আণবিক ডকিং এবং স্কোরিংয়ের মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে ডকিং হল একটি কৌশল যা দুটি অণুর মধ্যে বন্ধনযুক্ত সম্পর্ক নির্ধারণ করতে ব্যবহৃত হয় যেখানে স্কোরিং হল অনুকূল আন্তঃআণবিক মিথস্ক্রিয়া সংখ্যা গণনা করে একটি নির্দিষ্ট ভঙ্গি মূল্যায়ন করার একটি প্রক্রিয়া।
আণবিক মডেলিংয়ের ক্ষেত্রে আণবিক ডকিং এবং স্কোরিং শব্দটি ব্যবহার করা হয়। আণবিক মডেলিং একটি প্রদত্ত পদার্থে বিভিন্ন অণুর সম্ভাব্য বিন্যাস নির্ধারণ করতে ব্যবহৃত একটি কৌশল। নতুন স্থিতিশীল যৌগ তৈরিতে এই কৌশলটি গুরুত্বপূর্ণ৷
আণবিক ডকিং কি?
আণবিক ডকিং একটি রিসেপ্টরের সাথে আবদ্ধ প্রার্থী লিগ্যান্ডের একটি গণনামূলক সিমুলেশন।এই পদ্ধতিটি একটি স্থিতিশীল কমপ্লেক্স গঠনের জন্য একে অপরের সাথে আবদ্ধ হয়ে অন্য অণুর সাথে একটি অণুর পছন্দের অভিযোজনের পূর্বাভাস দেয়। এই কৌশল থেকে প্রাপ্ত ফলাফল দুটি অণুর মধ্যে সংযোগের শক্তি বা আবদ্ধ সম্পর্ক ভবিষ্যদ্বাণী করতে ব্যবহার করা যেতে পারে। এখানে, আণবিক স্কোরিং ফাংশনটিও গুরুত্বপূর্ণ৷
চিত্র 01: জৈবিক সিস্টেমে আণবিক মিথস্ক্রিয়াগুলির প্রক্রিয়া দেখানো একটি সহজ চিত্র
সাধারণত, এই কৌশলটি জৈবিকভাবে প্রাসঙ্গিক অণু যেমন প্রোটিন, পেপটাইড, নিউক্লিক অ্যাসিড, কার্বোহাইড্রেট এবং লিপিড বিবেচনা করে। এই অণুগুলি খুবই গুরুত্বপূর্ণ, এবং তারা আমাদের শরীরের সংকেত ট্রান্সডাকশন প্রক্রিয়াতে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে। অতএব, এই সংকেত ট্রান্সডাকশন প্রক্রিয়ার জন্য আবদ্ধ হতে চলেছে এমন দুটি অণুর অভিযোজন এখানে উত্পাদিত সংকেতের ধরণকে প্রভাবিত করে।এর মানে; জৈবিক সিস্টেমে সিগন্যাল ট্রান্সডাকশনের সময় উত্পাদিত শক্তি এবং সংকেতের ধরন উভয়ই নির্ধারণে আণবিক ডকিং গুরুত্বপূর্ণ।
এছাড়াও, কাঠামো-ভিত্তিক ওষুধ ডিজাইন করার ক্ষেত্রে আণবিক ডকিং কৌশল গুরুত্বপূর্ণ। এটি একটি উপযুক্ত বাইন্ডিং সাইটে লিগ্যান্ডের মতো ছোট অণুগুলির আবদ্ধ হওয়ার পূর্বাভাসযোগ্যতার কারণে।
আণবিক স্কোরিং কি?
আণবিক স্কোরিং হল এক ধরনের গাণিতিক ফাংশন যা আণবিক ডকিংয়ের অগ্রগতি মূল্যায়নে কার্যকর। কম্পিউটেশনাল কেমিস্ট্রির ক্ষেত্রে, স্কোরিং ফাংশনগুলি ডকিং প্রক্রিয়ার পরে দুটি অণুর মধ্যে আবদ্ধ সম্পর্ক ভবিষ্যদ্বাণী করার জন্য ব্যবহৃত হয়। উদাহরণস্বরূপ, যদি আমাদের কাছে একটি কণা ওষুধের একটি ছোট অণু থাকে এবং সেখানে একটি জৈবিক লক্ষ্য থাকে যেমন একটি প্রোটিন, আমরা বাঁধাই সাইটের প্রতি ওষুধের সখ্যতা মূল্যায়ন করতে পারি। অধিকন্তু, আণবিক স্কোরিং দুটি প্রোটিনের মধ্যে বা একটি প্রোটিন এবং ডিএনএ অণুর মধ্যে আন্তঃআণবিক মিথস্ক্রিয়াগুলির পূর্বাভাস দিতে ব্যবহার করা যেতে পারে।
চিত্র 02: সংক্ষেপে স্কোরিং ফাংশন
আণবিক স্কোরিংয়ের প্রধান প্রয়োগ হল ড্রাগ ডিজাইনিং প্রসেস-উদাহরণস্বরূপ, ভার্চুয়াল স্ক্রীনিং, ডি নভো ডিজাইনিং, লিড অপ্টিমাইজেশান ইত্যাদি।
আণবিক ডকিং এবং স্কোরিংয়ের মধ্যে পার্থক্য কী?
আণবিক মডেলিংয়ে আণবিক ডকিং এবং স্কোরিং গুরুত্বপূর্ণ। আণবিক ডকিং এবং স্কোরিংয়ের মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে ডকিং হল একটি কৌশল যা দুটি অণুর মধ্যে আবদ্ধ সম্পর্ক নির্ধারণ করতে ব্যবহৃত হয় যেখানে স্কোরিং হল অনুকূল আন্তঃআণবিক মিথস্ক্রিয়াগুলির সংখ্যা গণনা করে একটি নির্দিষ্ট ভঙ্গি মূল্যায়ন করার একটি প্রক্রিয়া৷
নিম্নলিখিত ইনফোগ্রাফিকটি আণবিক ডকিং এবং স্কোরিংয়ের মধ্যে পার্থক্যকে সংক্ষিপ্ত করে৷
সারাংশ – আণবিক ডকিং বনাম স্কোরিং
আণবিক মডেলিংয়ে আণবিক ডকিং এবং স্কোরিং গুরুত্বপূর্ণ। আণবিক ডকিং এবং স্কোরিংয়ের মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে ডকিং হল একটি কৌশল যা দুটি অণুর মধ্যে আবদ্ধ সম্পর্ক নির্ধারণ করতে ব্যবহৃত হয় যেখানে স্কোরিং হল অনুকূল আন্তঃআণবিক মিথস্ক্রিয়াগুলির সংখ্যা গণনা করে একটি নির্দিষ্ট ভঙ্গি মূল্যায়ন করার একটি প্রক্রিয়া৷
