু এবং অ-মেরু অঞ্চল উভয়ই রয়েছে। পোলার হেডগুলি বিলেয়ারের পৃষ্ঠ থেকে বেরিয়ে আসে যখন অ-মেরু অঞ্চলগুলি এতে এম্বেড থাকে। সাধারণত শুধুমাত্র অ-মেরু অঞ্চলগুলি ফসফোলিপিডের ফ্যাটি অ্যাসিড লেজের সাথে হাইড্রোফোবিক বন্ধন তৈরি করে প্লাজমা ঝিল্লির হাইড্রোফোবিক কোরের সাথে যোগাযোগ করে।
ডলারঅভ্যন্তরীণ পৃষ্ঠ থেকে বাইরের পৃষ্ঠ পর্যন্ত পুরো ঝিল্লিটি বিস্তৃত অবিচ্ছেদ্য প্রোটিনগুলিকে ট্রান্সমেম্ব্রেন প্রোটিন বলা হয়। ট্রান্সমেমব্রেন প্রোটিনে, লিপিড স্তরের বাইরে প্রজেক্টের উভয় প্রান্তই মেরু বা হাইড্রোফিলিক অঞ্চল। মধ্যবর্তী অঞ্চলগুলি অ-মেরু এবং তাদের পৃষ্ঠে হাইড্রোফোবিক অ্যামিনো অ্যাসিড রয়েছে। তিন ধরনের মিথস্ক্রিয়া এই প্রোটিনগুলিকে লিপিড বিলেয়ারে এম্বেড করতে সাহায্য করে, যথা, ফসফোলিপিড অণুর পোলার হেডের সাথে আয়নিক মিথস্ক্রিয়া, ফসফোলিপিড অণুর হাইড্রোফোবিক লেজের সাথে হাইড্রোফোবিক মিথস্ক্রিয়া এবং লিপিডের নির্দিষ্ট অঞ্চলের সাথে নির্দিষ্ট মিথস্ক্রিয়া, গ্লাইকোলিপিডস বা গ্লাইকোলিপিডস।
পেরিফেরাল প্রোটিন
পেরিফেরাল প্রোটিন (বাহ্যিক প্রোটিন) ফসফোলিপিড বাইলেয়ারের সবচেয়ে ভিতরের এবং বাইরের দিকে থাকে। এই প্রোটিনগুলি সরাসরি ফসফোলিপিড বিলেয়ারের পোলার হেডগুলির সাথে মিথস্ক্রিয়া দ্বারা বা পরোক্ষভাবে অবিচ্ছেদ্য প্রোটিনের সাথে মিথস্ক্রিয়া দ্বারা প্লাজমা ঝিল্লিতে আবদ্ধ থাকে। এই প্রোটিনগুলি মোট মেমব্রেন প্রোটিনের প্রায় 20-30% গঠন করে৷
অধিকাংশ পেরিফেরাল প্রোটিন ঝিল্লির অভ্যন্তরীণ পৃষ্ঠ বা সাইটোপ্লাজমিক পৃষ্ঠে পাওয়া যায়। এই প্রোটিনগুলি হয় ফ্যাটি চেইন সহ সমযোজী বন্ধনের মাধ্যমে বা অলিগোস্যাকারাইডের মাধ্যমে ফসফোলিপিডের সাথে আবদ্ধ থাকে৷
ইনটিগ্রাল এবং পেরিফেরাল প্রোটিনের মধ্যে পার্থক্য কী?
• পেরিফেরাল প্রোটিনগুলি প্লাজমা মেমব্রেনের উপরিভাগে দেখা যায় যেখানে অবিচ্ছেদ্য প্রোটিনগুলি প্লাজমা ঝিল্লির লিপিড স্তরে সম্পূর্ণ বা আংশিকভাবে নিমজ্জিত থাকে৷
• পেরিফেরাল প্রোটিনগুলি লিপিড বিলেয়ারের সাথে আলগাভাবে আবদ্ধ থাকে এবং ফসফোলিপিডের দুটি স্তরের মধ্যে হাইড্রোফোবিক কোরের সাথে যোগাযোগ করে না।বিপরীতে, অবিচ্ছেদ্য প্রোটিনগুলি শক্তভাবে আবদ্ধ এবং সরাসরি প্লাজমা ঝিল্লির হাইড্রোফোবিক কোরের সাথে যোগাযোগ করছে। এই কারণে, পেরিফেরাল প্রোটিনের চেয়ে অবিচ্ছেদ্য প্রোটিন বিচ্ছিন্নকরণ আরও কঠিন৷
• প্লাজমা মেমব্রেন থেকে পেরিফেরাল প্রোটিন বিচ্ছিন্ন করার জন্য হালকা চিকিত্সা ব্যবহার করা যেতে পারে, কিন্তু অবিচ্ছেদ্য প্রোটিন বিচ্ছিন্ন করার জন্য, হালকা চিকিত্সা যথেষ্ট নয়। হাইড্রোফোবিক বন্ধন ভাঙ্গার জন্য, ডিটারজেন্ট প্রয়োজন। এইভাবে, অবিচ্ছেদ্য প্রোটিনগুলি প্লাজমা ঝিল্লি থেকে বিচ্ছিন্ন করা যেতে পারে।
• প্লাজমা ঝিল্লি থেকে এই দুটি প্রোটিন বিচ্ছিন্ন করার পরে, পেরিফেরাল প্রোটিনগুলি নিরপেক্ষ জলীয় বাফারে দ্রবীভূত করা যেতে পারে যখন অবিচ্ছেদ্য প্রোটিনগুলি নিরপেক্ষ জলীয় বাফার বা সমষ্টিতে দ্রবীভূত করা যায় না৷
• পেরিফেরাল প্রোটিনের বিপরীতে, ইন্টিগ্রাল প্রোটিন লিপিডের সাথে যুক্ত থাকে যখন দ্রবণীয় হয়৷
• পেরিফেরাল প্রোটিনের উদাহরণ হল এরিথ্রোসাইটের স্পেকট্রিন, সাইটোক্রোম সি এবং মাইটোকন্ড্রিয়ার এটিপি-এস এবং ইলেক্ট্রোপ্ল্যাক্স মেমব্রেনে অ্যাসিটাইলকোলিনস্টেরেজ। অবিচ্ছেদ্য প্রোটিনের উদাহরণ হল ঝিল্লি আবদ্ধ এনজাইম, ড্রাগ এবং হরমোন রিসেপ্টর, অ্যান্টিজেন এবং রোডোপসিন।
• ইন্টিগ্রাল প্রোটিন প্রায় 70% প্রতিনিধিত্ব করে যখন পেরিফেরাল প্রোটিনগুলি প্লাজমা মেমব্রেন প্রোটিনের অবশিষ্ট অংশকে প্রতিনিধিত্ব করে৷
